Contribución de los tipos y variantes de virus Epstein-Barr (EBV) a la detección temprana de los desórdenes linfoproliferativos post-trasplante (PTLD)

Autores
Torrá, Florencia Lucía
Año de publicación
2024
Idioma
español castellano
Tipo de recurso
tesis de maestría
Estado
versión aceptada
Colaborador/a o director/a de tesis
Picconi, María Alejandra
Fellner, María Dolores
Cavallaro, Lucía V.
Preciado, María Victoria
Giordano, Mirta
Descripción
Epstein-Barr virus (EBV) infection is widely distributed in the world and produces a\npersistent infection in B lymphocytes. It is associated with the development of benign and\nmalignant pathologies, including Post-Lymphoproliferative Disorders (PTLD) in transplant patients.\nAccording to genomic heterogeneity, EBV has been classified into viral types (EBV-1 and EBV-2)\nand genetic variants, among them those encoding the EBNA-1 and LMP-1 proteins. Analysis of\nviral genetic variability could identify strains that contribute to the development of PTLD or that\nonly reflect local geographic circulation. The objective of this study was to analyze the genetic\ndiversity of EBV and its relationship with the development of PTLD.\nA cross-sectional study was carried out in the anatomical compartments of viral\npersistence, in which tonsils samples and peripheral blood mononuclear cells (PBMC) from a\npediatric population were analyzed, including: 57 non-transplanted children (Non-Tx), 44\ntransplanted recipients (Tx) and 52 transplanted patients with histological diagnosis of PTLD (Tx-\nPTLD). In addition, an exploratory study on the frequency of appearance of genetic variability was\nperformed: PBMC, which had been taken during the follow-up of 10 transplant patients, 5 of\nwhom developed PTLD, were analyzed. EBV-1 and EBV-2 types and variants in EBNA-1 and LMP-1\nwere determined using PCR/sequencing strategies.\nIn all the groups studied, both viral types were detected, with a frequency of EBV-1\ngreater than 80% and a higher presence of coinfection (EBV-1 + EBV-2) in the Tx and Tx-PTLD\ngroups. The EBNA-1 variants in decreasing frequency were: V-leu, P-thr, P-ala, and V-ala. Four\nnew sub-variants were described (V-ala (I), V-leu (I), V-leu Ag (I), V-leu Ag (II)). A wide variability in\nLMP-1 was described, with a variant of China-1 (China-1*) being the only one detected in Non-Tx\nand the predominant one in Tx and Tx-PTLD. There were no differences in the distribution of viral\ntypes, nor in the EBNA-1 or LMP-1 variants among the groups of children studied (p>0.05), nor\nbetween the anatomical compartments of viral persistence (p>0.05).\nIn the follow-up analysis, the same viral type and EBNA-1 variant was observed in the Tx\ngroup (EBV-1 and EBNA-1V-leu), while before the diagnosis of PTLD, EBV-2 and/or or the EBNA-\n1P-thr variant was identified.\nPTLD would not be associated with a specific pattern of variability, although EBV-2 or\nEBNA-1P-thr could indicate a trend towards their development. In our region, the predominant\nviral type and variants in EBNA-1 and LMP-1 would be EBV-1, V-leu and China-1*. Viral types and\nvariants do not show compartmentalization at the anatomical sites of viral persistence.\nInformation is provided that could be relevant for the implementation of future vaccines and/or\nspecific treatments in relation to PTLD and other EBV associated diseases.
