Estudio QSAR de la toxicidad aguda de pesticidas en la lombriz Eisenia Foetida

Autores
Duchowicz, Pablo Román; Bennardi, Daniel Oscar; Aranda, José Francisco
Año de publicación
2022
Idioma
español castellano
Tipo de recurso
artículo
Estado
versión publicada
Descripción
El objetivo de este trabajo fue el desarrollo de relaciones cuantitativas estructura–actividad (QSAR) predictivas con el fin de predecir la toxicidad aguda de los plaguicidas en lombrices de tierra (Eisenia foetida). Los datos de toxicidad experimentales fueron obtenidos de la base de datos de propiedades de pesticidas (PPDB) desarrollada en la Universidad de Hertfordshire. Se dibujaron las estructuras moleculares con ACD ChemSketch. Los descriptores moleculares no conformacionales se calcularon mediante los programas PaDEL, Mold2 , DataWarrior y QuBiLsMAS. Tras la exclusión de los descriptores constantes, linealmente dependientes y de valores únicos se obtuvieron un total de 2055 variables estructurales. Se usó el Método de Subconjuntos Balanceados (BSM) para dividir el conjunto molecular (58 moléculas) en 3 grupos de calibración, validación y predicción. Se llevaron a cabo regresiones lineales QSAR de 1-5 descriptores, mediante un algoritmo matemático, el Método de Reemplazo. Se encontró un modelo de regresión lineal de 4 descriptores que poseía los mejores resultados de validación. Posteriormente se utilizó este modelo para predecir la toxicidad de 21 plaguicidas cuyos valores experimentales eran no verificados o menos confiables. Las predicciones fueron por lo general próximas a los valores reportados no verificados.
The aim of this work was the development of predictive quantitative structure–activity relationships (QSARs) in order to predict the acute toxicity of pesticides in earthworms (Eisenia foetida). Experimental toxicity data were obtained from the Pesticide Properties Database (PPDB) developed at the University of Hertfordshire. Molecular structures were drawn with ACD ChemSketch. Non-conformational molecular descriptors were calculated using PaDEL, Mold2 , DataWarrior and QuBiLs-MAS programs. After excluding the constant, linearly dependent, and unique value descriptors, a total of 2,055 structural variables were obtained. The Balanced Subset Method (BSM) was used to divide the molecular set (58 molecules) into 3 groups for calibration, validation and prediction. QSAR linear regressions of 1-5 descriptors were carried out using a mathematical algorithm, the Replacement Method. A 4-descriptor linear regression model was found to have the best validation results. This model was then used to predict the toxicity of 21 pesticides whose experimental values were unverified or less reliable. The predictions were generally close to the unverified reported values.
Fil: Duchowicz, Pablo Román. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Investigaciones Fisicoquímicas Teóricas y Aplicadas. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Instituto de Investigaciones Fisicoquímicas Teóricas y Aplicadas; Argentina
Fil: Bennardi, Daniel Oscar. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Agrarias y Forestales; Argentina
Fil: Aranda, José Francisco. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Investigaciones Fisicoquímicas Teóricas y Aplicadas. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Instituto de Investigaciones Fisicoquímicas Teóricas y Aplicadas; Argentina
Materia
plaguicidas
Eisenia foetida
QSAR
regresión lineal multivariable
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
Repositorio
CONICET Digital (CONICET)
Institución
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
OAI Identificador
oai:ri.conicet.gov.ar:11336/240943

id CONICETDig_26f2e47b13141598a560f55f3bdf3df7
oai_identifier_str oai:ri.conicet.gov.ar:11336/240943
network_acronym_str CONICETDig
repository_id_str 3498
network_name_str CONICET Digital (CONICET)
