Is the nitrification a redundant process in arid regions?: activity, abundance and diversity of nitrifiers microorganisms

Autores
Noe, Laura Belen; Abril, Adriana
Año de publicación
2013
Idioma
inglés
Tipo de recurso
artículo
Estado
versión publicada
Descripción
We tested if the microbial functional redundancy concept (theory relating changes in ecosystem functioning by species loss) apply for changes in the ammonium-oxidizing community (nitrifi er bacteria) due to: a) grazing disturbance, b) seasonal variations (dry season vs. wet season), c) habitat type (soil vs. organic residues), and d) ecological conditions (two eco-regions), in an arid region of central-western of Argentina. We determined: a) abundance of culturable nitrifi er bacteria, b) nitrifi cation activity and effi ciency, and c) nitrifi er community genetic structure by PCR-DGGE (richness and similarity index). Grazing did not change the nitrifi er abundance, activity and richness, while seasonally and eco- region effects were scarce. Contrarily, the habitat type affected nitrifi er activity, which was higher in organic residues than in soil. All similarity indexes were low (average 0.50, range 0.76-0.18) which suggest high species diversity in these arid eco-regions. Our results indicate that the nitrifi cation process in arid region of Argentina is redundant but it applies only for each habitat. To our knowledge, this is the fi rst functional redundancy study on microbial ecological process in disturbed arid zones, in which we report an important species replacement but without modifi cations in microorganism abundance and activity.
Nosotros testeamos si el concepto de redundancia funcional microbiana (teoría que relaciona los cambios en el funcionamiento del ecosistema y la pérdida de especies) se aplica para la comunidad de microorganismos oxidadores de amonio (bacterias nitrificadoras) afectada por el pastoreo, la estacionalidad (estación seca y húmeda), el tipo de hábitat (suelo y restos orgánicos), y las condiciones ecológicas (eco-región del Chaco Árido y el Monte), en la región árida del centro-oeste de Argentina. Se determinó: a) la abundancia de bacterias nitrificadoras cultivables, b) la actividad y eficiencia de la nitrificación, y c) la estructura genética de la comunidad de nitrificadores mediante PCR- DGGE (riqueza e índice de similitud). El pastoreo no modificó la abundancia de nitrificadores, la actividad y la riqueza, mientras que el efecto de la estacionalidad y la eco-región fue escaso. Contrariamente, el tipo de hábitat afectó la actividad nitrificadora, la cual fue más alta en los restos orgánicos que en el suelo. Todos los índices de similitud fueron bajos (promedio = 0.5; rango entre 0.76-0.18), lo cual sugiere una alta diversidad de especies en estas regiones áridas. Nuestros resultados indican que el proceso de nitrificación en la región árida central de Argentina es redundante, pero que se puede aplicar solo para cada tipo de hábitat. En nuestro conocimiento, este es el primer estudio de redundancia funcional sobre procesos ecológicos microbianos en zonas áridas disturbadas, en el cual se detectó un importante remplazo de especies, sin modificaciones en la abundancia y actividad de los microorganismos.