Fil: Torrá, Florencia Lucía. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Buenos Aires, Argentina
La infección por el virus Epstein-Barr (EBV) se halla ampliamente distribuida en el mundo y\nproduce una infección persistente en linfocitos B. Se asocia al desarrollo de patologías benignas y\nmalignas, entre ellas en pacientes trasplantados puede provocar el desarrollo de Desórdenes\nLinfoproliferativos Post-trasplante (PTLD). De acuerdo a la heterogeneidad genómica el EBV ha\nsido clasificado en tipos virales (EBV-1 y EBV-2) y variantes genéticas, entre ellas las que codifican\na las proteínas EBNA-1 y LMP-1. El análisis de la variabilidad genética viral podría identificar cepas\nque contribuyen al desarrollo de PTLD o que sólo reflejen la circulación geográfica local. El\nobjetivo de esta tesis fue analizar la diversidad genética del EBV y su relación con el desarrollo de\nPTLD.\nSe realizó un estudio transversal en los compartimientos anatómicos de persistencia viral, en\nel cual se analizaron muestras de amígdalas y células mononucleares periféricas (CMP) de 57 no\ntrasplantados (No-Tx), 44 trasplantados (Tx) y 52 trasplantados con diagnóstico histológico de\nPTLD (Tx-PTLD). Además, se efectuó un estudio exploratorio sobre la frecuencia de aparición de\nvariabilidad genética: se analizaron CMP tomadas durante el seguimiento de 10 pacientes\ntrasplantados, 5 de los cuales desarrollaron PTLD. Los tipos EBV-1 y EBV-2 y las variantes en EBNA-\n1 y LMP-1 se determinaron utilizando estrategias de PCR/secuenciación.\nEn todos los grupos estudiados se detectó a ambos tipos virales, con una frecuencia del EBV-1\nsuperior al 80% y mayor presencia de coinfección (EBV-1 + EBV-2) en los grupos Tx y Tx-PTLD. Las\nvariantes de EBNA-1 en frecuencia decreciente fueron: V-leu, P-thr, P-ala, y V-ala. Se describieron\n4 nuevas sub-variantes (V-ala (I), V- leu (I), V-leu Ag (I), V-leu Ag (II)). Se describió una amplia\nvariabilidad en LMP-1, siendo una variante de China-1 (China-1*) la única detectada en No-Tx y la\npredominante en Tx y Tx-PTLD. No hubo diferencias en la distribución de los tipos virales, ni en las\nvariantes EBNA-1 o LMP-1 entre los grupos niños estudiados (p>0.05), ni entre los\ncompartimentos anatómicos de persistencia viral (p>0.05).\nEn el análisis de seguimiento, se observó el mismo tipo viral y variante de EBNA-1 en el grupo\nTx (EBV-1 y EBNA-1V-leu), mientras que antes del diagnóstico de PTLD, se identificó al EBV-2 y/o a la\nvariante EBNA-1P-thr.\nLos PTLDs no se asociarían con un patrón de variabilidad específico, aunque el EBV-2 o EBNA-\n1P-thr podrían indicar una tendencia a su desarrollo. En nuestra región, el tipo viral y las variantes\nen EBNA-1 y LMP-1 predominantes serían EBV-1, V-leu y China-1*. Los tipos y variantes virales no\nmuestran compartimentalización en los sitios anatómicos de persistencia viral. Se aporta\nconocimiento que podría ser relevante para la implementación de futuras vacunas y/o\ntratamientos específicos en relación a los PTLDs y a otras enfermedades asociadas a EBV.
Magíster de la Universidad de Buenos Aires en Biología Molecular Médica
Materia
Epstein-Barr
Desórdenes linfoproliferativos post-trasplante
Variabilidad genética
Tipos virales
Variantes de EBNA-1 y LMP-1
Epstein-Barr
Post-transplant lymphoproliferative disorders
Genetic variability
Viral types
EBNA-1 and LMP-1 variants
Ciencias de la vida
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
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Repositorio
Repositorio Digital Institucional de la Universidad de Buenos Aires
Institución
Universidad de Buenos Aires
