Mapeo fino de genes de resistencia a roya de la hoja provenientes de una variedad de trigo con resistencia durable a esta enfermedad

Autores
Pergolesi, María Fernanda
Año de publicación
2025
Idioma
español castellano
Tipo de recurso
tesis doctoral
Estado
versión aceptada
Colaborador/a o director/a de tesis
Sacco, Francisco (director)
Dieguez, Maria Jose (directora asistente)
Descripción
Tesis presentada para optar al título de Doctora en el área de Ciencias Biológicas, de la Universidad de Buenos Aires, en febrero de 2025
El objetivo general del presente trabajo fue desarrollar mapas genéticos de alta resolución para dos genes de resistencia a roya de la hoja de trigo, identificados en la variedad con resistencia durable Sinvalocho MA (SV). Uno de los genes detectados es el Lr3 de resistencia desde plántula (ASR) y el otro el LrSV2 de expresión en planta adulta (APR) con un efecto significativo en la resistencia observada a campo. Un mapa de alta resolución permite definir un intervalo genético lo suficientemente reducido para identificar un bajo número de genes codificantes que deberán ser posteriormente validados como responsables del fenotipo estudiado (clonado posicional). Se logró posicionar al gen Lr3, localizado en el cromosoma 6BL, en un intervalo de 6,9 cM y al gen LrSV2, ubicado en el cromosoma 3BS, en un intervalo de 0,04 cM. Estos intervalos corresponden a 2 Mb y 748 kb respectivamente en la variedad Chinese Spring (CS), donde se han anotado con alta confianza 57 y 40 genes respectivamente. Mediante tratamientos mutagénicos con EMS (etilo metano sulfonato) sobre semillas de SV, se obtuvieron hasta el momento, 3 mutantes susceptibles a la raza que identifica al LrSV2 en planta adulta, que serán de utilidad para validar potenciales genes candidatos. La disponibilidad de mapas de alta resolución es un insumo fundamental para el clonado posicional de genes. La información acerca de las secuencias génicas permite la introducción eficiente de los mismos en cultivares elite, tanto mediante retrocruzas asistidas por marcadores desarrollados a partir de su secuencia, como por transgénesis o edición génica. La utilización de genes de resistencia es una herramienta muy eficaz para el control de enfermedades y además mejora la sustentabilidad del cultivo, ya que contribuye a reducir el uso de agroquímicos. Asimismo, un mejor conocimiento de las bases moleculares de la interacción planta-patógeno puede contribuir a desarrollar nuevas y más eficientes metodologías para el control de enfermedades de origen fúngico en cereales.
Fine mapping of leaf rust resistance genes from a wheat variety with durable resistance to this disease The main objective of the present work was to develop high resolution genetic maps for two leaf rust resistance genes, identified in the wheat durable resistant variety Sinvalocho MA (SV). One of the genes detected is the ASR Lr3 gene, and the other APR LrSV2 gene. This last gene showed a significant effect on field leaf rust resistance. A high-resolution map allows defining a small genetic interval that contains a low number of coding genes, that must subsequently be validated as responsible for the observed phenotype (positional cloning). Lr3 gene, located on a telomeric region of chromosome 6BL, was mapped in a 6,9 cM interval. LrSV2 gene, located on a subtelomeric region of chromosome 3BS, was mapped in a 0.04 cM interval. These intervals are equivalent to 2 Mb and 748 Kb, respectively, in CS wheat, where 57 and 40 high confidence genes were annotated, respectively. Through mutagenic treatments with EMS (ethyl methane sulfonate) on SV seeds, 3 M3 susceptible mutant plants to the race that identifies LrSV2 in adult plants were obtained to date, which will be useful to validate potential candidate genes. The availability of high-resolution maps is a fundamental input for positional gene cloning. Information about gene sequences allows their efficient introduction into elite cultivars, both through backcrosses assisted by markers developed from their sequence, as well as by transgenesis or gene editing. The use of resistance genes is a very effective tool for disease control, and improves the sustainability of the crop, since it contributes to reducing the use of agrochemicals. Likewise, a better knowledge of the molecular bases of the plant-pathogen interaction can contribute to developing new and more efficient methodologies for the control of fungal diseases in cereals.
