Estudio de la familia génica Asr de tomate (Lycopersicon esculentum)

Autores
Maskin, Laura
Año de publicación
2003
Idioma
español castellano
Tipo de recurso
tesis doctoral
Estado
versión publicada
Colaborador/a o director/a de tesis
Iusem, Norberto Daniel
Descripción
En este trabajo se estudiaron los miembros de la familia génica Asr detomate (Asr1, Asr2 y Asr3). Por métodos computacionales se compararon las secuencias aminoacídicasde las proteinas codificadas y se realizó una búsqueda de proteinas homólogas quereveló la existencia de moléculas proteicas conservadas que se acumulan ensituaciones de variados tipos de estrés y/o en fruto. La comparación de todas estasproteínas "tipo ASR", provenientes de muy distintas especies, mostró que lahomología se encuentra concentrada en dos dominios particulares. Además, todascomparten caracteristicas estructurales como la alta hidrofilicidad,alta carga, sitiosconservados de miristoilación y dos regiones hidrofóbicas. Por otro lado, se evaluó la expresión de cada uno de los miembrosconocidos de esta familia génica en tomate (L. esculentum), determinándose queposeen un nivel de expresión variable en condiciones basales en los órganosanalizados y que se inducen diferencialmente en respuesta al estrés hídrico, aldaño, al frio y durante la maduración del fruto. Se observó que la expresión basal de Asr1 y Asr2 en hoja se limitaespecificamente a células acompañantes del floema. En condiciones de falta deagua, la expresión en hoja y en raíz se visualiza también en las célulasparenquimáticas adyacentes. Se muestran evidencias de que ASR forma agregados in vitro (dímeros ytrímeros). Finalmente, ensayos preliminares de expresión en sistemas heterólogosdemuestran que ASR1 provoca un aumento de la viabilidad de levaduras sometidasa estrés salino.
This work reports the study of the members of the tomato Asr gene family (Asr1, Asr2 and Asr3). Using computational methods, the amino acidic sequences were compared. A search of homologous proteins reveled the presence of conserved molecules thataccumulate in responses to various types of stress and/or in fruit. Comparison of allthese ASR-like proteins from different plant species showed that homology isconcentrated at two particular domains. Besides, all of them share structuralfeatures like high hydrophilicity, high charge, a conserved myristoylation signal andtwo hydrophobic zones. In addition, the expression of each known member of the Asr family in tomato (L. esculentum) were evaluated. The results showed variable basal expression levelin all the analyzed organs and differential induction in response to water stress,wounding, cold and during fruit ripening. In leaves, Asr1 and Asr2 basal expression was restricted to the companionphloem cells. Under water deficit conditions, this expression was also visualized inleaf and root parenchyma adjacent cells. Evidences that ASR form aggregates in vitro (dimers and trimers) are shown. Finally, preliminar assays in heterologous expression systems showed that ASR1 causes an increment in viability of yeast subjeted to salt stressed.
Fil: Maskin, Laura. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina.
Nivel de accesibilidad
acceso abierto
Condiciones de uso
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar
Repositorio
Biblioteca Digital (UBA-FCEN)
Institución
Universidad Nacional de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales
OAI Identificador
tesis:tesis_n3676_Maskin

id BDUBAFCEN_d4d1a2ca3245a830192f01d99d7a07b2
oai_identifier_str tesis:tesis_n3676_Maskin
network_acronym_str BDUBAFCEN
repository_id_str 1896
network_name_str Biblioteca Digital (UBA-FCEN)
spelling Estudio de la familia génica Asr de tomate (Lycopersicon esculentum)Maskin, LauraEn este trabajo se estudiaron los miembros de la familia génica Asr detomate (Asr1, Asr2 y Asr3). Por métodos computacionales se compararon las secuencias aminoacídicasde las proteinas codificadas y se realizó una búsqueda de proteinas homólogas quereveló la existencia de moléculas proteicas conservadas que se acumulan ensituaciones de variados tipos de estrés y/o en fruto. La comparación de todas estasproteínas "tipo ASR", provenientes de muy distintas especies, mostró que lahomología se encuentra concentrada en dos dominios particulares. Además, todascomparten caracteristicas estructurales como la alta hidrofilicidad,alta carga, sitiosconservados de miristoilación y dos regiones hidrofóbicas. Por otro lado, se evaluó la expresión de cada uno de los miembrosconocidos de esta familia génica en tomate (L. esculentum), determinándose queposeen un nivel de expresión variable en condiciones basales en los órganosanalizados y que se inducen diferencialmente en respuesta al estrés hídrico, aldaño, al frio y durante la maduración del fruto. Se observó que la expresión basal de Asr1 y Asr2 en hoja se limitaespecificamente a células acompañantes del floema. En condiciones de falta deagua, la expresión en hoja y en raíz se visualiza también