Fingerprints of Both Watson–Crick and Hoogsteen Isomers of the Isolated (Cytosine-Guanine)H + Pair

Autores
Cruz Ortiz, Andres Felipe; Rossa, Maximiliano; Berthias, Francis; Berdakin, Matias; Maitre, Philippe; Pino, Gustavo Ariel
Año de publicación
2017
Idioma
inglés
Tipo de recurso
artículo
Estado
versión publicada
Descripción
Gas phase protonated guanine-cytosine (CGH+) pair was generated using an electrospray ionization source from solutions at two different pH (5.8 and 3.2). Consistent evidence from MS/MS fragmentation patterns and differential ion mobility spectra (DIMS) point toward the presence of two isomers of the CGH+ pair, whose relative populations depend strongly on the pH of the solution. Gas phase infrared multiphoton dissociation (IRMPD) spectroscopy in the 900-1900 cm-1 spectral range further confirms that the Watson-Crick isomer is preferentially produced (91%) at pH = 5.8, while the Hoogsteen isomer predominates (66%) at pH = 3.2). These fingerprint signatures are expected to be useful for the development of new analytical methodologies and to trigger isomer selective photochemical studies of protonated DNA base pairs.
Fil: Cruz Ortiz, Andres Felipe. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Investigaciones en Físico-química de Córdoba. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Químicas. Instituto de Investigaciones en Físico-química de Córdoba; Argentina
Fil: Rossa, Maximiliano. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Investigaciones en Físico-química de Córdoba. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Químicas. Instituto de Investigaciones en Físico-química de Córdoba; Argentina
Fil: Berthias, Francis. Université Paris Sud; Francia
Fil: Berdakin, Matias. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Investigaciones en Físico-química de Córdoba. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Químicas. Instituto de Investigaciones en Físico-química de Córdoba; Argentina
Fil: Maitre, Philippe. Université Paris Sud; Francia
Fil: Pino, Gustavo Ariel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Investigaciones en Físico-química de Córdoba. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Químicas. Instituto de Investigaciones en Físico-química de Córdoba; Argentina
Materia
Tandem Mass Spectrometry
Irmpd Spectroscopy
Differential Ion Mobility Spectroscopy
Dft
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
Repositorio
CONICET Digital (CONICET)
Institución
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
OAI Identificador
oai:ri.conicet.gov.ar:11336/64354
Acceder
id CONICETDig_6c6dcd388bc61aae5908da33d4282312
oai_identifier_str oai:ri.conicet.gov.ar:11336/64354
network_acronym_str CONICETDig
repository_id_str 3498
network_name_str CONICET Digital (CONICET)
spelling Fingerprints of Both Watson–Crick and Hoogsteen Isomers of the Isolated (Cytosine-Guanine)H + PairCruz Ortiz, Andres FelipeRossa, MaximilianoBerthias, FrancisBerdakin, MatiasMaitre, PhilippePino, Gustavo ArielTandem Mass SpectrometryIrmpd SpectroscopyDifferential Ion Mobility SpectroscopyDfthttps://purl.org/becyt/ford/1.4https://purl.org/becyt/ford/1Gas phase protonated guanine-cytosine (CGH+) pair was generated using an electrospray ionization source from solutions at two different pH (5.8 and 3.2). Consistent evidence from MS/MS fragmentation patterns and differential ion mobility spectra (DIMS) point toward the presence of two isomers of the CGH+ pair, whose relative populations depend strongly on the pH of the solution. Gas phase infrared multiphoton dissociation (IRMPD) spectroscopy in the 900-1900 cm-1 spectral range further confirms that the Watson-Crick isomer is preferentially produced (91%) at pH = 5.8, while the Hoogsteen isomer predominates (66%) at pH = 3.2). These fingerprint signatures are expected to be useful for the development of new analytical methodologies and to trigger isomer selective photochemical studies of protonated DNA base pairs.Fil: Cruz Ortiz, Andres Felipe. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Investigaciones en Físico-química de Córdoba. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Químicas. Instituto de Investigaciones en Físico-química de Córdoba; ArgentinaFil: Rossa, Maximiliano. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Investigaciones en Físico-química de Córdoba. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Químicas. Instituto de Investigaciones en Físico-química de Córdoba; ArgentinaFil: Berthias, Francis. Université Paris Sud; FranciaFil: Berdakin, Matias. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Investigaciones en Físico-química de Córdoba. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Químicas. Instituto de Investigaciones en Físico-química de Córdoba; ArgentinaFil: Maitre, Philippe. Université Paris Sud; FranciaFil: Pino, Gustavo Ariel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Investigaciones en Físico-química de Córdoba. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Químicas. Instituto de Investigaciones en Físico-química de Córdoba; ArgentinaAmerican Chemical Society2017-11-24info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_6501info:ar-repo/semantics/articuloapplication/pdfapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/11336/64354Cruz Ortiz, Andres Felipe; Rossa, Maximiliano; Berthias, Francis; Berdakin, Matias; Maitre, Philippe; et al.; Fingerprints of Both Watson–Crick and Hoogsteen Isomers of the Isolated (Cytosine-Guanine)H + Pair; American Chemical Society; The Journal of Physical Chemistry Letters; 8; 22; 24-11-2017; 5501–55061948-71851948-7185CONICET DigitalCONICETenginfo:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/acs.jpclett.7b02140info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/10.1021/acs.jpclett.7b02140info:eu-repo/semantics/openAccesshttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/reponame:CONICET Digital (CONICET)instname:Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas2025-10-22T11:03:27Zoai:ri.conicet.gov.ar:11336/64354instacron:CONICETInstitucionalhttp://ri.conicet.gov.ar/Organismo científico-tecnológicoNo correspondehttp://ri.conicet.gov.ar/oai/requestdasensio@conicet.gov.ar; lcarlino@conicet.gov.arArgentinaNo correspondeNo correspondeNo correspondeopendoar:34982025-10-22 11:03:28.021CONICET Digital (CONICET) - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicasfalse
dc.title.none.fl_str_mv Fingerprints of Both Watson–Crick and Hoogsteen Isomers of the Isolated (Cytosine-Guanine)H + Pair
title Fingerprints of Both Watson–Crick and Hoogsteen Isomers of the Isolated (Cytosine-Guanine)H + Pair
spellingShingle Fingerprints of Both Watson–Crick and Hoogsteen Isomers of the Isolated (Cytosine-Guanine)H + Pair
Cruz Ortiz, Andres Felipe
Tandem Mass Spectrometry
Irmpd Spectroscopy
Differential Ion Mobility Spectroscopy
Dft
title_short Fingerprints of Both Watson–Crick and Hoogsteen Isomers of the Isolated (Cytosine-Guanine)H + Pair
title_full Fingerprints of Both Watson–Crick and Hoogsteen Isomers of the Isolated (Cytosine-Guanine)H + Pair
title_fullStr Fingerprints of Both Watson–Crick and Hoogsteen Isomers of the Isolated (Cytosine-Guanine)H + Pair
title_full_unstemmed Fingerprints of Both Watson–Crick and Hoogsteen Isomers of the Isolated (Cytosine-Guanine)H + Pair
title_sort Fingerprints of Both Watson–Crick and Hoogsteen Isomers of the Isolated (Cytosine-Guanine)H + Pair
dc.creator.none.fl_str_mv Cruz Ortiz, Andres Felipe
Rossa, Maximiliano
Berthias, Francis
Berdakin, Matias
Maitre, Philippe
Pino, Gustavo Ariel
author Cruz Ortiz, Andres Felipe
author_facet Cruz Ortiz, Andres Felipe
Rossa, Maximiliano
Berthias, Francis
Berdakin, Matias
Maitre, Philippe
Pino, Gustavo Ariel
author_role author
author2 Rossa, Maximiliano
Berthias, Francis
Berdakin, Matias
Maitre, Philippe
Pino, Gustavo Ariel
author2_role author
author
author
author
author
dc.subject.none.fl_str_mv Tandem Mass Spectrometry
Irmpd Spectroscopy
Differential Ion Mobility Spectroscopy
Dft
topic Tandem Mass Spectrometry
Irmpd Spectroscopy
Differential Ion Mobility Spectroscopy
Dft
purl_subject.fl_str_mv https://purl.org/becyt/ford/1.4
https://purl.org/becyt/ford/1
dc.description.none.fl_txt_mv Gas phase protonated guanine-cytosine (CGH+) pair was generated using an electrospray ionization source from solutions at two different pH (5.8 and 3.2). Consistent evidence from MS/MS fragmentation patterns and differential ion mobility spectra (DIMS) point toward the presence of two isomers of the CGH+ pair, whose relative populations depend strongly on the pH of the solution. Gas phase infrared multiphoton dissociation (IRMPD) spectroscopy in the 900-1900 cm-1 spectral range further confirms that the Watson-Crick isomer is preferentially produced (91%) at pH = 5.8, while the Hoogsteen isomer predominates (66%) at pH = 3.2). These fingerprint signatures are expected to be useful for the development of new analytical methodologies and to trigger isomer selective photochemical studies of protonated DNA base pairs.
