Búsqueda evolutiva de vías metabólicas

Autores
Gerard, Matías; Stegmayer, Georgina; Milone, Diego Humberto
Año de publicación
2010
Idioma
español castellano
Tipo de recurso
documento de conferencia
Estado
versión publicada
Descripción
Los métodos de búsqueda clásicos permiten encontrar secuencias de operadores para producir determinadas transiciones entre estados. En forma similar, los algoritmos evolutivos realizan la búsqueda usando operadores estadísticos y una función de aptitud que evalúa las características de los individuos, explorando múltiples soluciones candidatas a la vez. En bioinformática la búsqueda de vías metabólicas que relacionen dos compuestos es una tarea habitual. En particular esto es de gran interés cuando se quiere descubrir relaciones metabólicas entre compuestos agrupados con técnicas de minería de datos. En este trabajo se propone un algoritmo evolutivo que permite encontrar vías metabólicas entre dos compuestos seleccionados a partir de agrupamientos generados con el modelo IL-SOM. Se describen los operadores empleados, el desarrollo de la función de aptitud y se compara el desempeño del algoritmo propuesto con el de dos métodos clásicos de búsqueda.
Sociedad Argentina de Informática e Investigación Operativa
Materia
Ciencias Informáticas
búsqueda
algoritmo evolutivo
vías metabólicas
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
Repositorio
SEDICI (UNLP)
Institución
Universidad Nacional de La Plata
OAI Identificador
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