Reverse vaccinology approach for identification and prioritization of antigen candidates for a vaccine against a poultry pathogen

• Autores: Felici, María Esperanza; Huberman, Yosef Daniel; Belkys Maletto, Angélica; Quiroga, Rodrigo
• Año de publicación: 2022
• Idioma: inglés
• Tipo de recurso: documento de conferencia
• Materia: Avibacterium Paragallinarum
• Institución: Universidad Nacional de Córdoba

Fil: Felici, María Esperanza. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Químicas. Departamento de Bioquímica Clínica; Argentina.
Fil: Felici, María Esperanza. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro de Investigaciones en Bioquímica Clínica e Inmunología; Argentina.
Fil: Huberman, Yosef Daniel. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria; Argentina.
Fil: Maletto, Belkys Angelica. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Químicas. Departamento de Bioquímica Clínica; Argentina.
Fil: Maletto, Belkys Angelica. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro de Investigaciones en Bioquímica Clínica e Inmunología.
Fil: Quiroga, Rodrigo. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Químicas. Departamento de Química Teórica y Computacional; Argentina.
Fil: Quiroga, Rodrigo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Investigaciones en Fisicoquímica de Córdoba.
Avibacterium paragallinarum es el agente causal de la coriza infecciosa, una enfermedad aguda que afecta el sistema respiratorio superior de los pollos. Esta bacteria gramnegativa está ampliamente distribuida en los sistemas de producción avícola de todo el mundo, causando importantes pérdidas económicas. A pesar de que la vacunación es la principal forma de prevención, las vacunas disponibles comercialmente muestran una protección incompleta contra cepas no incluidas en la formulación. Como primer paso para desarrollar una vacuna más eficaz, implementamos estrategias de vaccinología inversa para identificar posibles antígenos presentes en 28 cepas de Av. paragallinarum. Se utilizaron genómica comparativa y sustractiva, y la predicción de varios atributos proteicos (conservación de secuencia, antigenicidad, esencialidad, homología con el hospedador, localización subcelular y probabilidad de adhesina, entre otras características) para delimitar la población. Asignar y priorizar proteínas con facilidad de expresión y potencial de protección. Para validar este flujo de trabajo computacional, se aplicó la misma secuencia a un conjunto de datos de 1085 proteínas con antigenicidad conocida experimentalmente, recopiladas de la literatura publicada y diversas bases de datos de antígenos y/o epítopos. Entre los posibles antígenos (~4% del proteoma de cada cepa), 25 proteínas se conservaron en todas las cepas. El factor de ensamblaje de proteínas de membrana externa BamA, la porina OmpA, la proteína de la familia TolC, el módulo de ensamblaje por translocación TamB y la proteína de ensamblaje de LPS LptD se clasificaron como los candidatos más destacados, cumpliendo con todos los criterios establecidos. Además, más del 27% del conjunto de datos de control positivo se identificó correctamente como antígenos potencialmente protectores. A pesar de que las restricciones impuestas conllevaron la pérdida de muchos antígenos verificados experimentalmente, los criterios restrictivos aplicados resultaron útiles para nuestro objetivo de priorización de proteínas. Si bien aún se requieren pruebas in vivo, este estudio proporciona una base para el desarrollo de una nueva vacuna de subunidades contra Av. paragallinarum.
https://www.medicinabuenosaires.com/revistas/vol82-22/s5/1s5.pdf
Fil: Felici, María Esperanza. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Químicas. Departamento de Bioquímica Clínica; Argentina.
Fil: Felici, María Esperanza. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro de Investigaciones en Bioquímica Clínica e Inmunología; Argentina.
Fil: Huberman, Yosef Daniel. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria; Argentina.
Fil: Maletto, Belkys Angelica. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Químicas. Departamento de Bioquímica Clínica; Argentina.
Fil: Maletto, Belkys Angelica. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro de Investigaciones en Bioquímica Clínica e Inmunología.
Fil: Quiroga, Rodrigo. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Químicas. Departamento de Química Teórica y Computacional; Argentina.
Fil: Quiroga, Rodrigo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Investigaciones en Fisicoquímica de Córdoba.
Ciencias Veterinarias