Fil: Cruz Ortiz, Andres Felipe. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Investigaciones en Físico-química de Córdoba. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Químicas. Instituto de Investigaciones en Físico-química de Córdoba; Argentina
Fil: Rossa, Maximiliano. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Investigaciones en Físico-química de Córdoba. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Químicas. Instituto de Investigaciones en Físico-química de Córdoba; Argentina
Fil: Berthias, Francis. Université Paris Sud; Francia
Fil: Berdakin, Matias. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Investigaciones en Físico-química de Córdoba. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Químicas. Instituto de Investigaciones en Físico-química de Córdoba; Argentina
Fil: Maitre, Philippe. Université Paris Sud; Francia
Fil: Pino, Gustavo Ariel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Investigaciones en Físico-química de Córdoba. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Químicas. Instituto de Investigaciones en Físico-química de Córdoba; Argentina
description Gas phase protonated guanine-cytosine (CGH+) pair was generated using an electrospray ionization source from solutions at two different pH (5.8 and 3.2). Consistent evidence from MS/MS fragmentation patterns and differential ion mobility spectra (DIMS) point toward the presence of two isomers of the CGH+ pair, whose relative populations depend strongly on the pH of the solution. Gas phase infrared multiphoton dissociation (IRMPD) spectroscopy in the 900-1900 cm-1 spectral range further confirms that the Watson-Crick isomer is preferentially produced (91%) at pH = 5.8, while the Hoogsteen isomer predominates (66%) at pH = 3.2). These fingerprint signatures are expected to be useful for the development of new analytical methodologies and to trigger isomer selective photochemical studies of protonated DNA base pairs.
publishDate 2017
dc.date.none.fl_str_mv 2017-11-24
dc.type.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/article
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
http://purl.org/coar/resource_type/c_6501
info:ar-repo/semantics/articulo
format article
status_str publishedVersion
dc.identifier.none.fl_str_mv http://hdl.handle.net/11336/64354
Cruz Ortiz, Andres Felipe; Rossa, Maximiliano; Berthias, Francis; Berdakin, Matias; Maitre, Philippe; et al.; Fingerprints of Both Watson–Crick and Hoogsteen Isomers of the Isolated (Cytosine-Guanine)H + Pair; American Chemical Society; The Journal of Physical Chemistry Letters; 8; 22; 24-11-2017; 5501–5506
1948-7185
1948-7185
CONICET Digital
CONICET
url http://hdl.handle.net/11336/64354
identifier_str_mv Cruz Ortiz, Andres Felipe; Rossa, Maximiliano; Berthias, Francis; Berdakin, Matias; Maitre, Philippe; et al.; Fingerprints of Both Watson–Crick and Hoogsteen Isomers of the Isolated (Cytosine-Guanine)H + Pair; American Chemical Society; The Journal of Physical Chemistry Letters; 8; 22; 24-11-2017; 5501–5506
1948-7185
CONICET Digital
CONICET
dc.language.none.fl_str_mv eng
language eng
dc.relation.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/acs.jpclett.7b02140
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/10.1021/acs.jpclett.7b02140
dc.rights.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
eu_rights_str_mv openAccess
rights_invalid_str_mv https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv American Chemical Society
publisher.none.fl_str_mv American Chemical Society
dc.source.none.fl_str_mv reponame:CONICET Digital (CONICET)
instname:Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
reponame_str CONICET Digital (CONICET)
collection CONICET Digital (CONICET)
instname_str Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
repository.name.fl_str_mv CONICET Digital (CONICET) - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
repository.mail.fl_str_mv dasensio@conicet.gov.ar; lcarlino@conicet.gov.ar
_version_ 1846781267928940544
score 12.982451

Publicaciones similares