Rol de los puentes hidrógeno en la detección de pH por la histidin-quinasa DesK

Autores
Cybulski, Larisa Estefania; Bortolotti, Ana; Almada, Juan Cruz; Ruysschaert, Jean Marie; Vazquez, Daniela; Moreno, Diego Martin; Drussin, Salvador
Año de publicación
2023
Idioma
inglés
Tipo de recurso
conjunto de datos
Estado
Descripción
This dataset corresponds to experiments conducted to study the response of transmembrane histidine kinase (DesK) to pH. The two-component system DesK-DesR regulates the synthesis of unsaturated fatty acids in the soil bacteria Bacillus Subtilis. This system is activated at low temperature and maintains membrane lipid fluidity upon temperature variations. We conducted five independent experiments and found that DesK also responds to pH, and studied the mechanism of pH sensing. We propose that a helix linking the transmembrane region with the cytoplasmic catalytic domain is involved in pH sensing.This helix contains several glutamate, lysine, and arginine residues At neutral pH, the linker forms an alpha helix that is stabilized by hydrogen bonds in the i, i + 4 register and thus favors the kinase state. At low pH, protonation of glutamate residues breaks salt bridges, which results in helix destabilization and interruption of signaling. This mechanism inhibits unsaturated fatty acid synthesis and rigidifies the membrane when Bacillus grows in acidic conditions. (2020-08-14). The paper has been published: A Transmembrane Histidine Kinase Functions as a pH Sensor. Bortolotti A, Vazquez DB, Almada JC, Inda ME, Drusin SI, Villalba JM, Moreno DM, Ruysschaert JM, Cybulski LE. Biomolecules. 2020 Aug 14;10(8):1183. doi: 10.3390/biom10081183. doi: 10.3390/biom10081183
Fil: Cybulski, Larisa Estefania. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario; Argentina. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Departamento de Microbiología; Argentina
Fil: Bortolotti, Ana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario; Argentina. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Departamento de Microbiología; Argentina
Fil: Almada, Juan Cruz. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario; Argentina. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Departamento de Microbiología; Argentina
Fil: Ruysschaert, Jean Marie. Université Libre de Bruxelles. Centre de Biologie Structurale et de Bioinformatique; Bélgica
Fil: Vazquez, Daniela. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Departamento de Microbiología; Argentina
Fil: Moreno, Diego Martin. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Química Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Instituto de Química Rosario; Argentina
Fil: Drussin, Salvador. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario; Argentina
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
Repositorio
CONICET Digital (CONICET)
Institución
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
OAI Identificador
oai:ri.conicet.gov.ar:11336/190880

id CONICETDig_dcb418e7948faf9d6feac898965e874d
oai_identifier_str oai:ri.conicet.gov.ar:11336/190880
network_acronym_str CONICETDig
repository_id_str 3498
network_name_str CONICET Digital (CONICET)
spelling Rol de los puentes hidrógeno en la detección de pH por la histidin-quinasa DesKCybulski, Larisa EstefaniaBortolotti, AnaAlmada, Juan CruzRuysschaert, Jean MarieVazquez, DanielaMoreno, Diego MartinDrussin, Salvadorhttps://purl.org/becyt/ford/1.6https://purl.org/becyt/ford/1This dataset corresponds to experiments conducted to study the response of transmembrane histidine kinase (DesK) to pH. The two-component system DesK-DesR regulates the synthesis of unsaturated fatty acids in the soil bacteria Bacillus Subtilis. This system is activated at low temperature and maintains membrane lipid fluidity upon temperature variations. We conducted five independent experiments and found that DesK also responds to pH, and studied the mechanism of pH sensing. We propose that a helix linking the transmembrane region with the cytoplasmic catalytic domain is involved in pH sensing.This helix contains several glutamate, lysine, and arginine residues At neutral pH, the linker forms an alpha helix that is stabilized by hydrogen bonds in the i, i + 4 register and thus favors the kinase state. At low pH, protonation of glutamate residues breaks salt bridges, which results in helix destabilization and interruption of signaling. This mechanism inhibits unsaturated fatty acid synthesis and rigidifies the membrane when Bacillus grows in acidic conditions. (2020-08-14). The paper has been published: A Transmembrane Histidine Kinase Functions as a pH Sensor. Bortolotti A, Vazquez DB, Almada JC, Inda ME, Drusin SI, Villalba JM, Moreno DM, Ruysschaert JM, Cybulski LE. Biomolecules. 2020 Aug 14;10(8):1183. doi: 10.3390/biom10081183. doi: 10.3390/biom10081183Fil: Cybulski, Larisa Estefania. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario; Argentina. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Departamento de Microbiología; ArgentinaFil: Bortolotti, Ana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario; Argentina. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Departamento de Microbiología; ArgentinaFil: Almada, Juan Cruz. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario; Argentina. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Departamento de Microbiología; ArgentinaFil: Ruysschaert, Jean Marie. Université Libre de Bruxelles. Centre de Biologie Structurale et de Bioinformatique; BélgicaFil: Vazquez, Daniela. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Departamento de Microbiología; ArgentinaFil: Moreno, Diego Martin. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Química Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Instituto de Química Rosario; ArgentinaFil: Drussin, Salvador. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario; Argentina2023info:ar-repo/semantics/conjuntoDeDatosv1.0info:eu-repo/semantics/dataSetapplication/vnd.openxmlformats-officedocument.spreadsheetml.sheetapplication/vnd.openxmlformats-officedocument.spreadsheetml.sheetimage/tiffimage/pngimage/jpegapplication/vnd.openxmlformats-officedocument.spreadsheetml.sheethttp://hdl.handle.net/11336/190880Cybulski, Larisa Estefania; Bortolotti, Ana; Almada, Juan Cruz; Ruysschaert, Jean Marie; Vazquez, Daniela; Moreno, Diego Martin; Drussin, Salvador; (2023): Rol de los puentes hidrógeno en la detección de pH por la histidin-quinasa DesK. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. (dataset). http://hdl.handle.net/11336/190880CONICET DigitalCONICETenginfo:eu-repo/grantAgreement/Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas/Cooperación internacional CONICET-FNRS 2017info:eu-repo/grantAgreement//Cooperación internacional CONICET-FNRS 2017info:eu-repo/grantAgreement//Cooperación internacional CONICET-FNRS 2017info:eu-repo/semantics/openAccesshttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/reponame:CONICET Digital (CONICET)instname:Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas2025-09-29T09:35:22Zoai:ri.conicet.gov.ar:11336/190880instacron:CONICETInstitucionalhttp://ri.conicet.gov.ar/Organismo científico-tecnológicoNo correspondehttp://ri.conicet.gov.ar/oai/requestdasensio@conicet.gov.ar; lcarlino@conicet.gov.arArgentinaNo correspondeNo correspondeNo correspondeopendoar:34982025-09-29 09:35:23.009CONICET Digital (CONICET) - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicasfalse
dc.title.none.fl_str_mv Rol de los puentes hidrógeno en la detección de pH por la histidin-quinasa DesK
title Rol de los puentes hidrógeno en la detección de pH por la histidin-quinasa DesK
spellingShingle Rol de los puentes hidrógeno en la detección de pH por la histidin-quinasa DesK
Cybulski, Larisa Estefania
title_short Rol de los puentes hidrógeno en la detección de pH por la histidin-quinasa DesK
title_full Rol de los puentes hidrógeno en la detección de pH por la histidin-quinasa DesK
title_fullStr Rol de los puentes hidrógeno en la detección de pH por la histidin-quinasa DesK
title_full_unstemmed Rol de los puentes hidrógeno en la detección de pH por la histidin-quinasa DesK
title_sort Rol de los puentes hidrógeno en la detección de pH por la histidin-quinasa DesK
dc.creator.none.fl_str_mv Cybulski, Larisa Estefania
Bortolotti, Ana
Almada, Juan Cruz
Ruysschaert, Jean Marie
Vazquez, Daniela
Moreno, Diego Martin
Drussin, Salvador
author Cybulski, Larisa Estefania
author_facet Cybulski, Larisa Estefania
Bortolotti, Ana
Almada, Juan Cruz
Ruysschaert, Jean Marie
Vazquez, Daniela
Moreno, Diego Martin
Drussin, Salvador
author_role author
author2 Bortolotti, Ana
Almada, Juan Cruz
Ruysschaert, Jean Marie
Vazquez, Daniela
Moreno, Diego Martin
Drussin, Salvador
author2_role author
author
author
author
author
author
purl_subject.fl_str_mv https://purl.org/becyt/ford/1.6
https://purl.org/becyt/ford/1
dc.description.none.fl_txt_mv This dataset corresponds to experiments conducted to study the response of transmembrane histidine kinase (DesK) to pH. The two-component system DesK-DesR regulates the synthesis of unsaturated fatty acids in the soil bacteria Bacillus Subtilis. This system is activated at low temperature and maintains membrane lipid fluidity upon temperature variations. We conducted five independent experiments and found that DesK also responds to pH, and studied the mechanism of pH sensing. We propose that a helix linking the transmembrane region with the cytoplasmic catalytic domain is involved in pH sensing.This helix contains several glutamate, lysine, and arginine residues At neutral pH, the linker forms an alpha helix that is stabilized by hydrogen bonds in the i, i + 4 register and thus favors the kinase state. At low pH, protonation of glutamate residues breaks salt bridges, which results in helix destabilization and interruption of signaling. This mechanism inhibits unsaturated fatty acid synthesis and rigidifies the membrane when Bacillus grows in acidic conditions. (2020-08-14). The paper has been published: A Transmembrane Histidine Kinase Functions as a pH Sensor. Bortolotti A, Vazquez DB, Almada JC, Inda ME, Drusin SI, Villalba JM, Moreno DM, Ruysschaert JM, Cybulski LE. Biomolecules. 2020 Aug 14;10(8):1183. doi: 10.3390/biom10081183. doi: 10.3390/biom10081183
