Podredumbre en frutos de olivo (antracnosis) en el valle central de la provincia de La Rioja: etiología, incidencia y severidad en dos de sus variedades

Autores
Maza, Claudia Elizabeth
Año de publicación
2023
Idioma
español castellano
Tipo de recurso
tesis de maestría
Estado
versión aceptada
Colaborador/a o director/a de tesis
Pastor, Silvina Estela
Roca, Mónica Esther (Co-directora)
Bernardi Lima, Nelson (Asesor)
Descripción
Tesis para optar al grado de Maestría en Cultivo e Industria del Olivo, de la Escuela de Posgrado, Universidad Nacional de Chilecito, en 2023
La antracnosis del olivo, causada por Colletotrichum spp., constituye la enfermedad más importante en los frutos de este cultivo, causando disminución en la calidad de las aceitunas de mesa y sus aceites. El cultivo del olivo (Olea europaea L.) ocupa una superficie de alrededor de 90.000 hectáreas en Argentina, posicionándose como el quinto exportador de aceituna de mesa a nivel mundial. La Rioja es la provincia con mayor producción olivícola en la actualidad. El objetivo del trabajo fue caracterizar la antracnosis del olivo a través de la identificación morfológica y molecular de las especies de Colletotrichum vinculadas a la enfermedad, estimando además el daño de cosecha por evaluación de incidencia y severidad en árboles y frutos. Para la caracterización molecular del agente causal, se amplificaron por PCR los genes glicerol - 3 fosfato dehidrogeasa (GAPDH), β-tubulin (TUB2) y calmodulina (CAL) para su posterior análisis de relaciones filogenéticas. La incidencia en frutos se evaluó, por un lado, a partir de una muestra de 100 unidades por árbol, y por otro de 100 unidades por sector de copa (base, medio y superior). Para la estimación del daño se utilizó un índice de severidad (IS). A partir del análisis Bayesiano de inferencia filogenética, se identificaron las especies C. nymphaea, C. theobromicola y C. siamense en var. Manzanilla; C. nymphaea, C. theobromicola en var. Leccino; y C. nymphaea en var. Arauco. La incidencia en árboles resultó significativamente superior en Manzanilla con 73 % respecto del 38 % en Arauco. En frutos, la incidencia y el índice de severidad (IS) alcanzaron 37,6 % y 1,7 % en Manzanilla, mientras que en Arauco fue 5,8 % y 0,7 % respectivamente. Por sector de copa, en Manzanilla se registró la mayor incidencia e IS en sector base con respecto a medio y superior. En Arauco ambos parámetros no mostraron diferencias por sector de copa. Es la primera determinación de las especies de Colletotrichum en el país, base para estudios de virulencia de Colletotrichum y manejo de la enfermedad.
Olive anthracnose, caused by the Colletotrichum species, is one of the most destructive diseases of this crop, causing direct yield losses and declining oil quality. Argentina is one of the main olive producers in South America, where occupies the largest cultivated area, over 90.000 hectares. The province of La Rioja is currently the largest producer of olives in the country. The aim of this work was to characterize isolates of the Colletotrichum spp. associated with olive anthracnose in the La Rioja province, northwestern Argentina, based on DNA sequence data and morphology. Disease incidence and severity were determined in fruits and plant assessments. Based on the multilocus phylogenetic analysis, combined sequences of the partial glyceraldehyde-3- phosphate dehydrogenase (GAPDH), β-tubulin (TUB2) and calmodulin (CAL) genes, revealed three species of the genus Colletotrichum (C. nymphaea, C. theobromicola and C. siamense). All species are reported for the first time associated with the olive fruits in Argentina. The incidence in fruits was evaluated, on one hand, from a sample of 100 units per tree, and on the other hand of 100 units per tree top sector (base, middle and top). To estimate the damage, a severity index was used. The incidence in trees was significantly higher in Manzanilla with 73 % compared to the 38 % in Arauco. In fruits, the incidence and incidence rate reached 37.6 % and 1.7 % in Manzanilla, while in Arauco it was 5.8 % and 0.7 % respectively. By tree top sector, Manzanilla recorded the highest incidence and incidence rate in the base sector compared to middle and top sectors. In Arauco both parameters did not show differences by tree top sector. It is the first determination of Colletotrichum species in the country, the basis for studies of Colletotrichum virulences and disease management.