Fil: Noe, Laura Belen. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico y Transferencia de Tecnologia a la Producción; Argentina;
Fil: Abril, Adriana. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Agropecuarias. Departamento de Recursos Naturales. Cátedra de Microbiología Agrícola; Argentina;
Fuente
www.scielo.cl
Materia
arid Chaco
similarity index
Monte desert
PCR-DGGE
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
Repositorio
CONICET Digital (CONICET)
Institución
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
OAI Identificador
oai:ri.conicet.gov.ar:11336/1092

id CONICETDig_31c0ab2cc1ebe92d63b0fbe567921852
oai_identifier_str oai:ri.conicet.gov.ar:11336/1092
network_acronym_str CONICETDig
repository_id_str 3498
network_name_str CONICET Digital (CONICET)
spelling Is the nitrification a redundant process in arid regions?: activity, abundance and diversity of nitrifiers microorganismsNoe, Laura BelenAbril, Adrianaarid Chacosimilarity indexMonte desertPCR-DGGEhttps://purl.org/becyt/ford/4https://purl.org/becyt/ford/4.1We tested if the microbial functional redundancy concept (theory relating changes in ecosystem functioning by species loss) apply for changes in the ammonium-oxidizing community (nitrifi er bacteria) due to: a) grazing disturbance, b) seasonal variations (dry season vs. wet season), c) habitat type (soil vs. organic residues), and d) ecological conditions (two eco-regions), in an arid region of central-western of Argentina. We determined: a) abundance of culturable nitrifi er bacteria, b) nitrifi cation activity and effi ciency, and c) nitrifi er community genetic structure by PCR-DGGE (richness and similarity index). Grazing did not change the nitrifi er abundance, activity and richness, while seasonally and eco- region effects were scarce. Contrarily, the habitat type affected nitrifi er activity, which was higher in organic residues than in soil. All similarity indexes were low (average 0.50, range 0.76-0.18) which suggest high species diversity in these arid eco-regions. Our results indicate that the nitrifi cation process in arid region of Argentina is redundant but it applies only for each habitat. To our knowledge, this is the fi rst functional redundancy study on microbial ecological process in disturbed arid zones, in which we report an important species replacement but without modifi cations in microorganism abundance and activity.Nosotros testeamos si el concepto de redundancia funcional microbiana (teoría que relaciona los cambios en el funcionamiento del ecosistema y la pérdida de especies) se aplica para la comunidad de microorganismos oxidadores de amonio (bacterias nitrificadoras) afectada por el pastoreo, la estacionalidad (estación seca y húmeda), el tipo de hábitat (suelo y restos orgánicos), y las condiciones ecológicas (eco-región del Chaco Árido y el Monte), en la región árida del centro-oeste de Argentina. Se determinó: a) la abundancia de bacterias nitrificadoras cultivables, b) la actividad y eficiencia de la nitrificación, y c) la estructura genética de la comunidad de nitrificadores mediante PCR- DGGE (riqueza e índice de similitud). El pastoreo no modificó la abundancia de nitrificadores, la actividad y la riqueza, mientras que el efecto de la estacionalidad y la eco-región fue escaso. Contrariamente, el tipo de hábitat afectó la actividad nitrificadora, la cual fue más alta en los restos orgánicos que en el suelo. Todos los índices de similitud fueron bajos (promedio = 0.5; rango entre 0.76-0.18), lo cual sugiere una alta diversidad de especies en estas regiones áridas. Nuestros resultados indican que el proceso de nitrificación en la región árida central de Argentina es redundante, pero que se puede aplicar solo para cada tipo de hábitat. En nuestro conocimiento, este es el primer estudio de redundancia funcional sobre procesos ecológicos microbianos en zonas áridas disturbadas, en el cual se detectó un importante remplazo de especies, sin modificaciones en la abundancia y actividad de los microorganismos.Fil: Noe, Laura Belen. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico y Transferencia de Tecnologia a la Producción; Argentina;Fil: Abril, Adriana. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Agropecuarias. Departamento de Recursos Naturales. Cátedra de Microbiología Agrícola; Argentina;Soc Biolgia Chile2013-09info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_6501info:ar-repo/semantics/articuloapplication/pdfapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/11336/1092Noe, Laura Belen; Abril, Adriana; Is the nitrification a redundant process in arid regions?: activity, abundance and diversity of nitrifiers microorganisms; Soc Biolgia Chile; Revista Chilena de Historia Natural; 86; 9-2013; 325-3350716-078X0717-6317www.scielo.clreponame:CONICET Digital (CONICET)instname:Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicaseng© Sociedad de Biología de Chileinfo:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/http://www.scielo.cl/pdf/rchnat/v86n3/art09.pdfinfo:eu-repo/semantics/openAccesshttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/2025-10-15T15:13:37Zoai:ri.conicet.gov.ar:11336/1092instacron:CONICETInstitucionalhttp://ri.conicet.gov.ar/Organismo científico-tecnológicoNo correspondehttp://ri.conicet.gov.ar/oai/requestdasensio@conicet.gov.ar; lcarlino@conicet.gov.arArgentinaNo correspondeNo correspondeNo correspondeopendoar:34982025-10-15 15:13:37.335CONICET Digital (CONICET) - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicasfalse
