Pre-breeding studies in Panicum coloratum var. coloratum: Characterization using agro-morphological traits and molecular markers = Estudios de pre-mejoramiento genético en Panicum...

Autores
Burgos, Estanislao; Thompson, Carolina Soledad; Giordano, Mabel Cristina; Tomas, Maria Andrea
Año de publicación
2018
Idioma
inglés
Tipo de recurso
artículo
Estado
versión publicada
Descripción
Panicum coloratum var. coloratum is a native African perennial C4 grass, introduced to Argentina. It is tolerant of salinity and cold and has good forage production. The scarce genotypic and phenotypic information about this grass limits its breeding in order to satisfy market demands. The aim of this study was to evaluate the variability in a collection of Panicum coloratum var. coloratum formed by 8 accessions and grown at EEA INTA Rafaela during the summer of 2011, based on 15 ISSR molecular markers and 17 morphological characters. For all morphological characters, the distribution of variability observed in the collection was high and not homogenous. The characters that showed greater variation were related to forage and seed production. Eight ISSRs, selected according to their reproducibility, showed 127 bands with 100% polymorphism and allowed grouping of populations according to their site of collection. AMOVA study indicated that more than 58% of the molecular variation existed within accessions; this would be consistent with the predominant allogamous form of reproduction. The results showed that the combined use of molecular and morphological markers offer complementary information. The high variability detected in this collection will allow for the initiation of a breeding program to improve important characters like those related to DM yield and seed production.
Panicum coloratum var. coloratum es una gramínea C4 perenne, originaria de África e introducida en Argentina alrededor de 1990. Se destaca por su buena producción de forraje y tolerancia a la salinidad y frío. La escasa información genotípica y fenotípica de este pasto ha limitado su uso en programas de mejoramiento y su demanda en el mercado. El objetivo del estudio fue evaluar la variabilidad en una colección de P. coloratum var. coloratum formada por 8 accesiones establecidas en la Estación Experimental Agropecuaria Rafaela del INTA en Argentina. El trabajo se realizó en la época de verano de 2011, utilizando 15 marcadores moleculares ISSR y 17 marcadores morfológicos. Todos los caracteres morfológicos evaluados presentaron una amplia distribución de la variabilidad, siendo esta no homogénea en la colección. Los caracteres con mayor variación fueron los relacionados con la producción de semilla y de forraje. Ocho ISSRs fueron seleccionados de acuerdo con su grado de reproducibilidad. Estos reprodujeron 127 bandas con 100% de polimorfismo y permitieron agrupar las poblaciones de acuerdo con su sitio de recolección. El análisis AMOVA indicó que más del 58% de la variación se presenta dentro de las accesiones, lo cual sería consecuente con la forma de reproducción alógama predominante en la especie. Estos resultados demuestran que el uso combinado de marcadores moleculares y morfológicos ofrece información complementaria de gran utilidad para evaluar la variabilidad de esta especie. Los resultados del estudio podrían ser utilizados para el comienzo de un programa de mejoramiento de caracteres importantes, entre ellos los relacionados con la producción de materia seca y semilla.
Instituto de Biotecnología
Fil: Burgos, Estanislao. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Biotecnología; Argentina
Fil: Thompson, Carolina Soledad. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Rafaela. Laboratorio de Inmunología; Argentina
Fil: Giordano, Mabel Cristina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Rafaela. Mejoramiento Genético de Forrajeras; Argentina
Fil: Tomas, Maria Andrea. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Rafaela. Mejoramiento Genético de Forrajeras; Argentina
Fuente
Tropical grasslands-Forrajes tropicales 6 (2) : 82–92. (2018)
Materia
Panicum Coloratum
Fitomejoramiento
Marcadores Genéticos
Variación Genética
Plant Breeding
Genetic Markers
Genetic Variation
ISSR
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
Repositorio
INTA Digital (INTA)
Institución
Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria
OAI Identificador
oai:localhost:20.500.12123/4129
Acceder
id INTADig_f9354dfff8b2b37597f94e201fca28af
oai_identifier_str oai:localhost:20.500.12123/4129
network_acronym_str INTADig
repository_id_str l
network_name_str INTA Digital (INTA)
