Estudio de la variabilidad genética entre aislamientos de Anaplasma marginale en un área endémica del Nordeste Argentino

Autores
Zimmer, Patricia Andrea
Año de publicación
2009
Idioma
español castellano
Tipo de recurso
tesis de maestría
Estado
versión aceptada
Colaborador/a o director/a de tesis
Spath, Ernesto Juan
Farber, Marisa Diana
Descripción
Tesis para obtener el grado de Magíster Scientiae en Sanidad Animal, de la Universidad Nacional de Mar del Plata, en noviembre de 2009
El objetivo del presente trabajo fue conocer las variantes genotípicas de Anaplasma marginale, en rodeos bovinos en una región del noroeste de Entre Ríos con antecedentes de ocurrencia de casos clínicos de anaplasmosis. A partir de un estudio observacional se obtuvieron muestras (sangre y suero) de terneros de cuatro a ocho meses de edad, de 49 establecimientos de los departamentos de Feliciano, Federal y La Paz (n=989). Las muestras de sueros se procesaron mediante la prueba de c-ELISA y según su resultado se determinó el estatus epidemiológico de anaplasmosis para cada rodeo (Mahoney; Ross, 1972). Mediante una selección de muestras por conveniencia se analizaron por PCR msp5 y RLBH 291 y 87 muestras de sangre respectivamente. Se evaluaron las variantes genotípicas del marcador molecular msp1α de A. marginale que presenta diferencias nucleotídicas en el número de repeticiones en tandem y en el tipo de bloque. Se determinó la variabilidad intra e inter-predio (OR). Se determinó que sólo 10 de los 49 rodeos analizados resultaron positivos a Anaplasma spp, y todos se encontraban en inestabilidad enzoótica, con alto o bajo riesgo de de ocurrencia de brotes de anaplasmosis. El 3,7 % (37/989), de los terneros resultó positivo en c-ELISA, mientras que de las muestras seleccionadas el 13,7 % (40/291) y el 39 % (34/87) fueron positivas en PCR msp5 y RLBH respectivamente. Las tres técnicas mostraron muy buena concordancia (K ≥ 0,8). Se encontraron ocho genotipos diferentes en los establecimientos de la Paz y Feliciano, de los cuales, cinco genotipos y dos bloques se describieron por primera vez en este trabajo. La variabilidad intra e inter establecimiento tuvo un Odds Ratio: 12,4 (IC 95% 5,9-25,67) y una asociación significativa (X2 46,3; p<0,0001), lo que indica que los genotipos que pertenecen al mismo establecimiento tienen mayor probabilidad de incluir secuencias iguales y la diversidad genotípica de los aislamientos no tendría una distribución al azar, sino por el contrario estaría agrupada por establecimientos. Las diferentes técnicas diagnósticas aplicadas estratégicamente, la recopilación de antecedentes y el conocimiento de la diversidad genotípica de A. marginale proporcionaron nueva información sobre la epidemiología de la anaplasmosis bovina en el NO de Entre Ríos.
The objective of this work was to study the genetic diversity of A. marginale in beef cattle herds in the North West of Entre Rios, province where clinical cases of anaplasmosis has frequently been reported. To establish the epidemiological status of each herd, samples from 49 cattle farms, located in 3 districts (n=989) were obtained and analyzed using c-ELISA. Convenient samples were selected to analyze blood samples using PCRmsp5 (n=291) and RLBH (n=87). The msp1α gene of A. marginale, selected as molecular marker, was analyzed based on nucleotide differences in the number of repetitions in tandem and in the block type. The genetic variability in and between herds was also evaluated (odds ratio). Ten of 49 herds (20,4%) resulted positive to Anaplasma spp. and were under enzootic instability with either high or low risk of occurrence of anaplasmosis outbreaks; 3.7 % (37/989) of calves were positive to c-ELISA, meanwhile on the selected blood samples 13.7 % (40/291) and 39% (39/87) were positives to PCRmsp5 and RLBH respectively. The three techniques showed a high concord (K≥ 0.8). Eight different genotypes were identified in La Paz and Feliciano districts, five of the genotypes and two of the blocks were described for the first time in Argentina. The odds ratio in and between herds was 12.4 (IC 95% 5.999-25.67) with significant association (X2 46.3; p <0.0001), pointing out that genotypes identified in each herd, had higher probabilities to include identical sequences. The A. marginale genetic diversity would not be randomly distributed; on the contrary it would be restricted to each herd. The conclusion of this work is that the combination of different diagnostic techniques and the knowledge of A. marginale genetic diversity provided solid information on the epidemiology of the bovine anaplasmosis in the NW of Entre Rios, and allowed to establish the needed to implement preventive measures in this region.
