Genómica comparativa y funcional aplicada a los mecanismos involucrados en el desarrollo hacia la extrema y pandroga resistencia antibiótica

Autores
Álvarez, Verónica Elizabeth
Año de publicación
2019
Idioma
español castellano
Tipo de recurso
tesis doctoral
Estado
versión aceptada
Colaborador/a o director/a de tesis
Quiroga, María Paula
Power, Pablo
Centrón, Daniela
Mollerach, Marta
Soria, Marcelo
Viale, Alejandro
Descripción
We took the class 1 integrons as a biological model to study the mechanisms of the Horizontal Gene Transfer of Antimicrobial Resistance Genes. These genetic elements are associated with the Multidrug Resistance (MDR). The intI1 gene was maintained in clinical strains belonging to lineages with epidemic behavior for more than 900 generations. Bioinformatics studies evidenced a dynamic flow of intI1 gene alleles in particular in human niches that have probably allowed their expansion since the appearance of humans due to vertical inheritance. When analyzing the adaptation of P. aeruginosa to the lung of a patient with Cystic Fibrosis during chronic colonization, we identified that mobile resistance acquisition events occurred simultaneously with genomic reduction. These events conferred a new genomic island named PApGI which has a class 1 integron carrying the gene cassette blaVIM-2. This gene is maintained over time in more than 1000 generations which makes genomic island PApGI an important reservoir that can potentially be transferred to other strains. These results demonstrate the adaptive role that class 1 integrons confer to diverse species and habitats, including chronic infections of P. aeruginosa.
Fil: Álvarez, Verónica Elizabeth. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Buenos Aires, Argentina
Tomamos como modelo biológico para estudiar los mecanismos de la Transferencia Horizontal Genética de Genes de Resistencia a Antibióticos a los integrones de clase 1, los cuales están asociados a la Multidroga Resistencia Antibiótica (MDRA). El gen intI1 se mantuvo en cepas clínicas pertenecientes a linajes con comportamiento epidémico por más de 900 generaciones. Mediante estudios de bioinformática evidenciamos un flujo dinámico de los alelos del gen intI1 en particular en nichos humanos que han permitido probablemente su expansión desde la aparición de los seres humanos por herencia vertical. Al analizar la adaptación de P. aeruginosa al pulmón de un paciente con Fibrosis Quística durante la colonización crónica, identificamos que simultáneamente a la reducción genómica, ocurrían eventos de adquisición de resistencia móvil, conferida por una nueva isla genómica PApGI, que posee embebido un integrón de clase 1 con el gen cassette blaVIM-2. Dicho gen se mantiene a través del tiempo en más de 1000 generaciones, lo cual la convierte en un importante reservorio que potencialmente puede ser trasferido a otras cepas. Estos resultados evidencian el rol adaptativo que confieren los integrones de clase 1 a diversas especies y hábitats, incluyendo las infecciones crónicas de P. aeruginosa.
Ciencias Biológicas
Doctora de la Universidad de Buenos Aires en Farmacia y Bioquímica
Materia
Resistencia antibiótica
Integrones
Multidroga resistencia antibiótica
Genes de resistencia antibiótica
Transferencia horizontal genética
Ciencias de la vida
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/ar/
Repositorio
Repositorio Digital Institucional de la Universidad de Buenos Aires
Institución
Universidad de Buenos Aires
OAI Identificador
oai:RDI UBA:posgraafa:HWA_5792

id RDIUBA_a17bbb54692d94e60ac649eb1b878551
oai_identifier_str oai:RDI UBA:posgraafa:HWA_5792
network_acronym_str RDIUBA
repository_id_str
network_name_str Repositorio Digital Institucional de la Universidad de Buenos Aires
spelling Genómica comparativa y funcional aplicada a los mecanismos involucrados en el desarrollo hacia la extrema y pandroga resistencia antibióticaÁlvarez, Verónica ElizabethResistencia antibióticaIntegronesMultidroga resistencia antibióticaGenes de resistencia antibióticaTransferencia horizontal genéticaCiencias de la vidaWe took the class 1 integrons as a biological model to study the mechanisms of the Horizontal Gene Transfer of Antimicrobial Resistance Genes. These genetic elements are associated with the Multidrug Resistance (MDR). The intI1 gene was maintained in clinical strains belonging to lineages with epidemic behavior for more than 900 generations. Bioinformatics studies evidenced a dynamic flow of intI1 gene alleles in particular in human niches that have probably allowed their expansion since the appearance of humans due to vertical inheritance. When analyzing the adaptation of P. aeruginosa to the lung of a patient with Cystic Fibrosis during chronic colonization, we identified that mobile resistance acquisition events occurred simultaneously with genomic reduction. These events conferred a new genomic island named PApGI which has a class 1 integron carrying the gene cassette blaVIM-2. This gene is maintained over time in more than 1000 generations which makes genomic island PApGI an important reservoir that can potentially be transferred to other strains. These results demonstrate the adaptive role that class 1 integrons confer to diverse species and habitats, including chronic infections of P. aeruginosa.Fil: Álvarez, Verónica Elizabeth. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Buenos Aires, ArgentinaTomamos como modelo biológico para estudiar los mecanismos de la Transferencia Horizontal Genética de Genes de Resistencia a Antibióticos a los integrones de clase 1, los cuales están asociados a la Multidroga Resistencia Antibiótica (MDRA). El gen intI1 se mantuvo en cepas clínicas pertenecientes a linajes con comportamiento epidémico por más de 900 generaciones. Mediante estudios de bioinformática evidenciamos un flujo dinámico de los alelos del gen intI1 en particular en nichos humanos que han permitido probablemente su expansión desde la aparición de los seres humanos por herencia vertical. Al analizar la adaptación de P. aeruginosa al pulmón de un paciente con Fibrosis Quística durante la colonización crónica, identificamos que simultáneamente a la reducción genómica, ocurrían eventos de adquisición de resistencia móvil, conferida por una nueva isla genómica PApGI, que posee embebido un integrón de clase 1 con el gen cassette blaVIM-2. Dicho gen se mantiene a través del tiempo en más de 1000 generaciones, lo cual la convierte en un importante reservorio que potencialmente puede ser trasferido a otras cepas. Estos resultados evidencian el rol adaptativo que confieren los integrones de clase 1 a diversas especies y hábitats, incluyendo las infecciones crónicas de P. aeruginosa.Ciencias BiológicasDoctora de la Universidad de Buenos Aires en Farmacia y BioquímicaUniversidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y BioquímicaQuiroga, María PaulaPower, PabloCentrón, DanielaMollerach, MartaSoria, MarceloViale, Alejandro2019-03-22info:eu-repo/semantics/doctoralThesisinfo:eu-repo/semantics/acceptedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_db06info:ar-repo/semantics/tesisDoctoralapplication/pdfhttp://repositoriouba.sisbi.uba.ar/gsdl/cgi-bin/library.cgi?a=d&c=posgraafa&cl=CL1&d=HWA_5792https://repositoriouba.sisbi.uba.ar/gsdl/collect/posgraafa/index/assoc/HWA_5792.dir/5792.PDFspainfo:eu-repo/semantics/openAccesshttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/ar/reponame:Repositorio Digital Institucional de la Universidad de Buenos Airesinstname:Universidad de Buenos Aires2025-09-04T11:43:41Zoai:RDI UBA:posgraafa:HWA_5792instacron:UBAInstitucionalhttp://repositoriouba.sisbi.uba.ar/Universidad públicahttps://www.uba.ar/http://repositoriouba.sisbi.uba.ar/gsdl/cgi-bin/oaiserver.cgicferrando@sisbi.uba.arArgentinaopendoar:2025-09-04 11:43:42.183Repositorio Digital Institucional de la Universidad de Buenos Aires - Universidad de Buenos Airesfalse
dc.title.none.fl_str_mv Genómica comparativa y funcional aplicada a los mecanismos involucrados en el desarrollo hacia la extrema y pandroga resistencia antibiótica
title Genómica comparativa y funcional aplicada a los mecanismos involucrados en el desarrollo hacia la extrema y pandroga resistencia antibiótica
spellingShingle Genómica comparativa y funcional aplicada a los mecanismos involucrados en el desarrollo hacia la extrema y pandroga resistencia antibiótica
Álvarez, Verónica Elizabeth
Resistencia antibiótica
Integrones
Multidroga resistencia antibiótica
Genes de resistencia antibiótica
Transferencia horizontal genética
Ciencias de la vida
title_short Genómica comparativa y funcional aplicada a los mecanismos involucrados en el desarrollo hacia la extrema y pandroga resistencia antibiótica
title_full Genómica comparativa y funcional aplicada a los mecanismos involucrados en el desarrollo hacia la extrema y pandroga resistencia antibiótica
title_fullStr Genómica comparativa y funcional aplicada a los mecanismos involucrados en el desarrollo hacia la extrema y pandroga resistencia antibiótica
title_full_unstemmed Genómica comparativa y funcional aplicada a los mecanismos involucrados en el desarrollo hacia la extrema y pandroga resistencia antibiótica
title_sort Genómica comparativa y funcional aplicada a los mecanismos involucrados en el desarrollo hacia la extrema y pandroga resistencia antibiótica
dc.creator.none.fl_str_mv Álvarez, Verónica Elizabeth
author Álvarez, Verónica Elizabeth
author_facet Álvarez, Verónica Elizabeth
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Quiroga, María Paula
Power, Pablo
Centrón, Daniela
Mollerach, Marta
Soria, Marcelo
Viale, Alejandro
dc.subject.none.fl_str_mv Resistencia antibiótica
Integrones
Multidroga resistencia antibiótica
Genes de resistencia antibiótica
Transferencia horizontal genética
Ciencias de la vida
topic Resistencia antibiótica
Integrones
Multidroga resistencia antibiótica
Genes de resistencia antibiótica
Transferencia horizontal genética
Ciencias de la vida
dc.description.none.fl_txt_mv We took the class 1 integrons as a biological model to study the mechanisms of the Horizontal Gene Transfer of Antimicrobial Resistance Genes. These genetic elements are associated with the Multidrug Resistance (MDR). The intI1 gene was maintained in clinical strains belonging to lineages with epidemic behavior for more than 900 generations. Bioinformatics studies evidenced a dynamic flow of intI1 gene alleles in particular in human niches that have probably allowed their expansion since the appearance of humans due to vertical inheritance. When analyzing the adaptation of P. aeruginosa to the lung of a patient with Cystic Fibrosis during chronic colonization, we identified that mobile resistance acquisition events occurred simultaneously with genomic reduction. These events conferred a new genomic island named PApGI which has a class 1 integron carrying the gene cassette blaVIM-2. This gene is maintained over time in more than 1000 generations which makes genomic island PApGI an important reservoir that can potentially be transferred to other strains. These results demonstrate the adaptive role that class 1 integrons confer to diverse species and habitats, including chronic infections of P. aeruginosa.