spelling Pre-breeding studies in Panicum coloratum var. coloratum: Characterization using agro-morphological traits and molecular markers = Estudios de pre-mejoramiento genético en Panicum coloratum var. coloratum : caracterización usando marcadores moleculares y caracteres agro-morfológicosBurgos, EstanislaoThompson, Carolina SoledadGiordano, Mabel CristinaTomas, Maria AndreaPanicum ColoratumFitomejoramientoMarcadores GenéticosVariación GenéticaPlant BreedingGenetic MarkersGenetic VariationISSRPanicum coloratum var. coloratum is a native African perennial C4 grass, introduced to Argentina. It is tolerant of salinity and cold and has good forage production. The scarce genotypic and phenotypic information about this grass limits its breeding in order to satisfy market demands. The aim of this study was to evaluate the variability in a collection of Panicum coloratum var. coloratum formed by 8 accessions and grown at EEA INTA Rafaela during the summer of 2011, based on 15 ISSR molecular markers and 17 morphological characters. For all morphological characters, the distribution of variability observed in the collection was high and not homogenous. The characters that showed greater variation were related to forage and seed production. Eight ISSRs, selected according to their reproducibility, showed 127 bands with 100% polymorphism and allowed grouping of populations according to their site of collection. AMOVA study indicated that more than 58% of the molecular variation existed within accessions; this would be consistent with the predominant allogamous form of reproduction. The results showed that the combined use of molecular and morphological markers offer complementary information. The high variability detected in this collection will allow for the initiation of a breeding program to improve important characters like those related to DM yield and seed production.Panicum coloratum var. coloratum es una gramínea C4 perenne, originaria de África e introducida en Argentina alrededor de 1990. Se destaca por su buena producción de forraje y tolerancia a la salinidad y frío. La escasa información genotípica y fenotípica de este pasto ha limitado su uso en programas de mejoramiento y su demanda en el mercado. El objetivo del estudio fue evaluar la variabilidad en una colección de P. coloratum var. coloratum formada por 8 accesiones establecidas en la Estación Experimental Agropecuaria Rafaela del INTA en Argentina. El trabajo se realizó en la época de verano de 2011, utilizando 15 marcadores moleculares ISSR y 17 marcadores morfológicos. Todos los caracteres morfológicos evaluados presentaron una amplia distribución de la variabilidad, siendo esta no homogénea en la colección. Los caracteres con mayor variación fueron los relacionados con la producción de semilla y de forraje. Ocho ISSRs fueron seleccionados de acuerdo con su grado de reproducibilidad. Estos reprodujeron 127 bandas con 100% de polimorfismo y permitieron agrupar las poblaciones de acuerdo con su sitio de recolección. El análisis AMOVA indicó que más del 58% de la variación se presenta dentro de las accesiones, lo cual sería consecuente con la forma de reproducción alógama predominante en la especie. Estos resultados demuestran que el uso combinado de marcadores moleculares y morfológicos ofrece información complementaria de gran utilidad para evaluar la variabilidad de esta especie. Los resultados del estudio podrían ser utilizados para el comienzo de un programa de mejoramiento de caracteres importantes, entre ellos los relacionados con la producción de materia seca y semilla.Instituto de BiotecnologíaFil: Burgos, Estanislao. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Biotecnología; ArgentinaFil: Thompson, Carolina Soledad. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Rafaela. Laboratorio de Inmunología; ArgentinaFil: Giordano, Mabel Cristina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Rafaela. Mejoramiento Genético de Forrajeras; ArgentinaFil: Tomas, Maria Andrea. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Rafaela. Mejoramiento Genético de Forrajeras; ArgentinaCIAT2018-12-20T17:01:25Z2018-12-20T17:01:25Z2018info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_6501info:ar-repo/semantics/articuloapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/20.500.12123/4129http://tropicalgrasslands.info/index.php/tgft/article/view/3752346-3775https://doi.org/10.17138/tgft(6)82-92Tropical grasslands-Forrajes tropicales 6 (2) : 82–92. (2018)reponame:INTA Digital (INTA)instname:Instituto Nacional de Tecnología Agropecuariaenginfo:eu-repo/semantics/openAccesshttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/Creative Commons Attribution-NonCommercial-ShareAlike 4.0 International (CC BY-NC-SA 4.0)2025-10-16T09:29:24Zoai:localhost:20.500.12123/4129instacron:INTAInstitucionalhttp://repositorio.inta.gob.ar/Organismo científico-tecnológicoNo correspondehttp://repositorio.inta.gob.ar/oai/requesttripaldi.nicolas@inta.gob.arArgentinaNo correspondeNo correspondeNo correspondeopendoar:l2025-10-16 09:29:24.58INTA Digital (INTA) - Instituto Nacional de Tecnología Agropecuariafalse
