Direct action of intestinal microorganisms in colorectal cancer cell line

Autores
Bernacchia, Juliana Lourdes; Palma, Alejandra Graciela; Lira, María Cecilia; Rosa, Francisco Damián; De Paulis, Adriana; Laudano, Oscar; Lleyda, Micaela; Nowicki, Susana; Vázquez Levin, Mónica; Rubio, Maria Fernanda; Costas, Monica Alejandra
Año de publicación
2022
Idioma
inglés
Tipo de recurso
documento de conferencia
Estado
versión publicada
Descripción
Numerous evidences demonstrate the importance of the microbiome mainly due to its immunological action, in the development of multiple diseases, such as colorectal cancer (CRC). In agreement with previous works, bacteria such as Escherichia coli (E.coli) and Bacteroides fragilis, among others, have high prevalence in CRC patients compared to the normal population.In this work we investigate the possible pathways and signaling that may contribute to CRC development that could be affected by direct action of bacteria over colorectal cancer cells, in the absence of additional signals from the immune system. Therefore, we first determined the total amount of genes that were up or down regulated (log FC >1 or <-1), as determined by RNAseq, in experiments where the CRC cell line DLD-1 was infected with the bacteria E.coli for 2 h or Enterotoxigenic Bacteroides fragilis (ETBF) for 2 to 24 h at MOI: 500 (database GSE130152). Then, we performed an over-representation analysis using the ConsensusPathDB bioinformatic tool.We found that ETBF upregulates 525 genes involved in processes like cell migration, inflammatory response, and the FOXO-mediated transcription of cell cycle genes (at least p< 0.05). While E.coli upregulates 2249 genes, most of them involved in TNF, NF-kB, MAPK, and inflammatory signaling pathways (at least p< 0.05). Interestingly, 231 upregulated and 414 downregulated genes are shared with ETBF as determined by Venn diagrams. Then to confirm the previous suggested incidence of these bacteria in CRC, we analyzed the presence of both, using LDA score (linear discriminant analysis) in colorectal neoplasms from GMrepo database of human gut metagenomes and found that they have LDA>4, thus, strongly involved in CRC.We conclude, there are signals and pathways independent of the immune system that could be induced directly by bacteria in the epithelial colorectal cells, contributing to CRC.
Fil: Bernacchia, Juliana Lourdes. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones Médicas; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones Médicas. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones Médicas; Argentina
Fil: Palma, Alejandra Graciela. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones Médicas; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones Médicas. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones Médicas; Argentina
Fil: Lira, María Cecilia. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones Médicas; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones Médicas. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones Médicas; Argentina
Fil: Rosa, Francisco Damián. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones Médicas. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones Médicas; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones Médicas; Argentina
Fil: De Paulis, Adriana. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones Médicas; Argentina
Fil: Laudano, Oscar. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones Médicas; Argentina
Fil: Lleyda, Micaela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología y Medicina Experimental. Fundación de Instituto de Biología y Medicina Experimental. Instituto de Biología y Medicina Experimental; Argentina
Fil: Nowicki, Susana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Centro de Investigaciones Endocrinológicas "Dr. César Bergada". Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Centro de Investigaciones Endocrinológicas "Dr. César Bergada". Fundación de Endocrinología Infantil. Centro de Investigaciones Endocrinológicas "Dr. César Bergada"; Argentina
Fil: Vázquez Levin, Mónica. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología y Medicina Experimental. Fundación de Instituto de Biología y Medicina Experimental. Instituto de Biología y Medicina Experimental; Argentina
Fil: Rubio, Maria Fernanda. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones Médicas; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones Médicas. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones Médicas; Argentina
Fil: Costas, Monica Alejandra. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones Médicas; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones Médicas. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones Médicas; Argentina
