Determinación de la susceptibilidad/resistencia genética a la infección por el Virus de Arteritis Equina (AVE) mediante el estudio de genes del complejo principal de histocompatibi...

Autores
Kalemkerian, Paula Belén
Año de publicación
2014
Idioma
español castellano
Tipo de recurso
tesis doctoral
Estado
versión aceptada
Colaborador/a o director/a de tesis
Echeverría, María Gabriela
Díaz, Silvina
Iglesias, Gabriela
Rambeaud, Magdalena
Kienast, Mariana Eva
Descripción
Las enfermedades infecciosas son resultado de una interacción compleja entre el agente patógeno infeccioso, condiciones del medio ambiente y factores dependientes del hospedador. La arteritis viral equina (AVE) es una enfermedad que afecta a los equinos y puede producir enfermedad subclínica, signos respiratorios o abortos, en la cual entre un 10 y 70% de los padrillos infectados pueden convertirse en portadores persistentes. Esta diferencia de susceptibilidad a la infección podría explicarse por diferencias en la constitución genética. Los estudios de asociación genética permiten detectar los genes involucrados mediante la comparación de variantes génicas en los individuos infectados y no infectados. Los genes del Complejo Mayor de Histocompatibilidad (MHC, según sus siglas en inglés) son los principales candidatos para estos estudios de asociación, dado que codifican proteínas que desempeñan una función en la respuesta inmune innata y adaptativa. El objetivo del trabajo consistió en identificar posibles asociaciones entre genes del MHC equino y resistencia/susceptibilidad a la infección por el virus de arteritis equina. Se seleccionaron muestras de sangre y suero de equinos previamente clasificados como seronegativos o seropositivos a AVE. Se tipificaron los genes ELA-DRA y TNF-α y los marcadores microsatélites Lex52, UM011 y TKY008, localizados en el MHC equino. Se estimaron las frecuencias génicas y genotípicas y se construyeron los mapas de desequilibrio de ligamiento para determinar haplotipos. La comparación de frecuencias y la estimación de asociación realizada por el denominado “odds ratio” en los grupos seropositivo y seronegativo no mostró diferencias estadísticamente significativas entre los caballos infectados y no infectados y no se pudo establecer asociación entre la condición serológica y los polimorfismos estudiados. No obstante, algunas combinaciones genotípicas y haplotípicas mostraron diferencias en la incidencia entre ambos grupos, por lo que los resultados no son concluyentes y debería extenderse el tamaño de la muestra y genotipificar marcadores y/o genes adicionales para determinar el origen de las diferencias de susceptibilidad observadas.
Infectious diseases are the result of a complex interaction between the infectious pathogen, environmental conditions and host-dependent factors. Several susceptibility differences could be found among individuals of the same population, exposed to the same infectious agent that could be explained by genetic differences. Equine viral arteritis (EVA) is a disease that affects horses causing a systemic infection with variable symptoms, from subclinical infection to respiratory distress and abortions. Between 10 to 70% of the infected stallions can become persistent carriers and spread the virus through the semen. This difference in susceptibility to infection could be explained by differences in genetic constitution. The genetic association studies allow detecting genes involved in the disease by comparing gene variants in infected and uninfected individuals. The genes of the Major Histocompatibility Complex (MHC) are prime candidates for these association studies, given that they encode proteins that play a role in innate and adaptive immune responses. The aim of the study was to identify possible associations between equine MHC genes and resistance / susceptibility to infection with equine arteritis virus. Blood and serum samples from horses previously classified as seronegative or seropositive to EVA were selected. ELA-DRA and TNF-α genes and microsatellite markers Lex52, UM011 and TKY008, located in the equine MHC were typed. Gene and genotype frequencies were estimated and linkage disequilibrium maps were constructed to determine haplotypes. Comparison of frequencies and odds ratio in EAV-positive and EAV-negative groups showed no statistically significant differences between infected and uninfected horses and could not be established association between serological status and polymorphisms studied. However, certain genotypic and haplotype combinations showed differences in incidence between the two groups, so the results are not conclusive and should extend the sample size and genotyping additional markers and/or other genes to determine the origin of the observed differences in susceptibility.