dc.title.none.fl_str_mv Pre-breeding studies in Panicum coloratum var. coloratum: Characterization using agro-morphological traits and molecular markers = Estudios de pre-mejoramiento genético en Panicum coloratum var. coloratum : caracterización usando marcadores moleculares y caracteres agro-morfológicos
title Pre-breeding studies in Panicum coloratum var. coloratum: Characterization using agro-morphological traits and molecular markers = Estudios de pre-mejoramiento genético en Panicum coloratum var. coloratum : caracterización usando marcadores moleculares y caracteres agro-morfológicos
spellingShingle Pre-breeding studies in Panicum coloratum var. coloratum: Characterization using agro-morphological traits and molecular markers = Estudios de pre-mejoramiento genético en Panicum coloratum var. coloratum : caracterización usando marcadores moleculares y caracteres agro-morfológicos
Burgos, Estanislao
Panicum Coloratum
Fitomejoramiento
Marcadores Genéticos
Variación Genética
Plant Breeding
Genetic Markers
Genetic Variation
ISSR
title_short Pre-breeding studies in Panicum coloratum var. coloratum: Characterization using agro-morphological traits and molecular markers = Estudios de pre-mejoramiento genético en Panicum coloratum var. coloratum : caracterización usando marcadores moleculares y caracteres agro-morfológicos
title_full Pre-breeding studies in Panicum coloratum var. coloratum: Characterization using agro-morphological traits and molecular markers = Estudios de pre-mejoramiento genético en Panicum coloratum var. coloratum : caracterización usando marcadores moleculares y caracteres agro-morfológicos
title_fullStr Pre-breeding studies in Panicum coloratum var. coloratum: Characterization using agro-morphological traits and molecular markers = Estudios de pre-mejoramiento genético en Panicum coloratum var. coloratum : caracterización usando marcadores moleculares y caracteres agro-morfológicos
title_full_unstemmed Pre-breeding studies in Panicum coloratum var. coloratum: Characterization using agro-morphological traits and molecular markers = Estudios de pre-mejoramiento genético en Panicum coloratum var. coloratum : caracterización usando marcadores moleculares y caracteres agro-morfológicos
title_sort Pre-breeding studies in Panicum coloratum var. coloratum: Characterization using agro-morphological traits and molecular markers = Estudios de pre-mejoramiento genético en Panicum coloratum var. coloratum : caracterización usando marcadores moleculares y caracteres agro-morfológicos
dc.creator.none.fl_str_mv Burgos, Estanislao
Thompson, Carolina Soledad
Giordano, Mabel Cristina
Tomas, Maria Andrea
author Burgos, Estanislao
author_facet Burgos, Estanislao
Thompson, Carolina Soledad
Giordano, Mabel Cristina
Tomas, Maria Andrea
author_role author
author2 Thompson, Carolina Soledad
Giordano, Mabel Cristina
Tomas, Maria Andrea
author2_role author
author
author
dc.subject.none.fl_str_mv Panicum Coloratum
Fitomejoramiento
Marcadores Genéticos
Variación Genética
Plant Breeding
Genetic Markers
Genetic Variation
ISSR
topic Panicum Coloratum
Fitomejoramiento
Marcadores Genéticos
Variación Genética
Plant Breeding
Genetic Markers
Genetic Variation
ISSR
dc.description.none.fl_txt_mv Panicum coloratum var. coloratum is a native African perennial C4 grass, introduced to Argentina. It is tolerant of salinity and cold and has good forage production. The scarce genotypic and phenotypic information about this grass limits its breeding in order to satisfy market demands. The aim of this study was to evaluate the variability in a collection of Panicum coloratum var. coloratum formed by 8 accessions and grown at EEA INTA Rafaela during the summer of 2011, based on 15 ISSR molecular markers and 17 morphological characters. For all morphological characters, the distribution of variability observed in the collection was high and not homogenous. The characters that showed greater variation were related to forage and seed production. Eight ISSRs, selected according to their reproducibility, showed 127 bands with 100% polymorphism and allowed grouping of populations according to their site of collection. AMOVA study indicated that more than 58% of the molecular variation existed within accessions; this would be consistent with the predominant allogamous form of reproduction. The results showed that the combined use of molecular and morphological markers offer complementary information. The high variability detected in this collection will allow for the initiation of a breeding program to improve important characters like those related to DM yield and seed production.