dc.title.none.fl_str_mv Is the nitrification a redundant process in arid regions?: activity, abundance and diversity of nitrifiers microorganisms
title Is the nitrification a redundant process in arid regions?: activity, abundance and diversity of nitrifiers microorganisms
spellingShingle Is the nitrification a redundant process in arid regions?: activity, abundance and diversity of nitrifiers microorganisms
Noe, Laura Belen
arid Chaco
similarity index
Monte desert
PCR-DGGE
title_short Is the nitrification a redundant process in arid regions?: activity, abundance and diversity of nitrifiers microorganisms
title_full Is the nitrification a redundant process in arid regions?: activity, abundance and diversity of nitrifiers microorganisms
title_fullStr Is the nitrification a redundant process in arid regions?: activity, abundance and diversity of nitrifiers microorganisms
title_full_unstemmed Is the nitrification a redundant process in arid regions?: activity, abundance and diversity of nitrifiers microorganisms
title_sort Is the nitrification a redundant process in arid regions?: activity, abundance and diversity of nitrifiers microorganisms
dc.creator.none.fl_str_mv Noe, Laura Belen
Abril, Adriana
author Noe, Laura Belen
author_facet Noe, Laura Belen
Abril, Adriana
author_role author
author2 Abril, Adriana
author2_role author
dc.subject.none.fl_str_mv arid Chaco
similarity index
Monte desert
PCR-DGGE
topic arid Chaco
similarity index
Monte desert
PCR-DGGE
purl_subject.fl_str_mv https://purl.org/becyt/ford/4
https://purl.org/becyt/ford/4.1
dc.description.none.fl_txt_mv We tested if the microbial functional redundancy concept (theory relating changes in ecosystem functioning by species loss) apply for changes in the ammonium-oxidizing community (nitrifi er bacteria) due to: a) grazing disturbance, b) seasonal variations (dry season vs. wet season), c) habitat type (soil vs. organic residues), and d) ecological conditions (two eco-regions), in an arid region of central-western of Argentina. We determined: a) abundance of culturable nitrifi er bacteria, b) nitrifi cation activity and effi ciency, and c) nitrifi er community genetic structure by PCR-DGGE (richness and similarity index). Grazing did not change the nitrifi er abundance, activity and richness, while seasonally and eco- region effects were scarce. Contrarily, the habitat type affected nitrifi er activity, which was higher in organic residues than in soil. All similarity indexes were low (average 0.50, range 0.76-0.18) which suggest high species diversity in these arid eco-regions. Our results indicate that the nitrifi cation process in arid region of Argentina is redundant but it applies only for each habitat. To our knowledge, this is the fi rst functional redundancy study on microbial ecological process in disturbed arid zones, in which we report an important species replacement but without modifi cations in microorganism abundance and activity.
Nosotros testeamos si el concepto de redundancia funcional microbiana (teoría que relaciona los cambios en el funcionamiento del ecosistema y la pérdida de especies) se aplica para la comunidad de microorganismos oxidadores de amonio (bacterias nitrificadoras) afectada por el pastoreo, la estacionalidad (estación seca y húmeda), el tipo de hábitat (suelo y restos orgánicos), y las condiciones ecológicas (eco-región del Chaco Árido y el Monte), en la región árida del centro-oeste de Argentina. Se determinó: a) la abundancia de bacterias nitrificadoras cultivables, b) la actividad y eficiencia de la nitrificación, y c) la estructura genética de la comunidad de nitrificadores mediante PCR- DGGE (riqueza e índice de similitud). El pastoreo no modificó la abundancia de nitrificadores, la actividad y la riqueza, mientras que el efecto de la estacionalidad y la eco-región fue escaso. Contrariamente, el tipo de hábitat afectó la actividad nitrificadora, la cual fue más alta en los restos orgánicos que en el suelo. Todos los índices de similitud fueron bajos (promedio = 0.5; rango entre 0.76-0.18), lo cual sugiere una alta diversidad de especies en estas regiones áridas. Nuestros resultados indican que el proceso de nitrificación en la región árida central de Argentina es redundante, pero que se puede aplicar solo para cada tipo de hábitat. En nuestro conocimiento, este es el primer estudio de redundancia funcional sobre procesos ecológicos microbianos en zonas áridas disturbadas, en el cual se detectó un importante remplazo de especies, sin modificaciones en la abundancia y actividad de los microorganismos.