EEA Mercedes
Fil: Zimmer, Patricia Andrea. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Mercedes; Argentina
Materia
Anaplasma Marginale
Variación Genética
Genotipos
ELISA
PCR
Marcadores Genéticos
Ganado Bovino
Anaplasmosis
Genetic Variation
Genotypes
Genetic Markers
Cattle
Marcadores Moleculares
Región Noreste, Argentina
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
Repositorio
INTA Digital (INTA)
Institución
Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria
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Las muestras de sueros se procesaron mediante la prueba de c-ELISA y según su resultado se determinó el estatus epidemiológico de anaplasmosis para cada rodeo (Mahoney; Ross, 1972). Mediante una selección de muestras por conveniencia se analizaron por PCR msp5 y RLBH 291 y 87 muestras de sangre respectivamente. Se evaluaron las variantes genotípicas del marcador molecular msp1α de A. marginale que presenta diferencias nucleotídicas en el número de repeticiones en tandem y en el tipo de bloque. Se determinó la variabilidad intra e inter-predio (OR). Se determinó que sólo 10 de los 49 rodeos analizados resultaron positivos a Anaplasma spp, y todos se encontraban en inestabilidad enzoótica, con alto o bajo riesgo de de ocurrencia de brotes de anaplasmosis. El 3,7 % (37/989), de los terneros resultó positivo en c-ELISA, mientras que de las muestras seleccionadas el 13,7 % (40/291) y el 39 % (34/87) fueron positivas en PCR msp5 y RLBH respectivamente. Las tres técnicas mostraron muy buena concordancia (K ≥ 0,8). Se encontraron ocho genotipos diferentes en los establecimientos de la Paz y Feliciano, de los cuales, cinco genotipos y dos bloques se describieron por primera vez en este trabajo. La variabilidad intra e inter establecimiento tuvo un Odds Ratio: 12,4 (IC 95% 5,9-25,67) y una asociación significativa (X2 46,3; p<0,0001), lo que indica que los genotipos que pertenecen al mismo establecimiento tienen mayor probabilidad de incluir secuencias iguales y la diversidad genotípica de los aislamientos no tendría una distribución al azar, sino por el contrario estaría agrupada por establecimientos. Las diferentes técnicas diagnósticas aplicadas estratégicamente, la recopilación de antecedentes y el conocimiento de la diversidad genotípica de A. marginale proporcionaron nueva información sobre la epidemiología de la anaplasmosis bovina en el NO de Entre Ríos.The objective of this work was to study the genetic diversity of A. marginale in beef cattle herds in the North West of Entre Rios, province where clinical cases of anaplasmosis has frequently been reported. To establish the epidemiological status of each herd, samples from 49 cattle farms, located in 3 districts (n=989) were obtained and analyzed using c-ELISA. Convenient samples were selected to analyze blood samples using PCRmsp5 (n=291) and RLBH (n=87). The msp1α gene of A. marginale, selected as molecular marker, was analyzed based on nucleotide differences in the number of repetitions in tandem and in the block type. The genetic variability in and between herds was also evaluated (odds ratio). Ten of 49 herds (20,4%) resulted positive to Anaplasma spp. and were under enzootic instability with either high or low risk of occurrence of anaplasmosis outbreaks; 3.7 % (37/989) of calves were positive to c-ELISA, meanwhile on the selected blood samples 13.7 % (40/291) and 39% (39/87) were positives to PCRmsp5 and RLBH respectively. The three techniques showed a high concord (K≥ 0.8). Eight different genotypes were identified in La Paz and Feliciano districts, five of the genotypes and two of the blocks were described for the first time in Argentina. The odds ratio in and between herds was 12.4 (IC 95% 5.999-25.67) with significant association (X2 46.3; p <0.0001), pointing out that genotypes identified in each herd, had higher probabilities to include identical sequences. The A. marginale genetic diversity would not be randomly distributed; on the contrary it would be restricted to each herd. The conclusion of this work is that the combination of different diagnostic techniques and the knowledge of A. marginale genetic diversity provided solid information on the epidemiology of the bovine anaplasmosis in the NW of Entre Rios, and allowed to establish the needed to implement preventive measures in this region.EEA MercedesFil: Zimmer, Patricia Andrea. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Mercedes; ArgentinaFacultad de Ciencias Agrarias, Universidad Nacional de Mar del PlataSpath, Ernesto JuanFarber, Marisa Diana2020-03-12T13:52:36Z2020-03-12T13:52:36Z2009-11info:eu-repo/semantics/masterThesisinfo:eu-repo/semantics/acceptedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_bdccinfo:ar-repo/semantics/tesisDeMaestriaapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/20.500.12123/6931http://intrabalc.inta.gob.ar/dbtw-wpd/images/Zimmer-P.pdfspainfo:eu-repo/semantics/openAccesshttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/Creative Commons Attribution-NonCommercial-ShareAlike 4.0 International (CC BY-NC-SA 4.0)reponame:INTA Digital (INTA)instname:Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria2026-02-26T11:44:22Zoai:localhost:20.500.12123/6931instacron:INTAInstitucionalhttp://repositorio.inta.gob.ar/Organismo científico-tecnológicoNo correspondehttp://repositorio.inta.gob.ar/oai/requesttripaldi.nicolas@inta.gob.arArgentinaNo correspondeNo correspondeNo correspondeopendoar:l2026-02-26 11:44:22.586INTA Digital (INTA) - Instituto Nacional de Tecnología Agropecuariafalse
