Molecular typing of Argentinian Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis isolates by multiple-locus variable number-tandem repeat analysis

Autores
Gioffré, Andrea Karina; Muñoz, Magnolia Correa; Alvarado Pinedo, María Fiorella; Vaca, Roberto Jose Antonio; Morsella, Claudia; Fiorentino, Maria Andrea; Paolicchi, Fernando Alberto; Ruybal, Paula; Zumárraga, Martín José; Travería, Gabriel Eduardo; Romano, Maria Isabel
Año de publicación
2015
Idioma
inglés
Tipo de recurso
artículo
Estado
versión publicada
Descripción
Multiple-locus variable number-tandem repeat analysis (MLVA) of Mycobacterium avium subspecies paratuberculosis (MAP) isolates may contribute to the knowledge of strain diversity in Argentina. Although the diversity of MAP has been previously investigated in Argentina using IS900-RFLP, a small number of isolates were employed, and a low discriminative power was reached. The aim of the present study was to test the genetic diversity among MAP isolates using an MLVA approach based on 8 repetitive loci. We studied 97 isolates from cattle, goat and sheep and could describe 7 different patterns: INMV1, INMV2, INMV11, INMV13, INMV16, INMV33 and one incomplete pattern. INMV1 and INMV2 were the most frequent patterns, grouping 76.3% of the isolates. We were also able to demonstrate the coexistence of genotypes in herds and co-infection at the organism level. This study shows that all the patterns described are common to those described in Europe, suggesting an epidemiological link between the continents.
Fil: Gioffré, Andrea Karina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Biotecnología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
Fil: Muñoz, Magnolia Correa. Universidad Autónoma de Baja California Sur; México
Fil: Alvarado Pinedo, María Fiorella. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Veterinarias. Departamento de Clínica. Centro de Diagnóstico e Investigaciones Veterinarias; Argentina
Fil: Vaca, Roberto Jose Antonio. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Veterinarias; Argentina
Fil: Morsella, Claudia. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Buenos Aires Sur. Estación Experimental Agropecuaria Balcarce; Argentina
Fil: Fiorentino, Maria Andrea. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Buenos Aires Sur. Estación Experimental Agropecuaria Balcarce; Argentina
Fil: Paolicchi, Fernando Alberto. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Buenos Aires Sur. Estación Experimental Agropecuaria Balcarce; Argentina
Fil: Ruybal, Paula. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Biotecnología; Argentina
Fil: Zumárraga, Martín José. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Biotecnología; Argentina
Fil: Travería, Gabriel Eduardo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Veterinarias. Departamento de Clínica. Centro de Diagnóstico e Investigaciones Veterinarias; Argentina
Fil: Romano, Maria Isabel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Biotecnología; Argentina
Materia
MIRU-VNTR
MLVA
MOLECULAR TYPING
PARATUBERCULOSIS
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
https://creativecommons.org/licenses/by-nc/2.5/ar/
Repositorio
CONICET Digital (CONICET)
Institución
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
OAI Identificador
oai:ri.conicet.gov.ar:11336/38142
Acceder
id CONICETDig_7ad963196cf8fce4febb90eba516c635
oai_identifier_str oai:ri.conicet.gov.ar:11336/38142
network_acronym_str CONICETDig
repository_id_str 3498
network_name_str CONICET Digital (CONICET)
