Caracterización de la diversidad genética de poblaciones naturales de Brassica rapa en Argentina mediante genotipificación por secuenciación (GBS)
- Autores
- Tillería, Sofía Gabriela; Pandolfo, Claudio Ezequiel; Presotto, Alejandro Daniel; Ureta, Maria Soledad
- Año de publicación
- 2024
- Idioma
- español castellano
- Tipo de recurso
- documento de conferencia
- Estado
- versión publicada
- Descripción
- Brassica rapa L. (nabo) es una maleza ampliamente distribuida en Argentina. En los últimos años, se han identificado biotipos resistentes a herbicidas (e.g., glifosato e imidazolinonas), incrementando la superficie invadida por esta especie. A pesar de su importancia, el origen y la diversidad genética del nabo en el país son desconocidos. El objetivo fue determinar la estructura y diversidad genética de poblaciones argentinas de B. rapa utilizando la técnica de genotipificación por secuenciación (GBS). Se evaluaron 58 muestras de 15 poblaciones colectadas en diferentes regiones del país, identificándose 35.951 SNPs. Mediante los programas ADMIXTURE y Population, se determinó la estructura y diversidad genética. Estos análisis definieron cuatro grupos, sugiriendo que las poblaciones de B. rapa argentinas no tendrían un origen único. Poblaciones colectadas en la misma región en diferentes años, mostraron diferenciación en la composición genética, evidenciando cambios evolutivos a lo largo del tiempo. La mayor diferenciación genética se encontró entre dos poblaciones provenientes de ambientes contrastantes (Río Negro vs. Tucumán) (FST= 0,23), lo que podría deberse a diferentes introducciones o a la adaptación local. El análisis de estructura genética mostró que las poblaciones argentinas tendrían una ascendencia común con el morfotipo “turnip” cultivado por su raíz engrosada. Los cambios en la estructura genética no se asociaron a la presencia de las resistencias. Este es el primer estudio que caracteriza la diversidad genética de las poblaciones argentinas de nabo
Fil: Tillería, Sofía Gabriela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Bahía Blanca. Centro de Recursos Naturales Renovables de la Zona Semiárida. Universidad Nacional del Sur. Centro de Recursos Naturales Renovables de la Zona Semiárida; Argentina. Universidad Nacional del Sur. Departamento de Agronomía; Argentina
Fil: Pandolfo, Claudio Ezequiel. Universidad Nacional del Sur. Departamento de Agronomía; Argentina
Fil: Presotto, Alejandro Daniel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Bahía Blanca. Centro de Recursos Naturales Renovables de la Zona Semiárida. Universidad Nacional del Sur. Centro de Recursos Naturales Renovables de la Zona Semiárida; Argentina. Universidad Nacional del Sur. Departamento de Agronomía; Argentina
Fil: Ureta, Maria Soledad. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Bahía Blanca. Centro de Recursos Naturales Renovables de la Zona Semiárida. Universidad Nacional del Sur. Centro de Recursos Naturales Renovables de la Zona Semiárida; Argentina. Universidad Nacional del Sur. Departamento de Agronomía; Argentina
IV Jornadas Regionales de Genética
Rosario
Argentina
Sociedad Argentina de Genética - Materia
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Brassica rapa
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Brassica rapa L. (nabo) es una maleza ampliamente distribuida en Argentina. En los últimos años, se han identificado biotipos resistentes a herbicidas (e.g., glifosato e imidazolinonas), incrementando la superficie invadida por esta especie. A pesar de su importancia, el origen y la diversidad genética del nabo en el país son desconocidos. El objetivo fue determinar la estructura y diversidad genética de poblaciones argentinas de B. rapa utilizando la técnica de genotipificación por secuenciación (GBS). Se evaluaron 58 muestras de 15 poblaciones colectadas en diferentes regiones del país, identificándose 35.951 SNPs. Mediante los programas ADMIXTURE y Population, se determinó la estructura y diversidad genética. Estos análisis definieron cuatro grupos, sugiriendo que las poblaciones de B. rapa argentinas no tendrían un origen único. Poblaciones colectadas en la misma región en diferentes años, mostraron diferenciación en la composición genética, evidenciando cambios evolutivos a lo largo del tiempo. La mayor diferenciación genética se encontró entre dos poblaciones provenientes de ambientes contrastantes (Río Negro vs. Tucumán) (FST= 0,23), lo que podría deberse a diferentes introducciones o a la adaptación local. El análisis de estructura genética mostró que las poblaciones argentinas tendrían una ascendencia común con el morfotipo “turnip” cultivado por su raíz engrosada. Los cambios en la estructura genética no se asociaron a la presencia de las resistencias. Este es el primer estudio que caracteriza la diversidad genética de las poblaciones argentinas de nabo |
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