Validación y verificación de qPCR con sonda Taqman basada en nrdB en la detección de Candidatus Liberibacter asiaticus = Validate and verify of nrdB-based Taqman probe qPCR in dete...

Autores
Tito, Blas Alfredo; Hauteville, Claudia; Gomez, Claudio Andres
Año de publicación
2025
Idioma
español castellano
Tipo de recurso
documento de conferencia
Estado
versión publicada
Descripción
Diapositivas y resumen. Publicado en: Concordia Produce 1º Exposición Productiva Multisectorial de Concordia y la región. Actas de resúmenes : 81-82. (noviembre 2025)
El Huanglongbing de los cítricos (HLB) es una enfermedad causada principalmente por la bacte-ria Candidatus Liberibacter asiaticus (CLas) y representa una amenaza importante para la industria de los cítricos. En la actualidad, la detección se basa en observación de síntomas característicos y su confirmación mediante qPCR. Estos síntomas no siempre son fáciles de distinguir de los causados por otras enfermedades de los cítricos o factores abióticos, y se dificulta su diagnóstico fiable porque esta bacteria tiene una distribución y concentración desigual en la planta. Por ello, además de su detección mediante oligonucleótidos basados en la secuencia diana que se encuentra en el gen ARNr 16S, es ne-cesario confirmarla con otra qPCR que detecte en otro gen. Por ello se planteó validar y verificar meto-dología de detección con qPCR con sonda Taqman basada en el gen nrdB para detectar CLas en cítricos. Se realizaron qPCR con sonda Taqman a extracciones de ADN en 200 mg de peciolo y nervadura central mediante método de SDS y acetato de potasio, con lavado con alcohol. Se encontró que las condiciones de ensayo satisfacen criterios de aceptación de qPCR y que la detección del gen nrdB es de utilidad para verificar la detección de CLas.
Citrus Huanglongbing (HLB) is a disease caused primarily by the bacterium Candidatus Liberibacter asiaticus (CLas) and represents a significant threat to the citrus industry. Currently, detection is based on the visual observation of characteristic symptoms and their confirmation by qPCR. These symptoms are not easy to distinguish from those caused by other citrus diseases or abiotic factors, and reliable diagnosis is difficult because this bacterium has an uneven distribution and concentration in the plant. Therefore, the detection by oligonucleotides based on the target sequence found in the 16S rRNA gene requires to confirm its detection with another qPCR that detects another gene. Therefore, the aim was to validate and verify the qPCR detection methodology with a Taqman probe based on the nrdB gene to detect CLas in citrus. Taqman probe qPCRs were performed on DNA extractions from 200 mg of petiole and midrib using the SDS-potassium acetate method, with alcohol washing. The assay conditions were found to meet qPCR acceptance criteria, and detection of the nrdB gene was useful for verifying the detection of CLas.
EEA Concordia
Fil: Tito, Blas Alfredo. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Concordia; Argentina
Fil: Hauteville, Claudia. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Concordia; Argentina
Fil: Gomez, Claudio Andres. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Concordia; Argentina
Fuente
1º Exposición Productiva Multisectorial de Concordia y la Región: "Concordia produce". Concordia, Argentina, 17 y 18 de octubre de 2025
Materia
Huanglongbing de los Cítricos
Liberibacter
Enfermedades de las Plantas
Reacción en Cadena de Polimerasa Cuantitativa
Citrus
Huanglongbing
Plant Diseases
Quantitative Polymerase Chain Reaction
Candidatus Liberibacter asiaticus (CLas)
qPCR
Sonda Taqman
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
Repositorio
INTA Digital (INTA)
Institución
Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria
OAI Identificador
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