Doctor en Ciencias Veterinarias
Universidad Nacional de La Plata
Facultad de Ciencias Veterinarias
Materia
Ciencias Veterinarias
Susceptibilidad genética
Complejo Mayor de Histocompatibilidad
Virus de la Arteritis Equina
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
Repositorio
SEDICI (UNLP)
Institución
Universidad Nacional de La Plata
OAI Identificador
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Esta diferencia de susceptibilidad a la infección podría explicarse por diferencias en la constitución genética. Los estudios de asociación genética permiten detectar los genes involucrados mediante la comparación de variantes génicas en los individuos infectados y no infectados. Los genes del Complejo Mayor de Histocompatibilidad (MHC, según sus siglas en inglés) son los principales candidatos para estos estudios de asociación, dado que codifican proteínas que desempeñan una función en la respuesta inmune innata y adaptativa. El objetivo del trabajo consistió en identificar posibles asociaciones entre genes del MHC equino y resistencia/susceptibilidad a la infección por el virus de arteritis equina. Se seleccionaron muestras de sangre y suero de equinos previamente clasificados como seronegativos o seropositivos a AVE. Se tipificaron los genes ELA-DRA y TNF-α y los marcadores microsatélites Lex52, UM011 y TKY008, localizados en el MHC equino. Se estimaron las frecuencias génicas y genotípicas y se construyeron los mapas de desequilibrio de ligamiento para determinar haplotipos. La comparación de frecuencias y la estimación de asociación realizada por el denominado “odds ratio” en los grupos seropositivo y seronegativo no mostró diferencias estadísticamente significativas entre los caballos infectados y no infectados y no se pudo establecer asociación entre la condición serológica y los polimorfismos estudiados. No obstante, algunas combinaciones genotípicas y haplotípicas mostraron diferencias en la incidencia entre ambos grupos, por lo que los resultados no son concluyentes y debería extenderse el tamaño de la muestra y genotipificar marcadores y/o genes adicionales para determinar el origen de las diferencias de susceptibilidad observadas.Infectious diseases are the result of a complex interaction between the infectious pathogen, environmental conditions and host-dependent factors. Several susceptibility differences could be found among individuals of the same population, exposed to the same infectious agent that could be explained by genetic differences. Equine viral arteritis (EVA) is a disease that affects horses causing a systemic infection with variable symptoms, from subclinical infection to respiratory distress and abortions. Between 10 to 70% of the infected stallions can become persistent carriers and spread the virus through the semen. This difference in susceptibility to infection could be explained by differences in genetic constitution. The genetic association studies allow detecting genes involved in the disease by comparing gene variants in infected and uninfected individuals. The genes of the Major Histocompatibility Complex (MHC) are prime candidates for these association studies, given that they encode proteins that play a role in innate and adaptive immune responses. 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Infectious diseases are the result of a complex interaction between the infectious pathogen, environmental conditions and host-dependent factors. Several susceptibility differences could be found among individuals of the same population, exposed to the same infectious agent that could be explained by genetic differences. Equine viral arteritis (EVA) is a disease that affects horses causing a systemic infection with variable symptoms, from subclinical infection to respiratory distress and abortions. Between 10 to 70% of the infected stallions can become persistent carriers and spread the virus through the semen. This difference in susceptibility to infection could be explained by differences in genetic constitution. The genetic association studies allow detecting genes involved in the disease by comparing gene variants in infected and uninfected individuals. The genes of the Major Histocompatibility Complex (MHC) are prime candidates for these association studies, given that they encode proteins that play a role in innate and adaptive immune responses. The aim of the study was to identify possible associations between equine MHC genes and resistance / susceptibility to infection with equine arteritis virus. Blood and serum samples from horses previously classified as seronegative or seropositive to EVA were selected. ELA-DRA and TNF-α genes and microsatellite markers Lex52, UM011 and TKY008, located in the equine MHC were typed. Gene and genotype frequencies were estimated and linkage disequilibrium maps were constructed to determine haplotypes. Comparison of frequencies and odds ratio in EAV-positive and EAV-negative groups showed no statistically significant differences between infected and uninfected horses and could not be established association between serological status and polymorphisms studied. However, certain genotypic and haplotype combinations showed differences in incidence between the two groups, so the results are not conclusive and should extend the sample size and genotyping additional markers and/or other genes to determine the origin of the observed differences in susceptibility.
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