Visual analytics in cheminformatics: user-supervised descriptor selection for QSAR methods
- Autores
- Martínez, María Jimena; Ponzoni, Ignacio; Diaz, Monica Fatima; Vazquez, Gustavo Esteban; Soto, Axel Juan
- Año de publicación
- 2015
- Idioma
- inglés
- Tipo de recurso
- artículo
- Estado
- versión publicada
- Descripción
- The design of QSAR/QSPR models is a challenging problem, where the selection of the most relevant descriptors constitutes a key step of the process. Several feature selection methods that address this step are concentrated on statistical associations among descriptors and target properties, whereas the chemical knowledge is left out of the analysis. For this reason, the interpretability and generality of the QSAR/QSPR models obtained by these feature selection methods are drastically affected. Therefore, an approach for integrating domain expert?s knowledge in the selection process is needed for increase the confidence in the final set of descriptors.
Fil: Martínez, María Jimena. Universidad Nacional del Sur. Departamento de Ciencias e Ingeniería de la Computación. Laboratorio de Investigación y Desarrollo en Computación Científica; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
Fil: Ponzoni, Ignacio. Universidad Nacional del Sur. Departamento de Ciencias e Ingeniería de la Computación. Laboratorio de Investigación y Desarrollo en Computación Científica; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
Fil: Diaz, Monica Fatima. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Bahía Blanca. Planta Piloto de Ingeniería Química. Universidad Nacional del Sur. Planta Piloto de Ingeniería Química; Argentina
Fil: Vazquez, Gustavo Esteban. Universidad Católica del Uruguay. Facultad de Ingeniería y Tecnologías; Uruguay. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
Fil: Soto, Axel Juan. Dalhousie University. Faculty of Computer Science; Canadá. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina - Materia
-
Feature selection
Visual analytics
QSAR
Cheminformatics - Nivel de accesibilidad
- acceso abierto
- Condiciones de uso
- https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
- Repositorio
- Institución
- Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
- OAI Identificador
- oai:ri.conicet.gov.ar:11336/24166
Ver los metadatos del registro completo
id |
CONICETDig_aff73d66f23b68d1d52f47a10aa4d97c |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:ri.conicet.gov.ar:11336/24166 |
network_acronym_str |
CONICETDig |
repository_id_str |
3498 |
network_name_str |
CONICET Digital (CONICET) |
spelling |
Visual analytics in cheminformatics: user-supervised descriptor selection for QSAR methodsMartínez, María JimenaPonzoni, IgnacioDiaz, Monica FatimaVazquez, Gustavo EstebanSoto, Axel JuanFeature selectionVisual analyticsQSARCheminformaticshttps://purl.org/becyt/ford/1.2https://purl.org/becyt/ford/1The design of QSAR/QSPR models is a challenging problem, where the selection of the most relevant descriptors constitutes a key step of the process. Several feature selection methods that address this step are concentrated on statistical associations among descriptors and target properties, whereas the chemical knowledge is left out of the analysis. For this reason, the interpretability and generality of the QSAR/QSPR models obtained by these feature selection methods are drastically affected. Therefore, an approach for integrating domain expert?s knowledge in the selection process is needed for increase the confidence in the final set of descriptors.Fil: Martínez, María Jimena. Universidad Nacional del Sur. Departamento de Ciencias e Ingeniería de la Computación. Laboratorio de Investigación y Desarrollo en Computación Científica; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Ponzoni, Ignacio. Universidad Nacional del Sur. Departamento de Ciencias e Ingeniería de la Computación. Laboratorio de Investigación y Desarrollo en Computación Científica; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Diaz, Monica Fatima. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Bahía Blanca. Planta Piloto de Ingeniería Química. Universidad Nacional del Sur. Planta Piloto de Ingeniería Química; ArgentinaFil: Vazquez, Gustavo Esteban. Universidad Católica del Uruguay. Facultad de Ingeniería y Tecnologías; Uruguay. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Soto, Axel Juan. Dalhousie University. Faculty of Computer Science; Canadá. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaChemistry Central2015-08-19info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_6501info:ar-repo/semantics/articuloapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/11336/24166Martínez, María Jimena; Ponzoni, Ignacio; Diaz, Monica Fatima; Vazquez, Gustavo Esteban; Soto, Axel Juan; Visual analytics in cheminformatics: user-supervised descriptor selection for QSAR methods; Chemistry Central; Journal of cheminformatics; 7; 39; 19-8-2015; 1-171758-2946CONICET DigitalCONICETenginfo:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://jcheminf.springeropen.com/articles/10.1186/s13321-015-0092-4info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/10.1186/s13321-015-0092-4info:eu-repo/semantics/openAccesshttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/reponame:CONICET Digital (CONICET)instname:Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas2025-09-03T09:56:39Zoai:ri.conicet.gov.ar:11336/24166instacron:CONICETInstitucionalhttp://ri.conicet.gov.ar/Organismo científico-tecnológicoNo correspondehttp://ri.conicet.gov.ar/oai/requestdasensio@conicet.gov.ar; lcarlino@conicet.gov.arArgentinaNo correspondeNo correspondeNo correspondeopendoar:34982025-09-03 09:56:39.933CONICET Digital (CONICET) - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicasfalse |
dc.title.none.fl_str_mv |
Visual analytics in cheminformatics: user-supervised descriptor selection for QSAR methods |
title |
Visual analytics in cheminformatics: user-supervised descriptor selection for QSAR methods |