Fil: Álvarez, Verónica Elizabeth. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Buenos Aires, Argentina
Tomamos como modelo biológico para estudiar los mecanismos de la Transferencia Horizontal Genética de Genes de Resistencia a Antibióticos a los integrones de clase 1, los cuales están asociados a la Multidroga Resistencia Antibiótica (MDRA). El gen intI1 se mantuvo en cepas clínicas pertenecientes a linajes con comportamiento epidémico por más de 900 generaciones. Mediante estudios de bioinformática evidenciamos un flujo dinámico de los alelos del gen intI1 en particular en nichos humanos que han permitido probablemente su expansión desde la aparición de los seres humanos por herencia vertical. Al analizar la adaptación de P. aeruginosa al pulmón de un paciente con Fibrosis Quística durante la colonización crónica, identificamos que simultáneamente a la reducción genómica, ocurrían eventos de adquisición de resistencia móvil, conferida por una nueva isla genómica PApGI, que posee embebido un integrón de clase 1 con el gen cassette blaVIM-2. Dicho gen se mantiene a través del tiempo en más de 1000 generaciones, lo cual la convierte en un importante reservorio que potencialmente puede ser trasferido a otras cepas. Estos resultados evidencian el rol adaptativo que confieren los integrones de clase 1 a diversas especies y hábitats, incluyendo las infecciones crónicas de P. aeruginosa.
Ciencias Biológicas
Doctora de la Universidad de Buenos Aires en Farmacia y Bioquímica
description We took the class 1 integrons as a biological model to study the mechanisms of the Horizontal Gene Transfer of Antimicrobial Resistance Genes. These genetic elements are associated with the Multidrug Resistance (MDR). The intI1 gene was maintained in clinical strains belonging to lineages with epidemic behavior for more than 900 generations. Bioinformatics studies evidenced a dynamic flow of intI1 gene alleles in particular in human niches that have probably allowed their expansion since the appearance of humans due to vertical inheritance. When analyzing the adaptation of P. aeruginosa to the lung of a patient with Cystic Fibrosis during chronic colonization, we identified that mobile resistance acquisition events occurred simultaneously with genomic reduction. These events conferred a new genomic island named PApGI which has a class 1 integron carrying the gene cassette blaVIM-2. This gene is maintained over time in more than 1000 generations which makes genomic island PApGI an important reservoir that can potentially be transferred to other strains. These results demonstrate the adaptive role that class 1 integrons confer to diverse species and habitats, including chronic infections of P. aeruginosa.
publishDate 2019
dc.date.none.fl_str_mv 2019-03-22
dc.type.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
info:eu-repo/semantics/acceptedVersion
http://purl.org/coar/resource_type/c_db06
info:ar-repo/semantics/tesisDoctoral
format doctoralThesis
status_str acceptedVersion
dc.identifier.none.fl_str_mv http://repositoriouba.sisbi.uba.ar/gsdl/cgi-bin/library.cgi?a=d&c=posgraafa&cl=CL1&d=HWA_5792
https://repositoriouba.sisbi.uba.ar/gsdl/collect/posgraafa/index/assoc/HWA_5792.dir/5792.PDF
url http://repositoriouba.sisbi.uba.ar/gsdl/cgi-bin/library.cgi?a=d&c=posgraafa&cl=CL1&d=HWA_5792
https://repositoriouba.sisbi.uba.ar/gsdl/collect/posgraafa/index/assoc/HWA_5792.dir/5792.PDF
dc.language.none.fl_str_mv spa
language spa
dc.rights.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/ar/
eu_rights_str_mv openAccess
rights_invalid_str_mv http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/ar/
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica
publisher.none.fl_str_mv Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositorio Digital Institucional de la Universidad de Buenos Aires
instname:Universidad de Buenos Aires
reponame_str Repositorio Digital Institucional de la Universidad de Buenos Aires
collection Repositorio Digital Institucional de la Universidad de Buenos Aires
instname_str Universidad de Buenos Aires
repository.name.fl_str_mv Repositorio Digital Institucional de la Universidad de Buenos Aires - Universidad de Buenos Aires
repository.mail.fl_str_mv cferrando@sisbi.uba.ar
_version_ 1842346706094522368
score 12.623145