Análisis informático de vías de defensa involucradas en la interacción Citrus - Candidatus Liberibacter spp. a partir de datos provenientes de rna-seq

Autores
Machado, Rodrigo; Moschen, Sebastián Nicolás; Di Rienzo, Julio Alejandro; González, Sergio Alberto; Burdyn, Lourdes; Fernández, Paula del Carmen; Hopp, Horacio Esteban; Conti, Gabriela
Año de publicación
2021
Idioma
español castellano
Tipo de recurso
documento de conferencia
Estado
versión publicada
Descripción
HuangLongBing (HLB) es la enfermedad más devastadora de los cítricos, que hasta elmomento no cuenta con un tratamiento efectivo. Es causada por bacterias del géneroCandidatus Liberibacter. Son parásitos obligadas de floema y se transmiten por un insectovector (el psílido Diaphorina citri). En Argentina se ha detectado la especie Ca. Liberibacterasiaticus. Estas bacterias aún no se han logrado cultivar, dificultando esto el avance en losestudios de patogenicidad y defensa. Los síntomas del HLB incluyen alteraciones sistémicas enla fisiología y el desarrollo y, en etapas avanzadas, la muerte de la planta. En el presenteestudio se analizaron de forma integrada un conjunto de bases de datos biológicos a partir desecuenciación masiva de ARN proveniente de los ensayos PRJNA203307, PRJNA280255,PRJNA31921, PRJNA348468, PRJNA417324, PRJNA645216. Los perfiles de expresióndiferencial génica en distintas variedades cítricas y tiempos de infección, mostraron que elavance de la enfermedad resulta en alteraciones fisiológicas como: (1) desbalance decarbohidratos relacionado con la interrupción de la relación fuente-sumidero, (2)perturbaciones en el crosstalk de fitohormonas involucradas en inmunidad y desarrollo (SA, JA,brasinosteroides, etc), (3) cambios en la activación rápida de vías de desintoxicación(particularmente GSTs). Este tipo de estudios permite integrar datos e identificar víasmetabólicas y nuevos transcriptos implicados en la activación de defensa que pueden ser útilespara la ingeniería genética.
Fil: Machado, Rodrigo. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro Regional Entre Rios. Estacion Experimental Agropecuaria Concordia.; Argentina
Fil: Moschen, Sebastián Nicolás. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Tucuman-Santiago del Estero. Estación Experimental Agropecuaria Famaillá; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán; Argentina
Fil: Di Rienzo, Julio Alejandro. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Agropecuarias. Departamento de Desarrollo Rural. Area de Estadística y Biometría; Argentina
Fil: González, Sergio Alberto. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación En Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina
Fil: Burdyn, Lourdes. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro Regional Entre Rios. Estacion Experimental Agropecuaria Concordia.; Argentina
Fil: Fernández, Paula del Carmen. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación En Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina
Fil: Hopp, Horacio Esteban. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación En Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina
Fil: Conti, Gabriela. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación En Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina
5º Congreso Argentino de Fitopatología; 59º Reunión APS División Caribe
Corrientes
Argentina
Asociación Argentina de Fitopatólogos
Materia
HLB
CITRUS
RNA-Seq
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
Repositorio
CONICET Digital (CONICET)
Institución
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
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Los síntomas del HLB incluyen alteraciones sistémicas enla fisiología y el desarrollo y, en etapas avanzadas, la muerte de la planta. En el presenteestudio se analizaron de forma integrada un conjunto de bases de datos biológicos a partir desecuenciación masiva de ARN proveniente de los ensayos PRJNA203307, PRJNA280255,PRJNA31921, PRJNA348468, PRJNA417324, PRJNA645216. Los perfiles de expresióndiferencial génica en distintas variedades cítricas y tiempos de infección, mostraron que elavance de la enfermedad resulta en alteraciones fisiológicas como: (1) desbalance decarbohidratos relacionado con la interrupción de la relación fuente-sumidero, (2)perturbaciones en el crosstalk de fitohormonas involucradas en inmunidad y desarrollo (SA, JA,brasinosteroides, etc), (3) cambios en la activación rápida de vías de desintoxicación(particularmente GSTs). 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Fil: Machado, Rodrigo. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro Regional Entre Rios. Estacion Experimental Agropecuaria Concordia.; Argentina
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Fil: Burdyn, Lourdes. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro Regional Entre Rios. Estacion Experimental Agropecuaria Concordia.; Argentina
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5º Congreso Argentino de Fitopatología; 59º Reunión APS División Caribe
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