Novel B2 mitogenomes from Continental southern Patagonia's Late Holocene : New insights into the peopling of the Southern Cone = Nuevos mitogenomas B2 del holoceno tardío del sur d...

Autores: Arencibia, Valeria; Muñoz Hidalgo, Marianne Graziel; Crespo, Cristian; Russo, M. Gabriela; Vera, Pablo Alfredo; Lia, Veronica Viviana; García Guraieb, Solana; Goñi, Rafael A.; Avena, Sergio; Puebla, Andrea Fabiana; Dejean, Cristina
Año de publicación: 2023
Idioma: inglés
Tipo de recurso: artículo
Estado: versión publicada
Descripción: Objectives: The main aim of this study is to discuss the migratory processes and peopling dynamics that shaped the genetic variability of populations during the settlement of the Southern Cone, through the analysis of complete mitogenomes of individuals from southern Patagonia. Materials and Methods: Complete mitogenomes were sequenced through massively parallel sequencing from two late Holocene individuals (SAC 1-1-3 and SAC 1-1-4) buried in the same chenque at Salitroso Lake Basin (Santa Cruz province, Argentina). To evaluate matrilineal phylogenetic affinities with other haplotypes, maximum likelihood and Bayesian phylogenetic reconstructions were performed, as well as a haplotype median-joining network. Results: The mitogenomes were assigned to haplogroups B2 and B2b, exhibiting an average depth of 54X and 89X (≥1X coverage of 98.6% and 100%), and a high number of nucleotide differences among them. The phylogenetic analyses showed a relatively close relationship between the haplotype found in SAC 1-1-4 and those retrieved from a Middle Holocene individual from Laguna Chica (Buenos Aires province), and from a group of individuals from the Peruvian coast. For the SAC 1-1-3, no clear affiliations to any other haplotype were established. Discussion: The large divergence between the haplotypes presented in this study suggests either a highly variable founder gene pool, or a later enrichment by frequent biological contact with other populations. Our results underline the persistence of genetic signals related to the first waves of peopling in South America, suggesting that the regional settlement of the southern end of the continent has been much more complex than initially thought.
Instituto de Biotecnología
Fil: Arencibia, Valeria. Universidad Maimónides. Centro de Ciencias Naturales, Ambientales y Antropológicas (CCNAA); Argentina
Fil: Arencibia, Valeria. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
Fil: Muñoz Hidalgo, Marianne Graziel. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular (IABIMO); Argentina
Fil: Muñoz Hidalgo, Marianne Graziel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
Fil: Crespo, Cristian. Universidad Nacional de Tierra del Fuego. Instituto de Ciencias Polares, Ambiente y Recursos Naturales (ICPA); Argentina
Fil: Russo, M. Gabriela. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Ecología, Genética y Evolución. Grupo de Investigación en Biología Evolutiva (GIBE); Argentina
Fil: Vera, Pablo Alfredo. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular (IABIMO); Argentina
Fil: Vera, Pablo Alfredo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
Fil: Lia, Veronica Viviana. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina
Fil: Lia, Veronica Viviana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
Fil: Lia, Veronica Viviana. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina
Fil: García Guraieb, Solana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
Fil: García Guraieb, Solana. Instituto Nacional de Antropología y Pensamiento Latinoamericano (INAPL); Argentina
Fil: García Guraieb, Solana. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Filosofía y Letras. Departamento de Ciencias Antropológicas; Argentina
Fil: Goñi, Rafael A. Instituto Nacional de Antropología y Pensamiento Latinoamericano (INAPL); Argentina
Fil: Goñi, Rafael A. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Filosofía y Letras. Departamento de Ciencias Antropológicas; Argentina
Fil: Avena, Sergio. Universidad Maimónides. Centro de Ciencias Naturales, Ambientales y Antropológicas (CCNAA); Argentina
Fil: Avena, Sergio. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
Fil: Avena, Sergio. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Filosofía y Letras. Departamento de Ciencias Antropológicas; Argentina
Fil: Puebla, Andrea Fabiana. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular (IABIMO); Argentina
Fil: Puebla, Andrea Fabiana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
Fil: Dejean, Cristina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular (IABIMO); Argentina
Fil: Dejean, Cristina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
Fil: Dejean, Cristina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Filosofía y Letras. Departamento de Ciencias Antropológicas; Argentina
Fil: Dejean, Cristina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Filosofía y Letras. Instituto de Ciencias Antropológicas. Sección Antropología Biológica; Argentina
Fuente: American Journal of Biological Anthropology (First published: 07 August 2023)
Materia: Genetic Variation
Holocene
Variación Genética
Holoceno
Mitogenomes
Mitogenomas
Región Patagónica
Nivel de accesibilidad: acceso restringido
Condiciones de uso: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
Repositorio
Institución: Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria
OAI Identificador: oai:localhost:20.500.12123/15129