Instituto de Genética
Fil: Pergolesi, Marí­a Fernanda. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Genética; Argentina
Fil: Pergolesi, Marí­a Fernanda. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Ecología, Genética y Evolución; Argentina
Materia
Triticum aestivum
Gen de Resistencia
Puccinia recondita
Trigo
Resistencia a la Enfermedad
Resistance Genes
Wheat
Disease Resistance
Puccinia triticina
Roya de la Hoja de Trigo
Wheat Leaf Rust
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
Repositorio
INTA Digital (INTA)
Institución
Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria
OAI Identificador
oai:localhost:20.500.12123/22875

id INTADig_6c43b679083064ddce4f543f97fb01cb
oai_identifier_str oai:localhost:20.500.12123/22875
network_acronym_str INTADig
repository_id_str l
network_name_str INTA Digital (INTA)
spelling Mapeo fino de genes de resistencia a roya de la hoja provenientes de una variedad de trigo con resistencia durable a esta enfermedadPergolesi, María FernandaTriticum aestivumGen de ResistenciaPuccinia reconditaTrigoResistencia a la EnfermedadResistance GenesWheatDisease ResistancePuccinia triticinaRoya de la Hoja de TrigoWheat Leaf RustTesis presentada para optar al título de Doctora en el área de Ciencias Biológicas, de la Universidad de Buenos Aires, en febrero de 2025El objetivo general del presente trabajo fue desarrollar mapas genéticos de alta resolución para dos genes de resistencia a roya de la hoja de trigo, identificados en la variedad con resistencia durable Sinvalocho MA (SV). Uno de los genes detectados es el Lr3 de resistencia desde plántula (ASR) y el otro el LrSV2 de expresión en planta adulta (APR) con un efecto significativo en la resistencia observada a campo. Un mapa de alta resolución permite definir un intervalo genético lo suficientemente reducido para identificar un bajo número de genes codificantes que deberán ser posteriormente validados como responsables del fenotipo estudiado (clonado posicional). Se logró posicionar al gen Lr3, localizado en el cromosoma 6BL, en un intervalo de 6,9 cM y al gen LrSV2, ubicado en el cromosoma 3BS, en un intervalo de 0,04 cM. Estos intervalos corresponden a 2 Mb y 748 kb respectivamente en la variedad Chinese Spring (CS), donde se han anotado con alta confianza 57 y 40 genes respectivamente. Mediante tratamientos mutagénicos con EMS (etilo metano sulfonato) sobre semillas de SV, se obtuvieron hasta el momento, 3 mutantes susceptibles a la raza que identifica al LrSV2 en planta adulta, que serán de utilidad para validar potenciales genes candidatos. La disponibilidad de mapas de alta resolución es un insumo fundamental para el clonado posicional de genes. La información acerca de las secuencias génicas permite la introducción eficiente de los mismos en cultivares elite, tanto mediante retrocruzas asistidas por marcadores desarrollados a partir de su secuencia, como por transgénesis o edición génica. La utilización de genes de resistencia es una herramienta muy eficaz para el control de enfermedades y además mejora la sustentabilidad del cultivo, ya que contribuye a reducir el uso de agroquímicos. Asimismo, un mejor conocimiento de las bases moleculares de la interacción planta-patógeno puede contribuir a desarrollar nuevas y más eficientes metodologías para el control de enfermedades de origen fúngico en cereales.Fine mapping of leaf rust resistance genes from a wheat variety with durable resistance to this disease The main objective of the present work was to develop high resolution genetic maps for two leaf rust resistance genes, identified in the wheat durable resistant variety Sinvalocho MA (SV). One of the genes detected is the ASR Lr3 gene, and the other APR LrSV2 gene. This last gene showed a significant effect on field leaf rust resistance. A high-resolution map allows defining a small genetic interval that contains a low number of coding genes, that must subsequently be validated as responsible for the observed phenotype (positional cloning). Lr3 gene, located on a telomeric region of chromosome 6BL, was mapped in a 6,9 cM interval. LrSV2 gene, located on a subtelomeric region of chromosome 3BS, was mapped in a 0.04 cM interval. These intervals are equivalent to 2 Mb and 748 Kb, respectively, in CS wheat, where 57 and 40 high confidence genes were annotated, respectively. Through mutagenic treatments with EMS (ethyl methane sulfonate) on SV seeds, 3 M3 susceptible mutant plants to the race that identifies LrSV2 in adult plants were obtained to date, which will be useful to validate potential candidate genes. The availability of high-resolution maps is a fundamental input for positional gene cloning. Information about gene sequences allows their efficient introduction into elite cultivars, both through backcrosses assisted by markers developed from their sequence, as well as by transgenesis or gene editing. The use of resistance genes is a very effective tool for disease control, and improves the sustainability of the crop, since it contributes to reducing the use of agrochemicals. Likewise, a better knowledge of the molecular bases of the plant-pathogen interaction can contribute to developing new and more efficient methodologies for the control of fungal diseases in cereals.Instituto de GenéticaFil: Pergolesi, Marí­a Fernanda. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Genética; ArgentinaFil: Pergolesi, Marí­a Fernanda. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Ecología, Genética y Evolución; ArgentinaFacultad de Ciencias Exactas y Naturales, Universidad de Buenos AiresSacco, Francisco (director)Dieguez, Maria Jose (directora asistente)2025-07-03T12:08:15Z2025-07-03T12:08:15Z2025-02info:eu-repo/semantics/doctoralThesisinfo:eu-repo/semantics/acceptedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_db06info:ar-repo/semantics/tesisDoctoralapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/20.500.12123/22875spainfo:eu-repo/semantics/openAccesshttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/Creative Commons Attribution-NonCommercial-ShareAlike 4.0 International (CC BY-NC-SA 4.0)reponame:INTA Digital (INTA)instname:Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria2025-09-29T13:47:23Zoai:localhost:20.500.12123/22875instacron:INTAInstitucionalhttp://repositorio.inta.gob.ar/Organismo científico-tecnológicoNo correspondehttp://repositorio.inta.gob.ar/oai/requesttripaldi.nicolas@inta.gob.arArgentinaNo correspondeNo correspondeNo correspondeopendoar:l2025-09-29 13:47:23.758INTA Digital (INTA) - Instituto Nacional de Tecnología Agropecuariafalse
dc.title.none.fl_str_mv Mapeo fino de genes de resistencia a roya de la hoja provenientes de una variedad de trigo con resistencia durable a esta enfermedad
title Mapeo fino de genes de resistencia a roya de la hoja provenientes de una variedad de trigo con resistencia durable a esta enfermedad
spellingShingle Mapeo fino de genes de resistencia a roya de la hoja provenientes de una variedad de trigo con resistencia durable a esta enfermedad
Pergolesi, María Fernanda
Triticum aestivum
Gen de Resistencia
Puccinia recondita
Trigo
Resistencia a la Enfermedad
Resistance Genes
Wheat
Disease Resistance
Puccinia triticina
Roya de la Hoja de Trigo
Wheat Leaf Rust
title_short Mapeo fino de genes de resistencia a roya de la hoja provenientes de una variedad de trigo con resistencia durable a esta enfermedad
title_full Mapeo fino de genes de resistencia a roya de la hoja provenientes de una variedad de trigo con resistencia durable a esta enfermedad
title_fullStr Mapeo fino de genes de resistencia a roya de la hoja provenientes de una variedad de trigo con resistencia durable a esta enfermedad
title_full_unstemmed Mapeo fino de genes de resistencia a roya de la hoja provenientes de una variedad de trigo con resistencia durable a esta enfermedad
title_sort Mapeo fino de genes de resistencia a roya de la hoja provenientes de una variedad de trigo con resistencia durable a esta enfermedad
dc.creator.none.fl_str_mv Pergolesi, María Fernanda
author Pergolesi, María Fernanda
author_facet Pergolesi, María Fernanda
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Sacco, Francisco (director)
Dieguez, Maria Jose (directora asistente)
dc.subject.none.fl_str_mv Triticum aestivum
Gen de Resistencia
Puccinia recondita
Trigo
Resistencia a la Enfermedad
Resistance Genes
Wheat
Disease Resistance
Puccinia triticina
Roya de la Hoja de Trigo
Wheat Leaf Rust
topic Triticum aestivum
Gen de Resistencia
Puccinia recondita
Trigo
Resistencia a la Enfermedad
Resistance Genes
Wheat
Disease Resistance
Puccinia triticina
Roya de la Hoja de Trigo
Wheat Leaf Rust
dc.description.none.fl_txt_mv Tesis presentada para optar al título de Doctora en el área de Ciencias Biológicas, de la Universidad de Buenos Aires, en febrero de 2025
El objetivo general del presente trabajo fue desarrollar mapas genéticos de alta resolución para dos genes de resistencia a roya de la hoja de trigo, identificados en la variedad con resistencia durable Sinvalocho MA (SV). Uno de los genes detectados es el Lr3 de resistencia desde plántula (ASR) y el otro el LrSV2 de expresión en planta adulta (APR) con un efecto significativo en la resistencia observada a campo. Un mapa de alta resolución permite definir un intervalo genético lo suficientemente reducido para identificar un bajo número de genes codificantes que deberán ser posteriormente validados como responsables del fenotipo estudiado (clonado posicional). Se logró posicionar al gen Lr3, localizado en el cromosoma 6BL, en un intervalo de 6,9 cM y al gen LrSV2, ubicado en el cromosoma 3BS, en un intervalo de 0,04 cM. Estos intervalos corresponden a 2 Mb y 748 kb respectivamente en la variedad Chinese Spring (CS), donde se han anotado con alta confianza 57 y 40 genes respectivamente. Mediante tratamientos mutagénicos con EMS (etilo metano sulfonato) sobre semillas de SV, se obtuvieron hasta el momento, 3 mutantes susceptibles a la raza que identifica al LrSV2 en planta adulta, que serán de utilidad para validar potenciales genes candidatos. La disponibilidad de mapas de alta resolución es un insumo fundamental para el clonado posicional de genes. La información acerca de las secuencias génicas permite la introducción eficiente de los mismos en cultivares elite, tanto mediante retrocruzas asistidas por marcadores desarrollados a partir de su secuencia, como por transgénesis o edición génica. La utilización de genes de resistencia es una herramienta muy eficaz para el control de enfermedades y además mejora la sustentabilidad del cultivo, ya que contribuye a reducir el uso de agroquímicos. Asimismo, un mejor conocimiento de las bases moleculares de la interacción planta-patógeno puede contribuir a desarrollar nuevas y más eficientes metodologías para el control de enfermedades de origen fúngico en cereales.