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Analysis of\nviral genetic variability could identify strains that contribute to the development of PTLD or that\nonly reflect local geographic circulation. The objective of this study was to analyze the genetic\ndiversity of EBV and its relationship with the development of PTLD.\nA cross-sectional study was carried out in the anatomical compartments of viral\npersistence, in which tonsils samples and peripheral blood mononuclear cells (PBMC) from a\npediatric population were analyzed, including: 57 non-transplanted children (Non-Tx), 44\ntransplanted recipients (Tx) and 52 transplanted patients with histological diagnosis of PTLD (Tx-\nPTLD). In addition, an exploratory study on the frequency of appearance of genetic variability was\nperformed: PBMC, which had been taken during the follow-up of 10 transplant patients, 5 of\nwhom developed PTLD, were analyzed. EBV-1 and EBV-2 types and variants in EBNA-1 and LMP-1\nwere determined using PCR/sequencing strategies.\nIn all the groups studied, both viral types were detected, with a frequency of EBV-1\ngreater than 80% and a higher presence of coinfection (EBV-1 + EBV-2) in the Tx and Tx-PTLD\ngroups. The EBNA-1 variants in decreasing frequency were: V-leu, P-thr, P-ala, and V-ala. Four\nnew sub-variants were described (V-ala (I), V-leu (I), V-leu Ag (I), V-leu Ag (II)). A wide variability in\nLMP-1 was described, with a variant of China-1 (China-1*) being the only one detected in Non-Tx\nand the predominant one in Tx and Tx-PTLD. There were no differences in the distribution of viral\ntypes, nor in the EBNA-1 or LMP-1 variants among the groups of children studied (p>0.05), nor\nbetween the anatomical compartments of viral persistence (p>0.05).\nIn the follow-up analysis, the same viral type and EBNA-1 variant was observed in the Tx\ngroup (EBV-1 and EBNA-1V-leu), while before the diagnosis of PTLD, EBV-2 and/or or the EBNA-\n1P-thr variant was identified.\nPTLD would not be associated with a specific pattern of variability, although EBV-2 or\nEBNA-1P-thr could indicate a trend towards their development. In our region, the predominant\nviral type and variants in EBNA-1 and LMP-1 would be EBV-1, V-leu and China-1*. Viral types and\nvariants do not show compartmentalization at the anatomical sites of viral persistence.\nInformation is provided that could be relevant for the implementation of future vaccines and/or\nspecific treatments in relation to PTLD and other EBV associated diseases.Fil: Torrá, Florencia Lucía. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Buenos Aires, ArgentinaLa infección por el virus Epstein-Barr (EBV) se halla ampliamente distribuida en el mundo y\nproduce una infección persistente en linfocitos B. Se asocia al desarrollo de patologías benignas y\nmalignas, entre ellas en pacientes trasplantados puede provocar el desarrollo de Desórdenes\nLinfoproliferativos Post-trasplante (PTLD). De acuerdo a la heterogeneidad genómica el EBV ha\nsido clasificado en tipos virales (EBV-1 y EBV-2) y variantes genéticas, entre ellas las que codifican\na las proteínas EBNA-1 y LMP-1. 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Los tipos EBV-1 y EBV-2 y las variantes en EBNA-\n1 y LMP-1 se determinaron utilizando estrategias de PCR/secuenciación.\nEn todos los grupos estudiados se detectó a ambos tipos virales, con una frecuencia del EBV-1\nsuperior al 80% y mayor presencia de coinfección (EBV-1 + EBV-2) en los grupos Tx y Tx-PTLD. Las\nvariantes de EBNA-1 en frecuencia decreciente fueron: V-leu, P-thr, P-ala, y V-ala. Se describieron\n4 nuevas sub-variantes (V-ala (I), V- leu (I), V-leu Ag (I), V-leu Ag (II)). Se describió una amplia\nvariabilidad en LMP-1, siendo una variante de China-1 (China-1*) la única detectada en No-Tx y la\npredominante en Tx y Tx-PTLD. No hubo diferencias en la distribución de los tipos virales, ni en las\nvariantes EBNA-1 o LMP-1 entre los grupos niños estudiados (p>0.05), ni entre los\ncompartimentos anatómicos de persistencia viral (p>0.05).\nEn el análisis de seguimiento, se observó el mismo tipo viral y variante de EBNA-1 en el grupo\nTx (EBV-1 y EBNA-1V-leu), mientras que antes del diagnóstico de PTLD, se identificó al EBV-2 y/o a la\nvariante EBNA-1P-thr.