Aplicaciones catalíticas de oligonucleótidos modificados

• Autores: Dellafiore, María Andrea
• Año de publicación: 2017
• Idioma: español castellano
• Tipo de recurso: tesis doctoral
• Colaborador/a o director/a de tesis: Iribarren, Adolfo M.; Moglioni, Albertina; Montserrat, Javier M.; Orelli, Liliana; Postigo, José; Furlong, Jorge
• Materia: Oligonucleótidos funcionales; 2'-desoxi-2'-C-metilpirimidin nucleósidos; DNAzima; Aptámero; DNAzima 8-17; DNAzima peroxidasa; siRNA; i-motif; Functional oligonucleotides; 2'-deoxy-2'-C-methylpyrimidin nucleosides; DNAzyme; Aptamer; 8-17 DNAzyme; Peroxidase DNAzyme; siRNA; i-motif; Ciencia de la vida
• Institución: Universidad de Buenos Aires

Oligonucleotides whose function is associated with catalytic or molecular recognition processes\nare known as functional oligonucleotides (ribozymes, DNAzymes, aptamers) and their applications\ninclude gene silencing therapy, diagnostic tools and sensor development, biocatalysis and\nnanotechnology.\nIn this work, we studied how to optimize the use of these oligonucleotides by incorporating\nchemical modifications.\nInitially, we studied the modulating effect of 2'-deoxy-2'-C-methylpyrimidin nucleosides on:\nthe hydrolytic activity and stability in biological media of 8-17 DNAzyme when incorporated in\ndifferent positions of their catalytic core; the silencing potency and specificity of siRNAs when\nincorporated in different positions of the antisense and sense strands; the thermodynamic stability\nof duplex and i-motif-forming DNA.\nFinally, the study was extended to the peroxidase DNAzyme using a fully modified sequence\nwith L-nucleotides and also an immobilized sequence testing a wide repertoire of substrates,\nincluding sulfides and paracetamol.
Fil: Dellafiore, María Andrea. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Buenos Aires, Argentina
Los oligonucleótidos cuya función se encuentra asociada a procesos catalíticos o de\nreconocimiento molecular se los conoce como oligonucleótidos funcionales (ribozimas, DNAzimas,\naptámeros) y sus aplicaciones abarcan el silenciamiento génico, el desarrollo de herramientas de\ndiagnóstico y sensores, la biocatálisis y la nanotecnología.\nEn este trabajo se estudió cómo optimizar el uso de estos oligonucleótidos mediante la\nincorporación de modificaciones químicas.\nInicialmente, se estudió el efecto modulador de 2?-desoxi-2?-C-metilpirimidín nucleósidos\nsobre: la actividad hidrolítica y estabilidad en medios biológicos de la DNAzima 8-17 al ser\nincorporados en distintas posiciones de su núcleo catalítico; la potencia silenciadora y la\nespecificidad de siRNAs al ser incorporados en distintas posiciones de las cadenas antisentido y\nsentido; la estabilidad termodinámica de oligonucleótidos de ADN formadores de dúplex e i-motif.\nPor último, se amplió el estudio a la DNAzima peroxidasa utilizando el oligonucleótido\nmodificado en su totalidad con L-nucleótidos y el oligonucleótido inmovilizado, empleando un\namplio repertorio de sustratos, entre ellos sulfuros y paracetamol.
Química Biológica
Doctora de la Universidad de Buenos Aires en Farmacia y Bioquímica