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El objetivo del presente trabajo fue conocer las variantes genotípicas de Anaplasma marginale, en rodeos bovinos en una región del noroeste de Entre Ríos con antecedentes de ocurrencia de casos clínicos de anaplasmosis. A partir de un estudio observacional se obtuvieron muestras (sangre y suero) de terneros de cuatro a ocho meses de edad, de 49 establecimientos de los departamentos de Feliciano, Federal y La Paz (n=989). Las muestras de sueros se procesaron mediante la prueba de c-ELISA y según su resultado se determinó el estatus epidemiológico de anaplasmosis para cada rodeo (Mahoney; Ross, 1972). Mediante una selección de muestras por conveniencia se analizaron por PCR msp5 y RLBH 291 y 87 muestras de sangre respectivamente. Se evaluaron las variantes genotípicas del marcador molecular msp1α de A. marginale que presenta diferencias nucleotídicas en el número de repeticiones en tandem y en el tipo de bloque. Se determinó la variabilidad intra e inter-predio (OR). Se determinó que sólo 10 de los 49 rodeos analizados resultaron positivos a Anaplasma spp, y todos se encontraban en inestabilidad enzoótica, con alto o bajo riesgo de de ocurrencia de brotes de anaplasmosis. El 3,7 % (37/989), de los terneros resultó positivo en c-ELISA, mientras que de las muestras seleccionadas el 13,7 % (40/291) y el 39 % (34/87) fueron positivas en PCR msp5 y RLBH respectivamente. Las tres técnicas mostraron muy buena concordancia (K ≥ 0,8). Se encontraron ocho genotipos diferentes en los establecimientos de la Paz y Feliciano, de los cuales, cinco genotipos y dos bloques se describieron por primera vez en este trabajo. La variabilidad intra e inter establecimiento tuvo un Odds Ratio: 12,4 (IC 95% 5,9-25,67) y una asociación significativa (X2 46,3; p<0,0001), lo que indica que los genotipos que pertenecen al mismo establecimiento tienen mayor probabilidad de incluir secuencias iguales y la diversidad genotípica de los aislamientos no tendría una distribución al azar, sino por el contrario estaría agrupada por establecimientos. Las diferentes técnicas diagnósticas aplicadas estratégicamente, la recopilación de antecedentes y el conocimiento de la diversidad genotípica de A. marginale proporcionaron nueva información sobre la epidemiología de la anaplasmosis bovina en el NO de Entre Ríos.
The objective of this work was to study the genetic diversity of A. marginale in beef cattle herds in the North West of Entre Rios, province where clinical cases of anaplasmosis has frequently been reported. To establish the epidemiological status of each herd, samples from 49 cattle farms, located in 3 districts (n=989) were obtained and analyzed using c-ELISA. Convenient samples were selected to analyze blood samples using PCRmsp5 (n=291) and RLBH (n=87). The msp1α gene of A. marginale, selected as molecular marker, was analyzed based on nucleotide differences in the number of repetitions in tandem and in the block type. The genetic variability in and between herds was also evaluated (odds ratio). Ten of 49 herds (20,4%) resulted positive to Anaplasma spp. and were under enzootic instability with either high or low risk of occurrence of anaplasmosis outbreaks; 3.7 % (37/989) of calves were positive to c-ELISA, meanwhile on the selected blood samples 13.7 % (40/291) and 39% (39/87) were positives to PCRmsp5 and RLBH respectively. The three techniques showed a high concord (K≥ 0.8). Eight different genotypes were identified in La Paz and Feliciano districts, five of the genotypes and two of the blocks were described for the first time in Argentina. The odds ratio in and between herds was 12.4 (IC 95% 5.999-25.67) with significant association (X2 46.3; p <0.0001), pointing out that genotypes identified in each herd, had higher probabilities to include identical sequences. The A. marginale genetic diversity would not be randomly distributed; on the contrary it would be restricted to each herd. The conclusion of this work is that the combination of different diagnostic techniques and the knowledge of A. marginale genetic diversity provided solid information on the epidemiology of the bovine anaplasmosis in the NW of Entre Rios, and allowed to establish the needed to implement preventive measures in this region.
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