Hepatitis C en Córdoba: Implicancias de la coinfección HIV/HCV y cambios locales en el perfil epidemiológico molecular

Autores
Farías, Adrián Alejandro
Año de publicación
2013
Idioma
español castellano
Tipo de recurso
tesis doctoral
Estado
versión publicada
Colaborador/a o director/a de tesis
Ré, Viviana Elizabeth
Descripción
Tesis - Doctorado en Ciencias de la Salud - Universidad nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Médicas. Secretaria de Graduados en Ciencias de la Salud, 2013
Fil: Farías, Adrián Alejandro. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Médicas Instituto de Virología Dr. José María Vanella; Argentina.
The hepatitis C virus (HCV) is considered one of the major causes of chronic hepatitis, cirrhosis and liver cancer. Co-infection with HIV accelerates the progression of liver disease, increases the efficiency of transmission of HCV by non-parental routes and has been associated with the decrease in the effectiveness of HAART. Worldwide, HCV distribution and its molecular pattern are markedly heterogeneous and are continuously changing, due to cultural changes, associated to new risk behaviors, as well as population movements. The aim of this work was to study the prevalence and genetic diversity of HCV infection in HIV co-infected individuals of Córdoba, evaluate its influence on antiretroviral therapy (HAART) and in HCV transmission, and identify possible changes in HCV genotype distribution pattern of Córdoba in the last 10 years. This study included the following samples obtained from patients of Córdoba: a) 349 serum samples from chronically infected individuals collected between 1999-2009; b) 86 serum samples from HCV/HIV co-infected patients obtained from a total of 558 HIV+ patients, collected in 2 periods between 2003-2007; and c) 37 biological fluid samples of HCV moninfected (n=21) and HCV/HIV co-infected individuals (n=16) [cervical swab (n=16), saliva (n=37), seminal plasma (n=21) and peripheral blood mononuclear cells (n=37)]. RT-nested PCR of the 5’ non-coding region (5’ NC) was used for HCV molecular detection. For genomic characterization and subsequent phylogenetic and viral evolution analysis, non-structural 5B and E1/E2 genomic regions were amplified and sequenced.
El virus de la Hepatitis C es considerado una de las principales causas de hepatitis crónica, cirrosis hepática y cáncer hepático. La coinfección con HIV acelera la progresión de la enfermedad hepática, aumenta la efectividad de la transmisión de HCV por vías no parenterales y ha sido asociada a la disminución de la efectividad de la terapia HAART. A nivel mundial, la distribución y el patrón molecular de HCV son marcadamente heterogéneos y se modifican continuamente debido tanto a cambios culturales, asociados a nuevas conductas de riesgo, como a movimientos poblacionales. El objetivo del presente trabajo fue estudiar la prevalencia y la diversidad genética de la infección por HCV en individuos coinfectados con HIV de Córdoba, evaluar su influencia en la terapia antiretroviral (HAART) y en la transmisión de HCV, y detectar posibles cambios en el patrón regional de distribución de genotipos en los últimos 10 años. En este estudio se incluyeron las siguientes muestras obtenidas de pacientes de Córdoba: a) 349 muestras de suero obtenidas de individuos crónicamente infectados por HCV colectados entre 1999-2009; b) 86 sueros de pacientes coinfectados HCV/HIV obtenidos de un total de 558 pacientes HIV+, colectados en dos periodos entre 2003-2007; y c) 37 muestras de fluidos biológicos de pacientes monoinfectados (n=21) y coinfectados HCV/HIV (n=16) [hisopado cervical (n=16), saliva (n=37), plasma seminal (n=21) y células mononucleares de sangre periférica (n=37)]. Para la detección molecular de HCV se utilizó RT-nested PCR de la región 5’ no codificante (5’ NC), y para la caracterización genómica y posterior análisis filogenético y evolución viral, se amplificaron y secuenciaron las regiones no estructural 5B y E1/E2.
Fil: Farías, Adrián Alejandro. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Médicas Instituto de Virología Dr. José María Vanella; Argentina.