\nLos PTLDs no se asociarían con un patrón de variabilidad específico, aunque el EBV-2 o EBNA-\n1P-thr podrían indicar una tendencia a su desarrollo. En nuestra región, el tipo viral y las variantes\nen EBNA-1 y LMP-1 predominantes serían EBV-1, V-leu y China-1*. Los tipos y variantes virales no\nmuestran compartimentalización en los sitios anatómicos de persistencia viral. Se aporta\nconocimiento que podría ser relevante para la implementación de futuras vacunas y/o\ntratamientos específicos en relación a los PTLDs y a otras enfermedades asociadas a EBV.Magíster de la Universidad de Buenos Aires en Biología Molecular MédicaUniversidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y BioquímicaPicconi, María AlejandraFellner, María DoloresCavallaro, Lucía V.Preciado, María VictoriaGiordano, Mirta2024-02-26info:eu-repo/semantics/masterThesisinfo:eu-repo/semantics/acceptedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_bdccinfo:ar-repo/semantics/tesisDeMaestriaapplication/pdfhttp://repositoriouba.sisbi.uba.ar/gsdl/cgi-bin/library.cgi?a=d&c=afamaster&cl=CL1&d=HWA_7816https://repositoriouba.sisbi.uba.ar/gsdl/collect/afamaster/index/assoc/HWA_7816.dir/7816.PDFspainfo:eu-repo/semantics/openAccesshttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/ar/reponame:Repositorio Digital Institucional de la Universidad de Buenos Airesinstname:Universidad de Buenos Aires2025-09-18T11:39:48Zoai:RDI UBA:afamaster:HWA_7816instacron:UBAInstitucionalhttp://repositoriouba.sisbi.uba.ar/Universidad públicahttps://www.uba.ar/http://repositoriouba.sisbi.uba.ar/gsdl/cgi-bin/oaiserver.cgicferrando@sisbi.uba.arArgentinaopendoar:2025-09-18 11:39:49.37Repositorio Digital Institucional de la Universidad de Buenos Aires - Universidad de Buenos Airesfalse
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Fil: Torrá, Florencia Lucía. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Buenos Aires, Argentina
La infección por el virus Epstein-Barr (EBV) se halla ampliamente distribuida en el mundo y\nproduce una infección persistente en linfocitos B. Se asocia al desarrollo de patologías benignas y\nmalignas, entre ellas en pacientes trasplantados puede provocar el desarrollo de Desórdenes\nLinfoproliferativos Post-trasplante (PTLD). De acuerdo a la heterogeneidad genómica el EBV ha\nsido clasificado en tipos virales (EBV-1 y EBV-2) y variantes genéticas, entre ellas las que codifican\na las proteínas EBNA-1 y LMP-1. El análisis de la variabilidad genética viral podría identificar cepas\nque contribuyen al desarrollo de PTLD o que sólo reflejen la circulación geográfica local. El\nobjetivo de esta tesis fue analizar la diversidad genética del EBV y su relación con el desarrollo de\nPTLD.\nSe realizó un estudio transversal en los compartimientos anatómicos de persistencia viral, en\nel cual se analizaron muestras de amígdalas y células mononucleares periféricas (CMP) de 57 no\ntrasplantados (No-Tx), 44 trasplantados (Tx) y 52 trasplantados con diagnóstico histológico de\nPTLD (Tx-PTLD). Además, se efectuó un estudio exploratorio sobre la frecuencia de aparición de\nvariabilidad genética: se analizaron CMP tomadas durante el seguimiento de 10 pacientes\ntrasplantados, 5 de los cuales desarrollaron PTLD. Los tipos EBV-1 y EBV-2 y las variantes en EBNA-\n1 y LMP-1 se determinaron utilizando estrategias de PCR/secuenciación.\nEn todos los grupos estudiados se detectó a ambos tipos virales, con una frecuencia del EBV-1\nsuperior al 80% y mayor presencia de coinfección (EBV-1 + EBV-2) en los grupos Tx y Tx-PTLD. Las\nvariantes de EBNA-1 en frecuencia decreciente fueron: V-leu, P-thr, P-ala, y V-ala. Se describieron\n4 nuevas sub-variantes (V-ala (I), V- leu (I), V-leu Ag (I), V-leu Ag (II)). Se describió una amplia\nvariabilidad en LMP-1, siendo una variante de China-1 (China-1*) la única detectada en No-Tx y la\npredominante en Tx y Tx-PTLD. No hubo diferencias en la distribución de los tipos virales, ni en las\nvariantes EBNA-1 o LMP-1 entre los grupos niños estudiados (p>0.05), ni entre los\ncompartimentos anatómicos de persistencia viral (p>0.05).\nEn el análisis de seguimiento, se observó el mismo tipo viral y variante de EBNA-1 en el grupo\nTx (EBV-1 y EBNA-1V-leu), mientras que antes del diagnóstico de PTLD, se identificó al EBV-2 y/o a la\nvariante EBNA-1P-thr.\nLos PTLDs no se asociarían con un patrón de variabilidad específico, aunque el EBV-2 o EBNA-\n1P-thr podrían indicar una tendencia a su desarrollo. En nuestra región, el tipo viral y las variantes\nen EBNA-1 y LMP-1 predominantes serían EBV-1, V-leu y China-1*. Los tipos y variantes virales no\nmuestran compartimentalización en los sitios anatómicos de persistencia viral. Se aporta\nconocimiento que podría ser relevante para la implementación de futuras vacunas y/o\ntratamientos específicos en relación a los PTLDs y a otras enfermedades asociadas a EBV.
