Advances in the functional study of the Arabidopsis DNA Glycosylase MBD4L

Autores
Torres, José Roberto; Lescano López, Ignacio; Alvarez, Maria Elena
Año de publicación
2017
Idioma
inglés
Tipo de recurso
documento de conferencia
Estado
versión publicada
Descripción
DNA glycosylases play important roles in the life of all organisms, acting at initial stages of the base excision DNA repair system that excises and replaces damaged bases from DNA. Interestingly, some particular DNA glycosylases remove 5-methylcytosine (5-mC), whose replacement by cytosine (C) can produce DNA demethylation. In Arabidopsis, DNA glycosylases from the DEMETER family have such capacity, and act over some well characterized targets. Here, we studied a novel DNA glycosylase recently described named MBD4L (methyl-binding domain protein 4 like), that is homologous to the human DNA glycosylase MBD4. Curiously, MBD4L does not recognize 5-mC in vitro. Even so, we evaluated if MBD4L can affect DNA methylation of some particular genomic regions. For that, we selected genomic targets with different chromatin states (euchromatic- heterochromatic) and used CHOP-PCR assays to determine their methylation level. Studies were conducted in wildtype, mbd4l mutant and MBD4L over-expressing plants, under both basal and stress conditions. We found that MBD4L controls DNAmethylation at loci having different chromatin states. Moreover, the enzyme affects DNA methylation both at basal and stress condition. These results suggest that the action of MBD4L is not restricted to a particular chromatin state and probably contributes to stress-induced responses. The putative effects of MBD4L on the different genomic sites and on transcriptional regulation will be discussed.
Fil: Torres, José Roberto. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Centro de Investigaciones en Química Biológica de Córdoba. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Químicas. Centro de Investigaciones en Química Biológica de Córdoba; Argentina
Fil: Lescano López, Ignacio. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Centro de Investigaciones en Química Biológica de Córdoba. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Químicas. Centro de Investigaciones en Química Biológica de Córdoba; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto Multidisciplinario de Biología Vegetal. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Exactas Físicas y Naturales. Instituto Multidisciplinario de Biología Vegetal; Argentina
Fil: Alvarez, Maria Elena. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Centro de Investigaciones en Química Biológica de Córdoba. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Químicas. Centro de Investigaciones en Química Biológica de Córdoba; Argentina
Reunión Conjunta de Sociedades de Biociencias; LXII Reunión Anual de la Sociedad Argentina de Investigación Clínica; LII Reunión Anual de la Sociedad Argentina de Investigación Bioquímica y Biología Molecular; LXV Reunión Anual de la Sociedad Argentina de Inmunología; Reunión de la Sociedad Argentina de Andrología; XLVI Reunión Anual de la Sociedad Argentina de Biofísica; XIX Reunión Anual de la Sociedad Argentina de Biología; XLIX Reunión Anual de la Sociedad Argentina de Farmacología Experimental; Reunión Anual de la Sociedad Argentina de Fisiología; Reunión de la Sociedad Argentina de Hematología; XXIX Reunión Anual de la Sociedad Argentina de Protozoología
Buenos Aires
Argentina
Sociedad Argentina de Investigación Bioquímica y Biología Molecular
Sociedad Argentina de Investigación Clínica
Sociedad Argentina de Inmunología
Sociedad Argentina de Andrología
Sociedad Argentina de Biofísica
Sociedad Argentina de Biología
Sociedad Argentina de Farmacología Experimental
Sociedad Argentina de Fisiología
Sociedad Argentina de Hematología
Sociedad Argentina de Protozoología
Materia
Epigenetics
DNA demethylation
DNA glycosylases
Stress
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
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Repositorio
CONICET Digital (CONICET)
Institución
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
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Even so, we evaluated if MBD4L can affect DNA methylation of some particular genomic regions. For that, we selected genomic targets with different chromatin states (euchromatic- heterochromatic) and used CHOP-PCR assays to determine their methylation level. Studies were conducted in wildtype, mbd4l mutant and MBD4L over-expressing plants, under both basal and stress conditions. We found that MBD4L controls DNAmethylation at loci having different chromatin states. Moreover, the enzyme affects DNA methylation both at basal and stress condition. These results suggest that the action of MBD4L is not restricted to a particular chromatin state and probably contributes to stress-induced responses. The putative effects of MBD4L on the different genomic sites and on transcriptional regulation will be discussed.Fil: Torres, José Roberto. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. 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Buenos Aires
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