en las célulasparenquimáticas adyacentes. Se muestran evidencias de que ASR forma agregados in vitro (dímeros ytrímeros). Finalmente, ensayos preliminares de expresión en sistemas heterólogosdemuestran que ASR1 provoca un aumento de la viabilidad de levaduras sometidasa estrés salino.This work reports the study of the members of the tomato Asr gene family (Asr1, Asr2 and Asr3). Using computational methods, the amino acidic sequences were compared. A search of homologous proteins reveled the presence of conserved molecules thataccumulate in responses to various types of stress and/or in fruit. Comparison of allthese ASR-like proteins from different plant species showed that homology isconcentrated at two particular domains. Besides, all of them share structuralfeatures like high hydrophilicity, high charge, a conserved myristoylation signal andtwo hydrophobic zones. In addition, the expression of each known member of the Asr family in tomato (L. esculentum) were evaluated. The results showed variable basal expression levelin all the analyzed organs and differential induction in response to water stress,wounding, cold and during fruit ripening. In leaves, Asr1 and Asr2 basal expression was restricted to the companionphloem cells. Under water deficit conditions, this expression was also visualized inleaf and root parenchyma adjacent cells. Evidences that ASR form aggregates in vitro (dimers and trimers) are shown. Finally, preliminar assays in heterologous expression systems showed that ASR1 causes an increment in viability of yeast subjeted to salt stressed.Fil: Maskin, Laura. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina.Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y NaturalesIusem, Norberto Daniel2003info:eu-repo/semantics/doctoralThesisinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_db06info:ar-repo/semantics/tesisDoctoralapplication/pdfhttps://hdl.handle.net/20.500.12110/tesis_n3676_Maskinspainfo:eu-repo/semantics/openAccesshttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/arreponame:Biblioteca Digital (UBA-FCEN)instname:Universidad Nacional de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturalesinstacron:UBA-FCEN2025-10-23T11:16:04Ztesis:tesis_n3676_MaskinInstitucionalhttps://digital.bl.fcen.uba.ar/Universidad públicaNo correspondehttps://digital.bl.fcen.uba.ar/cgi-bin/oaiserver.cgiana@bl.fcen.uba.arArgentinaNo correspondeNo correspondeNo correspondeopendoar:18962025-10-23 11:16:05.486Biblioteca Digital (UBA-FCEN) - Universidad Nacional de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturalesfalse
dc.title.none.fl_str_mv Estudio de la familia génica Asr de tomate (Lycopersicon esculentum)
title Estudio de la familia génica Asr de tomate (Lycopersicon esculentum)
spellingShingle Estudio de la familia génica Asr de tomate (Lycopersicon esculentum)
Maskin, Laura
title_short Estudio de la familia génica Asr de tomate (Lycopersicon esculentum)
title_full Estudio de la familia génica Asr de tomate (Lycopersicon esculentum)
title_fullStr Estudio de la familia génica Asr de tomate (Lycopersicon esculentum)
title_full_unstemmed Estudio de la familia génica Asr de tomate (Lycopersicon esculentum)
title_sort Estudio de la familia génica Asr de tomate (Lycopersicon esculentum)
dc.creator.none.fl_str_mv Maskin, Laura
author Maskin, Laura
author_facet Maskin, Laura
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Iusem, Norberto Daniel
dc.description.none.fl_txt_mv En este trabajo se estudiaron los miembros de la familia génica Asr detomate (Asr1, Asr2 y Asr3). Por métodos computacionales se compararon las secuencias aminoacídicasde las proteinas codificadas y se realizó una búsqueda de proteinas homólogas quereveló la existencia de moléculas proteicas conservadas que se acumulan ensituaciones de variados tipos de estrés y/o en fruto. La comparación de todas estasproteínas "tipo ASR", provenientes de muy distintas especies, mostró que lahomología se encuentra concentrada en dos dominios particulares. Además, todascomparten caracteristicas estructurales como la alta hidrofilicidad,alta carga, sitiosconservados de miristoilación y dos regiones hidrofóbicas. Por otro lado, se evaluó la expresión de cada uno de los miembrosconocidos de esta familia génica en tomate (L. esculentum), determinándose queposeen un nivel de expresión variable en condiciones basales en los órganosanalizados y que se inducen diferencialmente en respuesta al estrés hídrico, aldaño, al frio y durante la maduración del fruto. Se observó que la expresión basal de Asr1 y Asr2 en hoja se limitaespecificamente a células acompañantes del floema. En condiciones de falta deagua, la expresión en hoja y en raíz se visualiza también en las célulasparenquimáticas adyacentes. Se muestran evidencias de que ASR forma agregados in vitro (dímeros ytrímeros). Finalmente, ensayos preliminares de expresión en sistemas heterólogosdemuestran que ASR1 provoca un aumento de la viabilidad de levaduras sometidasa estrés salino.
