In-House Validation of Rapid Detection PCRs for Bacterial Pathogens Causing Infant Diarrhea

Autores
Londero, Alejandra; Leotta, Gerardo Anibal; Brusa, Victoria; Costa, Magdalena; Golijow, Carlos Daniel; Gutkind, Gabriel Osvaldo; Gonzalez, E.; Galli, Lucía
Año de publicación
2017
Idioma
inglés
Tipo de recurso
artículo
Estado
versión publicada
Descripción
In Argentina, conventional culture methods for the isolation of diarrheal bacteria continue to be the most widely used form of diagnosis in many clinical laboratories. In this work we validated 11 in-house real-time polymerasechain reactions (PCRs) assays for the specific and rapid detection of Salmonella spp., Shigella spp., enteroinvasive E. coli, enteropathogenic E. coli, enterotoxigenic E. coli, Shiga toxin-producing E. coli, E. coli O157, Cronobacter sakazakii, Campylobacter jejuni, Campylobacter coli, Vibrio cholera and Clostridium difficile. The sensitivity of the assays was less than 100 CFU/ml for all the studied pathogens; selectivity and specificity were 100% in all cases and robustness was optimal. These PCR methods could be used to accurately detect the main bacterial causes of infant gastroenteritis.
Fil: Londero, Alejandra. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico CONICET- La Plata. Instituto de Genética Veterinaria "Ing. Fernando Noel Dulout". Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Veterinarias. Instituto de Genética Veterinaria; Argentina
Fil: Leotta, Gerardo Anibal. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico CONICET- La Plata. Instituto de Genética Veterinaria "Ing. Fernando Noel Dulout". Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Veterinarias. Instituto de Genética Veterinaria; Argentina
Fil: Brusa, Victoria. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico CONICET- La Plata. Instituto de Genética Veterinaria "Ing. Fernando Noel Dulout". Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Veterinarias. Instituto de Genética Veterinaria; Argentina
Fil: Costa, Magdalena. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico CONICET- La Plata. Instituto de Genética Veterinaria "Ing. Fernando Noel Dulout". Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Veterinarias. Instituto de Genética Veterinaria; Argentina
Fil: Golijow, Carlos Daniel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico CONICET- La Plata. Instituto de Genética Veterinaria "Ing. Fernando Noel Dulout". Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Veterinarias. Instituto de Genética Veterinaria; Argentina
Fil: Gutkind, Gabriel Osvaldo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica; Argentina
Fil: Gonzalez, E.. Centro de Diagnóstico Molecular S.A.; Argentina
Fil: Galli, Lucía. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico CONICET- La Plata. Instituto de Genética Veterinaria "Ing. Fernando Noel Dulout". Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Veterinarias. Instituto de Genética Veterinaria; Argentina
Materia
DIAGNOSIS
PATHOGEN
DIARRHEAL
RT-PCR
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
https://creativecommons.org/licenses/by/2.5/ar/
Repositorio
CONICET Digital (CONICET)
Institución
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
OAI Identificador
oai:ri.conicet.gov.ar:11336/48103
Acceder
id CONICETDig_7751aba25e99ecec199746a2ab245572
oai_identifier_str oai:ri.conicet.gov.ar:11336/48103
network_acronym_str CONICETDig
repository_id_str 3498
network_name_str CONICET Digital (CONICET)
spelling In-House Validation of Rapid Detection PCRs for Bacterial Pathogens Causing Infant DiarrheaLondero, AlejandraLeotta, Gerardo AnibalBrusa, VictoriaCosta, MagdalenaGolijow, Carlos DanielGutkind, Gabriel OsvaldoGonzalez, E.Galli, LucíaDIAGNOSISPATHOGENDIARRHEALRT-PCRhttps://purl.org/becyt/ford/1.6https://purl.org/becyt/ford/1In Argentina, conventional culture methods for the isolation of diarrheal bacteria continue to be the most widely used form of diagnosis in many clinical laboratories. In this work we validated 11 in-house real-time polymerasechain reactions (PCRs) assays for the specific and rapid detection of Salmonella spp., Shigella spp., enteroinvasive E. coli, enteropathogenic E. coli, enterotoxigenic E. coli, Shiga toxin-producing E. coli, E. coli O157, Cronobacter sakazakii, Campylobacter jejuni, Campylobacter coli, Vibrio cholera and Clostridium difficile. The sensitivity of the assays was less than 100 CFU/ml for all the studied pathogens; selectivity and specificity were 100% in all cases and robustness was optimal. These PCR methods could be used to accurately detect the main bacterial causes of infant gastroenteritis.Fil: Londero, Alejandra. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico CONICET- La Plata. Instituto de Genética Veterinaria "Ing. Fernando Noel Dulout". Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Veterinarias. Instituto de Genética Veterinaria; ArgentinaFil: Leotta, Gerardo Anibal. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico CONICET- La Plata. Instituto de Genética Veterinaria "Ing. Fernando Noel Dulout". Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Veterinarias. Instituto de Genética Veterinaria; ArgentinaFil: Brusa, Victoria. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico CONICET- La Plata. Instituto de Genética Veterinaria "Ing. Fernando Noel Dulout". Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Veterinarias. Instituto de Genética Veterinaria; ArgentinaFil: Costa, Magdalena. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico CONICET- La Plata. Instituto de Genética Veterinaria "Ing. Fernando Noel Dulout". Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Veterinarias. Instituto de Genética Veterinaria; ArgentinaFil: Golijow, Carlos Daniel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico CONICET- La Plata. Instituto de Genética Veterinaria "Ing. Fernando Noel Dulout". Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Veterinarias. Instituto de Genética Veterinaria; ArgentinaFil: Gutkind, Gabriel Osvaldo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica; ArgentinaFil: Gonzalez, E.. Centro de Diagnóstico Molecular S.A.; ArgentinaFil: Galli, Lucía. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico CONICET- La Plata. Instituto de Genética Veterinaria "Ing. Fernando Noel Dulout". Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Veterinarias. Instituto de Genética Veterinaria; ArgentinaOMICS International2017-01info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_6501info:ar-repo/semantics/articuloapplication/pdfapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/11336/48103Londero, Alejandra; Leotta, Gerardo Anibal; Brusa, Victoria; Costa, Magdalena; Golijow, Carlos Daniel; et al.; In-House Validation of Rapid Detection PCRs for Bacterial Pathogens Causing Infant Diarrhea; OMICS International; Journal of Medical Microbiology & Diagnosis; 6; 4; 1-2017; 268-2712161-0703CONICET DigitalCONICETenginfo:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://www.omicsonline.org/open-access/inhouse-validation-of-rapid-detection-pcrs-for-bacterial-pathogens-causing-infant-diarrhea-2161-0703-1000268-97066.htmlinfo:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/10.4172/2161-0703.1000268info:eu-repo/semantics/openAccesshttps://creativecommons.org/licenses/by/2.5/ar/reponame:CONICET Digital (CONICET)instname:Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas2025-09-29T10:13:46Zoai:ri.conicet.gov.ar:11336/48103instacron:CONICETInstitucionalhttp://ri.conicet.gov.ar/Organismo científico-tecnológicoNo correspondehttp://ri.conicet.gov.ar/oai/requestdasensio@conicet.gov.ar; lcarlino@conicet.gov.arArgentinaNo correspondeNo correspondeNo correspondeopendoar:34982025-09-29 10:13:46.713CONICET Digital (CONICET) - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicasfalse
dc.title.none.fl_str_mv In-House Validation of Rapid Detection PCRs for Bacterial Pathogens Causing Infant Diarrhea
title In-House Validation of Rapid Detection PCRs for Bacterial Pathogens Causing Infant Diarrhea
spellingShingle In-House Validation of Rapid Detection PCRs for Bacterial Pathogens Causing Infant Diarrhea
Londero, Alejandra
DIAGNOSIS
PATHOGEN
DIARRHEAL
RT-PCR
title_short In-House Validation of Rapid Detection PCRs for Bacterial Pathogens Causing Infant Diarrhea
title_full In-House Validation of Rapid Detection PCRs for Bacterial Pathogens Causing Infant Diarrhea
title_fullStr In-House Validation of Rapid Detection PCRs for Bacterial Pathogens Causing Infant Diarrhea
title_full_unstemmed In-House Validation of Rapid Detection PCRs for Bacterial Pathogens Causing Infant Diarrhea
title_sort In-House Validation of Rapid Detection PCRs for Bacterial Pathogens Causing Infant Diarrhea
dc.creator.none.fl_str_mv Londero, Alejandra
Leotta, Gerardo Anibal
Brusa, Victoria
Costa, Magdalena
Golijow, Carlos Daniel
Gutkind, Gabriel Osvaldo
Gonzalez, E.
Galli, Lucía
author Londero, Alejandra
author_facet Londero, Alejandra
Leotta, Gerardo Anibal
Brusa, Victoria
Costa, Magdalena
Golijow, Carlos Daniel
Gutkind, Gabriel Osvaldo
Gonzalez, E.
Galli, Lucía
author_role author
author2 Leotta, Gerardo Anibal
Brusa, Victoria
Costa, Magdalena
Golijow, Carlos Daniel
Gutkind, Gabriel Osvaldo
Gonzalez, E.
Galli, Lucía
author2_role author
author
author
author
author
author
author
dc.subject.none.fl_str_mv DIAGNOSIS
PATHOGEN
DIARRHEAL
RT-PCR
topic DIAGNOSIS
PATHOGEN
DIARRHEAL
RT-PCR
purl_subject.fl_str_mv https://purl.org/becyt/ford/1.6
https://purl.org/becyt/ford/1
dc.description.none.fl_txt_mv In Argentina, conventional culture methods for the isolation of diarrheal bacteria continue to be the most widely used form of diagnosis in many clinical laboratories. In this work we validated 11 in-house real-time polymerasechain reactions (PCRs) assays for the specific and rapid detection of Salmonella spp., Shigella spp., enteroinvasive E. coli, enteropathogenic E. coli, enterotoxigenic E. coli, Shiga toxin-producing E. coli, E. coli O157, Cronobacter sakazakii, Campylobacter jejuni, Campylobacter coli, Vibrio cholera and Clostridium difficile. The sensitivity of the assays was less than 100 CFU/ml for all the studied pathogens; selectivity and specificity were 100% in all cases and robustness was optimal. These PCR methods could be used to accurately detect the main bacterial causes of infant gastroenteritis.
