Estructura secundaria del gen 16S-ARNr de Pseudosuccinea columella (Say, 1817) (Gastropoda: Lymnaeidae)

Autores
Molina, Samanta; Guzmán, Leila Belén; Peso, Juana Guadalupe; Vogler, Roberto Eugenio; Beltramino, Ariel Anibal
Año de publicación
2020
Idioma
español castellano
Tipo de recurso
documento de conferencia
Estado
versión publicada
Descripción
Pseudosuccinea columella (Say, 1817) es un caracol dulciacuícola nativo de Estados Unidos. Debido a su éxito como invasor actualmente presenta una distribución cosmopolita y es considerado de importancia médico-veterinaria por ser hospedador intermediario de Fasciola hepatica (Linnaeus, 1758). Recientemente se caracterizó su variabilidad genética a escala global mediante marcadores mitocondriales y microsatélites, identificándose 10 haplotipos para el gen 16S-ARNr. En Latinoamérica predominó el haplotipo F ampliamente expandido en áreas invadidas, excepto para Argentina y Paraguay que presentaron exclusivamente el haplotipo H. El gen 16S-ARNr presenta una estructura secundaria que consta de seis dominios y su predicción brinda información útil para alineamientos de secuencias y posteriores reconstrucciones filogenéticas. En este estudio se generó un modelo de estructura secundaria del 16S-ARNr (dominios IV-V) en Pseudosuccinea columella. Para ello se extrajo ADN por protocolo CTAB y se amplificó por PCR una región del 16S-ARNr en individuos de siete localidades de Misiones, Argentina. Las secuencias obtenidas tuvieron una longitud de 423-424 pb y fueron comparadas con los haplotipos caracterizados globalmente. Esto último, permitió identificar cuatro haplotipos para Misiones, dos de los cuales corresponden a nuevas variantes. Posteriormente se generó un modelo de estructura secundaria mediante plegamiento manual y comparación con modelos de referencia. La estructura secundaria obtenida permitió valorar las restricciones estructurales y funcionales de la variación genética. Además, se constituye en el primer modelo para Lymnaeidae Rafinesque, 1815 por lo que se espera que esta información contribuya a futuros análisis comparativos intraespecíficos y reconstrucciones filogenéticas de la familia.
Fil: Molina, Samanta. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Biología Subtropical. Universidad Nacional de Misiones. Instituto de Biología Subtropical; Argentina
Fil: Guzmán, Leila Belén. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Biología Subtropical. Instituto de Biología Subtropical - Nodo Posadas | Universidad Nacional de Misiones. Instituto de Biología Subtropical. Instituto de Biología Subtropical - Nodo Posadas; Argentina
Fil: Peso, Juana Guadalupe. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Biología Subtropical. Instituto de Biología Subtropical - Nodo Posadas | Universidad Nacional de Misiones. Instituto de Biología Subtropical. Instituto de Biología Subtropical - Nodo Posadas; Argentina
Fil: Vogler, Roberto Eugenio. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Biología Subtropical. Instituto de Biología Subtropical - Nodo Posadas | Universidad Nacional de Misiones. Instituto de Biología Subtropical. Instituto de Biología Subtropical - Nodo Posadas; Argentina
Fil: Beltramino, Ariel Anibal. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Biología Subtropical. Instituto de Biología Subtropical - Nodo Posadas | Universidad Nacional de Misiones. Instituto de Biología Subtropical. Instituto de Biología Subtropical - Nodo Posadas; Argentina
XI Congreso Latinoamericano de Malacología
Edición virtual
Uruguay
Asociación Latinoamericana de Malacología
Asociación Argentina de Malacología
Sociedade Brasileira de Malacología
Sociedad Malacológica de Chile
Sociedad Malacológica de Uruguay
Materia
GEN MITOCONDRIAL
CARACTERIZACIÓN ESTRUCTURAL
HAPLOTIPOS
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
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Repositorio
CONICET Digital (CONICET)
Institución
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
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El gen 16S-ARNr presenta una estructura secundaria que consta de seis dominios y su predicción brinda información útil para alineamientos de secuencias y posteriores reconstrucciones filogenéticas. En este estudio se generó un modelo de estructura secundaria del 16S-ARNr (dominios IV-V) en Pseudosuccinea columella. Para ello se extrajo ADN por protocolo CTAB y se amplificó por PCR una región del 16S-ARNr en individuos de siete localidades de Misiones, Argentina. Las secuencias obtenidas tuvieron una longitud de 423-424 pb y fueron comparadas con los haplotipos caracterizados globalmente. Esto último, permitió identificar cuatro haplotipos para Misiones, dos de los cuales corresponden a nuevas variantes. Posteriormente se generó un modelo de estructura secundaria mediante plegamiento manual y comparación con modelos de referencia. La estructura secundaria obtenida permitió valorar las restricciones estructurales y funcionales de la variación genética. 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Fil: Molina, Samanta. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Biología Subtropical. Universidad Nacional de Misiones. Instituto de Biología Subtropical; Argentina
Fil: Guzmán, Leila Belén. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Biología Subtropical. Instituto de Biología Subtropical - Nodo Posadas | Universidad Nacional de Misiones. Instituto de Biología Subtropical. Instituto de Biología Subtropical - Nodo Posadas; Argentina
Fil: Peso, Juana Guadalupe. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Biología Subtropical. Instituto de Biología Subtropical - Nodo Posadas | Universidad Nacional de Misiones. Instituto de Biología Subtropical. Instituto de Biología Subtropical - Nodo Posadas; Argentina
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