Mhc-B haplotypes in “Campero-Inta” chicken synthetic line

Autores
Iglesias, Gabriela Marisa; Canet, Zulma E.; Cantaro, Horacio; Miquel, María C.; Melo, Julián E.; Miller, Marcia M.; Berres, Mark E.; Fulton, Janet E.
Año de publicación
2019
Idioma
inglés
Tipo de recurso
artículo
Estado
versión aceptada
Descripción
Fil: Iglesias, Gabriela M. Universidad Nacional de Río Negro. Sede Alto Valle y Valle Medio. Escuela de Veterinaria y producción agroindustrial. Cátedra de Genética; Argentina.
Fil: Canet, Zulma E. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Veterinarias. Cátedra de Genética; Argentina.
Fil: Canet, Zulma E. INTA Pergamino. Estación Experimental Agropecuaria “Ing. Agr. Walter Kugler”; Argentina
Fil: Cantaro, Horacio. Universidad Nacional de Río Negro. Sede Alto Valle y Valle Medio. Escuela de Veterinaria y producción agroindustrial. Catedra Producción de Aves y Pilíferos; Argentina
Fil: Cantaro, Horacio. INTA. Proyecto Nacional de Avicultura (PAVI). Estación Experimental Agropecuaria Alto Valle. Programa Nacional de Producción Animal; Argentina
Fil: Miquel, María C. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Veterinarias. Cátedra de Genética; Argentina
Fil: Melo, Julián E. Universidad Católica Pontificia Argentina (UCA), Facultad de Ciencias Agrícolas; Argentina
Fil: Melo, Julián E. Universidad Nacional de Luján (UNLu), Departamento de tecnología; Argentina
Fil: Miller, Marcia M. Department of Molecular and Cellular Biology, Beckman Research Institute of the City of Hope; California
Fil: Berres, Mark E. University of Wisconsin. Biotechnology Center; Estados Unidos
Fil: Fulton, Janet E. Hy-Line International; Estados Unidos
Fil: Fulton, Janet E. University of Wisconsin. Biotechnology Center; Estados Unidos
The major histocompatibility complex-B (MHC-B) in chickens is a cluster of genes located on chromosome 16. The chicken MHC-B is known to be highly associated with resistance to numerous diseases caused by viruses, bacteria, and parasitic pathogens. Since the level of resistance varies with MHC-B haplotypes, identification and classification of different haplotypes within lines is important for sustaining lines. The “Campero-INTA” chicken breed is a meat-type free-range poultry breed that was developed specifically for small producers in Argentina. Campero-INTA was started by selection in populations produced by crosses between a variety of established lines. MHC-B variation was examined in 65 samples obtained in 2002 using the VNTR marker LEI0258, a marker for MHC-B region. These samples plus and an additional 55 samples from 2018 were examined for variation using the MHC-B specific SNP panel that encompasses ∼230,000 bp of the MHC-B region. Eleven MHC-B SNP haplotypes with 6 LEI0258 alleles were identified in the 120 samples representing the Campero-INTA AH (male) line. Seven haplotypes originate from the breeds originally used in the development of Campero-INTA AH line. Two appear to be recombinant haplotypes. The origin of the remaining 2 is not known, but may be associated with genes introduced from crosses with the Fayoumi breed conducted more recently to sustain the line.
El principal complejo de histocompatibilidad-B (MHC-B) en los pollos es un grupo de genes ubicados en el cromosoma 16. Se sabe que el MHC-B de pollo está altamente asociado con la resistencia a numerosas enfermedades causadas por virus, bacterias y patógenos parasitarios. Dado que el nivel de resistencia varía con los haplotipos MHC-B, la identificación y clasificación de diferentes haplotipos dentro de las líneas es importante para mantener las líneas. La raza de pollo "Campero-INTA" es una raza de aves de corral que se desarrolla específicamente para pequeños productores en Argentina. Campero-INTA se inició mediante la selección en poblaciones producidas por cruces entre una variedad de líneas establecidas. La variación de MHC-B se examinó en 65 muestras obtenidas en 2002 utilizando el marcador VNTR LEI0258, un marcador para la región MHC-B. Estas muestras más y otras 55 muestras adicionales de 2018 se examinaron para determinar la variación utilizando el panel SNP específico de MHC-B que abarca ∼230,000 pb de la región MHC-B. Se identificaron once haplotipos MHC-B SNP con 6 alelos LEI0258 en las 120 muestras que representan la línea Campero-INTA AH (masculina). Siete haplotipos se originan de las razas originalmente utilizadas en el desarrollo de la línea Campero-INTA AH. Dos parecen ser haplotipos recombinantes. Se desconoce el origen de los 2 restantes, pero puede estar asociado con genes introducidos a partir de cruces con la raza Fayoumi realizados más recientemente para mantener la línea.
