Investigación de microorganismos promotores del crecimiento vegetal en cultivos de interés agronómico mediante análisis metagenómico y microbiológico

Autores
Ramos Cabrera, Efrén Venancio
Año de publicación
2018
Idioma
español castellano
Tipo de recurso
tesis doctoral
Estado
versión aceptada
Colaborador/a o director/a de tesis
Aguilar, Orlando Mario
Collavino, Mónica Mariana
Descripción
La ocurrencia de una amplia diversidad de microorganismos endófitos diazotróficos asociados a cultivares de importancia agronómica ha sido descripta en varias publicaciones aplicando técnicas de secuenciación masiva, huella dactilar y cultivo dependientes. El análisis de las secuencias nifH sugiere que una importante proporción de estos endófitos se corresponden con microorganismos aún sin identificación taxonómica y/o no han sido cultivados in vitro. En estos estudios se encuentra rasgos interesantes en la abundancia y dominancia de la comunidad fijadora dentro de la endofítica. Por otra parte se ha reportado que estas comunidades son principalmente afectadas por factores tales como el tipo de suelo, el estado fenológico y nutricional de la planta, la fertilización química e inoculación con bacterias PGPR, indicando que son dinámicas y se adecúan a los diferentes cambios ambientales. Las metodologías independientes del cultivo celular han sido muy útiles para ahondar en el conocimiento sobre la estructura de la comunidad con potencialidad de fijar nitrógeno en ambientes naturales. La identificación de las secuencias nifH obtenidas a partir del ADN, permite aproximarnos a la diversidad de las comunidades de fijadores, y la definición del perfil de las comunidades endofíticas. Burbano et al. (2011) [93] estudiaron la estructura de la comunidad endófita activa en raíces de caña de azúcar a través del análisis de secuencias ADN-nifH, revelando que la mayor parte de los transcriptos presentaron alta homología con el gen nifH de Rhizobium rosettiformans. En análisis de secuencias nifH, a partir del ADN de tejidos desinfectados superficialmente de arroz mostraron una amplia diversidad de genes nifH relacionados con Gama-, Beta-, Alfa-, y Deltaproteobacterias, Firmicutes, Cyanobacterias. Se ha sugerido que el interior de los tejidos vegetales es un ambiente propicio para que se lleve a cabo la FBN, ya que contiene bajos niveles de oxígeno y relativamente alto en fuentes de carbono, siendo favorable para activar la enzima nitrogenasa y soportar los requerimientos nutricionales de los endófitos. Cabe destacar, que la presencia de secuencias nifH en el ADN no implica necesariamente que las mismas correspondan a bacterias activas en este proceso, ya que FBN es un procesofuertemente regulado, tanto a nivel transcripcional como al post-traducciónal En el presente capítulo se describen los resultados del estudio de secuencias nifH de la comunidad endofítica de trigo mediante las técnicas de RFLP y pirosecuenciación, efectos de la inoculación con bacterias PGPR y el sitio de cultivo.
