Implementación de RT-LAMP para la detección de Strawberrymottle virus en Argentina

Autores
Luciani, Cecilia Elizabeth; Celli, Marcos Giovani; Brugo, M. F.; Pozzi, E. A.; Conci, Vilma Cecilia; Perotto, Maria Cecilia
Año de publicación
2021
Idioma
español castellano
Tipo de recurso
documento de conferencia
Estado
versión publicada
Descripción
Strawberrymottle virus (SMoV) es uno de los virus más importantes a nivel mundial enel cultivo de frutilla. La técnica de detección utilizada en Argentina para el diagnósticode SMoV es la reacción en cadena de la polimerasa con transcripción reversa (RT-PCR). El diagnóstico del virus mediante esta técnica presenta dificultades, ya que escompleja y costosa. Recientemente, en China, SMoV fue detectado por amplificaciónisotérmica mediada por bucles (loop-mediatedisothermalamplificationassay, LAMP),cuyas principales ventajas son la alta sensibilidad, detección rápida y fácilfuncionamiento. El objetivo de este trabajo fue implementar la RT-LAMP para eldiagnóstico de SMoV en el cultivo de frutilla en Argentina. Se extrajeron los ácidosnucleicos totales por el método CTAB con modificaciones de dos plantas negativas yocho plantas positivas por RT-PCR a SMoV. Se utilizaron cebadores FIP/BIP F3/B3 yapublicados para la detección del virus, Bst DNA polimerasa (NEB) y AMV (Promega)para la transcripción reversa. La reacción se incubó durante una hora a 62oC y se tiñócon 1ul de SYBR Green I (Invitrogen).Además, 5 ul de producto de cada reacción secorrió por electroforesis en un gel de agarosa 1%. Los resultados mostraronfluorescencia en las plantas positivas a SMoV previamente testeadas y amplicones enel gel de agarosa. La RT-LAMP se implementó exitosamente y fue específica paraSMoV, con lo cual se recomienda su utilización como herramienta práctica para elrápido diagnóstico en muestras de campo, y para el control de producción de materiallibre de virus en el país.
Fil: Luciani, Cecilia Elizabeth. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Unidad de Fitopatologia y Modelizacion Agricola. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Centro Cientifico Tecnologico Conicet - Cordoba. Unidad de Fitopatologia y Modelizacion Agricola.; Argentina
Fil: Celli, Marcos Giovani. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Unidad de Fitopatologia y Modelizacion Agricola. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Centro Cientifico Tecnologico Conicet - Cordoba. Unidad de Fitopatologia y Modelizacion Agricola.; Argentina
Fil: Brugo, M. F.. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Unidad de Fitopatologia y Modelizacion Agricola. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Centro Cientifico Tecnologico Conicet - Cordoba. Unidad de Fitopatologia y Modelizacion Agricola.; Argentina
Fil: Pozzi, E. A.. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Córdoba. Estación Experimental Agropecuaria Marcos Juárez; Argentina
Fil: Conci, Vilma Cecilia. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Unidad de Fitopatologia y Modelizacion Agricola. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Centro Cientifico Tecnologico Conicet - Cordoba. Unidad de Fitopatologia y Modelizacion Agricola.; Argentina
Fil: Perotto, Maria Cecilia. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Unidad de Fitopatologia y Modelizacion Agricola. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Centro Cientifico Tecnologico Conicet - Cordoba. Unidad de Fitopatologia y Modelizacion Agricola.; Argentina
41º Congreso Argentino de Horticultura y V Simposio de Aromáticas, Medicinales y Condimenticias
La Plata
Argentina
Asociación Argentina de Horticultura
Materia
RT-LAMP
STRAWBERRY MOTTLE VIRUS
ARGENTINA
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
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Repositorio
CONICET Digital (CONICET)
Institución
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
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El objetivo de este trabajo fue implementar la RT-LAMP para eldiagnóstico de SMoV en el cultivo de frutilla en Argentina. Se extrajeron los ácidosnucleicos totales por el método CTAB con modificaciones de dos plantas negativas yocho plantas positivas por RT-PCR a SMoV. Se utilizaron cebadores FIP/BIP F3/B3 yapublicados para la detección del virus, Bst DNA polimerasa (NEB) y AMV (Promega)para la transcripción reversa. La reacción se incubó durante una hora a 62oC y se tiñócon 1ul de SYBR Green I (Invitrogen).Además, 5 ul de producto de cada reacción secorrió por electroforesis en un gel de agarosa 1%. Los resultados mostraronfluorescencia en las plantas positivas a SMoV previamente testeadas y amplicones enel gel de agarosa. La RT-LAMP se implementó exitosamente y fue específica paraSMoV, con lo cual se recomienda su utilización como herramienta práctica para elrápido diagnóstico en muestras de campo, y para el control de producción de materiallibre de virus en el país.Fil: Luciani, Cecilia Elizabeth. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Unidad de Fitopatologia y Modelizacion Agricola. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Centro Cientifico Tecnologico Conicet - Cordoba. Unidad de Fitopatologia y Modelizacion Agricola.; ArgentinaFil: Celli, Marcos Giovani. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Unidad de Fitopatologia y Modelizacion Agricola. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Centro Cientifico Tecnologico Conicet - Cordoba. Unidad de Fitopatologia y Modelizacion Agricola.; ArgentinaFil: Brugo, M. F.. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. 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Fil: Luciani, Cecilia Elizabeth. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Unidad de Fitopatologia y Modelizacion Agricola. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Centro Cientifico Tecnologico Conicet - Cordoba. Unidad de Fitopatologia y Modelizacion Agricola.; Argentina
Fil: Celli, Marcos Giovani. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Unidad de Fitopatologia y Modelizacion Agricola. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Centro Cientifico Tecnologico Conicet - Cordoba. Unidad de Fitopatologia y Modelizacion Agricola.; Argentina
Fil: Brugo, M. F.. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Unidad de Fitopatologia y Modelizacion Agricola. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Centro Cientifico Tecnologico Conicet - Cordoba. Unidad de Fitopatologia y Modelizacion Agricola.; Argentina
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Fil: Conci, Vilma Cecilia. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Unidad de Fitopatologia y Modelizacion Agricola. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Centro Cientifico Tecnologico Conicet - Cordoba. Unidad de Fitopatologia y Modelizacion Agricola.; Argentina
Fil: Perotto, Maria Cecilia. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Unidad de Fitopatologia y Modelizacion Agricola. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Centro Cientifico Tecnologico Conicet - Cordoba. Unidad de Fitopatologia y Modelizacion Agricola.; Argentina
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