Panicum coloratum var. coloratum es una gramínea C4 perenne, originaria de África e introducida en Argentina alrededor de 1990. Se destaca por su buena producción de forraje y tolerancia a la salinidad y frío. La escasa información genotípica y fenotípica de este pasto ha limitado su uso en programas de mejoramiento y su demanda en el mercado. El objetivo del estudio fue evaluar la variabilidad en una colección de P. coloratum var. coloratum formada por 8 accesiones establecidas en la Estación Experimental Agropecuaria Rafaela del INTA en Argentina. El trabajo se realizó en la época de verano de 2011, utilizando 15 marcadores moleculares ISSR y 17 marcadores morfológicos. Todos los caracteres morfológicos evaluados presentaron una amplia distribución de la variabilidad, siendo esta no homogénea en la colección. Los caracteres con mayor variación fueron los relacionados con la producción de semilla y de forraje. Ocho ISSRs fueron seleccionados de acuerdo con su grado de reproducibilidad. Estos reprodujeron 127 bandas con 100% de polimorfismo y permitieron agrupar las poblaciones de acuerdo con su sitio de recolección. El análisis AMOVA indicó que más del 58% de la variación se presenta dentro de las accesiones, lo cual sería consecuente con la forma de reproducción alógama predominante en la especie. Estos resultados demuestran que el uso combinado de marcadores moleculares y morfológicos ofrece información complementaria de gran utilidad para evaluar la variabilidad de esta especie. Los resultados del estudio podrían ser utilizados para el comienzo de un programa de mejoramiento de caracteres importantes, entre ellos los relacionados con la producción de materia seca y semilla.
Instituto de Biotecnología
Fil: Burgos, Estanislao. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Biotecnología; Argentina
Fil: Thompson, Carolina Soledad. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Rafaela. Laboratorio de Inmunología; Argentina
Fil: Giordano, Mabel Cristina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Rafaela. Mejoramiento Genético de Forrajeras; Argentina
Fil: Tomas, Maria Andrea. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Rafaela. Mejoramiento Genético de Forrajeras; Argentina
description Panicum coloratum var. coloratum is a native African perennial C4 grass, introduced to Argentina. It is tolerant of salinity and cold and has good forage production. The scarce genotypic and phenotypic information about this grass limits its breeding in order to satisfy market demands. The aim of this study was to evaluate the variability in a collection of Panicum coloratum var. coloratum formed by 8 accessions and grown at EEA INTA Rafaela during the summer of 2011, based on 15 ISSR molecular markers and 17 morphological characters. For all morphological characters, the distribution of variability observed in the collection was high and not homogenous. The characters that showed greater variation were related to forage and seed production. Eight ISSRs, selected according to their reproducibility, showed 127 bands with 100% polymorphism and allowed grouping of populations according to their site of collection. AMOVA study indicated that more than 58% of the molecular variation existed within accessions; this would be consistent with the predominant allogamous form of reproduction. The results showed that the combined use of molecular and morphological markers offer complementary information. The high variability detected in this collection will allow for the initiation of a breeding program to improve important characters like those related to DM yield and seed production.
publishDate 2018
dc.date.none.fl_str_mv 2018-12-20T17:01:25Z
2018-12-20T17:01:25Z
2018
dc.type.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/article
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
http://purl.org/coar/resource_type/c_6501
info:ar-repo/semantics/articulo
format article
status_str publishedVersion
dc.identifier.none.fl_str_mv http://hdl.handle.net/20.500.12123/4129
http://tropicalgrasslands.info/index.php/tgft/article/view/375
2346-3775
https://doi.org/10.17138/tgft(6)82-92
url http://hdl.handle.net/20.500.12123/4129
http://tropicalgrasslands.info/index.php/tgft/article/view/375
https://doi.org/10.17138/tgft(6)82-92
identifier_str_mv 2346-3775
dc.language.none.fl_str_mv eng
language eng
dc.rights.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
Creative Commons Attribution-NonCommercial-ShareAlike 4.0 International (CC BY-NC-SA 4.0)
eu_rights_str_mv openAccess
rights_invalid_str_mv http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
Creative Commons Attribution-NonCommercial-ShareAlike 4.0 International (CC BY-NC-SA 4.0)
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv CIAT
publisher.none.fl_str_mv CIAT
dc.source.none.fl_str_mv Tropical grasslands-Forrajes tropicales 6 (2) : 82–92. (2018)
reponame:INTA Digital (INTA)
instname:Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria
reponame_str INTA Digital (INTA)
collection INTA Digital (INTA)
instname_str Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria
repository.name.fl_str_mv INTA Digital (INTA) - Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria
repository.mail.fl_str_mv tripaldi.nicolas@inta.gob.ar
_version_ 1846143509228158976
score 12.712165

Publicaciones similares