Fil: Noe, Laura Belen. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico y Transferencia de Tecnologia a la Producción; Argentina;
Fil: Abril, Adriana. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Agropecuarias. Departamento de Recursos Naturales. Cátedra de Microbiología Agrícola; Argentina;
description We tested if the microbial functional redundancy concept (theory relating changes in ecosystem functioning by species loss) apply for changes in the ammonium-oxidizing community (nitrifi er bacteria) due to: a) grazing disturbance, b) seasonal variations (dry season vs. wet season), c) habitat type (soil vs. organic residues), and d) ecological conditions (two eco-regions), in an arid region of central-western of Argentina. We determined: a) abundance of culturable nitrifi er bacteria, b) nitrifi cation activity and effi ciency, and c) nitrifi er community genetic structure by PCR-DGGE (richness and similarity index). Grazing did not change the nitrifi er abundance, activity and richness, while seasonally and eco- region effects were scarce. Contrarily, the habitat type affected nitrifi er activity, which was higher in organic residues than in soil. All similarity indexes were low (average 0.50, range 0.76-0.18) which suggest high species diversity in these arid eco-regions. Our results indicate that the nitrifi cation process in arid region of Argentina is redundant but it applies only for each habitat. To our knowledge, this is the fi rst functional redundancy study on microbial ecological process in disturbed arid zones, in which we report an important species replacement but without modifi cations in microorganism abundance and activity.
publishDate 2013
dc.date.none.fl_str_mv 2013-09
dc.type.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/article
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
http://purl.org/coar/resource_type/c_6501
info:ar-repo/semantics/articulo
format article
status_str publishedVersion
dc.identifier.none.fl_str_mv http://hdl.handle.net/11336/1092
Noe, Laura Belen; Abril, Adriana; Is the nitrification a redundant process in arid regions?: activity, abundance and diversity of nitrifiers microorganisms; Soc Biolgia Chile; Revista Chilena de Historia Natural; 86; 9-2013; 325-335
0716-078X
0717-6317
url http://hdl.handle.net/11336/1092
identifier_str_mv Noe, Laura Belen; Abril, Adriana; Is the nitrification a redundant process in arid regions?: activity, abundance and diversity of nitrifiers microorganisms; Soc Biolgia Chile; Revista Chilena de Historia Natural; 86; 9-2013; 325-335
0716-078X
0717-6317
dc.language.none.fl_str_mv eng
language eng
dc.relation.none.fl_str_mv © Sociedad de Biología de Chile
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/http://www.scielo.cl/pdf/rchnat/v86n3/art09.pdf
dc.rights.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
eu_rights_str_mv openAccess
rights_invalid_str_mv https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Soc Biolgia Chile
publisher.none.fl_str_mv Soc Biolgia Chile
dc.source.none.fl_str_mv www.scielo.cl
reponame:CONICET Digital (CONICET)
instname:Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
reponame_str CONICET Digital (CONICET)
collection CONICET Digital (CONICET)
instname_str Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
repository.name.fl_str_mv CONICET Digital (CONICET) - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
repository.mail.fl_str_mv dasensio@conicet.gov.ar; lcarlino@conicet.gov.ar
_version_ 1846083283545227264
score 13.22299