Aplicação de processamento paralelo no problema de reconhecimento de genes

Autores
Takuno, Leonardo M.; Matsumoto Sato, Liria; Midorikawa, Edson T.
Año de publicación
2004
Idioma
portugués
Tipo de recurso
documento de conferencia
Estado
versión publicada
Descripción
Nos últimos anos, a quantidade de dados biológicos em bancos de dados públicos vem aumentando exponencialmente. Como conseqüência, os algoritmos de análises de dados, em especial algoritmos de predição de genes, estão associados a longos tempos de execução. Neste sentido, a computação paralela é um meio eficaz para diminuir o tempo de execução do processamento de tais análises. Neste artigo, apresentaremos uma solução paralela para o tratamento do problema de reconhecimento de genes, problema este de grande relevância biológica e computacional. Para isso utilizaremos um algoritmo de predição de genes conhecido por Sim4. Este algoritmo foi projetado para alinhar seqüências de DNA complementar (cDNA) com seqüências de DNA genômico, e produzir como resultado uma tabela contendo as localizações das regiões que codificam proteínas.
Eje: IV - Workshop de procesamiento distribuido y paralelo
Red de Universidades con Carreras en Informática (RedUNCI)
Materia
Ciencias Informáticas
Parallel processing
Distributed
Parallel
computação paralela
Sim4
predição de genes
distribuição de dados
aglomerados de computadores
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
Repositorio
SEDICI (UNLP)
Institución
Universidad Nacional de La Plata
OAI Identificador
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Acceder
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