spelling Estudio QSAR de la toxicidad aguda de pesticidas en la lombriz Eisenia FoetidaDuchowicz, Pablo RománBennardi, Daniel OscarAranda, José FranciscoplaguicidasEisenia foetidaQSARregresión lineal multivariablehttps://purl.org/becyt/ford/1.4https://purl.org/becyt/ford/1El objetivo de este trabajo fue el desarrollo de relaciones cuantitativas estructura–actividad (QSAR) predictivas con el fin de predecir la toxicidad aguda de los plaguicidas en lombrices de tierra (Eisenia foetida). Los datos de toxicidad experimentales fueron obtenidos de la base de datos de propiedades de pesticidas (PPDB) desarrollada en la Universidad de Hertfordshire. Se dibujaron las estructuras moleculares con ACD ChemSketch. Los descriptores moleculares no conformacionales se calcularon mediante los programas PaDEL, Mold2 , DataWarrior y QuBiLsMAS. Tras la exclusión de los descriptores constantes, linealmente dependientes y de valores únicos se obtuvieron un total de 2055 variables estructurales. Se usó el Método de Subconjuntos Balanceados (BSM) para dividir el conjunto molecular (58 moléculas) en 3 grupos de calibración, validación y predicción. Se llevaron a cabo regresiones lineales QSAR de 1-5 descriptores, mediante un algoritmo matemático, el Método de Reemplazo. Se encontró un modelo de regresión lineal de 4 descriptores que poseía los mejores resultados de validación. Posteriormente se utilizó este modelo para predecir la toxicidad de 21 plaguicidas cuyos valores experimentales eran no verificados o menos confiables. Las predicciones fueron por lo general próximas a los valores reportados no verificados.The aim of this work was the development of predictive quantitative structure–activity relationships (QSARs) in order to predict the acute toxicity of pesticides in earthworms (Eisenia foetida). Experimental toxicity data were obtained from the Pesticide Properties Database (PPDB) developed at the University of Hertfordshire. Molecular structures were drawn with ACD ChemSketch. Non-conformational molecular descriptors were calculated using PaDEL, Mold2 , DataWarrior and QuBiLs-MAS programs. After excluding the constant, linearly dependent, and unique value descriptors, a total of 2,055 structural variables were obtained. The Balanced Subset Method (BSM) was used to divide the molecular set (58 molecules) into 3 groups for calibration, validation and prediction. QSAR linear regressions of 1-5 descriptors were carried out using a mathematical algorithm, the Replacement Method. A 4-descriptor linear regression model was found to have the best validation results. This model was then used to predict the toxicity of 21 pesticides whose experimental values were unverified or less reliable. The predictions were generally close to the unverified reported values.Fil: Duchowicz, Pablo Román. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Investigaciones Fisicoquímicas Teóricas y Aplicadas. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Instituto de Investigaciones Fisicoquímicas Teóricas y Aplicadas; ArgentinaFil: Bennardi, Daniel Oscar. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Agrarias y Forestales; ArgentinaFil: Aranda, José Francisco. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Investigaciones Fisicoquímicas Teóricas y Aplicadas. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Instituto de Investigaciones Fisicoquímicas Teóricas y Aplicadas; ArgentinaAsociación Química Argentina2022-07info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_6501info:ar-repo/semantics/articuloapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/11336/240943Duchowicz, Pablo Román; Bennardi, Daniel Oscar; Aranda, José Francisco; Estudio QSAR de la toxicidad aguda de pesticidas en la lombriz Eisenia Foetida; Asociación Química Argentina; Anales de la Asociación Química Argentina; 109; 1-2; 7-2022; 5-190365-03752545-8655CONICET DigitalCONICETspainfo:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://aqa.org.ar/images/anales/pdf109/109.pdfinfo:eu-repo/semantics/openAccesshttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/reponame:CONICET Digital (CONICET)instname:Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas2025-09-03T10:11:29Zoai:ri.conicet.gov.ar:11336/240943instacron:CONICETInstitucionalhttp://ri.conicet.gov.ar/Organismo científico-tecnológicoNo correspondehttp://ri.conicet.gov.ar/oai/requestdasensio@conicet.gov.ar; lcarlino@conicet.gov.arArgentinaNo correspondeNo correspondeNo correspondeopendoar:34982025-09-03 10:11:30.256CONICET Digital (CONICET) - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicasfalse
