Diversidad fúngica en suelos con diferentes usos en la región Pampeana Argentina.

Autores
Marcos Valle, Facundo José; Moreno, Maria Virginia; Silvestro, L. B.; Castellari, Claudia Carla; Diaz Delfino, Alberto; Andreoli, Yolanda Elina; Picone, Liliana Inés
Año de publicación
2019
Idioma
español castellano
Tipo de recurso
artículo
Estado
versión publicada
Descripción
Los hongos son relevantes en la descomposición de la materia orgánica, ciclado de nutrientes y sudisponibilidad para las plantas. El objetivo del presente estudio fue evaluar la comunidad fúngicade suelos con diferente uso utilizando la técnica PCR-DGGE. Se tomaron muestras de suelo (0-5 y5-20 cm de profundidad) de agricultura continua bajo siembra directa (AC), monte de Acacia sp.(MA) y pastizal natural (PN), en la región pampeana Argentina. La composición de la comunidadde hongos fue analizada utilizando la técnica molecular de la reacción en cadena de la polimerasa(PCR), electroforesis en geles con gradiente desnaturalizante (DGGE). A partir de los perfiles debandas de los geles DGGE se determinaron el número de bandas (S) y el coeficiente de similitudde Jaccard. Los perfiles obtenidos de la amplificación de fragmentos de ADN permitieron detectarespecies únicas en los primeros 5 cm de suelo para los usos de MA, AC y PN, al igual que para MAy PN en los 5 a 20 cm de profundidad. Por otro lado, se observaron fragmentos compartidos entrelos tres usos de suelo. El dendrograma identificó dos grupos, con un nivel de similitud próximo a35%. Los perfiles moleculares determinaron que la comunidad del PN se diferenció de las de MA yAC, los cuales están más cercanos entre sí. En conclusión, la técnica PCR-DGGE permitió determinardiferencias en la composición de las comunidades fúngicas edáficas entre suelos con diferente usoen la región pampeana Argentina.
Fungi have a key role in organic matter decomposition, nutrient cycling and nutrient availability to plants. The objective of the present study was to evaluate the fungal community of soils with different uses using the PCR-DGGE technique. Soil samples (0-5 and 5-20 cm depth) were taken from continuous agriculture under no-till (AC), Acacia sp. forest (MA) and prairie (PN) in the pampean region of Argentina. The fungal community was analyzed using the molecular technique polymerase chain reaction (PCR) – denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE). The number of bands (S) and Jaccard similarity coefficient were determined from band profiles of DGGE gels. The profiles obtained from amplification of DNA fragments allowed identifying unique species in the first 5 cm of the soil for MA, AC and PN uses as well as for MA and PN from 5 to 20 cm depth. On the other hand, shared fragments were observed among the three soil uses. The dendrogram identified two groups, with similarity coefficient close to 35%. The molecular profiles determined that the PN community differed from those of MA and AC, which are closer to each other. In conclusion, the PCR-DGGE technique allowed determining differences in the composition of edaphic fungal communities between soils with different use in the pampean region of Argentina.
Fil: Marcos Valle, Facundo José. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro Regional Buenos Aires Sur.; Argentina
Fil: Moreno, Maria Virginia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Cientifico Tecnolológico Mar del Plata. Instituto de Investigaciones en Biodiversidad y Biotecnología. Laboratorio de Biología Funcional y Biotecnología; Argentina
Fil: Silvestro, L. B.. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Cientifico Tecnolológico Mar del Plata. Instituto de Investigaciones en Biodiversidad y Biotecnología. Laboratorio de Biología Funcional y Biotecnología; Argentina
Fil: Castellari, Claudia Carla. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Buenos Aires Sur. Estación Experimental Agropecuaria Balcarce; Argentina
Fil: Diaz Delfino, Alberto. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro Regional Buenos Aires Sur.; Argentina
Fil: Andreoli, Yolanda Elina. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro Regional Buenos Aires Sur.; Argentina
Fil: Picone, Liliana Inés. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro Regional Buenos Aires Sur.; Argentina
Materia
MICOBIOTA EDAFICA
AGRICULTURA
DGGE
PASTIZAL NATURAL
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
Repositorio
CONICET Digital (CONICET)
Institución
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
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La composición de la comunidadde hongos fue analizada utilizando la técnica molecular de la reacción en cadena de la polimerasa(PCR), electroforesis en geles con gradiente desnaturalizante (DGGE). A partir de los perfiles debandas de los geles DGGE se determinaron el número de bandas (S) y el coeficiente de similitudde Jaccard. Los perfiles obtenidos de la amplificación de fragmentos de ADN permitieron detectarespecies únicas en los primeros 5 cm de suelo para los usos de MA, AC y PN, al igual que para MAy PN en los 5 a 20 cm de profundidad. Por otro lado, se observaron fragmentos compartidos entrelos tres usos de suelo. El dendrograma identificó dos grupos, con un nivel de similitud próximo a35%. Los perfiles moleculares determinaron que la comunidad del PN se diferenció de las de MA yAC, los cuales están más cercanos entre sí. En conclusión, la técnica PCR-DGGE permitió determinardiferencias en la composición de las comunidades fúngicas edáficas entre suelos con diferente usoen la región pampeana Argentina.Fungi have a key role in organic matter decomposition, nutrient cycling and nutrient availability to plants. The objective of the present study was to evaluate the fungal community of soils with different uses using the PCR-DGGE technique. Soil samples (0-5 and 5-20 cm depth) were taken from continuous agriculture under no-till (AC), Acacia sp. forest (MA) and prairie (PN) in the pampean region of Argentina. The fungal community was analyzed using the molecular technique polymerase chain reaction (PCR) – denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE). The number of bands (S) and Jaccard similarity coefficient were determined from band profiles of DGGE gels. The profiles obtained from amplification of DNA fragments allowed identifying unique species in the first 5 cm of the soil for MA, AC and PN uses as well as for MA and PN from 5 to 20 cm depth. On the other hand, shared fragments were observed among the three soil uses. The dendrogram identified two groups, with similarity coefficient close to 35%. The molecular profiles determined that the PN community differed from those of MA and AC, which are closer to each other. In conclusion, the PCR-DGGE technique allowed determining differences in the composition of edaphic fungal communities between soils with different use in the pampean region of Argentina.Fil: Marcos Valle, Facundo José. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro Regional Buenos Aires Sur.; ArgentinaFil: Moreno, Maria Virginia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Cientifico Tecnolológico Mar del Plata. Instituto de Investigaciones en Biodiversidad y Biotecnología. 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