Hybridization and polyploidization effects on LTR‑retrotransposon activation in potato genome

Autores
Gantuz, Magdalena; Morales Sanfurgo, Hugo Andres; Bertoldi, Maria Victoria; Ibañez, Verónica Noé; Duarte, Paola Fernanda; Marfil, Carlos Federico; Masuelli, Ricardo Williams
Año de publicación
2021
Idioma
inglés
Tipo de recurso
artículo
Estado
versión publicada
Descripción
Hybridization and polyploidization are major forces in plant evolution and potatoes are not an exception. It is proposed that the proliferation of Long Terminal Repeat-retrotransposons (LTR-RT) is related to genome reorganization caused by hybridization and/or polyploidization. The main purpose of the present work was to evaluate the effect of interspecific hybridization and polyploidization on the activation of LTR-RT. We evaluated the proliferation of putative active LTR-RT in a diploid hybrid between the cultivated potato Solanum tuberosum and the wild diploid potato species S. kurtzianum, allotetraploid lines derived from this interspecific hybrid and S. kurtzianum autotetraploid lines (ktz-autotetraploid) using the S-SAP (sequence-specific amplified polymorphism) technique and normalized copy number determination by qPCR. Twenty-nine LTR-RT copies were activated in the hybrid and present in the allotetraploid lines. Major LTR-RT activity was detected in Copia-27, Copia-12, Copia-14 and, Gypsy-22. According to our results, LTR-RT copies were activated principally in the hybrid, there was no activation in allotetraploid lines and only one copy was activated in the autotetraploid.
EEA Mendoza
Fil: Gantuz, Magdalena. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Biología Agrícola de Mendoza; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología Agrícola de Mendoza; Argentina
Fil: Morales Sanfurgo, Hugo Andres. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Mendoza; Argentina
Fil: Bertoldi, Maria Victoria. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Biología Agrícola de Mendoza; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología Agrícola de Mendoza; Argentina
Fil: Ibañez, Veronica Noe. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Biología Agrícola de Mendoza; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología Agrícola de Mendoza; Argentina
Fil: Duarte, Paola Fernanda. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Biología Agrícola de Mendoza; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología Agrícola de Mendoza; Argentina
Fil: Marfil, Carlos Federico. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Biología Agrícola de Mendoza; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología Agrícola de Mendoza; Argentina
Fil: Masuelli, Ricardo William. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Biología Agrícola de Mendoza; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología Agrícola de Mendoza; Argentina
Fuente
Journal of Plant Research (Published: 21 October 2021)
Materia
Papa
Hibridación
Poliploidia
Potatoes
Hybridation
Polyploidia
Solanum tuberosum
Long Terminal Repeat Retrotransposons
Nivel de accesibilidad
acceso restringido
Condiciones de uso
Repositorio
INTA Digital (INTA)
Institución
Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria
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Fil: Marfil, Carlos Federico. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Biología Agrícola de Mendoza; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología Agrícola de Mendoza; Argentina
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