Complete genome sequence of sunflower ring blotch virus, a new potyvirus infecting sunflower in Argentina

Autores
Cabrera Mederos, Dariel; Bejerman, Nicolas Esteban; Trucco, Veronica Milagros; De Breuil, Soledad; Lenardon, Sergio Luis; Giolitti, Fabian
Año de publicación
2017
Idioma
inglés
Tipo de recurso
artículo
Estado
versión publicada
Descripción
The complete genome sequence of sunflower ring blotch virus (SuRBV), a previously undescribed potyvirus infecting sunflower in Argentina, is reported. The SuRBV genome comprises 9555 nucleotides (nt) and encodes a polyprotein of 3061 amino acids, flanked by 5′ and 3′ untranslated regions of 117 and 255 nt, respectively. Phylogenetic analysis showed that SuRBV belongs to the potato virus Y (PVY) subgroup and clusters together with sunflower chlorotic mottle virus and bidens mosaic virus. Percentage nucleotide identity between the whole genomes of SuRBV and BiMV was 70.6%, suggesting SuRBV should be considered a distinct species in the genus Potyvirus.
Instituto de Patología Vegetal
Fil: Cabrera Mederos, Dariel. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad Central “Marta Abreu” de Las Villas. Facultad de Ciencias Agropecuarias. Departamento de Agronomía; Cuba
Fil: Bejerman, Nicolas Esteban. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
Fil: Trucco, Veronica Milagros: Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; Argentina
Fil: De Breuil, Soledad. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
Fil: Lenardon, Sergio Luis. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; Argentina
Fil: Giolitti, Fabian. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; Argentina
Fuente
Archives of virology 162 (6) : 787–1790. (June 2017)
Materia
Helianthus annuus
Virus de las Plantas
Potyvirus
Genomas
Secuencia Nucleotídica
Plant Viruses
Potyviruses
Genomes
Nucleotide Sequence
Argentina
Girasol
Sunflower
Nivel de accesibilidad
acceso restringido
Condiciones de uso
Repositorio
INTA Digital (INTA)
Institución
Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria
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Fil: Cabrera Mederos, Dariel. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Patología Vegetal; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad Central “Marta Abreu” de Las Villas. Facultad de Ciencias Agropecuarias. Departamento de Agronomía; Cuba
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