Análisis funcional de genes de respuesta a la inoculación con Fusarium en espiga de trigo candeal

Autores
Soresi, Daniela Soledad; Díaz, Marina Lucía; Zappacosta, Diego Carlos; Cuppari, Selva Yanet; Carrera, Alicia Delia
Año de publicación
2017
Idioma
español castellano
Tipo de recurso
documento de conferencia
Estado
versión publicada
Descripción
La fusariosis de la espiga de trigo, causada por Fusarium graminearum genera pérdidas en el rendimiento y contaminación con micotoxinas. La resistencia de las variedades cultivadas de trigo candeal es limitada. La línea resistente LDN(Dic-3A)10 deriva de la var. Langdon de T. turgidum spp. durum por introgresión con T. turgidum ssp dicoccoides (Qfhs.ndsu-3AS). Se busca caracterizar funcionalmente los genes inducidos en LDN(Dic-3A)10 obtenidos del análisis transcriptómico. Se inocularon espigas de Langdon y LDN(Dic-3A)10, se extrajo ARN 72 hs post-inoculación y se secuenció mediante Illumina. Se obtuvieron 126,4 Mi de lecturas de calidad, ensambladas en 178.078 unigenes. Mostraron expresión diferencial 717 unigenes (FDR≤0,001; |FC|≥2.0) siendo 361 inducidos en LDN(Dic-3A)10. De los mismos, el 36,3% presentaron anotación funcional con SwissProt, PFAM o Gene Onthology y fueron mapeados en vías metabólicas utilizando la base Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG). Entre los unigenes con mayor expresión significativa en LDN(Dic-3A)10 encontramos tirosina/DOPA decarboxilasa (asociada a la biosíntesis de metabolitos secundarios), 1-aminociclopropano-1-carboxilato oxidasa (biosíntesis de etileno) y heat shock 70kDa (protección frente a estrés). También se encuentran inducidos unigenes de resistencia (genes R) con dominios NBS-LRR (reconocimiento del patógeno e inicio de la respuesta de defensa), UDP-glucosiltransferasa (degradación de toxina) y ascorbato peroxidasa (degradación de especies reactivas de oxígeno). Además, se identificaron los factores de transcripción FRS (asociados a la transducción de señales luminosas), ARF (crecimiento celular) y NAC (respuesta a condiciones de estrés). Los genes identificados se asocian a la generación de resistencia que confiere el segmento Qfhs.ndsu-3AS.
Fil: Soresi, Daniela Soledad. Universidad Nacional del Sur. Departamento de Biología, Bioquímica y Farmacia; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Bahía Blanca. Centro de Recursos Naturales Renovables de la Zona Semiárida. Universidad Nacional del Sur. Centro de Recursos Naturales Renovables de la Zona Semiárida; Argentina
Fil: Díaz, Marina Lucía. Universidad Nacional del Sur. Departamento de Biología, Bioquímica y Farmacia; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Bahía Blanca. Centro de Recursos Naturales Renovables de la Zona Semiárida. Universidad Nacional del Sur. Centro de Recursos Naturales Renovables de la Zona Semiárida; Argentina
Fil: Zappacosta, Diego Carlos. Universidad Nacional del Sur. Departamento de Agronomía; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Bahía Blanca. Centro de Recursos Naturales Renovables de la Zona Semiárida. Universidad Nacional del Sur. Centro de Recursos Naturales Renovables de la Zona Semiárida; Argentina
Fil: Cuppari, Selva Yanet. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Bahía Blanca. Centro de Recursos Naturales Renovables de la Zona Semiárida. Universidad Nacional del Sur. Centro de Recursos Naturales Renovables de la Zona Semiárida; Argentina
Fil: Carrera, Alicia Delia. Universidad Nacional del Sur. Departamento de Agronomía; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Bahía Blanca. Centro de Recursos Naturales Renovables de la Zona Semiárida. Universidad Nacional del Sur. Centro de Recursos Naturales Renovables de la Zona Semiárida; Argentina
Simposio de Genómica Funcional de Plantas
Rosario
Argentina
Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario
Agencia Nacional de Promoción Científica y Tecnológica
Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria
Bolsa de Comercio de Rosario
Materia
Fusariosis de la espiga
Trigo candeal
Expresión diferencial de genes
Transcriptoma
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
Repositorio
CONICET Digital (CONICET)
Institución
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
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Universidad Nacional del Sur. Centro de Recursos Naturales Renovables de la Zona Semiárida; ArgentinaFil: Zappacosta, Diego Carlos. Universidad Nacional del Sur. Departamento de Agronomía; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Bahía Blanca. Centro de Recursos Naturales Renovables de la Zona Semiárida. Universidad Nacional del Sur. Centro de Recursos Naturales Renovables de la Zona Semiárida; ArgentinaFil: Cuppari, Selva Yanet. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Bahía Blanca. Centro de Recursos Naturales Renovables de la Zona Semiárida. Universidad Nacional del Sur. Centro de Recursos Naturales Renovables de la Zona Semiárida; ArgentinaFil: Carrera, Alicia Delia. Universidad Nacional del Sur. Departamento de Agronomía; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Bahía Blanca. 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Fil: Zappacosta, Diego Carlos. Universidad Nacional del Sur. Departamento de Agronomía; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Bahía Blanca. Centro de Recursos Naturales Renovables de la Zona Semiárida. Universidad Nacional del Sur. Centro de Recursos Naturales Renovables de la Zona Semiárida; Argentina
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Fil: Carrera, Alicia Delia. Universidad Nacional del Sur. Departamento de Agronomía; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Bahía Blanca. Centro de Recursos Naturales Renovables de la Zona Semiárida. Universidad Nacional del Sur. Centro de Recursos Naturales Renovables de la Zona Semiárida; Argentina
Simposio de Genómica Funcional de Plantas
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Argentina
Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario
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Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria
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