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description Epstein-Barr virus (EBV) infection is widely distributed in the world and produces a\npersistent infection in B lymphocytes. It is associated with the development of benign and\nmalignant pathologies, including Post-Lymphoproliferative Disorders (PTLD) in transplant patients.\nAccording to genomic heterogeneity, EBV has been classified into viral types (EBV-1 and EBV-2)\nand genetic variants, among them those encoding the EBNA-1 and LMP-1 proteins. Analysis of\nviral genetic variability could identify strains that contribute to the development of PTLD or that\nonly reflect local geographic circulation. The objective of this study was to analyze the genetic\ndiversity of EBV and its relationship with the development of PTLD.\nA cross-sectional study was carried out in the anatomical compartments of viral\npersistence, in which tonsils samples and peripheral blood mononuclear cells (PBMC) from a\npediatric population were analyzed, including: 57 non-transplanted children (Non-Tx), 44\ntransplanted recipients (Tx) and 52 transplanted patients with histological diagnosis of PTLD (Tx-\nPTLD). In addition, an exploratory study on the frequency of appearance of genetic variability was\nperformed: PBMC, which had been taken during the follow-up of 10 transplant patients, 5 of\nwhom developed PTLD, were analyzed. EBV-1 and EBV-2 types and variants in EBNA-1 and LMP-1\nwere determined using PCR/sequencing strategies.\nIn all the groups studied, both viral types were detected, with a frequency of EBV-1\ngreater than 80% and a higher presence of coinfection (EBV-1 + EBV-2) in the Tx and Tx-PTLD\ngroups. The EBNA-1 variants in decreasing frequency were: V-leu, P-thr, P-ala, and V-ala. Four\nnew sub-variants were described (V-ala (I), V-leu (I), V-leu Ag (I), V-leu Ag (II)). A wide variability in\nLMP-1 was described, with a variant of China-1 (China-1*) being the only one detected in Non-Tx\nand the predominant one in Tx and Tx-PTLD. There were no differences in the distribution of viral\ntypes, nor in the EBNA-1 or LMP-1 variants among the groups of children studied (p>0.05), nor\nbetween the anatomical compartments of viral persistence (p>0.05).\nIn the follow-up analysis, the same viral type and EBNA-1 variant was observed in the Tx\ngroup (EBV-1 and EBNA-1V-leu), while before the diagnosis of PTLD, EBV-2 and/or or the EBNA-\n1P-thr variant was identified.\nPTLD would not be associated with a specific pattern of variability, although EBV-2 or\nEBNA-1P-thr could indicate a trend towards their development. In our region, the predominant\nviral type and variants in EBNA-1 and LMP-1 would be EBV-1, V-leu and China-1*. Viral types and\nvariants do not show compartmentalization at the anatomical sites of viral persistence.\nInformation is provided that could be relevant for the implementation of future vaccines and/or\nspecific treatments in relation to PTLD and other EBV associated diseases.
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