The complete genome of a putative endornavirus identified in yerba mate (Ilex paraguariensis St. Hil.)

Autores
Debat, Humberto Julio; Grabiele, Mauro; Aguilera, Patricia Mabel; Bubillo, Rosana Elizabeth; Zapata, Pedro Dario; Marti, Dardo Andrea; Ducasse, Daniel Adrián
Año de publicación
2014
Idioma
inglés
Tipo de recurso
artículo
Estado
versión publicada
Descripción
We present the first report of a virus infecting the subtropical tree crop yerba mate (Ilex paraguariensis St. Hil.). Total RNA purification, followed by next-generation sequencing, transcripts assembly and annotation, resulted in the identification of a new endornavirus species infecting yerba mate. The complete sequence of the linear dsRNA viral genome is 13,954-nt long, contains a single 13,743 nt ORF, and presents a 149 nt 5′UTR and a 61 nt 3′UTR. The predicted ORF encodes a 4,581 aa polypeptide with a UDP-glucose glycosyl-transferase, a capsular polysaccharide synthesis protein, and a RNA-dependent RNA polymerase domain. The name yerba mate endornavirus is proposed for the identified virus. Due to the intriguing peculiarities of this virus family, and the complete lack of the yerba mate virus literature, we consider that the information reported here will be helpful in leading to a new and needed attention to this important topic and crop.
Fil: Debat, Humberto Julio. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Instituto de Patología Vegetal; Argentina
Fil: Grabiele, Mauro. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Biología Subtropical. Universidad Nacional de Misiones. Instituto de Biología Subtropical; Argentina
Fil: Aguilera, Patricia Mabel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Biología Subtropical. Universidad Nacional de Misiones. Instituto de Biología Subtropical; Argentina
Fil: Bubillo, Rosana Elizabeth. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria; Argentina
Fil: Zapata, Pedro Dario. Universidad Nacional de Misiones. Facultad de Ciencias Exactas, Químicas y Naturales; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
Fil: Marti, Dardo Andrea. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Biología Subtropical. Universidad Nacional de Misiones. Instituto de Biología Subtropical; Argentina
Fil: Ducasse, Daniel Adrián. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Instituto de Patología Vegetal; Argentina
Materia
Endornavirus
Ilex Paraguariensis
Phylogenetic Analysis
Virus Genome
Yerba Mate
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
Repositorio
CONICET Digital (CONICET)
Institución
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
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