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Materials and Methods: Complete mitogenomes were sequenced through massively parallel sequencing from two late Holocene individuals (SAC 1-1-3 and SAC 1-1-4) buried in the same chenque at Salitroso Lake Basin (Santa Cruz province, Argentina). To evaluate matrilineal phylogenetic affinities with other haplotypes, maximum likelihood and Bayesian phylogenetic reconstructions were performed, as well as a haplotype median-joining network. Results: The mitogenomes were assigned to haplogroups B2 and B2b, exhibiting an average depth of 54X and 89X (≥1X coverage of 98.6% and 100%), and a high number of nucleotide differences among them. The phylogenetic analyses showed a relatively close relationship between the haplotype found in SAC 1-1-4 and those retrieved from a Middle Holocene individual from Laguna Chica (Buenos Aires province), and from a group of individuals from the Peruvian coast. For the SAC 1-1-3, no clear affiliations to any other haplotype were established. Discussion: The large divergence between the haplotypes presented in this study suggests either a highly variable founder gene pool, or a later enrichment by frequent biological contact with other populations. Our results underline the persistence of genetic signals related to the first waves of peopling in South America, suggesting that the regional settlement of the southern end of the continent has been much more complex than initially thought.Instituto de BiotecnologíaFil: Arencibia, Valeria. Universidad Maimónides. Centro de Ciencias Naturales, Ambientales y Antropológicas (CCNAA); ArgentinaFil: Arencibia, Valeria. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Muñoz Hidalgo, Marianne Graziel. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular (IABIMO); ArgentinaFil: Muñoz Hidalgo, Marianne Graziel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Crespo, Cristian. Universidad Nacional de Tierra del Fuego. Instituto de Ciencias Polares, Ambiente y Recursos Naturales (ICPA); ArgentinaFil: Russo, M. Gabriela. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Ecología, Genética y Evolución. Grupo de Investigación en Biología Evolutiva (GIBE); ArgentinaFil: Vera, Pablo Alfredo. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular (IABIMO); ArgentinaFil: Vera, Pablo Alfredo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Lia, Veronica Viviana. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; ArgentinaFil: Lia, Veronica Viviana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Lia, Veronica Viviana. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; ArgentinaFil: García Guraieb, Solana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: García Guraieb, Solana. Instituto Nacional de Antropología y Pensamiento Latinoamericano (INAPL); ArgentinaFil: García Guraieb, Solana. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Filosofía y Letras. Departamento de Ciencias Antropológicas; ArgentinaFil: Goñi, Rafael A. Instituto Nacional de Antropología y Pensamiento Latinoamericano (INAPL); ArgentinaFil: Goñi, Rafael A. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Filosofía y Letras. Departamento de Ciencias Antropológicas; ArgentinaFil: Avena, Sergio. Universidad Maimónides. Centro de Ciencias Naturales, Ambientales y Antropológicas (CCNAA); ArgentinaFil: Avena, Sergio. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Avena, Sergio. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Filosofía y Letras. Departamento de Ciencias Antropológicas; ArgentinaFil: Puebla, Andrea Fabiana. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular (IABIMO); ArgentinaFil: Puebla, Andrea Fabiana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Dejean, Cristina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular (IABIMO); ArgentinaFil: Dejean, Cristina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Dejean, Cristina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Filosofía y Letras. Departamento de Ciencias Antropológicas; ArgentinaFil: Dejean, Cristina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Filosofía y Letras. Instituto de Ciencias Antropológicas. Sección Antropología Biológica; ArgentinaWiley2023-09-07T10:10:25Z2023-09-07T10:10:25Z2023-08info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_6501info:ar-repo/semantics/articuloapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/20.500.12123/15129https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/ajpa.248222692-7691https://doi.org/10.1002/ajpa.24822American Journal of Biological Anthropology (First published: 07 August 2023)reponame:INTA Digital (INTA)instname:Instituto Nacional de Tecnología Agropecuariaenginfo:eu-repo/semantics/restrictedAccesshttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/Creative Commons Attribution-NonCommercial-ShareAlike 4.0 International (CC BY-NC-SA 4.0)2025-09-29T13:46:04Zoai:localhost:20.500.12123/15129instacron:INTAInstitucionalhttp://repositorio.inta.gob.ar/Organismo científico-tecnológicoNo correspondehttp://repositorio.inta.gob.ar/oai/requesttripaldi.nicolas@inta.gob.arArgentinaNo correspondeNo correspondeNo correspondeopendoar:l2025-09-29 13:46:04.912INTA Digital (INTA) - Instituto Nacional de Tecnología Agropecuariafalse
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description	Objectives: The main aim of this study is to discuss the migratory processes and peopling dynamics that shaped the genetic variability of populations during the settlement of the Southern Cone, through the analysis of complete mitogenomes of individuals from southern Patagonia. Materials and Methods: Complete mitogenomes were sequenced through massively parallel sequencing from two late Holocene individuals (SAC 1-1-3 and SAC 1-1-4) buried in the same chenque at Salitroso Lake Basin (Santa Cruz province, Argentina). To evaluate matrilineal phylogenetic affinities with other haplotypes, maximum likelihood and Bayesian phylogenetic reconstructions were performed, as well as a haplotype median-joining network. Results: The mitogenomes were assigned to haplogroups B2 and B2b, exhibiting an average depth of 54X and 89X (≥1X coverage of 98.6% and 100%), and a high number of nucleotide differences among them. The phylogenetic analyses showed a relatively close relationship between the haplotype found in SAC 1-1-4 and those retrieved from a Middle Holocene individual from Laguna Chica (Buenos Aires province), and from a group of individuals from the Peruvian coast. For the SAC 1-1-3, no clear affiliations to any other haplotype were established. Discussion: The large divergence between the haplotypes presented in this study suggests either a highly variable founder gene pool, or a later enrichment by frequent biological contact with other populations. Our results underline the persistence of genetic signals related to the first waves of peopling in South America, suggesting that the regional settlement of the southern end of the continent has been much more complex than initially thought.
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