Doctor en Ciencias Exactas, área Ciencias Biológicas
Universidad Nacional de La Plata
Facultad de Ciencias Exactas
Materia
Ciencias Exactas
PGPR, Enterobacter, nifH
metagenómica
Biología
Cultivos Agrícolas
Microbiología
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
Repositorio
SEDICI (UNLP)
Institución
Universidad Nacional de La Plata
OAI Identificador
oai:sedici.unlp.edu.ar:10915/67081
Acceder
id SEDICI_ffd9014d8c1af488899ff5999f283b25
oai_identifier_str oai:sedici.unlp.edu.ar:10915/67081
network_acronym_str SEDICI
repository_id_str 1329
network_name_str SEDICI (UNLP)
spelling Investigación de microorganismos promotores del crecimiento vegetal en cultivos de interés agronómico mediante análisis metagenómico y microbiológicoRamos Cabrera, Efrén VenancioCiencias ExactasPGPR, Enterobacter, nifHmetagenómicaBiologíaCultivos AgrícolasMicrobiologíaLa ocurrencia de una amplia diversidad de microorganismos endófitos diazotróficos asociados a cultivares de importancia agronómica ha sido descripta en varias publicaciones aplicando técnicas de secuenciación masiva, huella dactilar y cultivo dependientes. El análisis de las secuencias nifH sugiere que una importante proporción de estos endófitos se corresponden con microorganismos aún sin identificación taxonómica y/o no han sido cultivados in vitro. En estos estudios se encuentra rasgos interesantes en la abundancia y dominancia de la comunidad fijadora dentro de la endofítica. Por otra parte se ha reportado que estas comunidades son principalmente afectadas por factores tales como el tipo de suelo, el estado fenológico y nutricional de la planta, la fertilización química e inoculación con bacterias PGPR, indicando que son dinámicas y se adecúan a los diferentes cambios ambientales. Las metodologías independientes del cultivo celular han sido muy útiles para ahondar en el conocimiento sobre la estructura de la comunidad con potencialidad de fijar nitrógeno en ambientes naturales. La identificación de las secuencias nifH obtenidas a partir del ADN, permite aproximarnos a la diversidad de las comunidades de fijadores, y la definición del perfil de las comunidades endofíticas. Burbano et al. (2011) [93] estudiaron la estructura de la comunidad endófita activa en raíces de caña de azúcar a través del análisis de secuencias ADN-nifH, revelando que la mayor parte de los transcriptos presentaron alta homología con el gen nifH de Rhizobium rosettiformans. En análisis de secuencias nifH, a partir del ADN de tejidos desinfectados superficialmente de arroz mostraron una amplia diversidad de genes nifH relacionados con Gama-, Beta-, Alfa-, y Deltaproteobacterias, Firmicutes, Cyanobacterias. Se ha sugerido que el interior de los tejidos vegetales es un ambiente propicio para que se lleve a cabo la FBN, ya que contiene bajos niveles de oxígeno y relativamente alto en fuentes de carbono, siendo favorable para activar la enzima nitrogenasa y soportar los requerimientos nutricionales de los endófitos. Cabe destacar, que la presencia de secuencias nifH en el ADN no implica necesariamente que las mismas correspondan a bacterias activas en este proceso, ya que FBN es un procesofuertemente regulado, tanto a nivel transcripcional como al post-traducciónal En el presente capítulo se describen los resultados del estudio de secuencias nifH de la comunidad endofítica de trigo mediante las técnicas de RFLP y pirosecuenciación, efectos de la inoculación con bacterias PGPR y el sitio de cultivo.Doctor en Ciencias Exactas, área Ciencias BiológicasUniversidad Nacional de La PlataFacultad de Ciencias ExactasAguilar, Orlando MarioCollavino, Mónica Mariana2018-05-28info:eu-repo/semantics/doctoralThesisinfo:eu-repo/semantics/acceptedVersionTesis de doctoradohttp://purl.org/coar/resource_type/c_db06info:ar-repo/semantics/tesisDoctoralapplication/pdfhttp://sedici.unlp.edu.ar/handle/10915/67081https://doi.org/10.35537/10915/67081spainfo:eu-repo/semantics/openAccesshttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International (CC BY-NC-ND 4.0)reponame:SEDICI (UNLP)instname:Universidad Nacional de La Platainstacron:UNLP2025-09-29T11:10:10Zoai:sedici.unlp.edu.ar:10915/67081Institucionalhttp://sedici.unlp.edu.ar/Universidad públicaNo correspondehttp://sedici.unlp.edu.ar/oai/snrdalira@sedici.unlp.edu.arArgentinaNo correspondeNo correspondeNo correspondeopendoar:13292025-09-29 11:10:10.624SEDICI (UNLP) - Universidad Nacional de La Platafalse
