Optimización de un diseño experimental para el estudio de la interacción Citrus - Candidatus Liberibacter spp., causante de la enfermedad HuangLongBing mediante análisis de RNA-seq...
- Autores
- Machado, Rodrigo; Moschen, Sebastian Nicolas; Conti, Gabriela; Gonzalez, Sergio Alberto; Burdyn, Lourdes; Hopp, Horacio Esteban; Di Rienzo, Julio Alejandro; Fernandez, Paula Del Carmen
- Año de publicación
- 2021
- Idioma
- español castellano
- Tipo de recurso
- documento de conferencia
- Estado
- versión publicada
- Descripción
- Póster y Resumen
El método por excelencia actualmente utilizado para la detección de HLB es la PCR en tiempo real basado en la secuencia 16S rDNA. Sin embargo, la distribución irregular de las bacterias en las plantas, genera dificultades en el proceso de muestreo y posterior análisis. Los análisis transcriptómicos permiten la identificación de un gran número de genes que la planta expresa en respuesta a la infección. Los datos generados mediante la implementación de esta estrategia permiten identificar patrones de expresión diferencial génica en plantas cítricas infectadas durante etapas tempranas de la enfermedad. Se realizaron análisis que permitieron optimizar los tiempos de muestreo a 12, 16, 20 y 24 semanas a fin de poder detectar los cambios transcriptómicos en etapas tempranas.
EEA Concordia
Fil: Machado, Rodrigo. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Concordia; Argentina.
Fil: Moschen, Sebastian Nicolas. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Famaillá; Argentina.
Fil: Conti, Gabriela. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina
Fil: Conti, Gabriela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET). Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina
Fil: Gonzalez, Sergio Alberto. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina
Fil: Gonzalez, Sergio Alberto. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET). Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina
Fil: Burdyn, Lourdes. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Concordia; Argentina.
Fil: Hopp, Horacio Esteban. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina
Fil: Hopp; Horacio Esteban. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET). Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina
Fil: Di Rienzo, Julio Alejandro. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Agropecuarias; Argentina
Fil: Fernandez, Paula Del Carmen. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina
Fil: Fernandez, Paula Del Carmen. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET). Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina - Fuente
- 13° Simposio REDBIO Argentina 2021.“La Biotecnología como Solución a Desafíos Pasados, Presentes y Futuros”. 07 al 11 de Junio (Modalidad virtual)
- Materia
-
Citrus
PCR
Análisis de Secuencias
Transcriptomas
Huanglongbing de los cítricos
Sequence analysis
Transcriptome
Huanglongbing
HLB - Nivel de accesibilidad
- acceso abierto
- Condiciones de uso
- http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
- Repositorio
- Institución
- Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria
- OAI Identificador
- oai:localhost:20.500.12123/17797
Ver los metadatos del registro completo
id |
INTADig_bd691ee2fc32cb9a76954fa7373d3c43 |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:localhost:20.500.12123/17797 |
network_acronym_str |
INTADig |
repository_id_str |
l |
network_name_str |
INTA Digital (INTA) |
spelling |
Optimización de un diseño experimental para el estudio de la interacción Citrus - Candidatus Liberibacter spp., causante de la enfermedad HuangLongBing mediante análisis de RNA-seqMachado, RodrigoMoschen, Sebastian NicolasConti, GabrielaGonzalez, Sergio AlbertoBurdyn, LourdesHopp, Horacio EstebanDi Rienzo, Julio AlejandroFernandez, Paula Del CarmenCitrusPCRAnálisis de SecuenciasTranscriptomasHuanglongbing de los cítricosSequence analysisTranscriptomeHuanglongbingHLBPóster y ResumenEl método por excelencia actualmente utilizado para la detección de HLB es la PCR en tiempo real basado en la secuencia 16S rDNA. Sin embargo, la distribución irregular de las bacterias en las plantas, genera dificultades en el proceso de muestreo y posterior análisis. Los análisis transcriptómicos permiten la identificación de un gran número de genes que la planta expresa en respuesta a la infección. Los datos generados mediante la implementación de esta estrategia permiten identificar patrones de expresión diferencial génica en plantas cítricas infectadas durante etapas tempranas de la enfermedad. Se realizaron análisis que permitieron optimizar los tiempos de muestreo a 12, 16, 20 y 24 semanas a fin de poder detectar los cambios transcriptómicos en etapas tempranas.EEA ConcordiaFil: Machado, Rodrigo. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Concordia; Argentina.Fil: Moschen, Sebastian Nicolas. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Famaillá; Argentina.Fil: Conti, Gabriela. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; ArgentinaFil: Conti, Gabriela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET). Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; ArgentinaFil: Gonzalez, Sergio Alberto. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; ArgentinaFil: Gonzalez, Sergio Alberto. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET). Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; ArgentinaFil: Burdyn, Lourdes. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Concordia; Argentina.Fil: Hopp, Horacio Esteban. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; ArgentinaFil: Hopp; Horacio Esteban. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET). Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; ArgentinaFil: Di Rienzo, Julio Alejandro. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Agropecuarias; ArgentinaFil: Fernandez, Paula Del Carmen. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; ArgentinaFil: Fernandez, Paula Del Carmen. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET). Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; ArgentinaREDBIO2024-05-17T17:27:21Z2024-05-17T17:27:21Z2021-06info:eu-repo/semantics/conferenceObjectinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_5794info:ar-repo/semantics/documentoDeConferenciaapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/20.500.12123/177971688-926613° Simposio REDBIO Argentina 2021.“La Biotecnología como Solución a Desafíos Pasados, Presentes y Futuros”. 07 al 11 de Junio (Modalidad virtual)reponame:INTA Digital (INTA)instname:Instituto Nacional de Tecnología Agropecuariaspainfo:eu-repo/semantics/openAccesshttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/Creative Commons Attribution-NonCommercial-ShareAlike 4.0 International (CC BY-NC-SA 4.0)2025-09-29T13:46:32Zoai:localhost:20.500.12123/17797instacron:INTAInstitucionalhttp://repositorio.inta.gob.ar/Organismo científico-tecnológicoNo correspondehttp://repositorio.inta.gob.ar/oai/requesttripaldi.nicolas@inta.gob.arArgentinaNo correspondeNo correspondeNo correspondeopendoar:l2025-09-29 13:46:33.081INTA Digital (INTA) - Instituto Nacional de Tecnología Agropecuariafalse |
dc.title.none.fl_str_mv |
Optimización de un diseño experimental para el estudio de la interacción Citrus - Candidatus Liberibacter spp., causante de la enfermedad HuangLongBing mediante análisis de RNA-seq |
title |
Optimización de un diseño experimental para el estudio de la interacción Citrus - Candidatus Liberibacter spp., causante de la enfermedad HuangLongBing mediante análisis de RNA-seq |
spellingShingle |
Optimización de un diseño experimental para el estudio de la interacción Citrus - Candidatus Liberibacter spp., causante de la enfermedad HuangLongBing mediante análisis de RNA-seq Machado, Rodrigo Citrus PCR Análisis de Secuencias Transcriptomas Huanglongbing de los cítricos Sequence analysis Transcriptome Huanglongbing HLB |
title_short |
Optimización de un diseño experimental para el estudio de la interacción Citrus - Candidatus Liberibacter spp., causante de la enfermedad HuangLongBing mediante análisis de RNA-seq |
title_full |
Optimización de un diseño experimental para el estudio de la interacción Citrus - Candidatus Liberibacter spp., causante de la enfermedad HuangLongBing mediante análisis de RNA-seq |
title_fullStr |
Optimización de un diseño experimental para el estudio de la interacción Citrus - Candidatus Liberibacter spp., causante de la enfermedad HuangLongBing mediante análisis de RNA-seq |
title_full_unstemmed |
Optimización de un diseño experimental para el estudio de la interacción Citrus - Candidatus Liberibacter spp., causante de la enfermedad HuangLongBing mediante análisis de RNA-seq |
title_sort |
Optimización de un diseño experimental para el estudio de la interacción Citrus - Candidatus Liberibacter spp., causante de la enfermedad HuangLongBing mediante análisis de RNA-seq |
dc.creator.none.fl_str_mv |
Machado, Rodrigo Moschen, Sebastian Nicolas Conti, Gabriela Gonzalez, Sergio Alberto Burdyn, Lourdes Hopp, Horacio Esteban Di Rienzo, Julio Alejandro Fernandez, Paula Del Carmen |
author |
Machado, Rodrigo |
author_facet |
Machado, Rodrigo Moschen, Sebastian Nicolas Conti, Gabriela Gonzalez, Sergio Alberto Burdyn, Lourdes Hopp, Horacio Esteban Di Rienzo, Julio Alejandro Fernandez, Paula Del Carmen |