spellingShingle |
Visual analytics in cheminformatics: user-supervised descriptor selection for QSAR methods Martínez, María Jimena Feature selection Visual analytics QSAR Cheminformatics |
title_short |
Visual analytics in cheminformatics: user-supervised descriptor selection for QSAR methods |
title_full |
Visual analytics in cheminformatics: user-supervised descriptor selection for QSAR methods |
title_fullStr |
Visual analytics in cheminformatics: user-supervised descriptor selection for QSAR methods |
title_full_unstemmed |
Visual analytics in cheminformatics: user-supervised descriptor selection for QSAR methods |
title_sort |
Visual analytics in cheminformatics: user-supervised descriptor selection for QSAR methods |
dc.creator.none.fl_str_mv |
Martínez, María Jimena Ponzoni, Ignacio Diaz, Monica Fatima Vazquez, Gustavo Esteban Soto, Axel Juan |
author |
Martínez, María Jimena |
author_facet |
Martínez, María Jimena Ponzoni, Ignacio Diaz, Monica Fatima Vazquez, Gustavo Esteban Soto, Axel Juan |
author_role |
author |
author2 |
Ponzoni, Ignacio Diaz, Monica Fatima Vazquez, Gustavo Esteban Soto, Axel Juan |
author2_role |
author author author author |
dc.subject.none.fl_str_mv |
Feature selection Visual analytics QSAR Cheminformatics |
topic |
Feature selection Visual analytics QSAR Cheminformatics |
purl_subject.fl_str_mv |
https://purl.org/becyt/ford/1.2 https://purl.org/becyt/ford/1 |
dc.description.none.fl_txt_mv |
The design of QSAR/QSPR models is a challenging problem, where the selection of the most relevant descriptors constitutes a key step of the process. Several feature selection methods that address this step are concentrated on statistical associations among descriptors and target properties, whereas the chemical knowledge is left out of the analysis. For this reason, the interpretability and generality of the QSAR/QSPR models obtained by these feature selection methods are drastically affected. Therefore, an approach for integrating domain expert?s knowledge in the selection process is needed for increase the confidence in the final set of descriptors. Fil: Martínez, María Jimena. Universidad Nacional del Sur. Departamento de Ciencias e Ingeniería de la Computación. Laboratorio de Investigación y Desarrollo en Computación Científica; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina Fil: Ponzoni, Ignacio. Universidad Nacional del Sur. Departamento de Ciencias e Ingeniería de la Computación. Laboratorio de Investigación y Desarrollo en Computación Científica; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina Fil: Diaz, Monica Fatima. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Bahía Blanca. Planta Piloto de Ingeniería Química. Universidad Nacional del Sur. Planta Piloto de Ingeniería Química; Argentina Fil: Vazquez, Gustavo Esteban. Universidad Católica del Uruguay. Facultad de Ingeniería y Tecnologías; Uruguay. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina Fil: Soto, Axel Juan. Dalhousie University. Faculty of Computer Science; Canadá. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina |
description |
The design of QSAR/QSPR models is a challenging problem, where the selection of the most relevant descriptors constitutes a key step of the process. Several feature selection methods that address this step are concentrated on statistical associations among descriptors and target properties, whereas the chemical knowledge is left out of the analysis. For this reason, the interpretability and generality of the QSAR/QSPR models obtained by these feature selection methods are drastically affected. Therefore, an approach for integrating domain expert?s knowledge in the selection process is needed for increase the confidence in the final set of descriptors. |
publishDate |
2015 |
dc.date.none.fl_str_mv |
2015-08-19 |
dc.type.none.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion http://purl.org/coar/resource_type/c_6501 info:ar-repo/semantics/articulo |
format |
article |
status_str |
publishedVersion |
dc.identifier.none.fl_str_mv |
http://hdl.handle.net/11336/24166 Martínez, María Jimena; Ponzoni, Ignacio; Diaz, Monica Fatima; Vazquez, Gustavo Esteban; Soto, Axel Juan; Visual analytics in cheminformatics: user-supervised descriptor selection for QSAR methods; Chemistry Central; Journal of cheminformatics; 7; 39; 19-8-2015; 1-17 1758-2946 CONICET Digital CONICET |
url |
http://hdl.handle.net/11336/24166 |
identifier_str_mv |
Martínez, María Jimena; Ponzoni, Ignacio; Diaz, Monica Fatima; Vazquez, Gustavo Esteban; Soto, Axel Juan; Visual analytics in cheminformatics: user-supervised descriptor selection for QSAR methods; Chemistry Central; Journal of cheminformatics; 7; 39; 19-8-2015; 1-17 1758-2946 CONICET Digital CONICET |
dc.language.none.fl_str_mv |
eng |
language |
eng |
dc.relation.none.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://jcheminf.springeropen.com/articles/10.1186/s13321-015-0092-4 info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/10.1186/s13321-015-0092-4 |
dc.rights.none.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/ |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
rights_invalid_str_mv |
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/ |
dc.format.none.fl_str_mv |
application/pdf application/pdf application/pdf application/pdf |
dc.publisher.none.fl_str_mv |
Chemistry Central |
publisher.none.fl_str_mv |
Chemistry Central |
dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:CONICET Digital (CONICET) instname:Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas |
reponame_str |
CONICET Digital (CONICET) |
collection |
CONICET Digital (CONICET) |
instname_str |
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas |
repository.name.fl_str_mv |
CONICET Digital (CONICET) - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas |
repository.mail.fl_str_mv |
dasensio@conicet.gov.ar; lcarlino@conicet.gov.ar |
_version_ |
1842269416151056384 |
score |
13.13397 |