EEA Chilecito
Fil: Maza, Claudia Elizabeth. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Chilecito; Argentina
Materia
Olea Europaea
Antracnosis
Podredumbres
Colletotrichum Acutatum
Glomerella Cingulata
Biología Molecular
Daños a las Plantas
La Rioja
Anthracnosis
Rots
Molecular Biology
Plant Injuries
Olivo
Colletotrichum Gloeosporioides
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
Repositorio
INTA Digital (INTA)
Institución
Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria
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El objetivo del trabajo fue caracterizar la antracnosis del olivo a través de la identificación morfológica y molecular de las especies de Colletotrichum vinculadas a la enfermedad, estimando además el daño de cosecha por evaluación de incidencia y severidad en árboles y frutos. Para la caracterización molecular del agente causal, se amplificaron por PCR los genes glicerol - 3 fosfato dehidrogeasa (GAPDH), β-tubulin (TUB2) y calmodulina (CAL) para su posterior análisis de relaciones filogenéticas. La incidencia en frutos se evaluó, por un lado, a partir de una muestra de 100 unidades por árbol, y por otro de 100 unidades por sector de copa (base, medio y superior). Para la estimación del daño se utilizó un índice de severidad (IS). A partir del análisis Bayesiano de inferencia filogenética, se identificaron las especies C. nymphaea, C. theobromicola y C. siamense en var. Manzanilla; C. nymphaea, C. theobromicola en var. Leccino; y C. nymphaea en var. Arauco. La incidencia en árboles resultó significativamente superior en Manzanilla con 73 % respecto del 38 % en Arauco. En frutos, la incidencia y el índice de severidad (IS) alcanzaron 37,6 % y 1,7 % en Manzanilla, mientras que en Arauco fue 5,8 % y 0,7 % respectivamente. Por sector de copa, en Manzanilla se registró la mayor incidencia e IS en sector base con respecto a medio y superior. En Arauco ambos parámetros no mostraron diferencias por sector de copa. Es la primera determinación de las especies de Colletotrichum en el país, base para estudios de virulencia de Colletotrichum y manejo de la enfermedad.Olive anthracnose, caused by the Colletotrichum species, is one of the most destructive diseases of this crop, causing direct yield losses and declining oil quality. Argentina is one of the main olive producers in South America, where occupies the largest cultivated area, over 90.000 hectares. The province of La Rioja is currently the largest producer of olives in the country. The aim of this work was to characterize isolates of the Colletotrichum spp. associated with olive anthracnose in the La Rioja province, northwestern Argentina, based on DNA sequence data and morphology. Disease incidence and severity were determined in fruits and plant assessments. Based on the multilocus phylogenetic analysis, combined sequences of the partial glyceraldehyde-3- phosphate dehydrogenase (GAPDH), β-tubulin (TUB2) and calmodulin (CAL) genes, revealed three species of the genus Colletotrichum (C. nymphaea, C. theobromicola and C. siamense). All species are reported for the first time associated with the olive fruits in Argentina. The incidence in fruits was evaluated, on one hand, from a sample of 100 units per tree, and on the other hand of 100 units per tree top sector (base, middle and top). To estimate the damage, a severity index was used. The incidence in trees was significantly higher in Manzanilla with 73 % compared to the 38 % in Arauco. In fruits, the incidence and incidence rate reached 37.6 % and 1.7 % in Manzanilla, while in Arauco it was 5.8 % and 0.7 % respectively. By tree top sector, Manzanilla recorded the highest incidence and incidence rate in the base sector compared to middle and top sectors. In Arauco both parameters did not show differences by tree top sector. It is the first determination of Colletotrichum species in the country, the basis for studies of Colletotrichum virulences and disease management.EEA ChilecitoFil: Maza, Claudia Elizabeth. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). 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La antracnosis del olivo, causada por Colletotrichum spp., constituye la enfermedad más importante en los frutos de este cultivo, causando disminución en la calidad de las aceitunas de mesa y sus aceites. El cultivo del olivo (Olea europaea L.) ocupa una superficie de alrededor de 90.000 hectáreas en Argentina, posicionándose como el quinto exportador de aceituna de mesa a nivel mundial. La Rioja es la provincia con mayor producción olivícola en la actualidad. El objetivo del trabajo fue caracterizar la antracnosis del olivo a través de la identificación morfológica y molecular de las especies de Colletotrichum vinculadas a la enfermedad, estimando además el daño de cosecha por evaluación de incidencia y severidad en árboles y frutos. Para la caracterización molecular del agente causal, se amplificaron por PCR los genes glicerol - 3 fosfato dehidrogeasa (GAPDH), β-tubulin (TUB2) y calmodulina (CAL) para su posterior análisis de relaciones filogenéticas. La incidencia en frutos se evaluó, por un lado, a partir de una muestra de 100 unidades por árbol, y por otro de 100 unidades por sector de copa (base, medio y superior). Para la estimación del daño se utilizó un índice de severidad (IS). A partir del análisis Bayesiano de inferencia filogenética, se identificaron las especies C. nymphaea, C. theobromicola y C. siamense en var. Manzanilla; C. nymphaea, C. theobromicola en var. Leccino; y C. nymphaea en var. Arauco. La incidencia en árboles resultó significativamente superior en Manzanilla con 73 % respecto del 38 % en Arauco. En frutos, la incidencia y el índice de severidad (IS) alcanzaron 37,6 % y 1,7 % en Manzanilla, mientras que en Arauco fue 5,8 % y 0,7 % respectivamente. Por sector de copa, en Manzanilla se registró la mayor incidencia e IS en sector base con respecto a medio y superior. En Arauco ambos parámetros no mostraron diferencias por sector de copa. Es la primera determinación de las especies de Colletotrichum en el país, base para estudios de virulencia de Colletotrichum y manejo de la enfermedad.
Olive anthracnose, caused by the Colletotrichum species, is one of the most destructive diseases of this crop, causing direct yield losses and declining oil quality. Argentina is one of the main olive producers in South America, where occupies the largest cultivated area, over 90.000 hectares. The province of La Rioja is currently the largest producer of olives in the country. The aim of this work was to characterize isolates of the Colletotrichum spp. associated with olive anthracnose in the La Rioja province, northwestern Argentina, based on DNA sequence data and morphology. Disease incidence and severity were determined in fruits and plant assessments. Based on the multilocus phylogenetic analysis, combined sequences of the partial glyceraldehyde-3- phosphate dehydrogenase (GAPDH), β-tubulin (TUB2) and calmodulin (CAL) genes, revealed three species of the genus Colletotrichum (C. nymphaea, C. theobromicola and C. siamense). All species are reported for the first time associated with the olive fruits in Argentina. The incidence in fruits was evaluated, on one hand, from a sample of 100 units per tree, and on the other hand of 100 units per tree top sector (base, middle and top). To estimate the damage, a severity index was used. The incidence in trees was significantly higher in Manzanilla with 73 % compared to the 38 % in Arauco. In fruits, the incidence and incidence rate reached 37.6 % and 1.7 % in Manzanilla, while in Arauco it was 5.8 % and 0.7 % respectively. By tree top sector, Manzanilla recorded the highest incidence and incidence rate in the base sector compared to middle and top sectors. In Arauco both parameters did not show differences by tree top sector. It is the first determination of Colletotrichum species in the country, the basis for studies of Colletotrichum virulences and disease management.
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