Fine mapping of leaf rust resistance genes from a wheat variety with durable resistance to this disease The main objective of the present work was to develop high resolution genetic maps for two leaf rust resistance genes, identified in the wheat durable resistant variety Sinvalocho MA (SV). One of the genes detected is the ASR Lr3 gene, and the other APR LrSV2 gene. This last gene showed a significant effect on field leaf rust resistance. A high-resolution map allows defining a small genetic interval that contains a low number of coding genes, that must subsequently be validated as responsible for the observed phenotype (positional cloning). Lr3 gene, located on a telomeric region of chromosome 6BL, was mapped in a 6,9 cM interval. LrSV2 gene, located on a subtelomeric region of chromosome 3BS, was mapped in a 0.04 cM interval. These intervals are equivalent to 2 Mb and 748 Kb, respectively, in CS wheat, where 57 and 40 high confidence genes were annotated, respectively. Through mutagenic treatments with EMS (ethyl methane sulfonate) on SV seeds, 3 M3 susceptible mutant plants to the race that identifies LrSV2 in adult plants were obtained to date, which will be useful to validate potential candidate genes. The availability of high-resolution maps is a fundamental input for positional gene cloning. Information about gene sequences allows their efficient introduction into elite cultivars, both through backcrosses assisted by markers developed from their sequence, as well as by transgenesis or gene editing. The use of resistance genes is a very effective tool for disease control, and improves the sustainability of the crop, since it contributes to reducing the use of agrochemicals. Likewise, a better knowledge of the molecular bases of the plant-pathogen interaction can contribute to developing new and more efficient methodologies for the control of fungal diseases in cereals.
Instituto de Genética
Fil: Pergolesi, Marí­a Fernanda. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Genética; Argentina
Fil: Pergolesi, Marí­a Fernanda. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Ecología, Genética y Evolución; Argentina
description Tesis presentada para optar al título de Doctora en el área de Ciencias Biológicas, de la Universidad de Buenos Aires, en febrero de 2025
publishDate 2025
dc.date.none.fl_str_mv 2025-07-03T12:08:15Z
2025-07-03T12:08:15Z
2025-02
dc.type.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
info:eu-repo/semantics/acceptedVersion
http://purl.org/coar/resource_type/c_db06
info:ar-repo/semantics/tesisDoctoral
format doctoralThesis
status_str acceptedVersion
dc.identifier.none.fl_str_mv http://hdl.handle.net/20.500.12123/22875
url http://hdl.handle.net/20.500.12123/22875
dc.language.none.fl_str_mv spa
language spa
dc.rights.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
Creative Commons Attribution-NonCommercial-ShareAlike 4.0 International (CC BY-NC-SA 4.0)
eu_rights_str_mv openAccess
rights_invalid_str_mv http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
Creative Commons Attribution-NonCommercial-ShareAlike 4.0 International (CC BY-NC-SA 4.0)
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Facultad de Ciencias Exactas y Naturales, Universidad de Buenos Aires
publisher.none.fl_str_mv Facultad de Ciencias Exactas y Naturales, Universidad de Buenos Aires
dc.source.none.fl_str_mv reponame:INTA Digital (INTA)
instname:Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria
reponame_str INTA Digital (INTA)
collection INTA Digital (INTA)
instname_str Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria
repository.name.fl_str_mv INTA Digital (INTA) - Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria
repository.mail.fl_str_mv tripaldi.nicolas@inta.gob.ar
_version_ 1844619206015844352
score 12.559606