Inter-laboratory comparison of eleven quantitative or digital PCR assays for detection of proviral bovine leukemia virus in blood samples

• Autores: Pluta, Aneta; Jaworski, Juan Pablo; Droscha, Casey; VanderWeele, Sophie; Taxis, Tasia M.; Valas, Stephen; Brnić, Dragan; Jungić, Andreja; Ruano, María José; Sánchez, Azucena; Murakami, Kenji; Nakamura, Kurumi; Puentes, Rodrigo; De Brun, MLaureana; Ruiz, Vanesa; Ladera Gomez, Marla Eliana; Lendez, Pamela Anahí; Dolcini, Guillermina Laura; Camargos, Marcelo Fernandes; Fonseca, Antônio; Barua, Subarna; Wang, Chengming; Giza, Aleksandra; Kuźmak, Jacek
• Año de publicación: 2024
• Idioma: inglés
• Tipo de recurso: artículo
• Materia: LEUCEMIA BOVINA; BLV; qPCR; DIAGNOSTICO; VALIDACION
• Institución: Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas

Bovine leukemia virus (BLV) is the etiological agent of enzootic bovine leukosis and causes a persistent infection that can leave cattle with no symptoms. Many countries have been able to successfully eradicate BLV through improved detection and management methods. However, with the increasing novel molecular detection methods there have been few eforts to standardize these results at global scale. This study aimed to determine the interlaboratory accuracy and agreement of 11 molecular tests in detecting BLV. Each qPCR/ddPCR method varied by target gene, primer design, DNA input and chemistries. DNA samples were extracted from blood of BLV-seropositive cattle and lyophilized to grant a better preservation during shipping to all participants around the globe. Twenty nine out of 44 samples were correctly identifed by the 11 labs and all methods exhibited a diagnostic sensitivity between 74 and 100%. Agreement amongst diferent assays was linked to BLV copy numbers present in samples and the characteristics of each assay (i.e., BLV target sequence). Finally, the mean correlation value for all assays was within the range of strong correlation. This study highlights the importance of continuous need for standardization and harmonization amongst assays and the diferent participants. The results underscore the need of an international calibrator to estimate the efciency (standard curve) of the diferent assays and improve quantitation accuracy. Additionally, this will inform future participants about the variability associated with emerging chemistries, methods, and technologies used to study BLV. Altogether, by improving tests performance worldwide it will positively aid in the eradication eforts.
Fil: Pluta, Aneta. National Veterinary Research Institute; Polonia
Fil: Jaworski, Juan Pablo. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro de Investigacion En Ciencias Veterinarias y Agronomicas. Instituto de Virologia E Innovaciones Tecnologicas. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Oficina de Coordinacion Administrativa Pque. Centenario. Instituto de Virologia E Innovaciones Tecnologicas.; Argentina
Fil: Droscha, Casey. CentralStar Cooperative; Estados Unidos
Fil: VanderWeele, Sophie. CentralStar Cooperative; Estados Unidos
Fil: Taxis, Tasia M.. Michigan State University; Estados Unidos
Fil: Valas, Stephen. French Agency for Food, Environmental and Occupational Health and Safety; Francia
Fil: Brnić, Dragan. Croatian Veterinary Institute; Croacia
Fil: Jungić, Andreja. Croatian Veterinary Institute; Croacia
Fil: Ruano, María José. Ministry of Agriculture, Fisheries and Food; España
Fil: Sánchez, Azucena. Ministry of Agriculture, Fisheries and Food; España
Fil: Murakami, Kenji. Iwate University; Japón
Fil: Nakamura, Kurumi. Iwate University; Japón
Fil: Puentes, Rodrigo. Universidad de la República; Uruguay
Fil: De Brun, MLaureana. Universidad de la República; Uruguay
Fil: Ruiz, Vanesa. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro de Investigacion En Ciencias Veterinarias y Agronomicas. Instituto de Virologia E Innovaciones Tecnologicas. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Oficina de Coordinacion Administrativa Pque. Centenario. Instituto de Virologia E Innovaciones Tecnologicas.; Argentina
Fil: Ladera Gomez, Marla Eliana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tandil. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil. Universidad Nacional del Centro de la Provincia de Buenos Aires. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comision de Investigaciones Científicas. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil; Argentina
Fil: Lendez, Pamela Anahí. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tandil. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil. Universidad Nacional del Centro de la Provincia de Buenos Aires. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comision de Investigaciones Científicas. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil; Argentina
Fil: Dolcini, Guillermina Laura. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tandil. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil. Universidad Nacional del Centro de la Provincia de Buenos Aires. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comision de Investigaciones Científicas. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil; Argentina
Fil: Camargos, Marcelo Fernandes. Laboratório Federal de Defesa Agropecuária de Minas Gerais; Brasil
Fil: Fonseca, Antônio. Laboratório Federal de Defesa Agropecuária de Minas Gerais; Brasil
Fil: Barua, Subarna. Auburn University.; Estados Unidos
Fil: Wang, Chengming. Auburn University.; Estados Unidos
Fil: Giza, Aleksandra. National Veterinary Research Institute; Polonia
Fil: Kuźmak, Jacek. National Veterinary Research Institute; Polonia