Proyecto Argentino Interinstitucional de genómica de SARS-CoV-2. Reporte Nº 1 Inicial. “Análisis de secuencias de SARS-CoV-2 obtenidas de pacientes con COVID-19 de Argentina”...

Autores
Consorcio Argentino de Genómica de SARS-CoV-2
Año de publicación
2020
Idioma
español castellano
Tipo de recurso
documento de trabajo
Estado
versión borrador
Descripción
Hasta el 9 de septiembre 2021 el Proyecto a generado 26 Reportes. Reporte nro 1 - Análisis inicial. Reporte nro 2 – Patagonia. Reportes nro 3 y 4 - CABA y Prov. BsAs. Reporte nro 5 – Córdoba. Reporte nro 6 – Chaco. Reporte UK. Reporte nro 8 - La Pampa, Neuquén y Río Negro. Reporte nro 9 - Vigilancia activa de variantes de SARS-COV-2 en la ciudad de Buenos Aires. Reporte nro 10 - Vigilancia activa de variantes de SARS-COV-2 en CABA, GBA y Santa Fe. Reporte nro 11 - Vigilancia activa de variantes de SARS-COV-2 en CABA y GBA. Reporte nro 12 - Vigilancia activa de variantes de SARS-CoV-2 en Argentina. Reporte de caso. Reporte nro 13 - Vigilancia activa de variantes de SARS-CoV-2 en el AMBA. Reporte nro 14 - Vigilancia activa de variantes de SARS-CoV-2 en Córdoba. Reporte nro 15 - Vigilancia activa de variantes de SARS-CoV-2 en CABA y GBA. Reporte nro 16 - Vigilancia activa de variantes de SARS-CoV-2 en CABA y GBA. Reporte nro 17 - Caracterización genómica de muestras de la provincia de Córdoba. Reporte nro 18 - Vigilancia activa de variantes de SARS-CoV-2 en CABA, GBA y Córdoba. Reporte nro 19 - Vigilancia activa de variantes de SARS-CoV-2 en CABA, GBA, Santa Fé, Córdoba y Neuquén. Reporte nro 20 - Parte A - Vigilancia de variantes de SARS-CoV-2 en el AMBA (CABA, Gran Buenos Aires y Gran La Plata). Reporte nro 20 - Completo - Vigilancia de variantes de SARS-CoV-2 en CABA, provincias de Buenos Aires, Córdoba, Entre Ríos, Mendoza, Neuquén, Río Negro, San Luis y Santa Fe. Reporte nro 21 - Caracterización genómica de muestras de la provincia de Santa Fe, primera ola. Reporte nro 22 - Caracterización genómica de SARS-CoV-2 de muestras de Jujuy, Salta y Tucumán, primera ola.Reporte nro 23 - Vigilancia de variantes de SARS-CoV-2 en la CABA, provincias de Buenos Aires, Córdoba, Entre Ríos, Neuquén y Santa Fe. Actualización del 07/06/2021. Seroneutralización de variantes SARS-CoV-2 Gamma, Alpha y Lambda en individuos vacunados con Sputnik V e individuos recuperados de la infección por SARS-CoV-2. Reporte nro 24 - Vigilancia de variantes SARS-CoV-2 en Provincias de Tierra del Fuego y Mendoza. Reporte nro 25 - Vigilancia de variantes SARS-CoV-2 en la CABA, provincias de Buenos Aires, Chaco, Córdoba, La Pampa, Neuquén y Santa Fe. Reporte nro 26 - Vigilancia de variantes SARS-CoV-2 en la provincia de Córdoba y en la CABA.
Fil: Consorcio Argentino de Genómica de SARS-CoV-2; Argentina.
Como objetivo general del “Proyecto Argentino Interinstitucional de genómica de SARS-CoV-2” proponemos analizar la trayectoria evolutiva de las cepas del SARS-CoV-2 que circulan en Argentina para estudiar su origen y dispersión en el país, en el contexto de las cepas mundiales, como así también analizar las mutaciones que pudieran afectar el diagnóstico, la transmisión y la virulencia del virus. Para ello realizaremos un muestreo en todo el país de aproximadamente 1000 genomas de SARS-CoV-2. Las muestras obtenidas serán secuenciadas por NGS para obtener sus secuencias genómicas, y así caracterizarlas y analizarlas desde varios enfoques: a) Análisis filogenéticos y epidemiológicos; b) Recolección de muestras de pacientes infectados y c) Secuenciación NGS y procesamiento bioinformático. Participa del Consorcio la Facultad de Ciencias Médicas. Instituto de Virología Dr. José María Vanella de la Universidad Nacional de Córdoba; Argentina. Se agrega en este caso el Reporte Nº 1 Inicial. “Análisis de secuencias de SARS-CoV-2 obtenidas de pacientes con COVID-19 de Argentina”.
Fil: Consorcio Argentino de Genómica de SARS-CoV-2; Argentina.
Materia
Covid 19
SARS-CoV-2
Evolución
Cepas
Análisis
Mutaciones
Muestreos
Genomas
Análisis filogenéticos
Análisis epidemiológicos
Secuenciación NGS
Procesamiento bioinformático
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
Repositorio
Repositorio Digital Universitario (UNC)
Institución
Universidad Nacional de Córdoba
OAI Identificador
oai:rdu.unc.edu.ar:11086/20225
Acceder
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Fil: Consorcio Argentino de Genómica de SARS-CoV-2; Argentina.
Como objetivo general del “Proyecto Argentino Interinstitucional de genómica de SARS-CoV-2” proponemos analizar la trayectoria evolutiva de las cepas del SARS-CoV-2 que circulan en Argentina para estudiar su origen y dispersión en el país, en el contexto de las cepas mundiales, como así también analizar las mutaciones que pudieran afectar el diagnóstico, la transmisión y la virulencia del virus. Para ello realizaremos un muestreo en todo el país de aproximadamente 1000 genomas de SARS-CoV-2. Las muestras obtenidas serán secuenciadas por NGS para obtener sus secuencias genómicas, y así caracterizarlas y analizarlas desde varios enfoques: a) Análisis filogenéticos y epidemiológicos; b) Recolección de muestras de pacientes infectados y c) Secuenciación NGS y procesamiento bioinformático. Participa del Consorcio la Facultad de Ciencias Médicas. Instituto de Virología Dr. José María Vanella de la Universidad Nacional de Córdoba; Argentina. Se agrega en este caso el Reporte Nº 1 Inicial. “Análisis de secuencias de SARS-CoV-2 obtenidas de pacientes con COVID-19 de Argentina”.
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