ADN repetitivo en Solanum betaceum Cav. (Solanaceae)
- Autores
- Sader, Mariela Analía; Vaio, Magdalena; Jaramillo Zapata, M.; Trenchi, Alejandra; Chiarini, Franco Ezequiel; López, A.; Urdampilleta, Juan Domingo
- Año de publicación
- 2023
- Idioma
- español castellano
- Tipo de recurso
- documento de conferencia
- Estado
- versión publicada
- Descripción
- El tomate de árbol (Solanaceas) es originario de la region andina de America del Sur. Es popular para su consumo en jugos y como fruta fresca, constituyendo un complemento de nutrientes necesarios en la dieta. Posee 2n=24 cromosomas y un tamano genomico grande. En Argentina, accesos de esta especie presentan diferencias fenotipicas. Para comprender y caracterizar la fraccion repetitiva del genoma, secuenciamos el ADN de cinco poblaciones utilizando baja cobertura (0,1×). Realizamos un analisis de agrupamiento, ensamblamos los genomas de cloroplastos y ADN ribosomales y localizamos las repeticiones mas abundantes mediante FISH. Observamos que todos los accesos tienen un tamano genomico similar (21,58-23,60 pg) y que la fraccion repetitiva constituye el 75% del genoma, siendo el retrotransposon Ty3/gypsy-Tekay (45%) es el mas abundante. Ademas, identificamos cuatro familias distintas de ADN satelite, que conforman el 0,7% de la fraccion repetitiva. Aunque los elementos repetitivos son compartidos por todos los accesos, la abundancia relativa de cada familia y de los ADN ribosomales varia. Los genomas plastidiales, a diferencia del nuclear, son altamente conservados (99%). Esto concuerda con estudios previos en otras especies de Solanaceae, donde se observo una acumulacion de secuencias de ADN repetitivas, especialmente retrotransposones. Nuestros resultados confirman que este genoma es altamente dinamico en su fraccion repetitiva, pero conservado en sus genomas plastidiales.
Fil: Sader, Mariela Analía. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto Multidisciplinario de Biología Vegetal. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas Físicas y Naturales. Instituto Multidisciplinario de Biología Vegetal; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Fitopatología y Fisiología Vegetal; Argentina
Fil: Vaio, Magdalena. Universidad de la República; Uruguay
Fil: Jaramillo Zapata, M.. Universidad San Pablo Tucumán; Argentina
Fil: Trenchi, Alejandra. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto Multidisciplinario de Biología Vegetal. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas Físicas y Naturales. Instituto Multidisciplinario de Biología Vegetal; Argentina
Fil: Chiarini, Franco Ezequiel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto Multidisciplinario de Biología Vegetal. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas Físicas y Naturales. Instituto Multidisciplinario de Biología Vegetal; Argentina
Fil: López, A.. Universidad Nacional de Mar del Plata; Argentina
Fil: Urdampilleta, Juan Domingo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto Multidisciplinario de Biología Vegetal. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas Físicas y Naturales. Instituto Multidisciplinario de Biología Vegetal; Argentina
XXXIX Jornadas Argentinas de Botánica
Catamarca
Argentina
Sociedad Argentina de Botánica - Materia
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Solanum betaceum
Repetitive DNA - Nivel de accesibilidad
- acceso abierto
- Condiciones de uso
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El tomate de árbol (Solanaceas) es originario de la region andina de America del Sur. Es popular para su consumo en jugos y como fruta fresca, constituyendo un complemento de nutrientes necesarios en la dieta. Posee 2n=24 cromosomas y un tamano genomico grande. En Argentina, accesos de esta especie presentan diferencias fenotipicas. Para comprender y caracterizar la fraccion repetitiva del genoma, secuenciamos el ADN de cinco poblaciones utilizando baja cobertura (0,1×). Realizamos un analisis de agrupamiento, ensamblamos los genomas de cloroplastos y ADN ribosomales y localizamos las repeticiones mas abundantes mediante FISH. Observamos que todos los accesos tienen un tamano genomico similar (21,58-23,60 pg) y que la fraccion repetitiva constituye el 75% del genoma, siendo el retrotransposon Ty3/gypsy-Tekay (45%) es el mas abundante. Ademas, identificamos cuatro familias distintas de ADN satelite, que conforman el 0,7% de la fraccion repetitiva. Aunque los elementos repetitivos son compartidos por todos los accesos, la abundancia relativa de cada familia y de los ADN ribosomales varia. Los genomas plastidiales, a diferencia del nuclear, son altamente conservados (99%). Esto concuerda con estudios previos en otras especies de Solanaceae, donde se observo una acumulacion de secuencias de ADN repetitivas, especialmente retrotransposones. Nuestros resultados confirman que este genoma es altamente dinamico en su fraccion repetitiva, pero conservado en sus genomas plastidiales. |
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