Genomic and phylogenetic analysis of hepatitis C virus isolates from Argentine patients: A six-year retrospective study

Autores
Quarleri, Jorge Fabian; Robertson, B.H.; Mathet, Veronica Lidia; Feld, Mariana; Espínola, Luis Alberto; Requeijo, M.P.; Mandó, Oscar Gaspar; Carballal, Guadalupe; Oubiña, Jose Raul
Año de publicación
2000
Idioma
inglés
Tipo de recurso
artículo
Estado
versión publicada
Descripción
Typing of hepatitis C virus (HCV) isolates from Argentine patients was performed by using different methodologies in a population of 243 patients. HCV subtype was assigned based upon restriction fragment length polymorphism (RFLP). HCV RNA genomes obtained from serum samples were classified as belonging to clade 1 (53.5%), 2 (23.0%), or 3 (8.6%); 14.8% of samples showed HCV mixed infections, more frequently implying different subtypes within the same clade. In addition to RFLP typing, phylogenetic relatedness among sequences from both 5′ untranslated region (n = 50) and nonstructural 5B coding region (n = 15) was established.
Fil: Quarleri, Jorge Fabian. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Departamento de Microbiología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay; Argentina
Fil: Robertson, B.H.. Centers For Disease Control And Prevention. National Center For Infectious Diseases; Estados Unidos
Fil: Mathet, Veronica Lidia. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Departamento de Microbiología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; Argentina
Fil: Feld, Mariana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Departamento de Microbiología; Argentina
Fil: Espínola, Luis Alberto. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Departamento de Microbiología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay; Argentina
Fil: Requeijo, M.P.. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. CEMIC-CONICET. Centro de Educaciones Médicas e Investigaciones Clínicas "Norberto Quirno". CEMIC-CONICET; Argentina
Fil: Mandó, Oscar Gaspar. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. CEMIC-CONICET. Centro de Educaciones Médicas e Investigaciones Clínicas "Norberto Quirno". CEMIC-CONICET; Argentina
Fil: Carballal, Guadalupe. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. CEMIC-CONICET. Centro de Educaciones Médicas e Investigaciones Clínicas "Norberto Quirno". CEMIC-CONICET; Argentina
Fil: Oubiña, Jose Raul. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Departamento de Microbiología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiología y Parasitología Médica; Argentina
Materia
Hepatitis C virus
HCV genotypes
Argentina
Phylogenetic analysis
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
Repositorio
CONICET Digital (CONICET)
Institución
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
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