Fil: Cybulski, Larisa Estefania. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario; Argentina. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Departamento de Microbiología; Argentina
Fil: Bortolotti, Ana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario; Argentina. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Departamento de Microbiología; Argentina
Fil: Almada, Juan Cruz. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario; Argentina. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Departamento de Microbiología; Argentina
Fil: Ruysschaert, Jean Marie. Université Libre de Bruxelles. Centre de Biologie Structurale et de Bioinformatique; Bélgica
Fil: Vazquez, Daniela. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Departamento de Microbiología; Argentina
Fil: Moreno, Diego Martin. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Química Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Instituto de Química Rosario; Argentina
Fil: Drussin, Salvador. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario; Argentina
description This dataset corresponds to experiments conducted to study the response of transmembrane histidine kinase (DesK) to pH. The two-component system DesK-DesR regulates the synthesis of unsaturated fatty acids in the soil bacteria Bacillus Subtilis. This system is activated at low temperature and maintains membrane lipid fluidity upon temperature variations. We conducted five independent experiments and found that DesK also responds to pH, and studied the mechanism of pH sensing. We propose that a helix linking the transmembrane region with the cytoplasmic catalytic domain is involved in pH sensing.This helix contains several glutamate, lysine, and arginine residues At neutral pH, the linker forms an alpha helix that is stabilized by hydrogen bonds in the i, i + 4 register and thus favors the kinase state. At low pH, protonation of glutamate residues breaks salt bridges, which results in helix destabilization and interruption of signaling. This mechanism inhibits unsaturated fatty acid synthesis and rigidifies the membrane when Bacillus grows in acidic conditions. (2020-08-14). The paper has been published: A Transmembrane Histidine Kinase Functions as a pH Sensor. Bortolotti A, Vazquez DB, Almada JC, Inda ME, Drusin SI, Villalba JM, Moreno DM, Ruysschaert JM, Cybulski LE. Biomolecules. 2020 Aug 14;10(8):1183. doi: 10.3390/biom10081183. doi: 10.3390/biom10081183
publishDate 2023
dc.date.none.fl_str_mv 2023
dc.type.none.fl_str_mv info:ar-repo/semantics/conjuntoDeDatos
v1.0
info:eu-repo/semantics/dataSet
format dataSet
dc.identifier.none.fl_str_mv http://hdl.handle.net/11336/190880
Cybulski, Larisa Estefania; Bortolotti, Ana; Almada, Juan Cruz; Ruysschaert, Jean Marie; Vazquez, Daniela; Moreno, Diego Martin; Drussin, Salvador; (2023): Rol de los puentes hidrógeno en la detección de pH por la histidin-quinasa DesK. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. (dataset). http://hdl.handle.net/11336/190880
CONICET Digital
CONICET
url http://hdl.handle.net/11336/190880
identifier_str_mv Cybulski, Larisa Estefania; Bortolotti, Ana; Almada, Juan Cruz; Ruysschaert, Jean Marie; Vazquez, Daniela; Moreno, Diego Martin; Drussin, Salvador; (2023): Rol de los puentes hidrógeno en la detección de pH por la histidin-quinasa DesK. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. (dataset). http://hdl.handle.net/11336/190880
CONICET Digital
CONICET
dc.language.none.fl_str_mv eng
language eng
dc.relation.none.fl_str_mv info:eu-repo/grantAgreement/Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas/Cooperación internacional CONICET-FNRS 2017
info:eu-repo/grantAgreement//Cooperación internacional CONICET-FNRS 2017
info:eu-repo/grantAgreement//Cooperación internacional CONICET-FNRS 2017
dc.rights.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
eu_rights_str_mv openAccess
rights_invalid_str_mv https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.format.none.fl_str_mv application/vnd.openxmlformats-officedocument.spreadsheetml.sheet
application/vnd.openxmlformats-officedocument.spreadsheetml.sheet
image/tiff
image/png
image/jpeg
application/vnd.openxmlformats-officedocument.spreadsheetml.sheet
dc.source.none.fl_str_mv reponame:CONICET Digital (CONICET)
instname:Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
reponame_str CONICET Digital (CONICET)
collection CONICET Digital (CONICET)
instname_str Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
repository.name.fl_str_mv CONICET Digital (CONICET) - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
repository.mail.fl_str_mv dasensio@conicet.gov.ar; lcarlino@conicet.gov.ar
_version_ 1844613101703397376
score 13.070432