Materia
Genetica, produccion animal
MHC-B, Chickens
Campero-INTA
Haplotypes
SNPs
LEI0258
Fayoumi
Genetica, produccion animal
Nivel de accesibilidad
acceso restringido
Condiciones de uso
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
Repositorio
RID-UNRN (UNRN)
Institución
Universidad Nacional de Río Negro
OAI Identificador
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Estación Experimental Agropecuaria Alto Valle. Programa Nacional de Producción Animal; ArgentinaFil: Miquel, María C. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Veterinarias. Cátedra de Genética; ArgentinaFil: Melo, Julián E. Universidad Católica Pontificia Argentina (UCA), Facultad de Ciencias Agrícolas; ArgentinaFil: Melo, Julián E. Universidad Nacional de Luján (UNLu), Departamento de tecnología; ArgentinaFil: Miller, Marcia M. Department of Molecular and Cellular Biology, Beckman Research Institute of the City of Hope; CaliforniaFil: Berres, Mark E. University of Wisconsin. Biotechnology Center; Estados UnidosFil: Fulton, Janet E. Hy-Line International; Estados UnidosFil: Fulton, Janet E. University of Wisconsin. Biotechnology Center; Estados UnidosThe major histocompatibility complex-B (MHC-B) in chickens is a cluster of genes located on chromosome 16. The chicken MHC-B is known to be highly associated with resistance to numerous diseases caused by viruses, bacteria, and parasitic pathogens. Since the level of resistance varies with MHC-B haplotypes, identification and classification of different haplotypes within lines is important for sustaining lines. The “Campero-INTA” chicken breed is a meat-type free-range poultry breed that was developed specifically for small producers in Argentina. Campero-INTA was started by selection in populations produced by crosses between a variety of established lines. MHC-B variation was examined in 65 samples obtained in 2002 using the VNTR marker LEI0258, a marker for MHC-B region. These samples plus and an additional 55 samples from 2018 were examined for variation using the MHC-B specific SNP panel that encompasses ∼230,000 bp of the MHC-B region. Eleven MHC-B SNP haplotypes with 6 LEI0258 alleles were identified in the 120 samples representing the Campero-INTA AH (male) line. Seven haplotypes originate from the breeds originally used in the development of Campero-INTA AH line. Two appear to be recombinant haplotypes. The origin of the remaining 2 is not known, but may be associated with genes introduced from crosses with the Fayoumi breed conducted more recently to sustain the line.El principal complejo de histocompatibilidad-B (MHC-B) en los pollos es un grupo de genes ubicados en el cromosoma 16. Se sabe que el MHC-B de pollo está altamente asociado con la resistencia a numerosas enfermedades causadas por virus, bacterias y patógenos parasitarios. Dado que el nivel de resistencia varía con los haplotipos MHC-B, la identificación y clasificación de diferentes haplotipos dentro de las líneas es importante para mantener las líneas. La raza de pollo "Campero-INTA" es una raza de aves de corral que se desarrolla específicamente para pequeños productores en Argentina. Campero-INTA se inició mediante la selección en poblaciones producidas por cruces entre una variedad de líneas establecidas. La variación de MHC-B se examinó en 65 muestras obtenidas en 2002 utilizando el marcador VNTR LEI0258, un marcador para la región MHC-B. Estas muestras más y otras 55 muestras adicionales de 2018 se examinaron para determinar la variación utilizando el panel SNP específico de MHC-B que abarca ∼230,000 pb de la región MHC-B. Se identificaron once haplotipos MHC-B SNP con 6 alelos LEI0258 en las 120 muestras que representan la línea Campero-INTA AH (masculina). Siete haplotipos se originan de las razas originalmente utilizadas en el desarrollo de la línea Campero-INTA AH. Dos parecen ser haplotipos recombinantes. 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The major histocompatibility complex-B (MHC-B) in chickens is a cluster of genes located on chromosome 16. The chicken MHC-B is known to be highly associated with resistance to numerous diseases caused by viruses, bacteria, and parasitic pathogens. Since the level of resistance varies with MHC-B haplotypes, identification and classification of different haplotypes within lines is important for sustaining lines. The “Campero-INTA” chicken breed is a meat-type free-range poultry breed that was developed specifically for small producers in Argentina. Campero-INTA was started by selection in populations produced by crosses between a variety of established lines. MHC-B variation was examined in 65 samples obtained in 2002 using the VNTR marker LEI0258, a marker for MHC-B region. These samples plus and an additional 55 samples from 2018 were examined for variation using the MHC-B specific SNP panel that encompasses ∼230,000 bp of the MHC-B region. Eleven MHC-B SNP haplotypes with 6 LEI0258 alleles were identified in the 120 samples representing the Campero-INTA AH (male) line. Seven haplotypes originate from the breeds originally used in the development of Campero-INTA AH line. Two appear to be recombinant haplotypes. The origin of the remaining 2 is not known, but may be associated with genes introduced from crosses with the Fayoumi breed conducted more recently to sustain the line.
El principal complejo de histocompatibilidad-B (MHC-B) en los pollos es un grupo de genes ubicados en el cromosoma 16. Se sabe que el MHC-B de pollo está altamente asociado con la resistencia a numerosas enfermedades causadas por virus, bacterias y patógenos parasitarios. Dado que el nivel de resistencia varía con los haplotipos MHC-B, la identificación y clasificación de diferentes haplotipos dentro de las líneas es importante para mantener las líneas. La raza de pollo "Campero-INTA" es una raza de aves de corral que se desarrolla específicamente para pequeños productores en Argentina. Campero-INTA se inició mediante la selección en poblaciones producidas por cruces entre una variedad de líneas establecidas. La variación de MHC-B se examinó en 65 muestras obtenidas en 2002 utilizando el marcador VNTR LEI0258, un marcador para la región MHC-B. Estas muestras más y otras 55 muestras adicionales de 2018 se examinaron para determinar la variación utilizando el panel SNP específico de MHC-B que abarca ∼230,000 pb de la región MHC-B. Se identificaron once haplotipos MHC-B SNP con 6 alelos LEI0258 en las 120 muestras que representan la línea Campero-INTA AH (masculina). Siete haplotipos se originan de las razas originalmente utilizadas en el desarrollo de la línea Campero-INTA AH. Dos parecen ser haplotipos recombinantes. Se desconoce el origen de los 2 restantes, pero puede estar asociado con genes introducidos a partir de cruces con la raza Fayoumi realizados más recientemente para mantener la línea.
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