dc.title.none.fl_str_mv Investigación de microorganismos promotores del crecimiento vegetal en cultivos de interés agronómico mediante análisis metagenómico y microbiológico
title Investigación de microorganismos promotores del crecimiento vegetal en cultivos de interés agronómico mediante análisis metagenómico y microbiológico
spellingShingle Investigación de microorganismos promotores del crecimiento vegetal en cultivos de interés agronómico mediante análisis metagenómico y microbiológico
Ramos Cabrera, Efrén Venancio
Ciencias Exactas
PGPR, Enterobacter, nifH
metagenómica
Biología
Cultivos Agrícolas
Microbiología
title_short Investigación de microorganismos promotores del crecimiento vegetal en cultivos de interés agronómico mediante análisis metagenómico y microbiológico
title_full Investigación de microorganismos promotores del crecimiento vegetal en cultivos de interés agronómico mediante análisis metagenómico y microbiológico
title_fullStr Investigación de microorganismos promotores del crecimiento vegetal en cultivos de interés agronómico mediante análisis metagenómico y microbiológico
title_full_unstemmed Investigación de microorganismos promotores del crecimiento vegetal en cultivos de interés agronómico mediante análisis metagenómico y microbiológico
title_sort Investigación de microorganismos promotores del crecimiento vegetal en cultivos de interés agronómico mediante análisis metagenómico y microbiológico
dc.creator.none.fl_str_mv Ramos Cabrera, Efrén Venancio
author Ramos Cabrera, Efrén Venancio
author_facet Ramos Cabrera, Efrén Venancio
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Aguilar, Orlando Mario
Collavino, Mónica Mariana
dc.subject.none.fl_str_mv Ciencias Exactas
PGPR, Enterobacter, nifH
metagenómica
Biología
Cultivos Agrícolas
Microbiología
topic Ciencias Exactas
PGPR, Enterobacter, nifH
metagenómica
Biología
Cultivos Agrícolas
Microbiología
dc.description.none.fl_txt_mv La ocurrencia de una amplia diversidad de microorganismos endófitos diazotróficos asociados a cultivares de importancia agronómica ha sido descripta en varias publicaciones aplicando técnicas de secuenciación masiva, huella dactilar y cultivo dependientes. El análisis de las secuencias nifH sugiere que una importante proporción de estos endófitos se corresponden con microorganismos aún sin identificación taxonómica y/o no han sido cultivados in vitro. En estos estudios se encuentra rasgos interesantes en la abundancia y dominancia de la comunidad fijadora dentro de la endofítica. Por otra parte se ha reportado que estas comunidades son principalmente afectadas por factores tales como el tipo de suelo, el estado fenológico y nutricional de la planta, la fertilización química e inoculación con bacterias PGPR, indicando que son dinámicas y se adecúan a los diferentes cambios ambientales. Las metodologías independientes del cultivo celular han sido muy útiles para ahondar en el conocimiento sobre la estructura de la comunidad con potencialidad de fijar nitrógeno en ambientes naturales. La identificación de las secuencias nifH obtenidas a partir del ADN, permite aproximarnos a la diversidad de las comunidades de fijadores, y la definición del perfil de las comunidades endofíticas. Burbano et al. (2011) [93] estudiaron la estructura de la comunidad endófita activa en raíces de caña de azúcar a través del análisis de secuencias ADN-nifH, revelando que la mayor parte de los transcriptos presentaron alta homología con el gen nifH de Rhizobium rosettiformans. En análisis de secuencias nifH, a partir del ADN de tejidos desinfectados superficialmente de arroz mostraron una amplia diversidad de genes nifH relacionados con Gama-, Beta-, Alfa-, y Deltaproteobacterias, Firmicutes, Cyanobacterias. Se ha sugerido que el interior de los tejidos vegetales es un ambiente propicio para que se lleve a cabo la FBN, ya que contiene bajos niveles de oxígeno y relativamente alto en fuentes de carbono, siendo favorable para activar la enzima nitrogenasa y soportar los requerimientos nutricionales de los endófitos. Cabe destacar, que la presencia de secuencias nifH en el ADN no implica necesariamente que las mismas correspondan a bacterias activas en este proceso, ya que FBN es un procesofuertemente regulado, tanto a nivel transcripcional como al post-traducciónal En el presente capítulo se describen los resultados del estudio de secuencias nifH de la comunidad endofítica de trigo mediante las técnicas de RFLP y pirosecuenciación, efectos de la inoculación con bacterias PGPR y el sitio de cultivo.