dc.title.none.fl_str_mv Estudio QSAR de la toxicidad aguda de pesticidas en la lombriz Eisenia Foetida
title Estudio QSAR de la toxicidad aguda de pesticidas en la lombriz Eisenia Foetida
spellingShingle Estudio QSAR de la toxicidad aguda de pesticidas en la lombriz Eisenia Foetida
Duchowicz, Pablo Román
plaguicidas
Eisenia foetida
QSAR
regresión lineal multivariable
title_short Estudio QSAR de la toxicidad aguda de pesticidas en la lombriz Eisenia Foetida
title_full Estudio QSAR de la toxicidad aguda de pesticidas en la lombriz Eisenia Foetida
title_fullStr Estudio QSAR de la toxicidad aguda de pesticidas en la lombriz Eisenia Foetida
title_full_unstemmed Estudio QSAR de la toxicidad aguda de pesticidas en la lombriz Eisenia Foetida
title_sort Estudio QSAR de la toxicidad aguda de pesticidas en la lombriz Eisenia Foetida
dc.creator.none.fl_str_mv Duchowicz, Pablo Román
Bennardi, Daniel Oscar
Aranda, José Francisco
author Duchowicz, Pablo Román
author_facet Duchowicz, Pablo Román
Bennardi, Daniel Oscar
Aranda, José Francisco
author_role author
author2 Bennardi, Daniel Oscar
Aranda, José Francisco
author2_role author
author
dc.subject.none.fl_str_mv plaguicidas
Eisenia foetida
QSAR
regresión lineal multivariable
topic plaguicidas
Eisenia foetida
QSAR
regresión lineal multivariable
purl_subject.fl_str_mv https://purl.org/becyt/ford/1.4
https://purl.org/becyt/ford/1
dc.description.none.fl_txt_mv El objetivo de este trabajo fue el desarrollo de relaciones cuantitativas estructura–actividad (QSAR) predictivas con el fin de predecir la toxicidad aguda de los plaguicidas en lombrices de tierra (Eisenia foetida). Los datos de toxicidad experimentales fueron obtenidos de la base de datos de propiedades de pesticidas (PPDB) desarrollada en la Universidad de Hertfordshire. Se dibujaron las estructuras moleculares con ACD ChemSketch. Los descriptores moleculares no conformacionales se calcularon mediante los programas PaDEL, Mold2 , DataWarrior y QuBiLsMAS. Tras la exclusión de los descriptores constantes, linealmente dependientes y de valores únicos se obtuvieron un total de 2055 variables estructurales. Se usó el Método de Subconjuntos Balanceados (BSM) para dividir el conjunto molecular (58 moléculas) en 3 grupos de calibración, validación y predicción. Se llevaron a cabo regresiones lineales QSAR de 1-5 descriptores, mediante un algoritmo matemático, el Método de Reemplazo. Se encontró un modelo de regresión lineal de 4 descriptores que poseía los mejores resultados de validación. Posteriormente se utilizó este modelo para predecir la toxicidad de 21 plaguicidas cuyos valores experimentales eran no verificados o menos confiables. Las predicciones fueron por lo general próximas a los valores reportados no verificados.
The aim of this work was the development of predictive quantitative structure–activity relationships (QSARs) in order to predict the acute toxicity of pesticides in earthworms (Eisenia foetida). Experimental toxicity data were obtained from the Pesticide Properties Database (PPDB) developed at the University of Hertfordshire. Molecular structures were drawn with ACD ChemSketch. Non-conformational molecular descriptors were calculated using PaDEL, Mold2 , DataWarrior and QuBiLs-MAS programs. After excluding the constant, linearly dependent, and unique value descriptors, a total of 2,055 structural variables were obtained. The Balanced Subset Method (BSM) was used to divide the molecular set (58 molecules) into 3 groups for calibration, validation and prediction. QSAR linear regressions of 1-5 descriptors were carried out using a mathematical algorithm, the Replacement Method. A 4-descriptor linear regression model was found to have the best validation results. This model was then used to predict the toxicity of 21 pesticides whose experimental values were unverified or less reliable. The predictions were generally close to the unverified reported values.
