Visual analytics in cheminformatics: user-supervised descriptor selection for QSAR methods

Autores
Martínez, María Jimena; Ponzoni, Ignacio; Diaz, Monica Fatima; Vazquez, Gustavo Esteban; Soto, Axel Juan
Año de publicación
2015
Idioma
inglés
Tipo de recurso
artículo
Estado
versión publicada
Descripción
The design of QSAR/QSPR models is a challenging problem, where the selection of the most relevant descriptors constitutes a key step of the process. Several feature selection methods that address this step are concentrated on statistical associations among descriptors and target properties, whereas the chemical knowledge is left out of the analysis. For this reason, the interpretability and generality of the QSAR/QSPR models obtained by these feature selection methods are drastically affected. Therefore, an approach for integrating domain expert?s knowledge in the selection process is needed for increase the confidence in the final set of descriptors.
Fil: Martínez, María Jimena. Universidad Nacional del Sur. Departamento de Ciencias e Ingeniería de la Computación. Laboratorio de Investigación y Desarrollo en Computación Científica; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
Fil: Ponzoni, Ignacio. Universidad Nacional del Sur. Departamento de Ciencias e Ingeniería de la Computación. Laboratorio de Investigación y Desarrollo en Computación Científica; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
Fil: Diaz, Monica Fatima. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Bahía Blanca. Planta Piloto de Ingeniería Química. Universidad Nacional del Sur. Planta Piloto de Ingeniería Química; Argentina
Fil: Vazquez, Gustavo Esteban. Universidad Católica del Uruguay. Facultad de Ingeniería y Tecnologías; Uruguay. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
Fil: Soto, Axel Juan. Dalhousie University. Faculty of Computer Science; Canadá. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
Materia
Feature selection
Visual analytics
QSAR
Cheminformatics
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
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Repositorio
CONICET Digital (CONICET)
Institución
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
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