Hybridization and polyploidization effects on LTR‑retrotransposon activation in potato genome

Autores
Gantuz, Magdalena; Morales Sanfurgo, Hugo Andres; Bertoldi, Maria Victoria; Ibañez, Verónica Noé; Duarte, Paola Fernanda; Marfil, Carlos Federico; Masuelli, Ricardo Williams
Año de publicación
2021
Idioma
inglés
Tipo de recurso
artículo
Estado
versión publicada
Descripción
Hybridization and polyploidization are major forces in plant evolution and potatoes are not an exception. It is proposed that the proliferation of Long Terminal Repeat-retrotransposons (LTR-RT) is related to genome reorganization caused by hybridization and/or polyploidization. The main purpose of the present work was to evaluate the effect of interspecific hybridization and polyploidization on the activation of LTR-RT. We evaluated the proliferation of putative active LTR-RT in a diploid hybrid between the cultivated potato Solanum tuberosum and the wild diploid potato species S. kurtzianum, allotetraploid lines derived from this interspecific hybrid and S. kurtzianum autotetraploid lines (ktz-autotetraploid) using the S-SAP (sequence-specific amplified polymorphism) technique and normalized copy number determination by qPCR. Twenty-nine LTR-RT copies were activated in the hybrid and present in the allotetraploid lines. Major LTR-RT activity was detected in Copia-27, Copia-12, Copia-14 and, Gypsy-22. According to our results, LTR-RT copies were activated principally in the hybrid, there was no activation in allotetraploid lines and only one copy was activated in the autotetraploid.
EEA Mendoza
Fil: Gantuz, Magdalena. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Biología Agrícola de Mendoza; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología Agrícola de Mendoza; Argentina
Fil: Morales Sanfurgo, Hugo Andres. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Mendoza; Argentina
Fil: Bertoldi, Maria Victoria. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Biología Agrícola de Mendoza; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología Agrícola de Mendoza; Argentina
Fil: Ibañez, Veronica Noe. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Biología Agrícola de Mendoza; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología Agrícola de Mendoza; Argentina
Fil: Duarte, Paola Fernanda. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Biología Agrícola de Mendoza; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología Agrícola de Mendoza; Argentina
Fil: Marfil, Carlos Federico. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Biología Agrícola de Mendoza; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología Agrícola de Mendoza; Argentina
Fil: Masuelli, Ricardo William. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Biología Agrícola de Mendoza; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología Agrícola de Mendoza; Argentina
Fuente
Journal of Plant Research (Published: 21 October 2021)
Materia
Papa
Hibridación
Poliploidia
Potatoes
Hybridation
Polyploidia
Solanum tuberosum
Long Terminal Repeat Retrotransposons
Nivel de accesibilidad
acceso restringido
Condiciones de uso
Repositorio
INTA Digital (INTA)
Institución
Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria
OAI Identificador
oai:localhost:20.500.12123/10592
Acceder
id INTADig_6d7bfa604581193312621d876e44c736
oai_identifier_str oai:localhost:20.500.12123/10592
network_acronym_str INTADig
repository_id_str l
network_name_str INTA Digital (INTA)
spelling Hybridization and polyploidization effects on LTR‑retrotransposon activation in potato genomeGantuz, MagdalenaMorales Sanfurgo, Hugo AndresBertoldi, Maria VictoriaIbañez, Verónica NoéDuarte, Paola FernandaMarfil, Carlos FedericoMasuelli, Ricardo WilliamsPapaHibridaciónPoliploidiaPotatoesHybridationPolyploidiaSolanum tuberosumLong Terminal Repeat RetrotransposonsHybridization and polyploidization are major forces in plant evolution and potatoes are not an exception. It is proposed that the proliferation of Long Terminal Repeat-retrotransposons (LTR-RT) is related to genome reorganization caused by hybridization and/or polyploidization. The main purpose of the present work was to evaluate the effect of interspecific hybridization and polyploidization on the activation of LTR-RT. We evaluated the proliferation of putative active LTR-RT in a diploid hybrid between the cultivated potato Solanum tuberosum and the wild diploid potato species S. kurtzianum, allotetraploid lines derived from this interspecific hybrid and S. kurtzianum autotetraploid lines (ktz-autotetraploid) using the S-SAP (sequence-specific amplified polymorphism) technique and normalized copy number determination by qPCR. Twenty-nine LTR-RT copies were activated in the hybrid and present in the allotetraploid lines. Major LTR-RT activity was detected in Copia-27, Copia-12, Copia-14 and, Gypsy-22. According to our results, LTR-RT copies were activated principally in the hybrid, there was no activation in allotetraploid lines and only one copy was activated in the autotetraploid.EEA MendozaFil: Gantuz, Magdalena. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Biología Agrícola de Mendoza; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología Agrícola de Mendoza; ArgentinaFil: Morales Sanfurgo, Hugo Andres. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Mendoza; ArgentinaFil: Bertoldi, Maria Victoria. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Biología Agrícola de Mendoza; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología Agrícola de Mendoza; ArgentinaFil: Ibañez, Veronica Noe. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Biología Agrícola de Mendoza; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología Agrícola de Mendoza; ArgentinaFil: Duarte, Paola Fernanda. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Biología Agrícola de Mendoza; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología Agrícola de Mendoza; ArgentinaFil: Marfil, Carlos Federico. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Biología Agrícola de Mendoza; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología Agrícola de Mendoza; ArgentinaFil: Masuelli, Ricardo William. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Biología Agrícola de Mendoza; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología Agrícola de Mendoza; ArgentinaThe Botanical Society of Japan2021-10-26T14:40:19Z2021-10-26T14:40:19Z2021-10-26info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_6501info:ar-repo/semantics/articuloapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/20.500.12123/10592https://link.springer.com/article/10.1007%2Fs10265-021-01354-90918-94401618-0860https://doi.org/10.1007/s10265-021-01354-9Journal of Plant Research (Published: 21 October 2021)reponame:INTA Digital (INTA)instname:Instituto Nacional de Tecnología Agropecuariaenginfo:eu-repo/semantics/restrictedAccess2025-11-27T08:39:01Zoai:localhost:20.500.12123/10592instacron:INTAInstitucionalhttp://repositorio.inta.gob.ar/Organismo científico-tecnológicoNo correspondehttp://repositorio.inta.gob.ar/oai/requesttripaldi.nicolas@inta.gob.arArgentinaNo correspondeNo correspondeNo correspondeopendoar:l2025-11-27 08:39:01.426INTA Digital (INTA) - Instituto Nacional de Tecnología Agropecuariafalse
dc.title.none.fl_str_mv Hybridization and polyploidization effects on LTR‑retrotransposon activation in potato genome
title Hybridization and polyploidization effects on LTR‑retrotransposon activation in potato genome
spellingShingle Hybridization and polyploidization effects on LTR‑retrotransposon activation in potato genome
Gantuz, Magdalena
Papa
Hibridación
Poliploidia
Potatoes
Hybridation
Polyploidia
Solanum tuberosum
Long Terminal Repeat Retrotransposons
title_short Hybridization and polyploidization effects on LTR‑retrotransposon activation in potato genome
title_full Hybridization and polyploidization effects on LTR‑retrotransposon activation in potato genome
title_fullStr Hybridization and polyploidization effects on LTR‑retrotransposon activation in potato genome
title_full_unstemmed Hybridization and polyploidization effects on LTR‑retrotransposon activation in potato genome
title_sort Hybridization and polyploidization effects on LTR‑retrotransposon activation in potato genome
dc.creator.none.fl_str_mv Gantuz, Magdalena
Morales Sanfurgo, Hugo Andres
Bertoldi, Maria Victoria
Ibañez, Verónica Noé
Duarte, Paola Fernanda
Marfil, Carlos Federico
Masuelli, Ricardo Williams
author Gantuz, Magdalena
author_facet Gantuz, Magdalena
Morales Sanfurgo, Hugo Andres
Bertoldi, Maria Victoria
Ibañez, Verónica Noé
Duarte, Paola Fernanda
Marfil, Carlos Federico
Masuelli, Ricardo Williams
author_role author
author2 Morales Sanfurgo, Hugo Andres
Bertoldi, Maria Victoria
Ibañez, Verónica Noé
Duarte, Paola Fernanda
Marfil, Carlos Federico
Masuelli, Ricardo Williams
author2_role author
author
author
author
author
author
dc.subject.none.fl_str_mv Papa
Hibridación
Poliploidia
Potatoes
Hybridation
Polyploidia
Solanum tuberosum
Long Terminal Repeat Retrotransposons
topic Papa
Hibridación
Poliploidia
Potatoes
Hybridation
Polyploidia
Solanum tuberosum
Long Terminal Repeat Retrotransposons
dc.description.none.fl_txt_mv Hybridization and polyploidization are major forces in plant evolution and potatoes are not an exception. It is proposed that the proliferation of Long Terminal Repeat-retrotransposons (LTR-RT) is related to genome reorganization caused by hybridization and/or polyploidization. The main purpose of the present work was to evaluate the effect of interspecific hybridization and polyploidization on the activation of LTR-RT. We evaluated the proliferation of putative active LTR-RT in a diploid hybrid between the cultivated potato Solanum tuberosum and the wild diploid potato species S. kurtzianum, allotetraploid lines derived from this interspecific hybrid and S. kurtzianum autotetraploid lines (ktz-autotetraploid) using the S-SAP (sequence-specific amplified polymorphism) technique and normalized copy number determination by qPCR. Twenty-nine LTR-RT copies were activated in the hybrid and present in the allotetraploid lines. Major LTR-RT activity was detected in Copia-27, Copia-12, Copia-14 and, Gypsy-22. According to our results, LTR-RT copies were activated principally in the hybrid, there was no activation in allotetraploid lines and only one copy was activated in the autotetraploid.
