Análisis genómico comparativo de variedades de Capsicum annuum: Distribución y abundancia de secuencias repetitivas
- Autores
- Yañez Santos, Anahi Mara; Paz, Rosalia Cristina; Urdampilleta, Juan Domingo
- Año de publicación
- 2023
- Idioma
- español castellano
- Tipo de recurso
- documento de conferencia
- Estado
- versión publicada
- Descripción
- Pimiento (C. annuum), es una hortaliza considerada de alto valor economico. Esta especie se caracteriza por tener un numero cromosomico de 2n=24 y un genoma relativamente grande (~3.20Gb) dentro de las Solanaceas. Este incremento del tamano genomico esta asociada a la acumulacion de secuencias de ADN repetitivo. Esta fraccion repetitiva fue analizada mediante analisis de clustering con RepeatExplorer2/ Elixir-Cerit. A partir de secuencias genomicas con cobertura de 0,1× para los cultivares Calafyuco, Fyuco y Zunla. El tamano del genoma calculado por citometria de flujo fue 6,80; 7,20 y 7,32 pg, la fraccion repetitiva estimada fue 48,51; 46,23 y 50,59%, para los cultivares Calafyuco, Fyuco y Zunla, respectivamente. Para los tres cultivares. Los principales grupos de elementos repetitivos son LTR de Clase I: Ty3/gypsy-Tekay (22,74; 19,29 y 13,98%); Ty3/gypsy-Athila (4,06; 3,33 y 1,67%); Ty3/gypsy-Ogre (2,29; 2,12 y 2,15%). El ADN repetitivo presento diferencias observadas en: Ty3/gypsy-Reina (presente solamente en Zunla), abundancia de ADN satelite (0,59; 0,22 y 1,02%) y en el ADNr, tanto en 45S (0,38; 0,12 y 0,45%), como en 5S (0,08; 0,10 y 0,03%). Los resultados proporcionan informacion original sobre la abundancia y distribucion cromosomica (FISH) de la fraccion repetitiva en los tres cultivares de pimiento. Permitiendo discutir la utilidad de marcadores citogeneticos y moleculares en el reconocimiento de variedades de importancia agronomica.
Fil: Yañez Santos, Anahi Mara. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - San Juan. Centro de Investigaciones de la Geosfera y Biosfera. Universidad Nacional de San Juan. Facultad de Ciencias Exactas Físicas y Naturales. Centro de Investigaciones de la Geosfera y Biosfera; Argentina
Fil: Paz, Rosalia Cristina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - San Juan. Centro de Investigaciones de la Geosfera y Biosfera. Universidad Nacional de San Juan. Facultad de Ciencias Exactas Físicas y Naturales. Centro de Investigaciones de la Geosfera y Biosfera; Argentina
Fil: Urdampilleta, Juan Domingo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto Multidisciplinario de Biología Vegetal. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas Físicas y Naturales. Instituto Multidisciplinario de Biología Vegetal; Argentina
XXXIX Jornadas Argentinas de Botánica
Catamarca
Argentina
Sociedad Argentina de Botánica - Materia
-
Capsicum annuum
ADN repetitivo - Nivel de accesibilidad
- acceso abierto
- Condiciones de uso
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- Repositorio
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Análisis genómico comparativo de variedades de Capsicum annuum: Distribución y abundancia de secuencias repetitivasComparative genomic analysis of Capsicum annuum varieties: Distribution and abundance of repeat sequencesYañez Santos, Anahi MaraPaz, Rosalia CristinaUrdampilleta, Juan DomingoCapsicum annuumADN repetitivohttps://purl.org/becyt/ford/1.6https://purl.org/becyt/ford/1Pimiento (C. annuum), es una hortaliza considerada de alto valor economico. Esta especie se caracteriza por tener un numero cromosomico de 2n=24 y un genoma relativamente grande (~3.20Gb) dentro de las Solanaceas. Este incremento del tamano genomico esta asociada a la acumulacion de secuencias de ADN repetitivo. Esta fraccion repetitiva fue analizada mediante analisis de clustering con RepeatExplorer2/ Elixir-Cerit. A partir de secuencias genomicas con cobertura de 0,1× para los cultivares Calafyuco, Fyuco y Zunla. El tamano del genoma calculado por citometria de flujo fue 6,80; 7,20 y 7,32 pg, la fraccion repetitiva estimada fue 48,51; 46,23 y 50,59%, para los cultivares Calafyuco, Fyuco y Zunla, respectivamente. Para los tres cultivares. Los principales grupos de elementos repetitivos son LTR de Clase I: Ty3/gypsy-Tekay (22,74; 19,29 y 13,98%); Ty3/gypsy-Athila (4,06; 3,33 y 1,67%); Ty3/gypsy-Ogre (2,29; 2,12 y 2,15%). El ADN repetitivo presento diferencias observadas en: Ty3/gypsy-Reina (presente solamente en Zunla), abundancia de ADN satelite (0,59; 0,22 y 1,02%) y en el ADNr, tanto en 45S (0,38; 0,12 y 0,45%), como en 5S (0,08; 0,10 y 0,03%). Los resultados proporcionan informacion original sobre la abundancia y distribucion cromosomica (FISH) de la fraccion repetitiva en los tres cultivares de pimiento. Permitiendo discutir la utilidad de marcadores citogeneticos y moleculares en el reconocimiento de variedades de importancia agronomica.Fil: Yañez Santos, Anahi Mara. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - San Juan. Centro de Investigaciones de la Geosfera y Biosfera. Universidad Nacional de San Juan. Facultad de Ciencias Exactas Físicas y Naturales. Centro de Investigaciones de la Geosfera y Biosfera; ArgentinaFil: Paz, Rosalia Cristina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - San Juan. Centro de Investigaciones de la Geosfera y Biosfera. Universidad Nacional de San Juan. Facultad de Ciencias Exactas Físicas y Naturales. Centro de Investigaciones de la Geosfera y Biosfera; ArgentinaFil: Urdampilleta, Juan Domingo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto Multidisciplinario de Biología Vegetal. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas Físicas y Naturales. Instituto Multidisciplinario de Biología Vegetal; ArgentinaXXXIX Jornadas Argentinas de BotánicaCatamarcaArgentinaSociedad Argentina de BotánicaSociedad Argentina de Botánica2023info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/conferenceObjectJornadaJournalhttp://purl.org/coar/resource_type/c_5794info:ar-repo/semantics/documentoDeConferenciaapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/11336/228213Análisis genómico comparativo de variedades de Capsicum annuum: Distribución y abundancia de secuencias repetitivas; XXXIX Jornadas Argentinas de Botánica; Catamarca; Argentina; 2023; 356-3560373-580XCONICET DigitalCONICETspainfo:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://botanicaargentina.org.ar/xxxix-jornadas-argentinas-de-botanica-catamarca-2023/#libro-de-res-menesNacionalinfo:eu-repo/semantics/openAccesshttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/reponame:CONICET Digital (CONICET)instname:Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas2025-09-03T09:57:27Zoai:ri.conicet.gov.ar:11336/228213instacron:CONICETInstitucionalhttp://ri.conicet.gov.ar/Organismo científico-tecnológicoNo correspondehttp://ri.conicet.gov.ar/oai/requestdasensio@conicet.gov.ar; lcarlino@conicet.gov.arArgentinaNo correspondeNo correspondeNo correspondeopendoar:34982025-09-03 09:57:27.936CONICET Digital (CONICET) - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicasfalse |
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