Study of the interaction of Huperzia saururus Lycopodium alkaloids with the Acetylcholinesterase enzyme

Autores
Puiatti, Marcelo; Borioni, José Luis; Vallejo, Mariana Guadalupe; Cabrera, Jose Luis; Agnese, Mariel; Ortega, María Gabriela; Pierini, Adriana Beatriz
Año de publicación
2013
Idioma
inglés
Tipo de recurso
artículo
Estado
versión publicada
Descripción
In the present study, we describe and compare the binding modes of three Lycopodium alkaloids (sauroine, 6-hydroxylycopodine and sauroxine; isolated from Huperzia saururus) and huperzine A with the enzyme acetylcholinesterase. Refinement and rescoring of the docking poses (obtained with different programs) with an all atom force field helped to improve the quality of the protein?ligand complexes. Molecular dynamics simulations were performed to investigate the complexes and the alkaloid´s binding modes. The combination of the latter two methodologies indicated that binding in the active site is favored for the active compounds. On the other hand, similar binding energies in both the active and the peripheral sites were obtained for sauroine, thus explaining its experimentally determined lack of activity. MM-GBSA predicted the order of binding energies in agreement with the experimental IC50 values
Fil: Puiatti, Marcelo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Investigaciones En Fisico- Química de Córdoba. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Cs.químicas. Instituto de Investigaciones En Fisico- Química de Córdoba; Argentina
Fil: Borioni, José Luis. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Investigaciones En Fisico- Química de Córdoba. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Cs.químicas. Instituto de Investigaciones En Fisico- Química de Córdoba; Argentina
Fil: Vallejo, Mariana Guadalupe. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto Multidisciplinario de Biología Vegetal. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas Físicas y Naturales. Instituto Multidisciplinario de Biología Vegetal; Argentina
Fil: Cabrera, Jose Luis. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto Multidisciplinario de Biología Vegetal. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas Físicas y Naturales. Instituto Multidisciplinario de Biología Vegetal; Argentina
Fil: Agnese, Mariel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto Multidisciplinario de Biología Vegetal. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas Físicas y Naturales. Instituto Multidisciplinario de Biología Vegetal; Argentina
Fil: Ortega, María Gabriela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto Multidisciplinario de Biología Vegetal. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas Físicas y Naturales. Instituto Multidisciplinario de Biología Vegetal; Argentina
Fil: Pierini, Adriana Beatriz. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Investigaciones En Fisico- Química de Córdoba. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Cs.químicas. Instituto de Investigaciones En Fisico- Química de Córdoba; Argentina
Materia
LYCOPODIUM ALKALOIDS
SAUROXINE
ACETYLCHOLINESTERASE INHIBITORS
MOLECULAR DYNAMICS
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
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Repositorio
CONICET Digital (CONICET)
Institución
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
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The combination of the latter two methodologies indicated that binding in the active site is favored for the active compounds. On the other hand, similar binding energies in both the active and the peripheral sites were obtained for sauroine, thus explaining its experimentally determined lack of activity. MM-GBSA predicted the order of binding energies in agreement with the experimental IC50 valuesFil: Puiatti, Marcelo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Investigaciones En Fisico- Química de Córdoba. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Cs.químicas. Instituto de Investigaciones En Fisico- Química de Córdoba; ArgentinaFil: Borioni, José Luis. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Investigaciones En Fisico- Química de Córdoba. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Cs.químicas. Instituto de Investigaciones En Fisico- Química de Córdoba; ArgentinaFil: Vallejo, Mariana Guadalupe. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto Multidisciplinario de Biología Vegetal. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas Físicas y Naturales. Instituto Multidisciplinario de Biología Vegetal; ArgentinaFil: Cabrera, Jose Luis. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto Multidisciplinario de Biología Vegetal. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas Físicas y Naturales. Instituto Multidisciplinario de Biología Vegetal; ArgentinaFil: Agnese, Mariel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto Multidisciplinario de Biología Vegetal. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas Físicas y Naturales. Instituto Multidisciplinario de Biología Vegetal; ArgentinaFil: Ortega, María Gabriela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto Multidisciplinario de Biología Vegetal. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas Físicas y Naturales. Instituto Multidisciplinario de Biología Vegetal; ArgentinaFil: Pierini, Adriana Beatriz. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Investigaciones En Fisico- Química de Córdoba. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Cs.químicas. Instituto de Investigaciones En Fisico- Química de Córdoba; ArgentinaElsevier Science Inc2013-06info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_6501info:ar-repo/semantics/articuloapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/11336/16386Puiatti, Marcelo; Borioni, José Luis; Vallejo, Mariana Guadalupe; Cabrera, Jose Luis; Agnese, Mariel; et al.; Study of the interaction of Huperzia saururus Lycopodium alkaloids with the Acetylcholinesterase enzyme; Elsevier Science Inc; Journal Of Molecular Graphics & Modelling.; 44; 6-2013; 136-1441093-32631873-4243enginfo:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1093326313001095info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/10.1016/j.jmgm.2013.05.009info:eu-repo/semantics/openAccesshttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/ar/reponame:CONICET Digital (CONICET)instname:Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas2025-09-03T10:02:57Zoai:ri.conicet.gov.ar:11336/16386instacron:CONICETInstitucionalhttp://ri.conicet.gov.ar/Organismo científico-tecnológicoNo correspondehttp://ri.conicet.gov.ar/oai/requestdasensio@conicet.gov.ar; lcarlino@conicet.gov.arArgentinaNo correspondeNo correspondeNo correspondeopendoar:34982025-09-03 10:02:58.008CONICET Digital (CONICET) - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicasfalse
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