Fil: Duchowicz, Pablo Román. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Investigaciones Fisicoquímicas Teóricas y Aplicadas. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Instituto de Investigaciones Fisicoquímicas Teóricas y Aplicadas; Argentina
Fil: Bennardi, Daniel Oscar. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Agrarias y Forestales; Argentina
Fil: Aranda, José Francisco. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Investigaciones Fisicoquímicas Teóricas y Aplicadas. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Instituto de Investigaciones Fisicoquímicas Teóricas y Aplicadas; Argentina
description El objetivo de este trabajo fue el desarrollo de relaciones cuantitativas estructura–actividad (QSAR) predictivas con el fin de predecir la toxicidad aguda de los plaguicidas en lombrices de tierra (Eisenia foetida). Los datos de toxicidad experimentales fueron obtenidos de la base de datos de propiedades de pesticidas (PPDB) desarrollada en la Universidad de Hertfordshire. Se dibujaron las estructuras moleculares con ACD ChemSketch. Los descriptores moleculares no conformacionales se calcularon mediante los programas PaDEL, Mold2 , DataWarrior y QuBiLsMAS. Tras la exclusión de los descriptores constantes, linealmente dependientes y de valores únicos se obtuvieron un total de 2055 variables estructurales. Se usó el Método de Subconjuntos Balanceados (BSM) para dividir el conjunto molecular (58 moléculas) en 3 grupos de calibración, validación y predicción. Se llevaron a cabo regresiones lineales QSAR de 1-5 descriptores, mediante un algoritmo matemático, el Método de Reemplazo. Se encontró un modelo de regresión lineal de 4 descriptores que poseía los mejores resultados de validación. Posteriormente se utilizó este modelo para predecir la toxicidad de 21 plaguicidas cuyos valores experimentales eran no verificados o menos confiables. Las predicciones fueron por lo general próximas a los valores reportados no verificados.
publishDate 2022
dc.date.none.fl_str_mv 2022-07
dc.type.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/article
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
http://purl.org/coar/resource_type/c_6501
info:ar-repo/semantics/articulo
format article
status_str publishedVersion
dc.identifier.none.fl_str_mv http://hdl.handle.net/11336/240943
Duchowicz, Pablo Román; Bennardi, Daniel Oscar; Aranda, José Francisco; Estudio QSAR de la toxicidad aguda de pesticidas en la lombriz Eisenia Foetida; Asociación Química Argentina; Anales de la Asociación Química Argentina; 109; 1-2; 7-2022; 5-19
0365-0375
2545-8655
CONICET Digital
CONICET
url http://hdl.handle.net/11336/240943
identifier_str_mv Duchowicz, Pablo Román; Bennardi, Daniel Oscar; Aranda, José Francisco; Estudio QSAR de la toxicidad aguda de pesticidas en la lombriz Eisenia Foetida; Asociación Química Argentina; Anales de la Asociación Química Argentina; 109; 1-2; 7-2022; 5-19
0365-0375
2545-8655
CONICET Digital
CONICET
dc.language.none.fl_str_mv spa
language spa
dc.relation.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://aqa.org.ar/images/anales/pdf109/109.pdf
dc.rights.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
eu_rights_str_mv openAccess
rights_invalid_str_mv https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
application/pdf
application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Asociación Química Argentina
publisher.none.fl_str_mv Asociación Química Argentina
dc.source.none.fl_str_mv reponame:CONICET Digital (CONICET)
instname:Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
reponame_str CONICET Digital (CONICET)
collection CONICET Digital (CONICET)
instname_str Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
repository.name.fl_str_mv CONICET Digital (CONICET) - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
repository.mail.fl_str_mv dasensio@conicet.gov.ar; lcarlino@conicet.gov.ar
_version_ 1842270160698736640
score 13.13397