Fuente
Farías AA. Hepatitis C en Córdoba: Implicancias de la coinfección HIV/HCV y cambios locales en el perfil epidemiológico molecular [Internet]. Universidad Nacional de Córdoba, 2013 [citado el 13 de febrero de 2020]. Disponible en: https://rdu.unc.edu.ar/handle/11086/6732
Materia
Argentina --epidemiología
Research Subject Categories::MEDICINE
Research Subject Categories::MEDICINE::Social medicine::Public health medicine research areas::Epidemiology
Hepatitis C--epidemiología
Hepacivirus
Genotipo
Filogenia--estadística y datos numéricos
Filogeografía
Evolución Biológica
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
Repositorio
Repositorio Digital Universitario (UNC)
Institución
Universidad Nacional de Córdoba
OAI Identificador
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This study included the following samples obtained from patients of Córdoba: a) 349 serum samples from chronically infected individuals collected between 1999-2009; b) 86 serum samples from HCV/HIV co-infected patients obtained from a total of 558 HIV+ patients, collected in 2 periods between 2003-2007; and c) 37 biological fluid samples of HCV moninfected (n=21) and HCV/HIV co-infected individuals (n=16) [cervical swab (n=16), saliva (n=37), seminal plasma (n=21) and peripheral blood mononuclear cells (n=37)]. RT-nested PCR of the 5’ non-coding region (5’ NC) was used for HCV molecular detection. For genomic characterization and subsequent phylogenetic and viral evolution analysis, non-structural 5B and E1/E2 genomic regions were amplified and sequenced.El virus de la Hepatitis C es considerado una de las principales causas de hepatitis crónica, cirrosis hepática y cáncer hepático. La coinfección con HIV acelera la progresión de la enfermedad hepática, aumenta la efectividad de la transmisión de HCV por vías no parenterales y ha sido asociada a la disminución de la efectividad de la terapia HAART. A nivel mundial, la distribución y el patrón molecular de HCV son marcadamente heterogéneos y se modifican continuamente debido tanto a cambios culturales, asociados a nuevas conductas de riesgo, como a movimientos poblacionales. El objetivo del presente trabajo fue estudiar la prevalencia y la diversidad genética de la infección por HCV en individuos coinfectados con HIV de Córdoba, evaluar su influencia en la terapia antiretroviral (HAART) y en la transmisión de HCV, y detectar posibles cambios en el patrón regional de distribución de genotipos en los últimos 10 años. En este estudio se incluyeron las siguientes muestras obtenidas de pacientes de Córdoba: a) 349 muestras de suero obtenidas de individuos crónicamente infectados por HCV colectados entre 1999-2009; b) 86 sueros de pacientes coinfectados HCV/HIV obtenidos de un total de 558 pacientes HIV+, colectados en dos periodos entre 2003-2007; y c) 37 muestras de fluidos biológicos de pacientes monoinfectados (n=21) y coinfectados HCV/HIV (n=16) [hisopado cervical (n=16), saliva (n=37), plasma seminal (n=21) y células mononucleares de sangre periférica (n=37)]. Para la detección molecular de HCV se utilizó RT-nested PCR de la región 5’ no codificante (5’ NC), y para la caracterización genómica y posterior análisis filogenético y evolución viral, se amplificaron y secuenciaron las regiones no estructural 5B y E1/E2.Fil: Farías, Adrián Alejandro. Universidad Nacional de Córdoba. 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The hepatitis C virus (HCV) is considered one of the major causes of chronic hepatitis, cirrhosis and liver cancer. Co-infection with HIV accelerates the progression of liver disease, increases the efficiency of transmission of HCV by non-parental routes and has been associated with the decrease in the effectiveness of HAART. Worldwide, HCV distribution and its molecular pattern are markedly heterogeneous and are continuously changing, due to cultural changes, associated to new risk behaviors, as well as population movements. The aim of this work was to study the prevalence and genetic diversity of HCV infection in HIV co-infected individuals of Córdoba, evaluate its influence on antiretroviral therapy (HAART) and in HCV transmission, and identify possible changes in HCV genotype distribution pattern of Córdoba in the last 10 years. This study included the following samples obtained from patients of Córdoba: a) 349 serum samples from chronically infected individuals collected between 1999-2009; b) 86 serum samples from HCV/HIV co-infected patients obtained from a total of 558 HIV+ patients, collected in 2 periods between 2003-2007; and c) 37 biological fluid samples of HCV moninfected (n=21) and HCV/HIV co-infected individuals (n=16) [cervical swab (n=16), saliva (n=37), seminal plasma (n=21) and peripheral blood mononuclear cells (n=37)]. RT-nested PCR of the 5’ non-coding region (5’ NC) was used for HCV molecular detection. For genomic characterization and subsequent phylogenetic and viral evolution analysis, non-structural 5B and E1/E2 genomic regions were amplified and sequenced.
El virus de la Hepatitis C es considerado una de las principales causas de hepatitis crónica, cirrosis hepática y cáncer hepático. La coinfección con HIV acelera la progresión de la enfermedad hepática, aumenta la efectividad de la transmisión de HCV por vías no parenterales y ha sido asociada a la disminución de la efectividad de la terapia HAART. A nivel mundial, la distribución y el patrón molecular de HCV son marcadamente heterogéneos y se modifican continuamente debido tanto a cambios culturales, asociados a nuevas conductas de riesgo, como a movimientos poblacionales. El objetivo del presente trabajo fue estudiar la prevalencia y la diversidad genética de la infección por HCV en individuos coinfectados con HIV de Córdoba, evaluar su influencia en la terapia antiretroviral (HAART) y en la transmisión de HCV, y detectar posibles cambios en el patrón regional de distribución de genotipos en los últimos 10 años. En este estudio se incluyeron las siguientes muestras obtenidas de pacientes de Córdoba: a) 349 muestras de suero obtenidas de individuos crónicamente infectados por HCV colectados entre 1999-2009; b) 86 sueros de pacientes coinfectados HCV/HIV obtenidos de un total de 558 pacientes HIV+, colectados en dos periodos entre 2003-2007; y c) 37 muestras de fluidos biológicos de pacientes monoinfectados (n=21) y coinfectados HCV/HIV (n=16) [hisopado cervical (n=16), saliva (n=37), plasma seminal (n=21) y células mononucleares de sangre periférica (n=37)]. Para la detección molecular de HCV se utilizó RT-nested PCR de la región 5’ no codificante (5’ NC), y para la caracterización genómica y posterior análisis filogenético y evolución viral, se amplificaron y secuenciaron las regiones no estructural 5B y E1/E2.
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