Fil: Londero, Alejandra. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico CONICET- La Plata. Instituto de Genética Veterinaria "Ing. Fernando Noel Dulout". Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Veterinarias. Instituto de Genética Veterinaria; Argentina
Fil: Leotta, Gerardo Anibal. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico CONICET- La Plata. Instituto de Genética Veterinaria "Ing. Fernando Noel Dulout". Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Veterinarias. Instituto de Genética Veterinaria; Argentina
Fil: Brusa, Victoria. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico CONICET- La Plata. Instituto de Genética Veterinaria "Ing. Fernando Noel Dulout". Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Veterinarias. Instituto de Genética Veterinaria; Argentina
Fil: Costa, Magdalena. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico CONICET- La Plata. Instituto de Genética Veterinaria "Ing. Fernando Noel Dulout". Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Veterinarias. Instituto de Genética Veterinaria; Argentina
Fil: Golijow, Carlos Daniel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico CONICET- La Plata. Instituto de Genética Veterinaria "Ing. Fernando Noel Dulout". Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Veterinarias. Instituto de Genética Veterinaria; Argentina
Fil: Gutkind, Gabriel Osvaldo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica; Argentina
Fil: Gonzalez, E.. Centro de Diagnóstico Molecular S.A.; Argentina
Fil: Galli, Lucía. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico CONICET- La Plata. Instituto de Genética Veterinaria "Ing. Fernando Noel Dulout". Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Veterinarias. Instituto de Genética Veterinaria; Argentina
description In Argentina, conventional culture methods for the isolation of diarrheal bacteria continue to be the most widely used form of diagnosis in many clinical laboratories. In this work we validated 11 in-house real-time polymerasechain reactions (PCRs) assays for the specific and rapid detection of Salmonella spp., Shigella spp., enteroinvasive E. coli, enteropathogenic E. coli, enterotoxigenic E. coli, Shiga toxin-producing E. coli, E. coli O157, Cronobacter sakazakii, Campylobacter jejuni, Campylobacter coli, Vibrio cholera and Clostridium difficile. The sensitivity of the assays was less than 100 CFU/ml for all the studied pathogens; selectivity and specificity were 100% in all cases and robustness was optimal. These PCR methods could be used to accurately detect the main bacterial causes of infant gastroenteritis.
publishDate 2017
dc.date.none.fl_str_mv 2017-01
dc.type.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/article
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
http://purl.org/coar/resource_type/c_6501
info:ar-repo/semantics/articulo
format article
status_str publishedVersion
dc.identifier.none.fl_str_mv http://hdl.handle.net/11336/48103
Londero, Alejandra; Leotta, Gerardo Anibal; Brusa, Victoria; Costa, Magdalena; Golijow, Carlos Daniel; et al.; In-House Validation of Rapid Detection PCRs for Bacterial Pathogens Causing Infant Diarrhea; OMICS International; Journal of Medical Microbiology & Diagnosis; 6; 4; 1-2017; 268-271
2161-0703
CONICET Digital
CONICET
url http://hdl.handle.net/11336/48103
identifier_str_mv Londero, Alejandra; Leotta, Gerardo Anibal; Brusa, Victoria; Costa, Magdalena; Golijow, Carlos Daniel; et al.; In-House Validation of Rapid Detection PCRs for Bacterial Pathogens Causing Infant Diarrhea; OMICS International; Journal of Medical Microbiology & Diagnosis; 6; 4; 1-2017; 268-271
2161-0703
CONICET Digital
CONICET
dc.language.none.fl_str_mv eng
language eng
dc.relation.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://www.omicsonline.org/open-access/inhouse-validation-of-rapid-detection-pcrs-for-bacterial-pathogens-causing-infant-diarrhea-2161-0703-1000268-97066.html
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/10.4172/2161-0703.1000268
dc.rights.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
https://creativecommons.org/licenses/by/2.5/ar/
eu_rights_str_mv openAccess
rights_invalid_str_mv https://creativecommons.org/licenses/by/2.5/ar/
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv OMICS International
publisher.none.fl_str_mv OMICS International
dc.source.none.fl_str_mv reponame:CONICET Digital (CONICET)
instname:Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
reponame_str CONICET Digital (CONICET)
collection CONICET Digital (CONICET)
instname_str Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
repository.name.fl_str_mv CONICET Digital (CONICET) - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
repository.mail.fl_str_mv dasensio@conicet.gov.ar; lcarlino@conicet.gov.ar
_version_ 1844614058312990720
score 13.070432

Publicaciones similares