This work reports the study of the members of the tomato Asr gene family (Asr1, Asr2 and Asr3). Using computational methods, the amino acidic sequences were compared. A search of homologous proteins reveled the presence of conserved molecules thataccumulate in responses to various types of stress and/or in fruit. Comparison of allthese ASR-like proteins from different plant species showed that homology isconcentrated at two particular domains. Besides, all of them share structuralfeatures like high hydrophilicity, high charge, a conserved myristoylation signal andtwo hydrophobic zones. In addition, the expression of each known member of the Asr family in tomato (L. esculentum) were evaluated. The results showed variable basal expression levelin all the analyzed organs and differential induction in response to water stress,wounding, cold and during fruit ripening. In leaves, Asr1 and Asr2 basal expression was restricted to the companionphloem cells. Under water deficit conditions, this expression was also visualized inleaf and root parenchyma adjacent cells. Evidences that ASR form aggregates in vitro (dimers and trimers) are shown. Finally, preliminar assays in heterologous expression systems showed that ASR1 causes an increment in viability of yeast subjeted to salt stressed.
Fil: Maskin, Laura. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina.
description En este trabajo se estudiaron los miembros de la familia génica Asr detomate (Asr1, Asr2 y Asr3). Por métodos computacionales se compararon las secuencias aminoacídicasde las proteinas codificadas y se realizó una búsqueda de proteinas homólogas quereveló la existencia de moléculas proteicas conservadas que se acumulan ensituaciones de variados tipos de estrés y/o en fruto. La comparación de todas estasproteínas "tipo ASR", provenientes de muy distintas especies, mostró que lahomología se encuentra concentrada en dos dominios particulares. Además, todascomparten caracteristicas estructurales como la alta hidrofilicidad,alta carga, sitiosconservados de miristoilación y dos regiones hidrofóbicas. Por otro lado, se evaluó la expresión de cada uno de los miembrosconocidos de esta familia génica en tomate (L. esculentum), determinándose queposeen un nivel de expresión variable en condiciones basales en los órganosanalizados y que se inducen diferencialmente en respuesta al estrés hídrico, aldaño, al frio y durante la maduración del fruto. Se observó que la expresión basal de Asr1 y Asr2 en hoja se limitaespecificamente a células acompañantes del floema. En condiciones de falta deagua, la expresión en hoja y en raíz se visualiza también en las célulasparenquimáticas adyacentes. Se muestran evidencias de que ASR forma agregados in vitro (dímeros ytrímeros). Finalmente, ensayos preliminares de expresión en sistemas heterólogosdemuestran que ASR1 provoca un aumento de la viabilidad de levaduras sometidasa estrés salino.
publishDate 2003
dc.date.none.fl_str_mv 2003
dc.type.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
http://purl.org/coar/resource_type/c_db06
info:ar-repo/semantics/tesisDoctoral
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.none.fl_str_mv https://hdl.handle.net/20.500.12110/tesis_n3676_Maskin
url https://hdl.handle.net/20.500.12110/tesis_n3676_Maskin
dc.language.none.fl_str_mv spa
language spa
dc.rights.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar
eu_rights_str_mv openAccess
rights_invalid_str_mv https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales
publisher.none.fl_str_mv Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Biblioteca Digital (UBA-FCEN)
instname:Universidad Nacional de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales
instacron:UBA-FCEN
reponame_str Biblioteca Digital (UBA-FCEN)
collection Biblioteca Digital (UBA-FCEN)
instname_str Universidad Nacional de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales
instacron_str UBA-FCEN
institution UBA-FCEN
repository.name.fl_str_mv Biblioteca Digital (UBA-FCEN) - Universidad Nacional de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales
repository.mail.fl_str_mv ana@bl.fcen.uba.ar
_version_ 1846784834389671936
score 12.982451