Doctor en Ciencias Exactas, área Ciencias Biológicas
Universidad Nacional de La Plata
Facultad de Ciencias Exactas
description La ocurrencia de una amplia diversidad de microorganismos endófitos diazotróficos asociados a cultivares de importancia agronómica ha sido descripta en varias publicaciones aplicando técnicas de secuenciación masiva, huella dactilar y cultivo dependientes. El análisis de las secuencias nifH sugiere que una importante proporción de estos endófitos se corresponden con microorganismos aún sin identificación taxonómica y/o no han sido cultivados in vitro. En estos estudios se encuentra rasgos interesantes en la abundancia y dominancia de la comunidad fijadora dentro de la endofítica. Por otra parte se ha reportado que estas comunidades son principalmente afectadas por factores tales como el tipo de suelo, el estado fenológico y nutricional de la planta, la fertilización química e inoculación con bacterias PGPR, indicando que son dinámicas y se adecúan a los diferentes cambios ambientales. Las metodologías independientes del cultivo celular han sido muy útiles para ahondar en el conocimiento sobre la estructura de la comunidad con potencialidad de fijar nitrógeno en ambientes naturales. La identificación de las secuencias nifH obtenidas a partir del ADN, permite aproximarnos a la diversidad de las comunidades de fijadores, y la definición del perfil de las comunidades endofíticas. Burbano et al. (2011) [93] estudiaron la estructura de la comunidad endófita activa en raíces de caña de azúcar a través del análisis de secuencias ADN-nifH, revelando que la mayor parte de los transcriptos presentaron alta homología con el gen nifH de Rhizobium rosettiformans. En análisis de secuencias nifH, a partir del ADN de tejidos desinfectados superficialmente de arroz mostraron una amplia diversidad de genes nifH relacionados con Gama-, Beta-, Alfa-, y Deltaproteobacterias, Firmicutes, Cyanobacterias. Se ha sugerido que el interior de los tejidos vegetales es un ambiente propicio para que se lleve a cabo la FBN, ya que contiene bajos niveles de oxígeno y relativamente alto en fuentes de carbono, siendo favorable para activar la enzima nitrogenasa y soportar los requerimientos nutricionales de los endófitos. Cabe destacar, que la presencia de secuencias nifH en el ADN no implica necesariamente que las mismas correspondan a bacterias activas en este proceso, ya que FBN es un procesofuertemente regulado, tanto a nivel transcripcional como al post-traducciónal En el presente capítulo se describen los resultados del estudio de secuencias nifH de la comunidad endofítica de trigo mediante las técnicas de RFLP y pirosecuenciación, efectos de la inoculación con bacterias PGPR y el sitio de cultivo.
publishDate 2018
dc.date.none.fl_str_mv 2018-05-28
dc.type.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
info:eu-repo/semantics/acceptedVersion
Tesis de doctorado
http://purl.org/coar/resource_type/c_db06
info:ar-repo/semantics/tesisDoctoral
format doctoralThesis
status_str acceptedVersion
dc.identifier.none.fl_str_mv http://sedici.unlp.edu.ar/handle/10915/67081
https://doi.org/10.35537/10915/67081
url http://sedici.unlp.edu.ar/handle/10915/67081
https://doi.org/10.35537/10915/67081
dc.language.none.fl_str_mv spa
language spa
dc.rights.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International (CC BY-NC-ND 4.0)
eu_rights_str_mv openAccess
rights_invalid_str_mv http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International (CC BY-NC-ND 4.0)
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.source.none.fl_str_mv reponame:SEDICI (UNLP)
instname:Universidad Nacional de La Plata
instacron:UNLP
reponame_str SEDICI (UNLP)
collection SEDICI (UNLP)
instname_str Universidad Nacional de La Plata
instacron_str UNLP
institution UNLP
repository.name.fl_str_mv SEDICI (UNLP) - Universidad Nacional de La Plata
repository.mail.fl_str_mv alira@sedici.unlp.edu.ar
_version_ 1844615969926807552
score 13.070432

Publicaciones similares