The complete genome of a putative endornavirus identified in yerba mate (Ilex paraguariensis St. Hil.)

Autores
Debat, Humberto Julio; Grabiele, Mauro; Aguilera, Patricia Mabel; Bubillo, Rosana Elizabeth; Zapata, Pedro Darío; Marti, Dardo Andrea; Ducasse, Daniel Adrian
Año de publicación
2014
Idioma
inglés
Tipo de recurso
artículo
Estado
versión publicada
Descripción
We present the first report of a virus infecting the subtropical tree crop yerba mate (Ilex paraguariensis St. Hil.). Total RNA purification, followed by next-generation sequencing, transcripts assembly and annotation, resulted in the identification of a new endornavirus species infecting yerba mate. The complete sequence of the linear dsRNA viral genome is 13,954-nt long, contains a single 13,743 nt ORF, and presents a 149 nt 5′UTR and a 61 nt 3′UTR. The predicted ORF encodes a 4,581 aa polypeptide with a UDP-glucose glycosyl-transferase, a capsular polysaccharide synthesis protein, and a RNA-dependent RNA polymerase domain. The name yerba mate endornavirus is proposed for the identified virus. Due to the intriguing peculiarities of this virus family, and the complete lack of the yerba mate virus literature, we consider that the information reported here will be helpful in leading to a new and needed attention to this important topic and crop.
Instituto de Patología Vegetal
Estación Experimental Agropecuaria Cerro Azul
Fil: Debat, Humberto Julio. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; Argentina
Fil: Grabiele, Mauro. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Biología Subtropical. Universidad Nacional de Misiones. Instituto de Biología Subtropical; Argentina
Fil: Aguilera, Patricia Mabel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Biología Subtropical. Universidad Nacional de Misiones. Instituto de Biología Subtropical; Argentina
Fil: Bubillo, Rosana Elizabeth. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Cerro Azul; Argentina
Fil: Zapata, Pedro Darío. Universidad Nacional de Misiones. Facultad de Ciencias Exactas Químicas y Naturales. Instituto de Biotecnología de Misiones; Argentina
Fil: Marti, Dardo Andrea. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Biología Subtropical. Universidad Nacional de Misiones. Instituto de Biología Subtropical; Argentina
Fil: Ducasse, Daniel Adrian. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; Argentina
Fuente
Virus genes 49 (2) : 348–350. (October 2014)
Materia
Ilex paraguariensis
Virus de las Plantas
Genomas
Mate
Plant Viruses
Genomes
Yerba Mate
Endornavirus
Nivel de accesibilidad
acceso restringido
Condiciones de uso
Repositorio
INTA Digital (INTA)
Institución
Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria
OAI Identificador
oai:localhost:20.500.12123/2241

id INTADig_472e306c0b074c6551e55bd1c8a2cbcf
oai_identifier_str oai:localhost:20.500.12123/2241
network_acronym_str INTADig
repository_id_str l
network_name_str INTA Digital (INTA)
spelling The complete genome of a putative endornavirus identified in yerba mate (Ilex paraguariensis St. Hil.)Debat, Humberto JulioGrabiele, MauroAguilera, Patricia MabelBubillo, Rosana ElizabethZapata, Pedro DaríoMarti, Dardo AndreaDucasse, Daniel AdrianIlex paraguariensisVirus de las PlantasGenomasMatePlant VirusesGenomesYerba MateEndornavirusWe present the first report of a virus infecting the subtropical tree crop yerba mate (Ilex paraguariensis St. Hil.). Total RNA purification, followed by next-generation sequencing, transcripts assembly and annotation, resulted in the identification of a new endornavirus species infecting yerba mate. The complete sequence of the linear dsRNA viral genome is 13,954-nt long, contains a single 13,743 nt ORF, and presents a 149 nt 5′UTR and a 61 nt 3′UTR. The predicted ORF encodes a 4,581 aa polypeptide with a UDP-glucose glycosyl-transferase, a capsular polysaccharide synthesis protein, and a RNA-dependent RNA polymerase domain. The name yerba mate endornavirus is proposed for the identified virus. Due to the intriguing peculiarities of this virus family, and the complete lack of the yerba mate virus literature, we consider that the information reported here will be helpful in leading to a new and needed attention to this important topic and crop.Instituto de Patología VegetalEstación Experimental Agropecuaria Cerro AzulFil: Debat, Humberto Julio. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; ArgentinaFil: Grabiele, Mauro. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Biología Subtropical. Universidad Nacional de Misiones. Instituto de Biología Subtropical; ArgentinaFil: Aguilera, Patricia Mabel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Biología Subtropical. Universidad Nacional de Misiones. Instituto de Biología Subtropical; ArgentinaFil: Bubillo, Rosana Elizabeth. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Cerro Azul; ArgentinaFil: Zapata, Pedro Darío. Universidad Nacional de Misiones. Facultad de Ciencias Exactas Químicas y Naturales. Instituto de Biotecnología de Misiones; ArgentinaFil: Marti, Dardo Andrea. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Biología Subtropical. Universidad Nacional de Misiones. Instituto de Biología Subtropical; ArgentinaFil: Ducasse, Daniel Adrian. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; Argentina2018-04-13T12:50:46Z2018-04-13T12:50:46Z2014-10info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_6501info:ar-repo/semantics/articuloapplication/pdfhttps://link.springer.com/article/10.1007%2Fs11262-014-1096-2http://hdl.handle.net/20.500.12123/22410920-8569 (Print)1572-994X (Online)https://doi.org/10.1007/s11262-014-1096-2Virus genes 49 (2) : 348–350. (October 2014)reponame:INTA Digital (INTA)instname:Instituto Nacional de Tecnología Agropecuariaenginfo:eu-repo/semantics/restrictedAccess2025-09-04T09:47:12Zoai:localhost:20.500.12123/2241instacron:INTAInstitucionalhttp://repositorio.inta.gob.ar/Organismo científico-tecnológicoNo correspondehttp://repositorio.inta.gob.ar/oai/requesttripaldi.nicolas@inta.gob.arArgentinaNo correspondeNo correspondeNo correspondeopendoar:l2025-09-04 09:47:13.052INTA Digital (INTA) - Instituto Nacional de Tecnología Agropecuariafalse
dc.title.none.fl_str_mv The complete genome of a putative endornavirus identified in yerba mate (Ilex paraguariensis St. Hil.)
title The complete genome of a putative endornavirus identified in yerba mate (Ilex paraguariensis St. Hil.)
spellingShingle The complete genome of a putative endornavirus identified in yerba mate (Ilex paraguariensis St. Hil.)
Debat, Humberto Julio
Ilex paraguariensis
Virus de las Plantas
Genomas
Mate
Plant Viruses
Genomes
Yerba Mate
Endornavirus
title_short The complete genome of a putative endornavirus identified in yerba mate (Ilex paraguariensis St. Hil.)
title_full The complete genome of a putative endornavirus identified in yerba mate (Ilex paraguariensis St. Hil.)
title_fullStr The complete genome of a putative endornavirus identified in yerba mate (Ilex paraguariensis St. Hil.)
title_full_unstemmed The complete genome of a putative endornavirus identified in yerba mate (Ilex paraguariensis St. Hil.)
title_sort The complete genome of a putative endornavirus identified in yerba mate (Ilex paraguariensis St. Hil.)
dc.creator.none.fl_str_mv Debat, Humberto Julio
Grabiele, Mauro
Aguilera, Patricia Mabel
Bubillo, Rosana Elizabeth
Zapata, Pedro Darío
Marti, Dardo Andrea
Ducasse, Daniel Adrian
author Debat, Humberto Julio
author_facet Debat, Humberto Julio
Grabiele, Mauro
Aguilera, Patricia Mabel
Bubillo, Rosana Elizabeth
Zapata, Pedro Darío
Marti, Dardo Andrea
Ducasse, Daniel Adrian
author_role author
author2 Grabiele, Mauro
Aguilera, Patricia Mabel
Bubillo, Rosana Elizabeth
Zapata, Pedro Darío
Marti, Dardo Andrea
Ducasse, Daniel Adrian
author2_role author
author
author
author
author
author
dc.subject.none.fl_str_mv Ilex paraguariensis
Virus de las Plantas
Genomas
Mate
Plant Viruses
Genomes
Yerba Mate
Endornavirus
topic Ilex paraguariensis
Virus de las Plantas
Genomas
Mate
Plant Viruses
Genomes
Yerba Mate
Endornavirus
dc.description.none.fl_txt_mv We present the first report of a virus infecting the subtropical tree crop yerba mate (Ilex paraguariensis St. Hil.). Total RNA purification, followed by next-generation sequencing, transcripts assembly and annotation, resulted in the identification of a new endornavirus species infecting yerba mate. The complete sequence of the linear dsRNA viral genome is 13,954-nt long, contains a single 13,743 nt ORF, and presents a 149 nt 5′UTR and a 61 nt 3′UTR. The predicted ORF encodes a 4,581 aa polypeptide with a UDP-glucose glycosyl-transferase, a capsular polysaccharide synthesis protein, and a RNA-dependent RNA polymerase domain. The name yerba mate endornavirus is proposed for the identified virus. Due to the intriguing peculiarities of this virus family, and the complete lack of the yerba mate virus literature, we consider that the information reported here will be helpful in leading to a new and needed attention to this important topic and crop.