LXVII Reunión Anual de la Sociedad Argentina de Investigación Clínica; LXX Reunión Anual de la Sociedad Argentina de Inmunología & 3er Congreso Franco Argentino de Inmunología; Reunión Anual 2022 de la Sociedad Argentina de Fisiología
Mar del Plata
Argentina
Sociedad Argentina de Investigación Clínica
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Then, we performed an over-representation analysis using the ConsensusPathDB bioinformatic tool.We found that ETBF upregulates 525 genes involved in processes like cell migration, inflammatory response, and the FOXO-mediated transcription of cell cycle genes (at least p< 0.05). While E.coli upregulates 2249 genes, most of them involved in TNF, NF-kB, MAPK, and inflammatory signaling pathways (at least p< 0.05). Interestingly, 231 upregulated and 414 downregulated genes are shared with ETBF as determined by Venn diagrams. Then to confirm the previous suggested incidence of these bacteria in CRC, we analyzed the presence of both, using LDA score (linear discriminant analysis) in colorectal neoplasms from GMrepo database of human gut metagenomes and found that they have LDA>4, thus, strongly involved in CRC.We conclude, there are signals and pathways independent of the immune system that could be induced directly by bacteria in the epithelial colorectal cells, contributing to CRC.Fil: Bernacchia, Juliana Lourdes. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones Médicas; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones Médicas. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones Médicas; ArgentinaFil: Palma, Alejandra Graciela. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones Médicas; Argentina. 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Instituto de Investigaciones Médicas; ArgentinaLXVII Reunión Anual de la Sociedad Argentina de Investigación Clínica; LXX Reunión Anual de la Sociedad Argentina de Inmunología & 3er Congreso Franco Argentino de Inmunología; Reunión Anual 2022 de la Sociedad Argentina de FisiologíaMar del PlataArgentinaSociedad Argentina de Investigación ClínicaSociedad Argentina de InmunologíaSociedad Argentina de FisiologíaFundación Revista Medicina2022info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/conferenceObjectReuniónJournalhttp://purl.org/coar/resource_type/c_5794info:ar-repo/semantics/documentoDeConferenciaapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/11336/260670Direct action of intestinal microorganisms in colorectal cancer cell line; LXVII Reunión Anual de la Sociedad Argentina de Investigación Clínica; LXX Reunión Anual de la Sociedad Argentina de Inmunología & 3er Congreso Franco Argentino de Inmunología; Reunión Anual 2022 de la Sociedad Argentina de Fisiología; Mar del Plata; Argentina; 2022; 267-2670025-7680CONICET DigitalCONICETenginfo:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://www.saic.org.ar/revista-medicinaInternacionalinfo:eu-repo/semantics/openAccesshttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/reponame:CONICET Digital (CONICET)instname:Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas2025-09-03T10:07:07Zoai:ri.conicet.gov.ar:11336/260670instacron:CONICETInstitucionalhttp://ri.conicet.gov.ar/Organismo científico-tecnológicoNo correspondehttp://ri.conicet.gov.ar/oai/requestdasensio@conicet.gov.ar; lcarlino@conicet.gov.arArgentinaNo correspondeNo correspondeNo correspondeopendoar:34982025-09-03 10:07:07.97CONICET Digital (CONICET) - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicasfalse
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Fil: De Paulis, Adriana. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones Médicas; Argentina
Fil: Laudano, Oscar. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones Médicas; Argentina
Fil: Lleyda, Micaela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología y Medicina Experimental. Fundación de Instituto de Biología y Medicina Experimental. Instituto de Biología y Medicina Experimental; Argentina
Fil: Nowicki, Susana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Centro de Investigaciones Endocrinológicas "Dr. César Bergada". Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Centro de Investigaciones Endocrinológicas "Dr. César Bergada". Fundación de Endocrinología Infantil. Centro de Investigaciones Endocrinológicas "Dr. César Bergada"; Argentina
Fil: Vázquez Levin, Mónica. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología y Medicina Experimental. Fundación de Instituto de Biología y Medicina Experimental. Instituto de Biología y Medicina Experimental; Argentina
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LXVII Reunión Anual de la Sociedad Argentina de Investigación Clínica; LXX Reunión Anual de la Sociedad Argentina de Inmunología & 3er Congreso Franco Argentino de Inmunología; Reunión Anual 2022 de la Sociedad Argentina de Fisiología
Mar del Plata
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