In Silico Analysis of Sea Urchin Pigments as Potential Therapeutic Agents Against SARS-CoV-2: Main Protease (Mpro) as a Target

Autores
Rubilar Panasiuk, Cynthia Tamara; Barbieri, Elena Susana; Gázquez, Ayelén; Avaro, Marisa; Vera Piombo, Mercedes; Gittardi Calderón, Agustín Adolfo; Seiler, Erina Noé; Fernandez, Jimena Pía; Sepúlveda, Lucas Roberto; Chaar, Florencia
Año de publicación
2020
Idioma
inglés
Tipo de recurso
artículo
Estado
versión publicada
Descripción
The SARS-CoV-2 outbreak has spread rapidly and globally generating a new coronavirus disease (COVID-19) since December 2019 that turned into a pandemic. Effective drugs are urgently needed and drug repurposing strategies offer a promising alternative to dramatically shorten the process of traditional de novo development. Based on their antiviral uses, the potential affinity of sea urchin pigments to bind main protease (Mpro) of SARS-CoV-2 was evaluated in silico. Docking analysis was used to test the potential of these sea urchin pigments as therapeutic and antiviral agents. All pigment compounds presented high molecular affinity to Mpro protein. However, the 1,4-naphtoquinones polihydroxilate (Spinochrome A and Echinochrome A) showed high affinity to bind around the Mpro´s pocket target by interfering with proper folding of the protein mainly through an H-bond with Glu166 residue. This interaction represents a potential blockage of this protease´s activity. All these results provide novel information regarding the uses of sea urchin pigments as antiviral drugs and suggest the need for further in vitro and in vivo analysis to expand all therapeutic uses against SARS-CoV-2.
Fil: Rubilar Panasiuk, Cynthia Tamara. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Centro Nacional Patagónico. Centro para el Estudio de Sistemas Marinos; Argentina. Universidad Nacional de la Patagonia "San Juan Bosco". Facultad de Ciencias Naturales - Sede Puerto Madryn. Instituto Patagónico del Mar; Argentina
Fil: Barbieri, Elena Susana. Universidad Nacional de la Patagonia "San Juan Bosco". Facultad de Ciencias Naturales - Sede Puerto Madryn. Instituto Patagónico del Mar; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Centro Nacional Patagónico. Centro para el Estudio de Sistemas Marinos; Argentina
Fil: Gázquez, Ayelén. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Investigaciones Biotecnológicas. Instituto de Investigaciones Biotecnológicas "Dr. Raúl Alfonsín" (sede Chascomús). Universidad Nacional de San Martín. Instituto de Investigaciones Biotecnológicas. Instituto de Investigaciones Biotecnológicas "Dr. Raúl Alfonsín" (sede Chascomús); Argentina
Fil: Avaro, Marisa. Universidad Nacional de la Patagonia "San Juan Bosco". Facultad de Ciencias Naturales - Sede Puerto Madryn. Instituto Patagónico del Mar; Argentina
Fil: Vera Piombo, Mercedes. Universidad Nacional de la Patagonia "San Juan Bosco". Facultad de Ciencias Naturales - Sede Puerto Madryn. Instituto Patagónico del Mar; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Centro Nacional Patagónico. Centro para el Estudio de Sistemas Marinos; Argentina
Fil: Gittardi Calderón, Agustín Adolfo. Universidad Nacional de la Patagonia "San Juan Bosco". Facultad de Ciencias Naturales - Sede Puerto Madryn. Instituto Patagónico del Mar; Argentina
Fil: Seiler, Erina Noé. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Centro Nacional Patagónico. Centro para el Estudio de Sistemas Marinos; Argentina. Universidad Nacional de la Patagonia "San Juan Bosco". Facultad de Ciencias Naturales - Sede Puerto Madryn. Instituto Patagónico del Mar; Argentina
Fil: Fernandez, Jimena Pía. Universidad Nacional de la Patagonia "San Juan Bosco". Facultad de Ciencias Naturales - Sede Puerto Madryn. Instituto Patagónico del Mar; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Centro Nacional Patagónico. Centro para el Estudio de Sistemas Marinos; Argentina
Fil: Sepúlveda, Lucas Roberto. Universidad Nacional de la Patagonia "San Juan Bosco". Facultad de Ciencias Naturales - Sede Puerto Madryn. Instituto Patagónico del Mar; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Centro Nacional Patagónico. Centro para el Estudio de Sistemas Marinos; Argentina
Fil: Chaar, Florencia. Universidad Nacional de la Patagonia "San Juan Bosco". Facultad de Ciencias Naturales - Sede Puerto Madryn. Instituto Patagónico del Mar; Argentina
Materia
2019 PANDEMIC
1,4-NAPHTOQUINONES POLIHYDROXILATE
SPINOCHROME A
ECHINOCHROME A
ANTIVIRAL DRUG
COVID-19
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
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Repositorio
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Fil: Rubilar Panasiuk, Cynthia Tamara. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Centro Nacional Patagónico. Centro para el Estudio de Sistemas Marinos; Argentina. Universidad Nacional de la Patagonia "San Juan Bosco". Facultad de Ciencias Naturales - Sede Puerto Madryn. Instituto Patagónico del Mar; Argentina
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