Evaluating the impact of the biocontrol agent Trichoderma harzianum ITEM 3636 on indigenous microbial communities from field soils

Autores
Ganuza, Mauricio Roque; Pastor, Nicolás Alejandro; Boccolini, Maricel Fatima; Erazo, Jessica Gabriela; Palacios, Sofia Alejendra; Oddino, Claudio Marcelo; Reynoso, Maria Marta; Rovera, Marisa; Torres, Adriana Monica
Año de publicación
2019
Idioma
inglés
Tipo de recurso
artículo
Estado
versión publicada
Descripción
To investigate the impact of inoculating peanut seeds with the biocontrol agent Trichoderma harzianum ITEM 3636 on the structure of bacterial and fungal communities from agricultural soils. Methods and Results: Polymerase chain reaction (PCR)-denaturing gradient gel electrophoresis (PCR-DGGE) and next-generation sequencing (NGS) of amplicons (or marker gene amplification metagenomics) were performed to investigate potential changes in the structure of microbial communities from fields located in a peanut-producing area in the province of Córdoba, Argentina. Fields had history of peanut smut (caused by Thecaphora frezii) incidence. The Shannon indexes (H′), which estimate diversity, obtained from the PCR-DGGE assays did not show significant differences neither for bacterial nor for fungal communities between control and inoculation treatments. On the other hand, the number of operational taxonomic units obtained after NGS was similar between all the analysed samples. Moreover, results of alpha and beta diversity showed that there were no significant variations between the relative abundances of the most representative bacterial and fungal phyla and genera, in both fields. Conclusions: Trichoderma harzianum ITEM 3636 decreases the incidence and severity of agriculturally relevant diseases without causing significant changes in the microbial communities of agricultural soils. Significance and Impact of the Study: Our investigations provide information on the structure of bacterial and fungal communities in peanut-producing fields after inoculation of seeds with a biocontrol agent.
Fil: Ganuza, Mauricio Roque. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas, Fisicoquímicas y Naturales. Departamento de Microbiología e Inmunología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
Fil: Pastor, Nicolás Alejandro. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas Fisicoquímicas y Naturales. Instituto de Investigación en Micología y Micotoxicología. - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Investigación en Micología y Micotoxicología; Argentina
Fil: Boccolini, Maricel Fatima. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas, Fisicoquímicas y Naturales. Departamento de Microbiología e Inmunología; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Buenos Aires; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
Fil: Erazo, Jessica Gabriela. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas Fisicoquímicas y Naturales. Instituto de Investigación en Micología y Micotoxicología. - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Investigación en Micología y Micotoxicología; Argentina
Fil: Palacios, Sofia Alejendra. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas, Fisicoquímicas y Naturales. Departamento de Microbiología e Inmunología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
Fil: Oddino, Claudio Marcelo. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Agronomía y Veterinaria; Argentina
Fil: Reynoso, Maria Marta. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas Fisicoquímicas y Naturales. Instituto de Investigación en Micología y Micotoxicología. - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Investigación en Micología y Micotoxicología; Argentina
Fil: Rovera, Marisa. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas, Fisicoquímicas y Naturales. Departamento de Microbiología e Inmunología; Argentina
Fil: Torres, Adriana Monica. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas, Fisicoquímicas y Naturales. Departamento de Microbiología e Inmunología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
Materia
BIOCONTROL
DENATURING GRADIENT GEL ELECTROPHORESIS
METAGENOMICS
MICROBIAL STRUCTURE
SOIL
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
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Repositorio
CONICET Digital (CONICET)
Institución
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
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Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Oddino, Claudio Marcelo. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Agronomía y Veterinaria; ArgentinaFil: Reynoso, Maria Marta. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas Fisicoquímicas y Naturales. Instituto de Investigación en Micología y Micotoxicología. - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Investigación en Micología y Micotoxicología; ArgentinaFil: Rovera, Marisa. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas, Fisicoquímicas y Naturales. Departamento de Microbiología e Inmunología; ArgentinaFil: Torres, Adriana Monica. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas, Fisicoquímicas y Naturales. Departamento de Microbiología e Inmunología; Argentina. 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