EEA Mendoza
Fil: Gantuz, Magdalena. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Biología Agrícola de Mendoza; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología Agrícola de Mendoza; Argentina
Fil: Morales Sanfurgo, Hugo Andres. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Mendoza; Argentina
Fil: Bertoldi, Maria Victoria. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Biología Agrícola de Mendoza; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología Agrícola de Mendoza; Argentina
Fil: Ibañez, Veronica Noe. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Biología Agrícola de Mendoza; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología Agrícola de Mendoza; Argentina
Fil: Duarte, Paola Fernanda. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Biología Agrícola de Mendoza; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología Agrícola de Mendoza; Argentina
Fil: Marfil, Carlos Federico. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Biología Agrícola de Mendoza; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología Agrícola de Mendoza; Argentina
Fil: Masuelli, Ricardo William. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Biología Agrícola de Mendoza; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología Agrícola de Mendoza; Argentina
description Hybridization and polyploidization are major forces in plant evolution and potatoes are not an exception. It is proposed that the proliferation of Long Terminal Repeat-retrotransposons (LTR-RT) is related to genome reorganization caused by hybridization and/or polyploidization. The main purpose of the present work was to evaluate the effect of interspecific hybridization and polyploidization on the activation of LTR-RT. We evaluated the proliferation of putative active LTR-RT in a diploid hybrid between the cultivated potato Solanum tuberosum and the wild diploid potato species S. kurtzianum, allotetraploid lines derived from this interspecific hybrid and S. kurtzianum autotetraploid lines (ktz-autotetraploid) using the S-SAP (sequence-specific amplified polymorphism) technique and normalized copy number determination by qPCR. Twenty-nine LTR-RT copies were activated in the hybrid and present in the allotetraploid lines. Major LTR-RT activity was detected in Copia-27, Copia-12, Copia-14 and, Gypsy-22. According to our results, LTR-RT copies were activated principally in the hybrid, there was no activation in allotetraploid lines and only one copy was activated in the autotetraploid.
publishDate 2021
dc.date.none.fl_str_mv 2021-10-26T14:40:19Z
2021-10-26T14:40:19Z
2021-10-26
dc.type.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/article
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
http://purl.org/coar/resource_type/c_6501
info:ar-repo/semantics/articulo
format article
status_str publishedVersion
dc.identifier.none.fl_str_mv http://hdl.handle.net/20.500.12123/10592
https://link.springer.com/article/10.1007%2Fs10265-021-01354-9
0918-9440
1618-0860
https://doi.org/10.1007/s10265-021-01354-9
url http://hdl.handle.net/20.500.12123/10592
https://link.springer.com/article/10.1007%2Fs10265-021-01354-9
https://doi.org/10.1007/s10265-021-01354-9
identifier_str_mv 0918-9440
1618-0860
dc.language.none.fl_str_mv eng
language eng
dc.rights.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/restrictedAccess
eu_rights_str_mv restrictedAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv The Botanical Society of Japan
publisher.none.fl_str_mv The Botanical Society of Japan
dc.source.none.fl_str_mv Journal of Plant Research (Published: 21 October 2021)
reponame:INTA Digital (INTA)
instname:Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria
reponame_str INTA Digital (INTA)
collection INTA Digital (INTA)
instname_str Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria
repository.name.fl_str_mv INTA Digital (INTA) - Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria
repository.mail.fl_str_mv tripaldi.nicolas@inta.gob.ar
_version_ 1849949292529188864
score 13.227901

Publicaciones similares