The complete genome of a putative endornavirus identified in yerba mate (Ilex paraguariensis St. Hil.)

Autores
Debat, Humberto Julio; Grabiele, Mauro; Aguilera, Patricia Mabel; Bubillo, Rosana Elizabeth; Zapata, Pedro Darío; Marti, Dardo Andrea; Ducasse, Daniel Adrian
Año de publicación
2014
Idioma
inglés
Tipo de recurso
artículo
Estado
versión publicada
Descripción
We present the first report of a virus infecting the subtropical tree crop yerba mate (Ilex paraguariensis St. Hil.). Total RNA purification, followed by next-generation sequencing, transcripts assembly and annotation, resulted in the identification of a new endornavirus species infecting yerba mate. The complete sequence of the linear dsRNA viral genome is 13,954-nt long, contains a single 13,743 nt ORF, and presents a 149 nt 5′UTR and a 61 nt 3′UTR. The predicted ORF encodes a 4,581 aa polypeptide with a UDP-glucose glycosyl-transferase, a capsular polysaccharide synthesis protein, and a RNA-dependent RNA polymerase domain. The name yerba mate endornavirus is proposed for the identified virus. Due to the intriguing peculiarities of this virus family, and the complete lack of the yerba mate virus literature, we consider that the information reported here will be helpful in leading to a new and needed attention to this important topic and crop.
Instituto de Patología Vegetal
Estación Experimental Agropecuaria Cerro Azul
Fil: Debat, Humberto Julio. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; Argentina
Fil: Grabiele, Mauro. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Biología Subtropical. Universidad Nacional de Misiones. Instituto de Biología Subtropical; Argentina
Fil: Aguilera, Patricia Mabel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Biología Subtropical. Universidad Nacional de Misiones. Instituto de Biología Subtropical; Argentina
Fil: Bubillo, Rosana Elizabeth. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Cerro Azul; Argentina
Fil: Zapata, Pedro Darío. Universidad Nacional de Misiones. Facultad de Ciencias Exactas Químicas y Naturales. Instituto de Biotecnología de Misiones; Argentina
Fil: Marti, Dardo Andrea. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Biología Subtropical. Universidad Nacional de Misiones. Instituto de Biología Subtropical; Argentina
Fil: Ducasse, Daniel Adrian. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; Argentina
Fuente
Virus genes 49 (2) : 348–350. (October 2014)
Materia
Ilex paraguariensis
Virus de las Plantas
Genomas
Mate
Plant Viruses
Genomes
Yerba Mate
Endornavirus
Nivel de accesibilidad
acceso restringido
Condiciones de uso
Repositorio
INTA Digital (INTA)
Institución
Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria
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Fil: Bubillo, Rosana Elizabeth. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Cerro Azul; Argentina
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Fil: Marti, Dardo Andrea. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Biología Subtropical. Universidad Nacional de Misiones. Instituto de Biología Subtropical; Argentina
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