spelling Molecular typing of Argentinian Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis isolates by multiple-locus variable number-tandem repeat analysisGioffré, Andrea KarinaMuñoz, Magnolia CorreaAlvarado Pinedo, María FiorellaVaca, Roberto Jose AntonioMorsella, ClaudiaFiorentino, Maria AndreaPaolicchi, Fernando AlbertoRuybal, PaulaZumárraga, Martín JoséTravería, Gabriel EduardoRomano, Maria IsabelMIRU-VNTRMLVAMOLECULAR TYPINGPARATUBERCULOSIShttps://purl.org/becyt/ford/1.6https://purl.org/becyt/ford/1Multiple-locus variable number-tandem repeat analysis (MLVA) of Mycobacterium avium subspecies paratuberculosis (MAP) isolates may contribute to the knowledge of strain diversity in Argentina. Although the diversity of MAP has been previously investigated in Argentina using IS900-RFLP, a small number of isolates were employed, and a low discriminative power was reached. The aim of the present study was to test the genetic diversity among MAP isolates using an MLVA approach based on 8 repetitive loci. We studied 97 isolates from cattle, goat and sheep and could describe 7 different patterns: INMV1, INMV2, INMV11, INMV13, INMV16, INMV33 and one incomplete pattern. INMV1 and INMV2 were the most frequent patterns, grouping 76.3% of the isolates. We were also able to demonstrate the coexistence of genotypes in herds and co-infection at the organism level. This study shows that all the patterns described are common to those described in Europe, suggesting an epidemiological link between the continents.Fil: Gioffré, Andrea Karina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Biotecnología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Muñoz, Magnolia Correa. Universidad Autónoma de Baja California Sur; MéxicoFil: Alvarado Pinedo, María Fiorella. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Veterinarias. Departamento de Clínica. Centro de Diagnóstico e Investigaciones Veterinarias; ArgentinaFil: Vaca, Roberto Jose Antonio. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Veterinarias; ArgentinaFil: Morsella, Claudia. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Buenos Aires Sur. Estación Experimental Agropecuaria Balcarce; ArgentinaFil: Fiorentino, Maria Andrea. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Buenos Aires Sur. Estación Experimental Agropecuaria Balcarce; ArgentinaFil: Paolicchi, Fernando Alberto. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Buenos Aires Sur. Estación Experimental Agropecuaria Balcarce; ArgentinaFil: Ruybal, Paula. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Biotecnología; ArgentinaFil: Zumárraga, Martín José. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Biotecnología; ArgentinaFil: Travería, Gabriel Eduardo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Veterinarias. Departamento de Clínica. Centro de Diagnóstico e Investigaciones Veterinarias; ArgentinaFil: Romano, Maria Isabel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Biotecnología; ArgentinaSociedade Brasileira de Microbiologia2015-06info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_6501info:ar-repo/semantics/articuloapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/11336/38142Gioffré, Andrea Karina; Muñoz, Magnolia Correa; Alvarado Pinedo, María Fiorella; Vaca, Roberto Jose Antonio; Morsella, Claudia; et al.; Molecular typing of Argentinian Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis isolates by multiple-locus variable number-tandem repeat analysis; Sociedade Brasileira de Microbiologia; Brazilian Journal of Microbiology; 46; 2; 6-2015; 557-5641517-83821678-4405CONICET DigitalCONICETenginfo:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/http://ref.scielo.org/fbkrjcinfo:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/10.1590/S1517-838246220140283info:eu-repo/semantics/openAccesshttps://creativecommons.org/licenses/by-nc/2.5/ar/reponame:CONICET Digital (CONICET)instname:Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas2025-09-03T10:07:49Zoai:ri.conicet.gov.ar:11336/38142instacron:CONICETInstitucionalhttp://ri.conicet.gov.ar/Organismo científico-tecnológicoNo correspondehttp://ri.conicet.gov.ar/oai/requestdasensio@conicet.gov.ar; lcarlino@conicet.gov.arArgentinaNo correspondeNo correspondeNo correspondeopendoar:34982025-09-03 10:07:49.964CONICET Digital (CONICET) - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicasfalse
dc.title.none.fl_str_mv Molecular typing of Argentinian Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis isolates by multiple-locus variable number-tandem repeat analysis
title Molecular typing of Argentinian Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis isolates by multiple-locus variable number-tandem repeat analysis
spellingShingle Molecular typing of Argentinian Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis isolates by multiple-locus variable number-tandem repeat analysis
Gioffré, Andrea Karina
MIRU-VNTR
MLVA
MOLECULAR TYPING
PARATUBERCULOSIS
title_short Molecular typing of Argentinian Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis isolates by multiple-locus variable number-tandem repeat analysis
title_full Molecular typing of Argentinian Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis isolates by multiple-locus variable number-tandem repeat analysis
title_fullStr Molecular typing of Argentinian Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis isolates by multiple-locus variable number-tandem repeat analysis
title_full_unstemmed Molecular typing of Argentinian Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis isolates by multiple-locus variable number-tandem repeat analysis
title_sort Molecular typing of Argentinian Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis isolates by multiple-locus variable number-tandem repeat analysis
dc.creator.none.fl_str_mv Gioffré, Andrea Karina
Muñoz, Magnolia Correa
Alvarado Pinedo, María Fiorella
Vaca, Roberto Jose Antonio
Morsella, Claudia
Fiorentino, Maria Andrea
Paolicchi, Fernando Alberto
Ruybal, Paula
Zumárraga, Martín José
Travería, Gabriel Eduardo
Romano, Maria Isabel
author Gioffré, Andrea Karina
author_facet Gioffré, Andrea Karina
Muñoz, Magnolia Correa
Alvarado Pinedo, María Fiorella
Vaca, Roberto Jose Antonio
Morsella, Claudia
Fiorentino, Maria Andrea
Paolicchi, Fernando Alberto
Ruybal, Paula
Zumárraga, Martín José
Travería, Gabriel Eduardo
Romano, Maria Isabel
author_role author
author2 Muñoz, Magnolia Correa
Alvarado Pinedo, María Fiorella
Vaca, Roberto Jose Antonio
Morsella, Claudia
Fiorentino, Maria Andrea
Paolicchi, Fernando Alberto
Ruybal, Paula
Zumárraga, Martín José
Travería, Gabriel Eduardo
Romano, Maria Isabel
author2_role author
author
author
author
author
author
author
author
author
author
dc.subject.none.fl_str_mv MIRU-VNTR
MLVA
MOLECULAR TYPING
PARATUBERCULOSIS
topic MIRU-VNTR
MLVA
MOLECULAR TYPING
PARATUBERCULOSIS
purl_subject.fl_str_mv https://purl.org/becyt/ford/1.6
https://purl.org/becyt/ford/1
dc.description.none.fl_txt_mv Multiple-locus variable number-tandem repeat analysis (MLVA) of Mycobacterium avium subspecies paratuberculosis (MAP) isolates may contribute to the knowledge of strain diversity in Argentina. Although the diversity of MAP has been previously investigated in Argentina using IS900-RFLP, a small number of isolates were employed, and a low discriminative power was reached. The aim of the present study was to test the genetic diversity among MAP isolates using an MLVA approach based on 8 repetitive loci. We studied 97 isolates from cattle, goat and sheep and could describe 7 different patterns: INMV1, INMV2, INMV11, INMV13, INMV16, INMV33 and one incomplete pattern. INMV1 and INMV2 were the most frequent patterns, grouping 76.3% of the isolates. We were also able to demonstrate the coexistence of genotypes in herds and co-infection at the organism level. This study shows that all the patterns described are common to those described in Europe, suggesting an epidemiological link between the continents.
