Metagenómica en enfermedades inflamatorias intestinales crónicas.

• Autores: Penas Steinhardt, Alberto
• Año de publicación: 2020
• Idioma: español castellano
• Tipo de recurso: informe técnico
• Materia: GASTROENTEROLOGIA; ENFERMEDAD INFLAMATORIA INTESTINAL
• Institución: Fundación H. A. Barceló

Fil: Penas Steinhardt, Alberto. Instituto Universitario de Ciencias de la Salud. Fundación Barceló; Argentina.
Fil: La microbiota intestinal está implicada en diversas patologias humanas. La colitis ulcerosa (CU) es una enfermedad inflamatoria intestinal crónica. Aunque se desconoce la causa específica, se han definido algunos factores genéticos y ambientales. El propósito de este estudio fue investigar si había diferencias en la microbiota intestinal en pacientes argentinos con CU versus controles sin UC. En este sentido, se incluyeron 23 pacientes con CU y 27 controles sanos sin CU, emparejados por sexo, edad e IMC. La extracción de ADN se realizó a partir de 200 mg de heces usando el kit PowerFecalDNAIsolation (Qiagen). Las regiones hipervariables V3-V4 del gen bacteriano 16S se secuenciaron usando el sistema MiSeq-Illumina. Las secuencias generadas se analizaron utilizando el conocimiento cuantitativo de la ecología microbiana (QIIME) versión 1.9.1 del paquete de software. Para comparar la abundancia relativa de taxones entre grupos, realizamos un efecto de análisis discriminante lineal (LDA) implementado en LEfSe. La diversidad alfa no difirió entre los pacientes con CU y los controles sin CU. Sin embargo, encontramos que los pacientes con CU difieren de los controles sin CU en la estructura comunitaria observada. En pacientes con CU, los filamentos dominantes fueron Bacteroidetes (43.49 ± 20.18%), Firmicutes (48.94 ± 18.61%), Proteobacterias (4.13 ± 7.12%), Actinobacterias (2.12 ± 1.97%) y Verrucomicrobia (0.38 ± 1.01%), mientras que las principales Los phyla encontrados en los controles fueron Bacteroidetes (60.06 ± 13.540%), Firmicutes (32.82 ± 13.51%), Proteobacterias (4.27 ± 3.32%), Verrucomicrobia (1.45 ± 3.18%) y Actinobacterias (0.81 ± 1.46%). El análisis discriminante lineal ( El método de tamaño del efecto LDA (LEfSe) reveló que los géneros Bacteroides y Akkermansia fueron más altos en el control sin CU y Bifidobacterium, Eubacterium, Lactobacillus, Collinsella, Peptostreptococcus, Actinomyces, Streptococcus, Slackia y Dialister en pacientes con CU (p <0.05, puntaje LDA > 2). Nuestros resultados demostraron que había diferencias en la microbiota intestinal en pacientes con CU. Estos hallazgos podrían proporcionar las bases para comprender mejor la relación causa-efecto entre comunidades microbianas y CU en la población argentina.