author_role |
author |
author2 |
Moschen, Sebastian Nicolas Conti, Gabriela Gonzalez, Sergio Alberto Burdyn, Lourdes Hopp, Horacio Esteban Di Rienzo, Julio Alejandro Fernandez, Paula Del Carmen |
author2_role |
author author author author author author author |
dc.subject.none.fl_str_mv |
Citrus PCR Análisis de Secuencias Transcriptomas Huanglongbing de los cítricos Sequence analysis Transcriptome Huanglongbing HLB |
topic |
Citrus PCR Análisis de Secuencias Transcriptomas Huanglongbing de los cítricos Sequence analysis Transcriptome Huanglongbing HLB |
dc.description.none.fl_txt_mv |
Póster y Resumen El método por excelencia actualmente utilizado para la detección de HLB es la PCR en tiempo real basado en la secuencia 16S rDNA. Sin embargo, la distribución irregular de las bacterias en las plantas, genera dificultades en el proceso de muestreo y posterior análisis. Los análisis transcriptómicos permiten la identificación de un gran número de genes que la planta expresa en respuesta a la infección. Los datos generados mediante la implementación de esta estrategia permiten identificar patrones de expresión diferencial génica en plantas cítricas infectadas durante etapas tempranas de la enfermedad. Se realizaron análisis que permitieron optimizar los tiempos de muestreo a 12, 16, 20 y 24 semanas a fin de poder detectar los cambios transcriptómicos en etapas tempranas. EEA Concordia Fil: Machado, Rodrigo. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Concordia; Argentina. Fil: Moschen, Sebastian Nicolas. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Famaillá; Argentina. Fil: Conti, Gabriela. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina Fil: Conti, Gabriela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET). Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina Fil: Gonzalez, Sergio Alberto. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina Fil: Gonzalez, Sergio Alberto. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET). Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina Fil: Burdyn, Lourdes. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Estación Experimental Agropecuaria Concordia; Argentina. Fil: Hopp, Horacio Esteban. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina Fil: Hopp; Horacio Esteban. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET). Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina Fil: Di Rienzo, Julio Alejandro. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Ciencias Agropecuarias; Argentina Fil: Fernandez, Paula Del Carmen. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA). Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina Fil: Fernandez, Paula Del Carmen. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET). Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina |
description |
Póster y Resumen |
publishDate |
2021 |
dc.date.none.fl_str_mv |
2021-06 2024-05-17T17:27:21Z 2024-05-17T17:27:21Z |
dc.type.none.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/conferenceObject info:eu-repo/semantics/publishedVersion http://purl.org/coar/resource_type/c_5794 info:ar-repo/semantics/documentoDeConferencia |
format |
conferenceObject |
status_str |
publishedVersion |
dc.identifier.none.fl_str_mv |
http://hdl.handle.net/20.500.12123/17797 1688-9266 |
url |
http://hdl.handle.net/20.500.12123/17797 |
identifier_str_mv |
1688-9266 |
dc.language.none.fl_str_mv |
spa |
language |
spa |
dc.rights.none.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/ Creative Commons Attribution-NonCommercial-ShareAlike 4.0 International (CC BY-NC-SA 4.0) |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
rights_invalid_str_mv |
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/ Creative Commons Attribution-NonCommercial-ShareAlike 4.0 International (CC BY-NC-SA 4.0) |
dc.format.none.fl_str_mv |
application/pdf |
dc.publisher.none.fl_str_mv |
REDBIO |
publisher.none.fl_str_mv |
REDBIO |
dc.source.none.fl_str_mv |
13° Simposio REDBIO Argentina 2021.“La Biotecnología como Solución a Desafíos Pasados, Presentes y Futuros”. 07 al 11 de Junio (Modalidad virtual) reponame:INTA Digital (INTA) instname:Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria |
reponame_str |
INTA Digital (INTA) |
collection |
INTA Digital (INTA) |
instname_str |
Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria |
repository.name.fl_str_mv |
INTA Digital (INTA) - Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria |
repository.mail.fl_str_mv |
tripaldi.nicolas@inta.gob.ar |
_version_ |
1844619188327415808 |
score |
12.559606 |