Molecular characterization of a novel cytorhabdovirus with a unique genomic organization infecting yerba mate (Ilex paraguariensis) in Argentina

Autores
Bejerman, Nicolas Esteban; Acevedo, Raúl Maximiliano; De Breuil, Soledad; Ruiz, Oscar Adolfo; Sansberro, Pedro Alfonso; Dietzgen, Ralf Georg; Nome Docampo, Claudia; Debat, Humberto Julio
Año de publicación
2020
Idioma
inglés
Tipo de recurso
artículo
Estado
versión publicada
Descripción
The genome of a novel rhabdovirus was detected in yerba mate (Ilex paraguariensis St. Hil.). The newly identified virus, tentatively named "yerba mate virus A" (YmVA), has a genome of 14,961 nucleotides. Notably, eight open reading frames were identified in the antigenomic orientation of the negative-sense, single-stranded viral RNA, including two novel accessory genes, in the order 3′-N-P-3-4-M-G-L-8-5′. Sequence comparisons of the encoded proteins as well as phylogenetic analysis suggest that YmVA is a new member of the genus Cytorhabdovirus, family Rhabdoviridae. YmVA's unique genomic organization and phylogenetic relationships indicate that this virus likely represents a distinct evolutionary lineage among the cytorhabdoviruses.
Instituto de Patología Vegetal
Fil: Bejerman, Nicolas Esteban. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
Fil: Acevedo, Raúl M. Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Botánica del Nordeste. Laboratorio de Biotecnología Aplicada y Genómica Funcional; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Botánica del Nordeste; Argentina
Fil: De Breuil, Soledad. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
Fil: Ruiz, Oscar Adolfo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Investigaciones Biotecnológicas. Instituto de Investigaciones Biotecnológicas "Dr. Raúl Alfonsín" (sede Chascomús). Universidad Nacional de San Martín. Instituto de Investigaciones Biotecnológicas. Instituto de Investigaciones Biotecnológicas "Dr. Raúl Alfonsín" (sede Chascomús); Argentina.
Fil: Sansberro, Pedro Alfonso. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Botánica del Nordeste. Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Botánica del Nordeste. Laboratorio de Biotecnología Aplicada y Genómica Funcional; Argentina
Fil: Dietzgen, Ralf Georg. University of Queensland. Queensland Alliance for Agriculture and Food Innovation; Australia
Fil: Fil: Nome Docampo, Claudia. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
Fil: Debat, Humberto Julio. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
Fuente
Archives of Virology (2020)
Materia
Ilex paraguariensis
Virus de las Plantas
Cytorhabdovirus
Mate
Marcadores Genéticos
Argentina
Plant Viruses
Genetic Markers
Yerba Mate
Marcadores Moleculares
Nivel de accesibilidad
acceso restringido
Condiciones de uso
Repositorio
INTA Digital (INTA)
Institución
Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria
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Instituto de Patología Vegetal
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Fil: Ruiz, Oscar Adolfo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Investigaciones Biotecnológicas. Instituto de Investigaciones Biotecnológicas "Dr. Raúl Alfonsín" (sede Chascomús). Universidad Nacional de San Martín. Instituto de Investigaciones Biotecnológicas. Instituto de Investigaciones Biotecnológicas "Dr. Raúl Alfonsín" (sede Chascomús); Argentina.
Fil: Sansberro, Pedro Alfonso. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Botánica del Nordeste. Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Botánica del Nordeste. Laboratorio de Biotecnología Aplicada y Genómica Funcional; Argentina
Fil: Dietzgen, Ralf Georg. University of Queensland. Queensland Alliance for Agriculture and Food Innovation; Australia
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