Fil: Gioffré, Andrea Karina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Biotecnología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
Fil: Muñoz, Magnolia Correa. Universidad Autónoma de Baja California Sur; México
Fil: Alvarado Pinedo, María Fiorella. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Veterinarias. Departamento de Clínica. Centro de Diagnóstico e Investigaciones Veterinarias; Argentina
Fil: Vaca, Roberto Jose Antonio. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Veterinarias; Argentina
Fil: Morsella, Claudia. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Buenos Aires Sur. Estación Experimental Agropecuaria Balcarce; Argentina
Fil: Fiorentino, Maria Andrea. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Buenos Aires Sur. Estación Experimental Agropecuaria Balcarce; Argentina
Fil: Paolicchi, Fernando Alberto. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Buenos Aires Sur. Estación Experimental Agropecuaria Balcarce; Argentina
Fil: Ruybal, Paula. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Biotecnología; Argentina
Fil: Zumárraga, Martín José. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Biotecnología; Argentina
Fil: Travería, Gabriel Eduardo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Veterinarias. Departamento de Clínica. Centro de Diagnóstico e Investigaciones Veterinarias; Argentina
Fil: Romano, Maria Isabel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Biotecnología; Argentina
description Multiple-locus variable number-tandem repeat analysis (MLVA) of Mycobacterium avium subspecies paratuberculosis (MAP) isolates may contribute to the knowledge of strain diversity in Argentina. Although the diversity of MAP has been previously investigated in Argentina using IS900-RFLP, a small number of isolates were employed, and a low discriminative power was reached. The aim of the present study was to test the genetic diversity among MAP isolates using an MLVA approach based on 8 repetitive loci. We studied 97 isolates from cattle, goat and sheep and could describe 7 different patterns: INMV1, INMV2, INMV11, INMV13, INMV16, INMV33 and one incomplete pattern. INMV1 and INMV2 were the most frequent patterns, grouping 76.3% of the isolates. We were also able to demonstrate the coexistence of genotypes in herds and co-infection at the organism level. This study shows that all the patterns described are common to those described in Europe, suggesting an epidemiological link between the continents.
publishDate 2015
dc.date.none.fl_str_mv 2015-06
dc.type.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/article
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
http://purl.org/coar/resource_type/c_6501
info:ar-repo/semantics/articulo
format article
status_str publishedVersion
dc.identifier.none.fl_str_mv http://hdl.handle.net/11336/38142
Gioffré, Andrea Karina; Muñoz, Magnolia Correa; Alvarado Pinedo, María Fiorella; Vaca, Roberto Jose Antonio; Morsella, Claudia; et al.; Molecular typing of Argentinian Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis isolates by multiple-locus variable number-tandem repeat analysis; Sociedade Brasileira de Microbiologia; Brazilian Journal of Microbiology; 46; 2; 6-2015; 557-564
1517-8382
1678-4405
CONICET Digital
CONICET
url http://hdl.handle.net/11336/38142
identifier_str_mv Gioffré, Andrea Karina; Muñoz, Magnolia Correa; Alvarado Pinedo, María Fiorella; Vaca, Roberto Jose Antonio; Morsella, Claudia; et al.; Molecular typing of Argentinian Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis isolates by multiple-locus variable number-tandem repeat analysis; Sociedade Brasileira de Microbiologia; Brazilian Journal of Microbiology; 46; 2; 6-2015; 557-564
1517-8382
1678-4405
CONICET Digital
CONICET
dc.language.none.fl_str_mv eng
language eng
dc.relation.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/http://ref.scielo.org/fbkrjc
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/10.1590/S1517-838246220140283
dc.rights.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
https://creativecommons.org/licenses/by-nc/2.5/ar/
eu_rights_str_mv openAccess
rights_invalid_str_mv https://creativecommons.org/licenses/by-nc/2.5/ar/
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
application/pdf
application/pdf
application/pdf
application/pdf
application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Sociedade Brasileira de Microbiologia
publisher.none.fl_str_mv Sociedade Brasileira de Microbiologia
dc.source.none.fl_str_mv reponame:CONICET Digital (CONICET)
instname:Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
reponame_str CONICET Digital (CONICET)
collection CONICET Digital (CONICET)
instname_str Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
repository.name.fl_str_mv CONICET Digital (CONICET) - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
repository.mail.fl_str_mv dasensio@conicet.gov.ar; lcarlino@conicet.gov.ar
_version_ 1842270019568795648
score 13.13397

Publicaciones similares