Increasing the digital repository of DNA barcoding sequences of sand flies (Psychodidae: Phlebotominae)

Autores
Laurito, Magdalena; Ontivero, Iliana M.; Almirón, Walter R.
Año de publicación
2019
Idioma
inglés
Tipo de recurso
artículo
Estado
versión publicada
Descripción
Fil: Laurito, Magdalena. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas, Físicas y Naturales. Centro de Investigaciones Entomológicas de Córdoba; Argentina.
Fil: Laurito, Magdalena. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Investigaciones Biológicas y Tecnológicas; Argentina.
Fil: Ontivero, Iliana M. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas, Físicas y Naturales. Centro de Investigaciones Entomológicas de Córdoba; Argentina.
Fil: Almirón, Walter R. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas, Físicas y Naturales. Centro de Investigaciones Entomológicas de Córdoba; Argentina.
Fil: Almirón, Walter R. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Investigaciones Biológicas y Tecnológicas; Argentina.
Sand fly identification is complex because it depends on the expertise of the taxonomist. The females show subtle morphological differences and the occurrence of the species complexes are usual in this taxon. Therefore, a fragment of the cytochrome c oxidase subunit I (COI) gene is used for taxon barcoding to resolve this kind of problem. This study incorporates barcode sequences, for the first time, for Evandromyia cortelezzii and Migonemyia migonei from Argentina. The nucleotide sequence divergences were estimated to generate a neighbour-joining (NJ) tree. The automatic barcode gap discovery (ABGD) approach was employed to find the barcode gaps and the operational taxonomic unit (OTU) delimitation. Other species of the subtribe were included. The frequency histogram of divergences showed a barcoding gap. The ABGD analysis identified 14 operational taxonomic units (OTUs) from 13 morphological species. Sequences of Ev. cortelezzii and Mg. migonei formed well supported clusters and were diagnosed as primary species. These sequences are useful tools for molecular identification of the sand flies of the New World.
http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0074-02762019000100421&tlng=en
publishedVersion
Fil: Laurito, Magdalena. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas, Físicas y Naturales. Centro de Investigaciones Entomológicas de Córdoba; Argentina.
Fil: Laurito, Magdalena. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Investigaciones Biológicas y Tecnológicas; Argentina.
Fil: Ontivero, Iliana M. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas, Físicas y Naturales. Centro de Investigaciones Entomológicas de Córdoba; Argentina.
Fil: Almirón, Walter R. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas, Físicas y Naturales. Centro de Investigaciones Entomológicas de Córdoba; Argentina.
Fil: Almirón, Walter R. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Investigaciones Biológicas y Tecnológicas; Argentina.
Zoología, Ornitología, Entomología, Etología
Materia
DNA barcoding
Evandromyia cortelezzii
Species delimitation
Migonemyia migonei
NATURAL SCIENCES
Entomología
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
Repositorio
Repositorio Digital Universitario (UNC)
Institución
Universidad Nacional de Córdoba
OAI Identificador
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Acceder
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Sand fly identification is complex because it depends on the expertise of the taxonomist. The females show subtle morphological differences and the occurrence of the species complexes are usual in this taxon. Therefore, a fragment of the cytochrome c oxidase subunit I (COI) gene is used for taxon barcoding to resolve this kind of problem. This study incorporates barcode sequences, for the first time, for Evandromyia cortelezzii and Migonemyia migonei from Argentina. The nucleotide sequence divergences were estimated to generate a neighbour-joining (NJ) tree. The automatic barcode gap discovery (ABGD) approach was employed to find the barcode gaps and the operational taxonomic unit (OTU) delimitation. Other species of the subtribe were included. The frequency histogram of divergences showed a barcoding gap. The ABGD analysis identified 14 operational taxonomic units (OTUs) from 13 morphological species. Sequences of Ev. cortelezzii and Mg. migonei formed well supported clusters and were diagnosed as primary species. These sequences are useful tools for molecular identification of the sand flies of the New World.
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