LIDeB Tools: A Latin American resource of freely available, open-source cheminformatics apps

Autores
Prada Gori, Denis Nihuel; Alberca, Lucas Nicolás; Rodríguez, Santiago; Alice, Juan Ignacio; Llanos, Manuel; Bellera, Carolina Leticia; Talevi, Alan
Año de publicación
2022
Idioma
inglés
Tipo de recurso
artículo
Estado
versión publicada
Descripción
Cheminformatics is the chemical field that deals with the storage, retrieval, analysis and manipulation of an increasing volume of available chemical data, and it plays a fundamental role in the fields of drug discovery, biology, chemistry, and biochemistry. Open source and freely available cheminformatics tools not only contribute to the generation of public knowledge, but also to reduce the technological gap between high- and low- to middle-income countries. Here, we describe a series of in-house cheminformatics applications developed by our academic drug discovery team, which are freely available on our website (https://lideb.biol.unlp.edu.ar/) as Web Apps and stand-alone versions. These apps include tools for clustering small molecules, decoy generation, druggability assessment, classificatory model evaluation, and data standardization and visualization.
Fil: Prada Gori, Denis Nihuel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata; Argentina. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencas Exactas. Laboratorio de Investigación y Desarrollo de Bioactivos; Argentina
Fil: Alberca, Lucas Nicolás. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata; Argentina. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencas Exactas. Laboratorio de Investigación y Desarrollo de Bioactivos; Argentina
Fil: Rodríguez, Santiago. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de La Plata "Prof. Dr. Rodolfo R. Brenner". Universidad Nacional de la Plata. Facultad de Ciencias Médicas. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de La Plata "Prof. Dr. Rodolfo R. Brenner"; Argentina. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencas Exactas. Laboratorio de Investigación y Desarrollo de Bioactivos; Argentina
Fil: Alice, Juan Ignacio. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata; Argentina. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencas Exactas. Laboratorio de Investigación y Desarrollo de Bioactivos; Argentina
Fil: Llanos, Manuel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata; Argentina. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencas Exactas. Laboratorio de Investigación y Desarrollo de Bioactivos; Argentina
Fil: Bellera, Carolina Leticia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata; Argentina. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencas Exactas. Laboratorio de Investigación y Desarrollo de Bioactivos; Argentina
Fil: Talevi, Alan. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata; Argentina. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencas Exactas. Laboratorio de Investigación y Desarrollo de Bioactivos; Argentina
Materia
CHEMINFORMATICS
OPEN SOURCE
WEB APPLICATIONS
CLUSTERING
DECOY GENERATION
DECOYS
DRUGGABILITY PREDICTION
DRUGGABILITY
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
https://creativecommons.org/licenses/by/2.5/ar/
Repositorio
CONICET Digital (CONICET)
Institución
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
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