Instituto de Patología Vegetal
Estación Experimental Agropecuaria Cerro Azul
Fil: Debat, Humberto Julio. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; Argentina
Fil: Grabiele, Mauro. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Biología Subtropical. Universidad Nacional de Misiones. Instituto de Biología Subtropical; Argentina
Fil: Aguilera, Patricia Mabel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Biología Subtropical. Universidad Nacional de Misiones. Instituto de Biología Subtropical; Argentina
Fil: Bubillo, Rosana Elizabeth. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Cerro Azul; Argentina
Fil: Zapata, Pedro Darío. Universidad Nacional de Misiones. Facultad de Ciencias Exactas Químicas y Naturales. Instituto de Biotecnología de Misiones; Argentina
Fil: Marti, Dardo Andrea. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Biología Subtropical. Universidad Nacional de Misiones. Instituto de Biología Subtropical; Argentina
Fil: Ducasse, Daniel Adrian. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; Argentina
description We present the first report of a virus infecting the subtropical tree crop yerba mate (Ilex paraguariensis St. Hil.). Total RNA purification, followed by next-generation sequencing, transcripts assembly and annotation, resulted in the identification of a new endornavirus species infecting yerba mate. The complete sequence of the linear dsRNA viral genome is 13,954-nt long, contains a single 13,743 nt ORF, and presents a 149 nt 5′UTR and a 61 nt 3′UTR. The predicted ORF encodes a 4,581 aa polypeptide with a UDP-glucose glycosyl-transferase, a capsular polysaccharide synthesis protein, and a RNA-dependent RNA polymerase domain. The name yerba mate endornavirus is proposed for the identified virus. Due to the intriguing peculiarities of this virus family, and the complete lack of the yerba mate virus literature, we consider that the information reported here will be helpful in leading to a new and needed attention to this important topic and crop.
publishDate 2014
dc.date.none.fl_str_mv 2014-10
2018-04-13T12:50:46Z
2018-04-13T12:50:46Z
dc.type.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/article
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
http://purl.org/coar/resource_type/c_6501
info:ar-repo/semantics/articulo
format article
status_str publishedVersion
dc.identifier.none.fl_str_mv https://link.springer.com/article/10.1007%2Fs11262-014-1096-2
http://hdl.handle.net/20.500.12123/2241
0920-8569 (Print)
1572-994X (Online)
https://doi.org/10.1007/s11262-014-1096-2
url https://link.springer.com/article/10.1007%2Fs11262-014-1096-2
http://hdl.handle.net/20.500.12123/2241
https://doi.org/10.1007/s11262-014-1096-2
identifier_str_mv 0920-8569 (Print)
1572-994X (Online)
dc.language.none.fl_str_mv eng
language eng
dc.rights.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/restrictedAccess
eu_rights_str_mv restrictedAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.source.none.fl_str_mv Virus genes 49 (2) : 348–350. (October 2014)
reponame:INTA Digital (INTA)
instname:Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria
reponame_str INTA Digital (INTA)
collection INTA Digital (INTA)
instname_str Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria
repository.name.fl_str_mv INTA Digital (INTA) - Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria
repository.mail.fl_str_mv tripaldi.nicolas@inta.gob.ar
_version_ 1842341354146889728
score 12.623145