Cambio en el codigo genético y alto contenido de at en genomas plastídicos de dos plantas holoparásitas (Balanophoraceae)

Autores
Ceriotti, Luis Federico; Roulet, Maria Emilia; Garcia, Laura Evangelina; Sánchez Puerta, María Virginia
Año de publicación
2019
Idioma
español castellano
Tipo de recurso
documento de conferencia
Estado
versión publicada
Descripción
La familia Balanophoraceae (orden Santalales) comprende 14 géneros de plantas holoparasitas de raíces (i.e. plantas no-fotosintéticas y completamente dependientes de su hospedador). En el presente estudio, se ensamblo el genoma plastídico completo y parcial de Ombrophytum subterraneum y Lophophytum mirabile (Balanophoraceae), respectivamente, a partir de la secuenciación masiva de ADN total con la tecnología Illumina. El ensamble de las regiones plastídicas se llevo a cabo en base a las lecturas apareadas utilizando diversas estrategias debido a la complejidad de dicha tarea. Al igual que en otras angiospermas no-fotosintéticas, los genomas plastídicos se caracterizaron por presentar un alto grado de reducción en tamaño y contenido génico, y altos niveles de contenido de AT. Las regiones plastídicas de L. mirabile y O. subterraneum mostraron un contenido de AT de 79,55% y 85,9% en promedio, respectivamente, lo cual dificulto la secuenciación y el posterior ensamble. Los genes que codifican ARN ribosomal y diversas proteínas fueron identificados por genómica comparativa y mostraron altas tasas de sustitución. A partir de la comparación de las secuencias genómicas y del transcriptoma de L. mirabile obtenido por RNAseq, no se observo edición en los transcriptos plastídicos de L. mirabile. Además, se identificó un cambio en el código genético diferente, en el cual el codón TGA (típicamente un codón de stop) codifica para triptofano. Este representa el segundo cambio en el código genético en genomas plastídicos de plantas terrestres.
Fil: Ceriotti, Luis Federico. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mendoza. Instituto de Biología Agrícola de Mendoza. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Biología Agrícola de Mendoza; Argentina
Fil: Roulet, Maria Emilia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mendoza. Instituto de Biología Agrícola de Mendoza. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Biología Agrícola de Mendoza; Argentina. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Agrarias; Argentina
Fil: Garcia, Laura Evangelina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mendoza. Instituto de Biología Agrícola de Mendoza. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Biología Agrícola de Mendoza; Argentina. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Agrarias; Argentina
Fil: Sánchez Puerta, María Virginia. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mendoza. Instituto de Biología Agrícola de Mendoza. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Biología Agrícola de Mendoza; Argentina. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Agrarias; Argentina
III Reunion Argentina de Biologia Evolutiva
Ciudad Autonoma de Buenos Aires
Argentina
Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales
Materia
holoparasita
plastido
genoma
codigo genetico
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
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Repositorio
CONICET Digital (CONICET)
Institución
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
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Al igual que en otras angiospermas no-fotosintéticas, los genomas plastídicos se caracterizaron por presentar un alto grado de reducción en tamaño y contenido génico, y altos niveles de contenido de AT. Las regiones plastídicas de L. mirabile y O. subterraneum mostraron un contenido de AT de 79,55% y 85,9% en promedio, respectivamente, lo cual dificulto la secuenciación y el posterior ensamble. Los genes que codifican ARN ribosomal y diversas proteínas fueron identificados por genómica comparativa y mostraron altas tasas de sustitución. A partir de la comparación de las secuencias genómicas y del transcriptoma de L. mirabile obtenido por RNAseq, no se observo edición en los transcriptos plastídicos de L. mirabile. Además, se identificó un cambio en el código genético diferente, en el cual el codón TGA (típicamente un codón de stop) codifica para triptofano. 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Fil: Ceriotti, Luis Federico. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mendoza. Instituto de Biología Agrícola de Mendoza. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Biología Agrícola de Mendoza; Argentina
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